MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis F/SW5

Total Repeats: 750

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017953	TGTGA	2	10	3881	3890	20 %	40 %	40 %	0 %	389859452
2	NC_017953	TTGAA	2	10	4237	4246	40 %	40 %	20 %	0 %	389859453
3	NC_017953	GAGAA	2	10	4531	4540	60 %	0 %	40 %	0 %	389859453
4	NC_017953	GAAAA	2	10	4968	4977	80 %	0 %	20 %	0 %	389859453
5	NC_017953	TTACA	2	10	5123	5132	40 %	40 %	0 %	20 %	389859453
6	NC_017953	GTCTT	2	10	5817	5826	0 %	60 %	20 %	20 %	389859454
7	NC_017953	TATTT	2	10	7632	7641	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017953	TGGTA	2	10	8290	8299	20 %	40 %	40 %	0 %	389859456
9	NC_017953	CGAAA	2	10	9698	9707	60 %	0 %	20 %	20 %	389859457
10	NC_017953	GGCTG	2	10	10334	10343	0 %	20 %	60 %	20 %	389859458
11	NC_017953	CCTCT	2	10	11126	11135	0 %	40 %	0 %	60 %	389859459
12	NC_017953	AAAGG	2	10	11285	11294	60 %	0 %	40 %	0 %	389859459
13	NC_017953	AAGAA	2	10	12405	12414	80 %	0 %	20 %	0 %	389859460
14	NC_017953	AAAGA	2	10	13803	13812	80 %	0 %	20 %	0 %	389859461
15	NC_017953	GGTGT	2	10	13907	13916	0 %	40 %	60 %	0 %	389859461
16	NC_017953	GATTT	2	10	15650	15659	20 %	60 %	20 %	0 %	389859463
17	NC_017953	CGTTC	2	10	16761	16770	0 %	40 %	20 %	40 %	389859464
18	NC_017953	GCTTC	2	10	17134	17143	0 %	40 %	20 %	40 %	389859464
19	NC_017953	GAAGG	2	10	17505	17514	40 %	0 %	60 %	0 %	389859464
20	NC_017953	GTTGT	2	10	20931	20940	0 %	60 %	40 %	0 %	389859467
21	NC_017953	AAGAT	2	10	22043	22052	60 %	20 %	20 %	0 %	389859468
22	NC_017953	TTTGC	2	10	22654	22663	0 %	60 %	20 %	20 %	389859468
23	NC_017953	GGAAA	2	10	24408	24417	60 %	0 %	40 %	0 %	389859468
24	NC_017953	AGAGG	2	10	26133	26142	40 %	0 %	60 %	0 %	389859469
25	NC_017953	GGAGA	2	10	27912	27921	40 %	0 %	60 %	0 %	389859470
26	NC_017953	ATCCG	2	10	28663	28672	20 %	20 %	20 %	40 %	389859472
27	NC_017953	AGGGT	2	10	29181	29190	20 %	20 %	60 %	0 %	389859472
28	NC_017953	CCTAT	2	10	30221	30230	20 %	40 %	0 %	40 %	389859473
29	NC_017953	AAGGA	2	10	31021	31030	60 %	0 %	40 %	0 %	389859474
30	NC_017953	GAGCT	2	10	32060	32069	20 %	20 %	40 %	20 %	389859475
31	NC_017953	AAAGA	2	10	33693	33702	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017953	TCAGT	2	10	36300	36309	20 %	40 %	20 %	20 %	389859481
33	NC_017953	CTATT	2	10	36734	36743	20 %	60 %	0 %	20 %	389859481
34	NC_017953	TCCTA	2	10	36781	36790	20 %	40 %	0 %	40 %	389859481
35	NC_017953	ACGAT	2	10	38697	38706	40 %	20 %	20 %	20 %	389859482
36	NC_017953	TTTGA	2	10	39062	39071	20 %	60 %	20 %	0 %	389859482
37	NC_017953	AGCAA	2	10	42713	42722	60 %	0 %	20 %	20 %	389859485
38	NC_017953	CGATG	2	10	42770	42779	20 %	20 %	40 %	20 %	389859485
39	NC_017953	TGCAA	2	10	42928	42937	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_017953	CAAAA	2	10	43246	43255	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_017953	TTTAT	2	10	44843	44852	20 %	80 %	0 %	0 %	389859489
42	NC_017953	CTTTC	2	10	46940	46949	0 %	60 %	0 %	40 %	389859491
43	NC_017953	AGTTT	2	10	47479	47488	20 %	60 %	20 %	0 %	389859491
44	NC_017953	GAAGA	2	10	48612	48621	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017953	CTATT	2	10	50191	50200	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_017953	CTTTT	2	10	50642	50651	0 %	80 %	0 %	20 %	389859494
47	NC_017953	ATTAA	2	10	51982	51991	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017953	CCGTA	2	10	54417	54426	20 %	20 %	20 %	40 %	389859497
49	NC_017953	AATTT	2	10	54657	54666	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017953	TTATC	2	10	55826	55835	20 %	60 %	0 %	20 %	389859498
51	NC_017953	TGAGT	2	10	55847	55856	20 %	40 %	40 %	0 %	389859498
52	NC_017953	GTTGT	2	10	56894	56903	0 %	60 %	40 %	0 %	389859499
53	NC_017953	GAGCA	2	10	60342	60351	40 %	0 %	40 %	20 %	389859501
54	NC_017953	TGTGA	2	10	62791	62800	20 %	40 %	40 %	0 %	389859503
55	NC_017953	AGTGA	2	10	64312	64321	40 %	20 %	40 %	0 %	389859504
56	NC_017953	CCTTC	2	10	64586	64595	0 %	40 %	0 %	60 %	389859504
57	NC_017953	AGGAG	2	10	66814	66823	40 %	0 %	60 %	0 %	389859506
58	NC_017953	GTTAA	2	10	66944	66953	40 %	40 %	20 %	0 %	389859506
59	NC_017953	AAAAG	2	10	69570	69579	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017953	GGAGC	2	10	70192	70201	20 %	0 %	60 %	20 %	389859509
61	NC_017953	GCGAT	2	10	70382	70391	20 %	20 %	40 %	20 %	389859509
62	NC_017953	CTCTT	2	10	70736	70745	0 %	60 %	0 %	40 %	389859509
63	NC_017953	AGGGG	2	10	71382	71391	20 %	0 %	80 %	0 %	389859509
64	NC_017953	AAGAA	2	10	71424	71433	80 %	0 %	20 %	0 %	389859509
65	NC_017953	CTTGC	2	10	72513	72522	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
66	NC_017953	ATTGG	2	10	72714	72723	20 %	40 %	40 %	0 %	389859511
67	NC_017953	GAAAA	2	10	73786	73795	80 %	0 %	20 %	0 %	389859511
68	NC_017953	TGGGA	2	10	74203	74212	20 %	20 %	60 %	0 %	389859512
69	NC_017953	TATTT	2	10	76730	76739	20 %	80 %	0 %	0 %	389859513
70	NC_017953	AAAAG	2	10	77263	77272	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017953	ATCAA	2	10	78961	78970	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_017953	TGTCT	2	10	80523	80532	0 %	60 %	20 %	20 %	389859516
73	NC_017953	TTACT	2	10	81030	81039	20 %	60 %	0 %	20 %	389859516
74	NC_017953	AGAAA	2	10	82420	82429	80 %	0 %	20 %	0 %	389859518
75	NC_017953	GGAAG	2	10	82933	82942	40 %	0 %	60 %	0 %	389859518
76	NC_017953	AGCGA	2	10	85399	85408	40 %	0 %	40 %	20 %	389859520
77	NC_017953	TTTGT	2	10	85698	85707	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017953	GATCC	2	10	86484	86493	20 %	20 %	20 %	40 %	389859521
79	NC_017953	AGAGC	2	10	87819	87828	40 %	0 %	40 %	20 %	389859522
80	NC_017953	AATAA	2	10	88697	88706	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017953	TTTTC	2	10	91551	91560	0 %	80 %	0 %	20 %	389859525
82	NC_017953	GGATG	2	10	91811	91820	20 %	20 %	60 %	0 %	389859526
83	NC_017953	CAACA	2	10	93350	93359	60 %	0 %	0 %	40 %	389859527
84	NC_017953	TTTAA	2	10	94233	94242	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017953	ACAGC	2	10	94394	94403	40 %	0 %	20 %	40 %	389859529
86	NC_017953	CTTTT	2	10	94768	94777	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_017953	GGAAC	2	10	95107	95116	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
88	NC_017953	GGATT	2	10	96007	96016	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017953	CAATC	2	10	97116	97125	40 %	20 %	0 %	40 %	389859531
90	NC_017953	TTTGC	2	10	97250	97259	0 %	60 %	20 %	20 %	389859531
91	NC_017953	ATTCA	2	10	97514	97523	40 %	40 %	0 %	20 %	389859531
92	NC_017953	GATCC	2	10	97773	97782	20 %	20 %	20 %	40 %	389859531
93	NC_017953	GTTTT	2	10	98194	98203	0 %	80 %	20 %	0 %	389859531
94	NC_017953	ACAAA	2	10	98321	98330	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_017953	AAGCT	2	10	99397	99406	40 %	20 %	20 %	20 %	389859532
96	NC_017953	AGGGG	2	10	99756	99765	20 %	0 %	80 %	0 %	389859532
97	NC_017953	ATAGC	2	10	100455	100464	40 %	20 %	20 %	20 %	389859533
98	NC_017953	AGCGA	2	10	103383	103392	40 %	0 %	40 %	20 %	389859536
99	NC_017953	TTTCT	2	10	103741	103750	0 %	80 %	0 %	20 %	389859536
100	NC_017953	ATCAT	2	10	104947	104956	40 %	40 %	0 %	20 %	389859537
101	NC_017953	GGCAT	2	10	105655	105664	20 %	20 %	40 %	20 %	389859537
102	NC_017953	AAAGC	2	10	109381	109390	60 %	0 %	20 %	20 %	389859540
103	NC_017953	GCATT	2	10	110541	110550	20 %	40 %	20 %	20 %	389859542
104	NC_017953	GCTCT	2	10	114594	114603	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
105	NC_017953	TGTTT	2	10	115218	115227	0 %	80 %	20 %	0 %	389859545
106	NC_017953	CATGT	2	10	115596	115605	20 %	40 %	20 %	20 %	389859545
107	NC_017953	TATCG	2	10	116300	116309	20 %	40 %	20 %	20 %	389859545
108	NC_017953	TTTCT	2	10	116816	116825	0 %	80 %	0 %	20 %	389859546
109	NC_017953	AAAGA	2	10	119061	119070	80 %	0 %	20 %	0 %	389859548
110	NC_017953	GCTTC	2	10	123051	123060	0 %	40 %	20 %	40 %	389859551
111	NC_017953	TACAA	2	10	126839	126848	60 %	20 %	0 %	20 %	389859555
112	NC_017953	ATCCA	2	10	129247	129256	40 %	20 %	0 %	40 %	389859558
113	NC_017953	GAAGA	2	10	130797	130806	60 %	0 %	40 %	0 %	389859558
114	NC_017953	AAAAG	2	10	132710	132719	80 %	0 %	20 %	0 %	389859559
115	NC_017953	GATTC	2	10	133041	133050	20 %	40 %	20 %	20 %	389859559
116	NC_017953	ATTGG	2	10	136326	136335	20 %	40 %	40 %	0 %	389859562
117	NC_017953	TGTTT	2	10	136785	136794	0 %	80 %	20 %	0 %	389859563
118	NC_017953	TTGCA	2	10	137575	137584	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
119	NC_017953	TCCAG	2	10	140531	140540	20 %	20 %	20 %	40 %	389859569
120	NC_017953	GTACA	2	10	141262	141271	40 %	20 %	20 %	20 %	389859570
121	NC_017953	TAGAT	2	10	141635	141644	40 %	40 %	20 %	0 %	389859570
122	NC_017953	AAAAG	2	10	142047	142056	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017953	AAAAC	2	10	142527	142536	80 %	0 %	0 %	20 %	389859571
124	NC_017953	TGCTA	2	10	143613	143622	20 %	40 %	20 %	20 %	389859573
125	NC_017953	GGAGC	2	10	143660	143669	20 %	0 %	60 %	20 %	389859573
126	NC_017953	CTGGG	2	10	145074	145083	0 %	20 %	60 %	20 %	389859575
127	NC_017953	GTTTT	2	10	145821	145830	0 %	80 %	20 %	0 %	389859576
128	NC_017953	GAACC	2	10	149555	149564	40 %	0 %	20 %	40 %	389859577
129	NC_017953	ATTCT	2	10	153051	153060	20 %	60 %	0 %	20 %	389859581
130	NC_017953	CTGTG	2	10	153255	153264	0 %	40 %	40 %	20 %	389859581
131	NC_017953	TTCTT	2	10	155728	155737	0 %	80 %	0 %	20 %	389859584
132	NC_017953	TTCTA	2	10	157833	157842	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_017953	AGGAA	2	10	160286	160295	60 %	0 %	40 %	0 %	389859588
134	NC_017953	CAAAA	2	10	162289	162298	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_017953	AGAGA	2	10	163517	163526	60 %	0 %	40 %	0 %	389859591
136	NC_017953	AGCAA	2	10	163952	163961	60 %	0 %	20 %	20 %	389859591
137	NC_017953	CAAAA	2	10	167455	167464	80 %	0 %	0 %	20 %	389859593
138	NC_017953	AAGAG	2	10	168288	168297	60 %	0 %	40 %	0 %	389859593
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