MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis Cp162 chromosome

Total Repeats: 43379

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018019	ACC	2	6	28103	28108	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392399613
502	NC_018019	AGTGCT	2	12	28133	28144	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	392399613
503	NC_018019	GAA	2	6	28160	28165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392399613
504	NC_018019	AGC	2	6	28201	28206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392399613
505	NC_018019	AATT	2	8	28212	28219	50 %	50 %	0 %	0 %	392399613
506	NC_018019	GAGT	2	8	28251	28258	25 %	25 %	50 %	0 %	392399613
507	NC_018019	GA	3	6	28263	28268	50 %	0 %	50 %	0 %	392399613
508	NC_018019	AGG	2	6	28310	28315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392399613
509	NC_018019	CA	3	6	28337	28342	50 %	0 %	0 %	50 %	392399613
510	NC_018019	TGG	2	6	28344	28349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392399613
511	NC_018019	TGGA	2	8	28369	28376	25 %	25 %	50 %	0 %	392399613
512	NC_018019	AGC	3	9	28463	28471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392399613
513	NC_018019	GCG	2	6	28489	28494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_018019	GAAG	2	8	28524	28531	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
515	NC_018019	GAA	2	6	28724	28729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392399614
516	NC_018019	GGT	2	6	28775	28780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392399614
517	NC_018019	AC	3	6	28781	28786	50 %	0 %	0 %	50 %	392399614
518	NC_018019	GTT	2	6	28907	28912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392399614
519	NC_018019	ACT	2	6	28973	28978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392399614
520	NC_018019	AGA	2	6	29062	29067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392399614
521	NC_018019	TGC	2	6	29071	29076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399614
522	NC_018019	CTGAT	2	10	29085	29094	20 %	40 %	20 %	20 %	392399614
523	NC_018019	GC	3	6	29110	29115	0 %	0 %	50 %	50 %	392399614
524	NC_018019	TCT	2	6	29157	29162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392399614
525	NC_018019	GAAA	2	8	29185	29192	75 %	0 %	25 %	0 %	392399614
526	NC_018019	CTTC	2	8	29194	29201	0 %	50 %	0 %	50 %	392399614
527	NC_018019	AGAA	2	8	29226	29233	75 %	0 %	25 %	0 %	392399614
528	NC_018019	CAG	2	6	29292	29297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392399614
529	NC_018019	CTT	2	6	29312	29317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392399614
530	NC_018019	CAA	2	6	29350	29355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392399614
531	NC_018019	TC	3	6	29357	29362	0 %	50 %	0 %	50 %	392399614
532	NC_018019	GCCC	2	8	29393	29400	0 %	0 %	25 %	75 %	392399614
533	NC_018019	TGA	2	6	29416	29421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392399614
534	NC_018019	TC	3	6	29436	29441	0 %	50 %	0 %	50 %	392399614
535	NC_018019	TCT	2	6	29475	29480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392399614
536	NC_018019	GAA	2	6	29542	29547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392399614
537	NC_018019	GAA	2	6	29560	29565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392399614
538	NC_018019	GAC	2	6	29588	29593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392399614
539	NC_018019	GAA	2	6	29639	29644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392399614
540	NC_018019	AAG	2	6	29663	29668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392399614
541	NC_018019	GCTA	2	8	29685	29692	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
542	NC_018019	AG	3	6	29707	29712	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
543	NC_018019	TAT	2	6	29730	29735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_018019	CAT	2	6	29880	29885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392399615
545	NC_018019	TAG	2	6	29928	29933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392399615
546	NC_018019	ATG	2	6	29956	29961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392399615
547	NC_018019	GGAGC	2	10	30037	30046	20 %	0 %	60 %	20 %	392399615
548	NC_018019	TA	3	6	30090	30095	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_018019	CGG	2	6	30264	30269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392399616
550	NC_018019	TGAG	2	8	30332	30339	25 %	25 %	50 %	0 %	392399616
551	NC_018019	GCA	2	6	30365	30370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392399616
552	NC_018019	TTG	2	6	30456	30461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392399616
553	NC_018019	CAA	2	6	30498	30503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392399616
554	NC_018019	GTAC	2	8	30533	30540	25 %	25 %	25 %	25 %	392399616
555	NC_018019	CAC	2	6	30601	30606	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392399616
556	NC_018019	TGA	2	6	30642	30647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392399616
557	NC_018019	TTC	2	6	30730	30735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392399616
558	NC_018019	CTT	2	6	30765	30770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392399616
559	NC_018019	GC	3	6	30802	30807	0 %	0 %	50 %	50 %	392399616
560	NC_018019	GAA	2	6	30839	30844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392399616
561	NC_018019	GTG	2	6	30860	30865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392399616
562	NC_018019	T	7	7	30866	30872	0 %	100 %	0 %	0 %	392399616
563	NC_018019	TGA	2	6	30903	30908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392399616
564	NC_018019	GCT	2	6	30966	30971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399616
565	NC_018019	TGC	2	6	31041	31046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399616
566	NC_018019	CCT	2	6	31076	31081	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392399616
567	NC_018019	TTGCT	2	10	31125	31134	0 %	60 %	20 %	20 %	392399616
568	NC_018019	GATC	2	8	31142	31149	25 %	25 %	25 %	25 %	392399616
569	NC_018019	TTC	2	6	31150	31155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392399616
570	NC_018019	GTG	2	6	31265	31270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392399616
571	NC_018019	GCA	2	6	31442	31447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392399616
572	NC_018019	GGA	2	6	31541	31546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392399616
573	NC_018019	GA	3	6	31634	31639	50 %	0 %	50 %	0 %	392399616
574	NC_018019	TGG	2	6	31683	31688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392399616
575	NC_018019	CGT	2	6	31689	31694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399616
576	NC_018019	GC	3	6	31698	31703	0 %	0 %	50 %	50 %	392399616
577	NC_018019	ATC	2	6	31748	31753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392399616
578	NC_018019	CGT	2	6	31791	31796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399616
579	NC_018019	TCT	2	6	31865	31870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392399616
580	NC_018019	CAA	2	6	31968	31973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392399616
581	NC_018019	GCA	2	6	32058	32063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392399616
582	NC_018019	CCT	2	6	32185	32190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392399617
583	NC_018019	TGA	2	6	32272	32277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392399617
584	NC_018019	GGAA	2	8	32280	32287	50 %	0 %	50 %	0 %	392399617
585	NC_018019	GGC	2	6	32341	32346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392399617
586	NC_018019	AAC	2	6	32352	32357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392399617
587	NC_018019	TTC	2	6	32436	32441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392399617
588	NC_018019	ACT	2	6	32496	32501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392399617
589	NC_018019	TCC	2	6	32514	32519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392399617
590	NC_018019	CAA	2	6	32520	32525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392399617
591	NC_018019	TGGC	2	8	32542	32549	0 %	25 %	50 %	25 %	392399617
592	NC_018019	TGC	2	6	32574	32579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399617
593	NC_018019	GAG	2	6	32580	32585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392399617
594	NC_018019	TCC	2	6	32635	32640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392399617
595	NC_018019	TTG	2	6	32648	32653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392399617
596	NC_018019	GTG	2	6	32740	32745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392399617
597	NC_018019	GGTT	2	8	32787	32794	0 %	50 %	50 %	0 %	392399617
598	NC_018019	CTG	2	6	32805	32810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399617
599	NC_018019	CTGA	2	8	32819	32826	25 %	25 %	25 %	25 %	392399617
600	NC_018019	AGT	2	6	32853	32858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392399617
601	NC_018019	GTG	2	6	32972	32977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392399617
602	NC_018019	GCC	3	9	33175	33183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392399617
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605	NC_018019	GCC	2	6	33298	33303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392399617
606	NC_018019	GA	3	6	33366	33371	50 %	0 %	50 %	0 %	392399617
607	NC_018019	CAC	2	6	33374	33379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392399617
608	NC_018019	GAT	2	6	33468	33473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392399617
609	NC_018019	GTC	2	6	33579	33584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399617
610	NC_018019	GCC	2	6	33606	33611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392399617
611	NC_018019	GTC	2	6	33639	33644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399617
612	NC_018019	GC	3	6	33711	33716	0 %	0 %	50 %	50 %	392399618
613	NC_018019	GCT	2	6	33722	33727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399618
614	NC_018019	GCT	2	6	33731	33736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399618
615	NC_018019	GGC	2	6	33760	33765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392399618
616	NC_018019	ACC	2	6	33772	33777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392399618
617	NC_018019	TGC	2	6	33781	33786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399618
618	NC_018019	ACC	2	6	33799	33804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392399618
619	NC_018019	T	6	6	33806	33811	0 %	100 %	0 %	0 %	392399618
620	NC_018019	ACC	2	6	33812	33817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392399618
621	NC_018019	CAG	2	6	33906	33911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392399618
622	NC_018019	CAA	2	6	34065	34070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392399618
623	NC_018019	GCC	2	6	34102	34107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392399618
624	NC_018019	GGAC	2	8	34143	34150	25 %	0 %	50 %	25 %	392399618
625	NC_018019	AGA	2	6	34198	34203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392399618
626	NC_018019	GCT	2	6	34274	34279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399618
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628	NC_018019	TGG	2	6	34519	34524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392399618
629	NC_018019	GCA	2	6	34619	34624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392399618
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631	NC_018019	CTT	2	6	34731	34736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392399618
632	NC_018019	CAC	2	6	34802	34807	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392399618
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635	NC_018019	GTA	2	6	34945	34950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392399618
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738	NC_018019	TACT	2	8	39591	39598	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
739	NC_018019	GCA	2	6	39627	39632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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741	NC_018019	AAGA	2	8	39673	39680	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
742	NC_018019	ATT	2	6	39886	39891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
743	NC_018019	CAC	2	6	39896	39901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
744	NC_018019	C	7	7	39975	39981	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
745	NC_018019	T	6	6	40053	40058	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
746	NC_018019	TGCG	2	8	40123	40130	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
747	NC_018019	CACAT	2	10	40142	40151	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
748	NC_018019	GTT	2	6	40238	40243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392399623
749	NC_018019	AG	3	6	40302	40307	50 %	0 %	50 %	0 %	392399623
750	NC_018019	TGG	2	6	40405	40410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392399623
751	NC_018019	AGG	2	6	40422	40427	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392399623
752	NC_018019	CTT	2	6	40444	40449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392399623
753	NC_018019	AAAG	2	8	40451	40458	75 %	0 %	25 %	0 %	392399623
754	NC_018019	CTG	2	6	40519	40524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399623
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