MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis F/SW5

Total Repeats: 2868

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017953	GGAT	2	8	57	64	25 %	25 %	50 %	0 %	389859449
2	NC_017953	AGTG	2	8	547	554	25 %	25 %	50 %	0 %	389859449
3	NC_017953	TGGC	2	8	581	588	0 %	25 %	50 %	25 %	389859449
4	NC_017953	AATG	2	8	1066	1073	50 %	25 %	25 %	0 %	389859449
5	NC_017953	CTAT	2	8	1400	1407	25 %	50 %	0 %	25 %	389859449
6	NC_017953	AAGG	2	8	1909	1916	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017953	AGTA	2	8	2089	2096	50 %	25 %	25 %	0 %	389859450
8	NC_017953	ATGA	2	8	2493	2500	50 %	25 %	25 %	0 %	389859451
9	NC_017953	GATA	2	8	2531	2538	50 %	25 %	25 %	0 %	389859451
10	NC_017953	TTTC	2	8	2828	2835	0 %	75 %	0 %	25 %	389859452
11	NC_017953	CATG	2	8	3709	3716	25 %	25 %	25 %	25 %	389859452
12	NC_017953	TTCC	2	8	4014	4021	0 %	50 %	0 %	50 %	389859452
13	NC_017953	TTTA	2	8	4412	4419	25 %	75 %	0 %	0 %	389859453
14	NC_017953	ATCC	2	8	4712	4719	25 %	25 %	0 %	50 %	389859453
15	NC_017953	GACG	2	8	5459	5466	25 %	0 %	50 %	25 %	389859453
16	NC_017953	TTGG	2	8	5562	5569	0 %	50 %	50 %	0 %	389859453
17	NC_017953	TGGA	2	8	5921	5928	25 %	25 %	50 %	0 %	389859454
18	NC_017953	CTTT	2	8	6298	6305	0 %	75 %	0 %	25 %	389859454
19	NC_017953	GGGA	2	8	6813	6820	25 %	0 %	75 %	0 %	389859454
20	NC_017953	GGAG	2	8	6904	6911	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017953	GGTG	2	8	7116	7123	0 %	25 %	75 %	0 %	389859455
22	NC_017953	AAAT	2	8	7182	7189	75 %	25 %	0 %	0 %	389859455
23	NC_017953	TATG	2	8	7553	7560	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017953	ATTT	2	8	7694	7701	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017953	ATTT	2	8	7785	7792	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017953	AAGC	2	8	8420	8427	50 %	0 %	25 %	25 %	389859456
27	NC_017953	ATTG	2	8	8818	8825	25 %	50 %	25 %	0 %	389859457
28	NC_017953	AGCG	2	8	9285	9292	25 %	0 %	50 %	25 %	389859457
29	NC_017953	AAAG	2	8	9306	9313	75 %	0 %	25 %	0 %	389859457
30	NC_017953	CTTT	2	8	9646	9653	0 %	75 %	0 %	25 %	389859457
31	NC_017953	TATT	2	8	9909	9916	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017953	TTCG	2	8	10020	10027	0 %	50 %	25 %	25 %	389859458
33	NC_017953	AATT	2	8	10125	10132	50 %	50 %	0 %	0 %	389859458
34	NC_017953	ATGG	2	8	10184	10191	25 %	25 %	50 %	0 %	389859458
35	NC_017953	CTTT	2	8	10809	10816	0 %	75 %	0 %	25 %	389859459
36	NC_017953	GCAA	2	8	11026	11033	50 %	0 %	25 %	25 %	389859459
37	NC_017953	AGCC	2	8	11256	11263	25 %	0 %	25 %	50 %	389859459
38	NC_017953	GAAA	2	8	11399	11406	75 %	0 %	25 %	0 %	389859459
39	NC_017953	AGAA	2	8	11803	11810	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017953	AATG	2	8	12142	12149	50 %	25 %	25 %	0 %	389859460
41	NC_017953	GTTT	2	8	13174	13181	0 %	75 %	25 %	0 %	389859461
42	NC_017953	ATGC	2	8	13604	13611	25 %	25 %	25 %	25 %	389859461
43	NC_017953	AAGG	2	8	14039	14046	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017953	TTGT	2	8	14640	14647	0 %	75 %	25 %	0 %	389859462
45	NC_017953	TTCT	2	8	14811	14818	0 %	75 %	0 %	25 %	389859462
46	NC_017953	ATTT	2	8	15017	15024	25 %	75 %	0 %	0 %	389859462
47	NC_017953	TTTC	2	8	15679	15686	0 %	75 %	0 %	25 %	389859463
48	NC_017953	AAAT	2	8	16161	16168	75 %	25 %	0 %	0 %	389859463
49	NC_017953	CAAA	2	8	16673	16680	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_017953	GTAA	2	8	17003	17010	50 %	25 %	25 %	0 %	389859464
51	NC_017953	CTAA	2	8	17196	17203	50 %	25 %	0 %	25 %	389859464
52	NC_017953	AGAA	2	8	17459	17466	75 %	0 %	25 %	0 %	389859464
53	NC_017953	ATTT	2	8	17605	17612	25 %	75 %	0 %	0 %	389859464
54	NC_017953	TGCG	2	8	19127	19134	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_017953	GAAG	2	8	20111	20118	50 %	0 %	50 %	0 %	389859466
56	NC_017953	TTTG	2	8	20137	20144	0 %	75 %	25 %	0 %	389859466
57	NC_017953	TGTA	2	8	20829	20836	25 %	50 %	25 %	0 %	389859467
58	NC_017953	GCCA	2	8	21621	21628	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_017953	CGCT	2	8	21869	21876	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_017953	TTAA	2	8	21890	21897	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017953	GTTA	2	8	21927	21934	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017953	GATC	2	8	21982	21989	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_017953	TGGG	2	8	22247	22254	0 %	25 %	75 %	0 %	389859468
64	NC_017953	CATT	2	8	23304	23311	25 %	50 %	0 %	25 %	389859468
65	NC_017953	GCTT	2	8	23647	23654	0 %	50 %	25 %	25 %	389859468
66	NC_017953	GGTT	2	8	23695	23702	0 %	50 %	50 %	0 %	389859468
67	NC_017953	TTCT	2	8	24065	24072	0 %	75 %	0 %	25 %	389859468
68	NC_017953	TAAC	2	8	24167	24174	50 %	25 %	0 %	25 %	389859468
69	NC_017953	CATT	2	8	24290	24297	25 %	50 %	0 %	25 %	389859468
70	NC_017953	GGTA	2	8	24660	24667	25 %	25 %	50 %	0 %	389859468
71	NC_017953	TTGA	2	8	25655	25662	25 %	50 %	25 %	0 %	389859469
72	NC_017953	TTCG	2	8	25800	25807	0 %	50 %	25 %	25 %	389859469
73	NC_017953	TAGG	2	8	25879	25886	25 %	25 %	50 %	0 %	389859469
74	NC_017953	TTCC	2	8	26003	26010	0 %	50 %	0 %	50 %	389859469
75	NC_017953	TAGG	2	8	26117	26124	25 %	25 %	50 %	0 %	389859469
76	NC_017953	TTTC	2	8	26552	26559	0 %	75 %	0 %	25 %	389859469
77	NC_017953	GCTT	2	8	26889	26896	0 %	50 %	25 %	25 %	389859469
78	NC_017953	GGAA	2	8	27472	27479	50 %	0 %	50 %	0 %	389859470
79	NC_017953	TTAA	2	8	27545	27552	50 %	50 %	0 %	0 %	389859470
80	NC_017953	AAAG	2	8	27595	27602	75 %	0 %	25 %	0 %	389859470
81	NC_017953	GGGC	2	8	27875	27882	0 %	0 %	75 %	25 %	389859470
82	NC_017953	GTTT	2	8	28158	28165	0 %	75 %	25 %	0 %	389859471
83	NC_017953	CAGA	2	8	28180	28187	50 %	0 %	25 %	25 %	389859471
84	NC_017953	ATTG	2	8	28539	28546	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017953	CTTT	2	8	30152	30159	0 %	75 %	0 %	25 %	389859473
86	NC_017953	TTTG	2	8	30167	30174	0 %	75 %	25 %	0 %	389859473
87	NC_017953	TTGT	2	8	30202	30209	0 %	75 %	25 %	0 %	389859473
88	NC_017953	TGGC	2	8	30365	30372	0 %	25 %	50 %	25 %	389859473
89	NC_017953	AAAG	2	8	30925	30932	75 %	0 %	25 %	0 %	389859474
90	NC_017953	AAAC	2	8	30995	31002	75 %	0 %	0 %	25 %	389859474
91	NC_017953	GATG	2	8	31138	31145	25 %	25 %	50 %	0 %	389859474
92	NC_017953	GATA	2	8	32247	32254	50 %	25 %	25 %	0 %	389859476
93	NC_017953	TGAT	2	8	34742	34749	25 %	50 %	25 %	0 %	389859479
94	NC_017953	AAGA	3	12	34870	34881	75 %	0 %	25 %	0 %	389859479
95	NC_017953	AAGC	2	8	35090	35097	50 %	0 %	25 %	25 %	389859480
96	NC_017953	GTTC	2	8	35123	35130	0 %	50 %	25 %	25 %	389859480
97	NC_017953	GGCA	2	8	35502	35509	25 %	0 %	50 %	25 %	389859481
98	NC_017953	TCGA	2	8	35759	35766	25 %	25 %	25 %	25 %	389859481
99	NC_017953	TGCT	2	8	35912	35919	0 %	50 %	25 %	25 %	389859481
100	NC_017953	TTGG	2	8	36144	36151	0 %	50 %	50 %	0 %	389859481
101	NC_017953	AGAT	2	8	36864	36871	50 %	25 %	25 %	0 %	389859481
102	NC_017953	CTTT	2	8	37237	37244	0 %	75 %	0 %	25 %	389859482
103	NC_017953	ATGA	2	8	37727	37734	50 %	25 %	25 %	0 %	389859482
104	NC_017953	TAGG	2	8	37886	37893	25 %	25 %	50 %	0 %	389859482
105	NC_017953	CAAT	2	8	38070	38077	50 %	25 %	0 %	25 %	389859482
106	NC_017953	AATG	2	8	38857	38864	50 %	25 %	25 %	0 %	389859482
107	NC_017953	AGAA	2	8	39694	39701	75 %	0 %	25 %	0 %	389859483
108	NC_017953	AAGA	2	8	39746	39753	75 %	0 %	25 %	0 %	389859483
109	NC_017953	ATCC	2	8	39754	39761	25 %	25 %	0 %	50 %	389859483
110	NC_017953	TAAT	2	8	39965	39972	50 %	50 %	0 %	0 %	389859483
111	NC_017953	GTGC	2	8	42054	42061	0 %	25 %	50 %	25 %	389859485
112	NC_017953	AGAA	2	8	42473	42480	75 %	0 %	25 %	0 %	389859485
113	NC_017953	GGAT	2	8	42625	42632	25 %	25 %	50 %	0 %	389859485
114	NC_017953	AAAC	2	8	43833	43840	75 %	0 %	0 %	25 %	389859487
115	NC_017953	CAAT	2	8	44037	44044	50 %	25 %	0 %	25 %	389859487
116	NC_017953	TGTT	2	8	44417	44424	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017953	AATA	2	8	44656	44663	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017953	ATTT	2	8	44794	44801	25 %	75 %	0 %	0 %	389859489
119	NC_017953	GCTC	2	8	45102	45109	0 %	25 %	25 %	50 %	389859489
120	NC_017953	TTCT	2	8	45244	45251	0 %	75 %	0 %	25 %	389859489
121	NC_017953	TTGA	2	8	45844	45851	25 %	50 %	25 %	0 %	389859490
122	NC_017953	TGTT	2	8	46016	46023	0 %	75 %	25 %	0 %	389859490
123	NC_017953	CTAT	2	8	46046	46053	25 %	50 %	0 %	25 %	389859490
124	NC_017953	TGTT	2	8	46075	46082	0 %	75 %	25 %	0 %	389859490
125	NC_017953	CTAT	2	8	46371	46378	25 %	50 %	0 %	25 %	389859490
126	NC_017953	AAGA	2	8	46867	46874	75 %	0 %	25 %	0 %	389859491
127	NC_017953	AAGA	2	8	46924	46931	75 %	0 %	25 %	0 %	389859491
128	NC_017953	AAAG	2	8	46964	46971	75 %	0 %	25 %	0 %	389859491
129	NC_017953	AAGA	2	8	47079	47086	75 %	0 %	25 %	0 %	389859491
130	NC_017953	ACTT	2	8	47340	47347	25 %	50 %	0 %	25 %	389859491
131	NC_017953	ATGG	2	8	47966	47973	25 %	25 %	50 %	0 %	389859491
132	NC_017953	AGGA	2	8	47997	48004	50 %	0 %	50 %	0 %	389859491
133	NC_017953	GAAC	2	8	48544	48551	50 %	0 %	25 %	25 %	389859491
134	NC_017953	AAGT	2	8	48579	48586	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017953	AACA	2	8	48788	48795	75 %	0 %	0 %	25 %	389859492
136	NC_017953	CTTT	2	8	48984	48991	0 %	75 %	0 %	25 %	389859492
137	NC_017953	CTTT	2	8	49869	49876	0 %	75 %	0 %	25 %	389859493
138	NC_017953	GTAG	2	8	49887	49894	25 %	25 %	50 %	0 %	389859493
139	NC_017953	GAAG	2	8	51315	51322	50 %	0 %	50 %	0 %	389859494
140	NC_017953	TTCA	2	8	51737	51744	25 %	50 %	0 %	25 %	389859494
141	NC_017953	TCTA	2	8	51954	51961	25 %	50 %	0 %	25 %	389859494
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