MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis Cp162 chromosome

Total Repeats: 43379

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_018019	GCC	2	6	259669	259674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392399814
5002	NC_018019	GCG	2	6	259706	259711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392399814
5003	NC_018019	CGT	2	6	259725	259730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399814
5004	NC_018019	GTG	2	6	259818	259823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392399814
5005	NC_018019	GTG	3	9	259907	259915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392399814
5006	NC_018019	GTG	2	6	259987	259992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392399814
5007	NC_018019	GTT	2	6	260033	260038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_018019	TTA	2	6	260046	260051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_018019	CGA	2	6	260065	260070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5010	NC_018019	GAATG	2	10	260243	260252	40 %	20 %	40 %	0 %	392399815
5011	NC_018019	GTG	2	6	260283	260288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392399815
5012	NC_018019	ACC	2	6	260387	260392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392399815
5013	NC_018019	TAC	2	6	260399	260404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392399815
5014	NC_018019	ACG	2	6	260553	260558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392399815
5015	NC_018019	TGCA	2	8	260588	260595	25 %	25 %	25 %	25 %	392399815
5016	NC_018019	GCTG	2	8	260604	260611	0 %	25 %	50 %	25 %	392399815
5017	NC_018019	AGC	2	6	260723	260728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392399816
5018	NC_018019	CT	3	6	260748	260753	0 %	50 %	0 %	50 %	392399816
5019	NC_018019	CAC	2	6	260769	260774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392399816
5020	NC_018019	CGG	2	6	260784	260789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392399816
5021	NC_018019	CGC	2	6	260799	260804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392399816
5022	NC_018019	CG	3	6	260821	260826	0 %	0 %	50 %	50 %	392399816
5023	NC_018019	GTG	2	6	260830	260835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392399816
5024	NC_018019	TGG	2	6	260939	260944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392399816
5025	NC_018019	CAG	2	6	260960	260965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392399816
5026	NC_018019	GGTGT	2	10	260998	261007	0 %	40 %	60 %	0 %	392399816
5027	NC_018019	GTC	2	6	261016	261021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399816
5028	NC_018019	G	6	6	261046	261051	0 %	0 %	100 %	0 %	392399816
5029	NC_018019	CTG	2	6	261080	261085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399816
5030	NC_018019	CTG	2	6	261191	261196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399816
5031	NC_018019	CGGGG	2	10	261239	261248	0 %	0 %	80 %	20 %	392399816
5032	NC_018019	TGG	2	6	261345	261350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392399816
5033	NC_018019	GAT	2	6	261433	261438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392399816
5034	NC_018019	CCG	2	6	261452	261457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392399816
5035	NC_018019	T	6	6	261463	261468	0 %	100 %	0 %	0 %	392399816
5036	NC_018019	ATT	2	6	261478	261483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392399816
5037	NC_018019	GCG	2	6	261565	261570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392399816
5038	NC_018019	TAGA	2	8	261608	261615	50 %	25 %	25 %	0 %	392399816
5039	NC_018019	CCA	2	6	261662	261667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392399816
5040	NC_018019	CAG	2	6	261707	261712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392399816
5041	NC_018019	TGG	2	6	261716	261721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392399816
5042	NC_018019	GGT	2	6	261765	261770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392399816
5043	NC_018019	GAACCA	2	12	261775	261786	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	392399816
5044	NC_018019	CGG	3	9	261945	261953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392399817
5045	NC_018019	AAT	2	6	262036	262041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392399817
5046	NC_018019	GCG	2	6	262089	262094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392399817
5047	NC_018019	ACA	2	6	262095	262100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392399817
5048	NC_018019	CGG	2	6	262135	262140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392399817
5049	NC_018019	TGC	2	6	262158	262163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399817
5050	NC_018019	CCG	2	6	262183	262188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392399817
5051	NC_018019	TCC	2	6	262202	262207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392399817
5052	NC_018019	ATG	2	6	262212	262217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392399817
5053	NC_018019	TCT	2	6	262254	262259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392399817
5054	NC_018019	ATG	2	6	262263	262268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392399817
5055	NC_018019	GTTG	2	8	262324	262331	0 %	50 %	50 %	0 %	392399817
5056	NC_018019	CTT	2	6	262375	262380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392399817
5057	NC_018019	TCGTC	2	10	262393	262402	0 %	40 %	20 %	40 %	392399817
5058	NC_018019	GAC	2	6	262465	262470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392399817
5059	NC_018019	CGA	2	6	262492	262497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392399817
5060	NC_018019	GAG	2	6	262535	262540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392399817
5061	NC_018019	CAGG	2	8	262579	262586	25 %	0 %	50 %	25 %	392399817
5062	NC_018019	CGG	2	6	262642	262647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392399817
5063	NC_018019	TTCT	2	8	262700	262707	0 %	75 %	0 %	25 %	392399817
5064	NC_018019	ATG	2	6	262719	262724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392399817
5065	NC_018019	TC	3	6	262756	262761	0 %	50 %	0 %	50 %	392399817
5066	NC_018019	GAG	2	6	262829	262834	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392399817
5067	NC_018019	GCC	2	6	262898	262903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392399817
5068	NC_018019	TCA	2	6	263089	263094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392399817
5069	NC_018019	GCATC	2	10	263137	263146	20 %	20 %	20 %	40 %	392399817
5070	NC_018019	G	6	6	263176	263181	0 %	0 %	100 %	0 %	392399817
5071	NC_018019	GGC	2	6	263210	263215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392399817
5072	NC_018019	AG	3	6	263284	263289	50 %	0 %	50 %	0 %	392399817
5073	NC_018019	ACG	2	6	263301	263306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392399817
5074	NC_018019	CAGA	2	8	263363	263370	50 %	0 %	25 %	25 %	392399817
5075	NC_018019	TGGC	2	8	263479	263486	0 %	25 %	50 %	25 %	392399817
5076	NC_018019	GTG	2	6	263532	263537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392399817
5077	NC_018019	GTA	2	6	263573	263578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392399817
5078	NC_018019	CAA	2	6	263893	263898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5079	NC_018019	GCG	2	6	263986	263991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392399818
5080	NC_018019	CGT	2	6	264042	264047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399818
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5082	NC_018019	CCCA	2	8	264177	264184	25 %	0 %	0 %	75 %	392399818
5083	NC_018019	GCA	2	6	264189	264194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392399818
5084	NC_018019	CGGG	2	8	264199	264206	0 %	0 %	75 %	25 %	392399818
5085	NC_018019	ATT	2	6	264259	264264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392399818
5086	NC_018019	GGTGG	2	10	264278	264287	0 %	20 %	80 %	0 %	392399818
5087	NC_018019	CCG	2	6	264392	264397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392399818
5088	NC_018019	AGC	2	6	264406	264411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392399818
5089	NC_018019	TGG	2	6	264415	264420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392399818
5090	NC_018019	CAT	2	6	264474	264479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392399818
5091	NC_018019	ACGCA	2	10	264549	264558	40 %	0 %	20 %	40 %	392399818
5092	NC_018019	GCT	2	6	264660	264665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399818
5093	NC_018019	CGC	2	6	264681	264686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392399818
5094	NC_018019	GGC	2	6	264845	264850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392399818
5095	NC_018019	TTG	2	6	264856	264861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392399818
5096	NC_018019	TTG	2	6	264892	264897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392399818
5097	NC_018019	G	6	6	264944	264949	0 %	0 %	100 %	0 %	392399818
5098	NC_018019	GCT	2	6	265034	265039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399818
5099	NC_018019	GGA	2	6	265070	265075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392399818
5100	NC_018019	GCC	2	6	265107	265112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392399818
5101	NC_018019	AGG	2	6	265129	265134	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392399818
5102	NC_018019	TTGATG	2	12	265156	265167	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	392399818
5103	NC_018019	TTC	2	6	265339	265344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392399819
5104	NC_018019	CGAGGC	2	12	265421	265432	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	392399819
5105	NC_018019	GCG	3	9	265438	265446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392399819
5106	NC_018019	CAA	2	6	265458	265463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392399819
5107	NC_018019	TGT	2	6	265478	265483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392399819
5108	NC_018019	CTTCT	2	10	265489	265498	0 %	60 %	0 %	40 %	392399819
5109	NC_018019	TCG	2	6	265499	265504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399819
5110	NC_018019	CGG	2	6	265537	265542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392399819
5111	NC_018019	CTC	2	6	265684	265689	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392399819
5112	NC_018019	ATCT	2	8	265744	265751	25 %	50 %	0 %	25 %	392399819
5113	NC_018019	AGGA	2	8	265972	265979	50 %	0 %	50 %	0 %	392399819
5114	NC_018019	TACC	2	8	266000	266007	25 %	25 %	0 %	50 %	392399819
5115	NC_018019	GGCAGC	2	12	266018	266029	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	392399819
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5117	NC_018019	GGC	2	6	266055	266060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392399819
5118	NC_018019	GGTC	2	8	266162	266169	0 %	25 %	50 %	25 %	392399820
5119	NC_018019	ACC	2	6	266216	266221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392399820
5120	NC_018019	TGC	2	6	266232	266237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399820
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5122	NC_018019	TTG	2	6	266297	266302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392399820
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5241	NC_018019	AGA	2	6	271629	271634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5242	NC_018019	GTT	2	6	271715	271720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5488	NC_018019	GAT	2	6	283500	283505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392399839
5489	NC_018019	AGGA	2	8	283549	283556	50 %	0 %	50 %	0 %	392399839
5490	NC_018019	GAA	2	6	283605	283610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392399839
5491	NC_018019	TAT	2	6	283630	283635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392399839
5492	NC_018019	GCC	3	9	283674	283682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392399839
5493	NC_018019	AGT	2	6	283695	283700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392399839
5494	NC_018019	GTTG	2	8	283703	283710	0 %	50 %	50 %	0 %	392399839
5495	NC_018019	GTG	2	6	283732	283737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392399839
5496	NC_018019	GAT	2	6	283814	283819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392399839
5497	NC_018019	TGGC	2	8	283885	283892	0 %	25 %	50 %	25 %	392399839
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5499	NC_018019	GCGCTT	2	12	284040	284051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399839
5500	NC_018019	GCA	2	6	284061	284066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392399839

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