MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis 258 chromosome

Total Repeats: 1305

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017945	ACCAC	2	10	1694	1703	40 %	0 %	0 %	60 %	389849361
2	NC_017945	CACGC	2	10	5735	5744	20 %	0 %	20 %	60 %	389849366
3	NC_017945	GTGGA	2	10	5772	5781	20 %	20 %	60 %	0 %	389849366
4	NC_017945	AATCT	2	10	6609	6618	40 %	40 %	0 %	20 %	389849366
5	NC_017945	TTATC	2	10	14083	14092	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_017945	CAGTA	2	10	14630	14639	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_017945	CAGTG	2	10	15501	15510	20 %	20 %	40 %	20 %	389849376
8	NC_017945	AAAAT	2	10	16761	16770	80 %	20 %	0 %	0 %	389849377
9	NC_017945	TAGCG	2	10	18329	18338	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NC_017945	CTTTT	2	10	19236	19245	0 %	80 %	0 %	20 %	389849381
11	NC_017945	GCTCT	2	10	19273	19282	0 %	40 %	20 %	40 %	389849381
12	NC_017945	CACAC	2	10	21463	21472	40 %	0 %	0 %	60 %	389849386
13	NC_017945	TGGAT	2	10	22056	22065	20 %	40 %	40 %	0 %	389849387
14	NC_017945	TGCGT	2	10	25050	25059	0 %	40 %	40 %	20 %	389849390
15	NC_017945	CTGAT	2	10	29081	29090	20 %	40 %	20 %	20 %	389849394
16	NC_017945	GGAGC	2	10	30033	30042	20 %	0 %	60 %	20 %	389849395
17	NC_017945	TTGCT	2	10	31121	31130	0 %	60 %	20 %	20 %	389849396
18	NC_017945	TGAGG	2	10	37954	37963	20 %	20 %	60 %	0 %	389849400
19	NC_017945	CACAT	2	10	40138	40147	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
20	NC_017945	TGCGG	2	10	41066	41075	0 %	20 %	60 %	20 %	389849404
21	NC_017945	GCCTC	2	10	47112	47121	0 %	20 %	20 %	60 %	389849414
22	NC_017945	GAAGG	2	10	47126	47135	40 %	0 %	60 %	0 %	389849414
23	NC_017945	CAGTG	2	10	49055	49064	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_017945	TGAGA	2	10	49397	49406	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017945	AGTGA	2	10	49447	49456	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017945	TTGGA	2	10	52481	52490	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017945	TTGAT	2	10	52516	52525	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017945	TGCAC	2	10	52610	52619	20 %	20 %	20 %	40 %	389849420
29	NC_017945	CTGGC	2	10	52869	52878	0 %	20 %	40 %	40 %	389849421
30	NC_017945	GCAGC	2	10	53368	53377	20 %	0 %	40 %	40 %	389849421
31	NC_017945	GACTG	2	10	53384	53393	20 %	20 %	40 %	20 %	389849421
32	NC_017945	AAGGC	2	10	55626	55635	40 %	0 %	40 %	20 %	389849422
33	NC_017945	ATGGC	2	10	59151	59160	20 %	20 %	40 %	20 %	389849427
34	NC_017945	ATGTG	2	10	63320	63329	20 %	40 %	40 %	0 %	389849431
35	NC_017945	GCTGG	2	10	65480	65489	0 %	20 %	60 %	20 %	389849434
36	NC_017945	AGGGA	2	10	68091	68100	40 %	0 %	60 %	0 %	389849437
37	NC_017945	ATTTG	2	10	68666	68675	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017945	AAGAT	2	10	69898	69907	60 %	20 %	20 %	0 %	389849438
39	NC_017945	GGAGC	2	10	70005	70014	20 %	0 %	60 %	20 %	389849438
40	NC_017945	GGTCT	2	10	71719	71728	0 %	40 %	40 %	20 %	389849440
41	NC_017945	AGGGG	2	10	72273	72282	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017945	CATGT	2	10	72296	72305	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_017945	CAGCG	2	10	73174	73183	20 %	0 %	40 %	40 %	389849441
44	NC_017945	ACTGA	2	10	73351	73360	40 %	20 %	20 %	20 %	389849441
45	NC_017945	CAGGC	2	10	73580	73589	20 %	0 %	40 %	40 %	389849441
46	NC_017945	ATGGC	2	10	74425	74434	20 %	20 %	40 %	20 %	389849442
47	NC_017945	AGGCA	2	10	75749	75758	40 %	0 %	40 %	20 %	389849444
48	NC_017945	TAATT	2	10	76995	77004	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017945	GCTTT	2	10	81591	81600	0 %	60 %	20 %	20 %	389849450
50	NC_017945	TGACC	2	10	81847	81856	20 %	20 %	20 %	40 %	389849450
51	NC_017945	CGTTA	2	10	82589	82598	20 %	40 %	20 %	20 %	389849451
52	NC_017945	TGCTG	2	10	83223	83232	0 %	40 %	40 %	20 %	389849451
53	NC_017945	TGGCC	2	10	85214	85223	0 %	20 %	40 %	40 %	389849452
54	NC_017945	GCGAC	2	10	86018	86027	20 %	0 %	40 %	40 %	389849452
55	NC_017945	TGGGA	2	10	89433	89442	20 %	20 %	60 %	0 %	389849458
56	NC_017945	GATCG	2	10	90533	90542	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
57	NC_017945	CAAAA	2	10	91266	91275	80 %	0 %	0 %	20 %	389849460
58	NC_017945	AACAA	2	10	94107	94116	80 %	0 %	0 %	20 %	389849462
59	NC_017945	TGCAA	2	10	97114	97123	40 %	20 %	20 %	20 %	389849465
60	NC_017945	TGCAG	2	10	97334	97343	20 %	20 %	40 %	20 %	389849465
61	NC_017945	AGGTC	2	10	99770	99779	20 %	20 %	40 %	20 %	389849468
62	NC_017945	ACCAA	2	10	101629	101638	60 %	0 %	0 %	40 %	389849468
63	NC_017945	TCATC	2	10	102892	102901	20 %	40 %	0 %	40 %	389849469
64	NC_017945	TGCAC	2	10	104708	104717	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
65	NC_017945	CCTGG	2	10	104924	104933	0 %	20 %	40 %	40 %	389849470
66	NC_017945	CGGTG	2	10	105132	105141	0 %	20 %	60 %	20 %	389849470
67	NC_017945	CGGCG	2	10	107751	107760	0 %	0 %	60 %	40 %	389849473
68	NC_017945	CGCGG	2	10	107811	107820	0 %	0 %	60 %	40 %	389849474
69	NC_017945	CAGCG	2	10	108347	108356	20 %	0 %	40 %	40 %	389849475
70	NC_017945	GGATC	2	10	119166	119175	20 %	20 %	40 %	20 %	389849485
71	NC_017945	TGTTT	2	10	121626	121635	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017945	CGGGA	2	10	126270	126279	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
73	NC_017945	GACTG	2	10	128527	128536	20 %	20 %	40 %	20 %	389849491
74	NC_017945	GGGGC	2	10	134295	134304	0 %	0 %	80 %	20 %	389849495
75	NC_017945	AGACG	2	10	136100	136109	40 %	0 %	40 %	20 %	389849497
76	NC_017945	ACGGT	2	10	137427	137436	20 %	20 %	40 %	20 %	389849499
77	NC_017945	CGATC	2	10	137700	137709	20 %	20 %	20 %	40 %	389849499
78	NC_017945	TGGCC	2	10	137907	137916	0 %	20 %	40 %	40 %	389849499
79	NC_017945	TGGTG	2	10	138285	138294	0 %	40 %	60 %	0 %	389849499
80	NC_017945	GGAGT	2	10	138757	138766	20 %	20 %	60 %	0 %	389849499
81	NC_017945	ATTGC	2	10	142691	142700	20 %	40 %	20 %	20 %	389849502
82	NC_017945	AAAAC	2	10	145517	145526	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_017945	TCACT	2	10	146558	146567	20 %	40 %	0 %	40 %	389849507
84	NC_017945	ATTTC	2	10	147175	147184	20 %	60 %	0 %	20 %	389849507
85	NC_017945	AATGG	2	10	150875	150884	40 %	20 %	40 %	0 %	389849510
86	NC_017945	GTGAG	2	10	151857	151866	20 %	20 %	60 %	0 %	389849512
87	NC_017945	CTGAA	2	10	152655	152664	40 %	20 %	20 %	20 %	389849512
88	NC_017945	CCAGC	2	10	153947	153956	20 %	0 %	20 %	60 %	389849513
89	NC_017945	TTGCC	2	10	154457	154466	0 %	40 %	20 %	40 %	389849514
90	NC_017945	GTACC	2	10	156417	156426	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
91	NC_017945	TACGC	2	10	156974	156983	20 %	20 %	20 %	40 %	389849516
92	NC_017945	GGTTG	2	10	161737	161746	0 %	40 %	60 %	0 %	389849522
93	NC_017945	CCTTG	2	10	162113	162122	0 %	40 %	20 %	40 %	389849523
94	NC_017945	GCATA	2	10	163836	163845	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
95	NC_017945	TGTGC	2	10	165059	165068	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
96	NC_017945	CGGTG	2	10	166080	166089	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
97	NC_017945	CATGG	2	10	168214	168223	20 %	20 %	40 %	20 %	389849528
98	NC_017945	CAGAT	2	10	168570	168579	40 %	20 %	20 %	20 %	389849528
99	NC_017945	GGATG	2	10	169468	169477	20 %	20 %	60 %	0 %	389849528
100	NC_017945	TAACA	2	10	170472	170481	60 %	20 %	0 %	20 %	389849529
101	NC_017945	GGGAC	2	10	172094	172103	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
102	NC_017945	CACTT	2	10	172275	172284	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
103	NC_017945	AAACT	2	10	173151	173160	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_017945	ACCGG	2	10	173546	173555	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
105	NC_017945	CCTAC	2	10	177988	177997	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
106	NC_017945	GAAAC	2	10	179943	179952	60 %	0 %	20 %	20 %	389849533
107	NC_017945	GGAGA	2	10	180028	180037	40 %	0 %	60 %	0 %	389849533
108	NC_017945	TTAAG	2	10	183701	183710	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017945	TGACC	2	10	184619	184628	20 %	20 %	20 %	40 %	389849536
110	NC_017945	TAATA	2	10	185425	185434	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017945	TTGCA	2	10	185903	185912	20 %	40 %	20 %	20 %	389849537
112	NC_017945	GTTTG	2	10	187813	187822	0 %	60 %	40 %	0 %	389849538
113	NC_017945	CGGAT	2	10	188752	188761	20 %	20 %	40 %	20 %	389849539
114	NC_017945	AGCGC	2	10	189910	189919	20 %	0 %	40 %	40 %	389849540
115	NC_017945	GCAGT	2	10	191397	191406	20 %	20 %	40 %	20 %	389849541
116	NC_017945	CAATG	2	10	191668	191677	40 %	20 %	20 %	20 %	389849541
117	NC_017945	TAACG	2	10	192620	192629	40 %	20 %	20 %	20 %	389849542
118	NC_017945	AAGCC	2	10	193947	193956	40 %	0 %	20 %	40 %	389849543
119	NC_017945	GGCCC	2	10	196020	196029	0 %	0 %	40 %	60 %	389849546
120	NC_017945	GAATT	2	10	199585	199594	40 %	40 %	20 %	0 %	389849551
121	NC_017945	CAAGG	2	10	200474	200483	40 %	0 %	40 %	20 %	389849551
122	NC_017945	GATGG	2	10	202914	202923	20 %	20 %	60 %	0 %	389849552
123	NC_017945	TGGCG	2	10	203648	203657	0 %	20 %	60 %	20 %	389849553
124	NC_017945	TGCCG	2	10	205232	205241	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
125	NC_017945	CAGGC	2	10	206768	206777	20 %	0 %	40 %	40 %	389849555
126	NC_017945	TTGTA	2	10	207178	207187	20 %	60 %	20 %	0 %	389849556
127	NC_017945	GCGAC	2	10	211707	211716	20 %	0 %	40 %	40 %	389849561
128	NC_017945	AGATC	2	10	211732	211741	40 %	20 %	20 %	20 %	389849561
129	NC_017945	CAAGG	2	10	212646	212655	40 %	0 %	40 %	20 %	389849562
130	NC_017945	AGAAA	2	10	213375	213384	80 %	0 %	20 %	0 %	389849563
131	NC_017945	AGTGC	2	10	218408	218417	20 %	20 %	40 %	20 %	389849569
132	NC_017945	CGGGG	2	10	219410	219419	0 %	0 %	80 %	20 %	389849570
133	NC_017945	GAAAA	2	10	219549	219558	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017945	CGAGA	2	10	220186	220195	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
135	NC_017945	TGCGC	2	10	221847	221856	0 %	20 %	40 %	40 %	389849572
136	NC_017945	CATTG	2	10	223696	223705	20 %	40 %	20 %	20 %	389849574
137	NC_017945	CAAAA	2	10	223811	223820	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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266	NC_017945	CGCAA	2	10	448701	448710	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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