MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis E/SW3

Total Repeats: 2863

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017952	GGAT	2	8	57	64	25 %	25 %	50 %	0 %	389858572
2	NC_017952	AGTG	2	8	547	554	25 %	25 %	50 %	0 %	389858572
3	NC_017952	TGGC	2	8	581	588	0 %	25 %	50 %	25 %	389858572
4	NC_017952	AATG	2	8	1066	1073	50 %	25 %	25 %	0 %	389858572
5	NC_017952	CTAT	2	8	1400	1407	25 %	50 %	0 %	25 %	389858572
6	NC_017952	AAGG	2	8	1909	1916	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017952	AGTA	2	8	2089	2096	50 %	25 %	25 %	0 %	389858573
8	NC_017952	ATGA	2	8	2493	2500	50 %	25 %	25 %	0 %	389858574
9	NC_017952	GATA	2	8	2531	2538	50 %	25 %	25 %	0 %	389858574
10	NC_017952	TTTC	2	8	2828	2835	0 %	75 %	0 %	25 %	389858575
11	NC_017952	CATG	2	8	3709	3716	25 %	25 %	25 %	25 %	389858575
12	NC_017952	TTCC	2	8	4014	4021	0 %	50 %	0 %	50 %	389858575
13	NC_017952	TTTA	2	8	4412	4419	25 %	75 %	0 %	0 %	389858576
14	NC_017952	ATCC	2	8	4712	4719	25 %	25 %	0 %	50 %	389858576
15	NC_017952	GACG	2	8	5459	5466	25 %	0 %	50 %	25 %	389858576
16	NC_017952	TTGG	2	8	5562	5569	0 %	50 %	50 %	0 %	389858576
17	NC_017952	TGGA	2	8	5923	5930	25 %	25 %	50 %	0 %	389858577
18	NC_017952	CTTT	2	8	6300	6307	0 %	75 %	0 %	25 %	389858577
19	NC_017952	GGGA	2	8	6815	6822	25 %	0 %	75 %	0 %	389858577
20	NC_017952	GGAG	2	8	6906	6913	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017952	GGTG	2	8	7118	7125	0 %	25 %	75 %	0 %	389858578
22	NC_017952	AAAT	2	8	7184	7191	75 %	25 %	0 %	0 %	389858578
23	NC_017952	TATG	2	8	7555	7562	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017952	ATTT	2	8	7696	7703	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017952	TTTG	2	8	7788	7795	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017952	AAGC	2	8	8421	8428	50 %	0 %	25 %	25 %	389858579
27	NC_017952	ATTG	2	8	8819	8826	25 %	50 %	25 %	0 %	389858580
28	NC_017952	AGCG	2	8	9286	9293	25 %	0 %	50 %	25 %	389858580
29	NC_017952	AAAG	2	8	9307	9314	75 %	0 %	25 %	0 %	389858580
30	NC_017952	CTTT	2	8	9647	9654	0 %	75 %	0 %	25 %	389858580
31	NC_017952	TATT	2	8	9910	9917	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017952	TTCG	2	8	10019	10026	0 %	50 %	25 %	25 %	389858581
33	NC_017952	AATT	2	8	10124	10131	50 %	50 %	0 %	0 %	389858581
34	NC_017952	ATGG	2	8	10183	10190	25 %	25 %	50 %	0 %	389858581
35	NC_017952	CTTT	2	8	10808	10815	0 %	75 %	0 %	25 %	389858582
36	NC_017952	GCAA	2	8	11025	11032	50 %	0 %	25 %	25 %	389858582
37	NC_017952	AGCC	2	8	11255	11262	25 %	0 %	25 %	50 %	389858582
38	NC_017952	GAAA	2	8	11398	11405	75 %	0 %	25 %	0 %	389858582
39	NC_017952	AGAA	2	8	11802	11809	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017952	AATG	2	8	12131	12138	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017952	ATTT	2	8	12908	12915	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017952	GTTT	2	8	13163	13170	0 %	75 %	25 %	0 %	389858583
43	NC_017952	ATGC	2	8	13593	13600	25 %	25 %	25 %	25 %	389858583
44	NC_017952	AAGG	2	8	14028	14035	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017952	TTGT	2	8	14629	14636	0 %	75 %	25 %	0 %	389858584
46	NC_017952	TTCT	2	8	14800	14807	0 %	75 %	0 %	25 %	389858584
47	NC_017952	ATTT	2	8	15006	15013	25 %	75 %	0 %	0 %	389858584
48	NC_017952	TTTC	2	8	15668	15675	0 %	75 %	0 %	25 %	389858585
49	NC_017952	AAAT	2	8	16150	16157	75 %	25 %	0 %	0 %	389858585
50	NC_017952	CAAA	2	8	16662	16669	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_017952	GTAA	2	8	16992	16999	50 %	25 %	25 %	0 %	389858586
52	NC_017952	CTAA	2	8	17185	17192	50 %	25 %	0 %	25 %	389858586
53	NC_017952	AGAA	2	8	17448	17455	75 %	0 %	25 %	0 %	389858586
54	NC_017952	ATTT	2	8	17594	17601	25 %	75 %	0 %	0 %	389858586
55	NC_017952	TGCG	2	8	19116	19123	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_017952	CTTT	2	8	19155	19162	0 %	75 %	0 %	25 %	389858588
57	NC_017952	GAAG	2	8	20100	20107	50 %	0 %	50 %	0 %	389858588
58	NC_017952	TTTG	2	8	20126	20133	0 %	75 %	25 %	0 %	389858588
59	NC_017952	TGTA	2	8	20818	20825	25 %	50 %	25 %	0 %	389858589
60	NC_017952	CGCT	2	8	21858	21865	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_017952	TTAA	2	8	21879	21886	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017952	GTTA	2	8	21916	21923	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017952	GATC	2	8	21971	21978	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_017952	TGGG	2	8	22236	22243	0 %	25 %	75 %	0 %	389858590
65	NC_017952	CATT	2	8	23293	23300	25 %	50 %	0 %	25 %	389858590
66	NC_017952	GCTT	2	8	23636	23643	0 %	50 %	25 %	25 %	389858590
67	NC_017952	GGTT	2	8	23684	23691	0 %	50 %	50 %	0 %	389858590
68	NC_017952	TTCT	2	8	24054	24061	0 %	75 %	0 %	25 %	389858590
69	NC_017952	TAAC	2	8	24156	24163	50 %	25 %	0 %	25 %	389858590
70	NC_017952	CATT	2	8	24279	24286	25 %	50 %	0 %	25 %	389858590
71	NC_017952	GGTA	2	8	24649	24656	25 %	25 %	50 %	0 %	389858590
72	NC_017952	TTGA	2	8	25644	25651	25 %	50 %	25 %	0 %	389858591
73	NC_017952	TTCG	2	8	25789	25796	0 %	50 %	25 %	25 %	389858591
74	NC_017952	TAGG	2	8	25868	25875	25 %	25 %	50 %	0 %	389858591
75	NC_017952	TTCC	2	8	25992	25999	0 %	50 %	0 %	50 %	389858591
76	NC_017952	TAGG	2	8	26106	26113	25 %	25 %	50 %	0 %	389858591
77	NC_017952	TTTC	2	8	26541	26548	0 %	75 %	0 %	25 %	389858591
78	NC_017952	GCTT	2	8	26878	26885	0 %	50 %	25 %	25 %	389858591
79	NC_017952	GGAA	2	8	27461	27468	50 %	0 %	50 %	0 %	389858592
80	NC_017952	TTAA	2	8	27534	27541	50 %	50 %	0 %	0 %	389858592
81	NC_017952	AAAG	2	8	27584	27591	75 %	0 %	25 %	0 %	389858592
82	NC_017952	GGGC	2	8	27864	27871	0 %	0 %	75 %	25 %	389858592
83	NC_017952	GTTT	2	8	28147	28154	0 %	75 %	25 %	0 %	389858593
84	NC_017952	CAGA	2	8	28169	28176	50 %	0 %	25 %	25 %	389858593
85	NC_017952	ATTG	2	8	28528	28535	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017952	CTTT	2	8	30141	30148	0 %	75 %	0 %	25 %	389858595
87	NC_017952	TTTG	2	8	30156	30163	0 %	75 %	25 %	0 %	389858595
88	NC_017952	TTGT	2	8	30191	30198	0 %	75 %	25 %	0 %	389858595
89	NC_017952	TGGC	2	8	30354	30361	0 %	25 %	50 %	25 %	389858595
90	NC_017952	AAAG	2	8	30914	30921	75 %	0 %	25 %	0 %	389858596
91	NC_017952	AAAC	2	8	30984	30991	75 %	0 %	0 %	25 %	389858596
92	NC_017952	GATG	2	8	31127	31134	25 %	25 %	50 %	0 %	389858596
93	NC_017952	GATA	2	8	32236	32243	50 %	25 %	25 %	0 %	389858598
94	NC_017952	TGAT	2	8	34731	34738	25 %	50 %	25 %	0 %	389858601
95	NC_017952	AAGA	3	12	34859	34870	75 %	0 %	25 %	0 %	389858601
96	NC_017952	AAGC	2	8	35079	35086	50 %	0 %	25 %	25 %	389858602
97	NC_017952	GTTC	2	8	35112	35119	0 %	50 %	25 %	25 %	389858602
98	NC_017952	GGCA	2	8	35491	35498	25 %	0 %	50 %	25 %	389858603
99	NC_017952	TCGA	2	8	35748	35755	25 %	25 %	25 %	25 %	389858603
100	NC_017952	TGCT	2	8	35901	35908	0 %	50 %	25 %	25 %	389858603
101	NC_017952	TTGG	2	8	36133	36140	0 %	50 %	50 %	0 %	389858603
102	NC_017952	AGAT	2	8	36853	36860	50 %	25 %	25 %	0 %	389858603
103	NC_017952	CTTT	2	8	37226	37233	0 %	75 %	0 %	25 %	389858604
104	NC_017952	ATGA	2	8	37716	37723	50 %	25 %	25 %	0 %	389858604
105	NC_017952	TAGG	2	8	37875	37882	25 %	25 %	50 %	0 %	389858604
106	NC_017952	CAAT	2	8	38059	38066	50 %	25 %	0 %	25 %	389858604
107	NC_017952	AATG	2	8	38846	38853	50 %	25 %	25 %	0 %	389858604
108	NC_017952	AGAA	2	8	39683	39690	75 %	0 %	25 %	0 %	389858605
109	NC_017952	AAGA	2	8	39735	39742	75 %	0 %	25 %	0 %	389858605
110	NC_017952	ATCC	2	8	39743	39750	25 %	25 %	0 %	50 %	389858605
111	NC_017952	TAAT	2	8	39954	39961	50 %	50 %	0 %	0 %	389858605
112	NC_017952	GTGC	2	8	42042	42049	0 %	25 %	50 %	25 %	389858607
113	NC_017952	AGAA	2	8	42461	42468	75 %	0 %	25 %	0 %	389858607
114	NC_017952	GGAT	2	8	42613	42620	25 %	25 %	50 %	0 %	389858607
115	NC_017952	AAAC	2	8	43821	43828	75 %	0 %	0 %	25 %	389858609
116	NC_017952	CAAT	2	8	44025	44032	50 %	25 %	0 %	25 %	389858609
117	NC_017952	TGTT	2	8	44405	44412	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017952	AATA	2	8	44644	44651	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017952	ATTT	2	8	44782	44789	25 %	75 %	0 %	0 %	389858611
120	NC_017952	GCTC	2	8	45090	45097	0 %	25 %	25 %	50 %	389858611
121	NC_017952	TTCT	2	8	45232	45239	0 %	75 %	0 %	25 %	389858611
122	NC_017952	TTGA	2	8	45832	45839	25 %	50 %	25 %	0 %	389858612
123	NC_017952	TGTT	2	8	46004	46011	0 %	75 %	25 %	0 %	389858612
124	NC_017952	CTAT	2	8	46034	46041	25 %	50 %	0 %	25 %	389858612
125	NC_017952	TGTT	2	8	46063	46070	0 %	75 %	25 %	0 %	389858612
126	NC_017952	CTAT	2	8	46359	46366	25 %	50 %	0 %	25 %	389858612
127	NC_017952	AAGA	2	8	46855	46862	75 %	0 %	25 %	0 %	389858613
128	NC_017952	AAGA	2	8	46912	46919	75 %	0 %	25 %	0 %	389858613
129	NC_017952	AAAG	2	8	46952	46959	75 %	0 %	25 %	0 %	389858613
130	NC_017952	AAGA	2	8	47067	47074	75 %	0 %	25 %	0 %	389858613
131	NC_017952	ACTT	2	8	47328	47335	25 %	50 %	0 %	25 %	389858613
132	NC_017952	ATGG	2	8	47954	47961	25 %	25 %	50 %	0 %	389858613
133	NC_017952	AGGA	2	8	47985	47992	50 %	0 %	50 %	0 %	389858613
134	NC_017952	GAAC	2	8	48532	48539	50 %	0 %	25 %	25 %	389858613
135	NC_017952	AAGT	2	8	48567	48574	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017952	AACA	2	8	48776	48783	75 %	0 %	0 %	25 %	389858614
137	NC_017952	CTTT	2	8	48972	48979	0 %	75 %	0 %	25 %	389858614
138	NC_017952	CTTT	2	8	49857	49864	0 %	75 %	0 %	25 %	389858615
139	NC_017952	GTAG	2	8	49875	49882	25 %	25 %	50 %	0 %	389858615
140	NC_017952	GAAG	2	8	51303	51310	50 %	0 %	50 %	0 %	389858616
141	NC_017952	TTCA	2	8	51725	51732	25 %	50 %	0 %	25 %	389858616
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143	NC_017952	TATT	2	8	52876	52883	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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