MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Cronobacter sakazakii ES15 chromosome

Total Repeats: 3198

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017933	GCGCT	2	10	5393	5402	0 %	20 %	40 %	40 %	389839005
2	NC_017933	CGACC	2	10	14004	14013	20 %	0 %	20 %	60 %	389839013
3	NC_017933	ACGCT	2	10	21954	21963	20 %	20 %	20 %	40 %	389839016
4	NC_017933	CTGGC	2	10	23708	23717	0 %	20 %	40 %	40 %	389839018
5	NC_017933	CAGCG	2	10	25425	25434	20 %	0 %	40 %	40 %	389839020
6	NC_017933	CGCGG	2	10	28370	28379	0 %	0 %	60 %	40 %	389839021
7	NC_017933	ACACG	2	10	29995	30004	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
8	NC_017933	GCGTC	2	10	31210	31219	0 %	20 %	40 %	40 %	389839024
9	NC_017933	TTGAT	2	10	31527	31536	20 %	60 %	20 %	0 %	389839024
10	NC_017933	TGGCC	2	10	33994	34003	0 %	20 %	40 %	40 %	389839026
11	NC_017933	ACTTC	2	10	36567	36576	20 %	40 %	0 %	40 %	389839027
12	NC_017933	GCGCG	2	10	41861	41870	0 %	0 %	60 %	40 %	389839031
13	NC_017933	ACCGT	2	10	43398	43407	20 %	20 %	20 %	40 %	389839032
14	NC_017933	TTTCA	2	10	43967	43976	20 %	60 %	0 %	20 %	389839033
15	NC_017933	CAGGC	2	10	44221	44230	20 %	0 %	40 %	40 %	389839033
16	NC_017933	GCGTG	2	10	44842	44851	0 %	20 %	60 %	20 %	389839033
17	NC_017933	TGGCG	2	10	49344	49353	0 %	20 %	60 %	20 %	389839037
18	NC_017933	CGCTG	2	10	52649	52658	0 %	20 %	40 %	40 %	389839041
19	NC_017933	TGCGC	2	10	54476	54485	0 %	20 %	40 %	40 %	389839044
20	NC_017933	TGCGC	2	10	54527	54536	0 %	20 %	40 %	40 %	389839044
21	NC_017933	TGCGC	2	10	54578	54587	0 %	20 %	40 %	40 %	389839044
22	NC_017933	TGCGC	2	10	54629	54638	0 %	20 %	40 %	40 %	389839044
23	NC_017933	TGCGC	2	10	54680	54689	0 %	20 %	40 %	40 %	389839044
24	NC_017933	AGCGC	2	10	54751	54760	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
25	NC_017933	GTGAT	2	10	56342	56351	20 %	40 %	40 %	0 %	389839045
26	NC_017933	ATTAC	2	10	60160	60169	40 %	40 %	0 %	20 %	389839049
27	NC_017933	GGGTA	2	10	63864	63873	20 %	20 %	60 %	0 %	389839051
28	NC_017933	TGACA	2	10	64245	64254	40 %	20 %	20 %	20 %	389839051
29	NC_017933	CCGCG	2	10	66508	66517	0 %	0 %	40 %	60 %	389839054
30	NC_017933	TGGCG	2	10	66986	66995	0 %	20 %	60 %	20 %	389839054
31	NC_017933	GCGAG	2	10	67483	67492	20 %	0 %	60 %	20 %	389839054
32	NC_017933	GCCAG	2	10	68807	68816	20 %	0 %	40 %	40 %	389839055
33	NC_017933	TGCGG	2	10	68849	68858	0 %	20 %	60 %	20 %	389839055
34	NC_017933	GTCTG	2	10	73570	73579	0 %	40 %	40 %	20 %	389839059
35	NC_017933	CGCTG	2	10	73952	73961	0 %	20 %	40 %	40 %	389839059
36	NC_017933	AGCGC	2	10	74086	74095	20 %	0 %	40 %	40 %	389839060
37	NC_017933	CCCAG	2	10	74482	74491	20 %	0 %	20 %	60 %	389839060
38	NC_017933	CCGCG	2	10	79563	79572	0 %	0 %	40 %	60 %	389839066
39	NC_017933	CAGGG	2	10	79820	79829	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
40	NC_017933	CAGGT	2	10	82803	82812	20 %	20 %	40 %	20 %	389839072
41	NC_017933	AGAGC	2	10	84558	84567	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
42	NC_017933	GCAAG	2	10	85936	85945	40 %	0 %	40 %	20 %	389839074
43	NC_017933	AAGCG	2	10	86463	86472	40 %	0 %	40 %	20 %	389839075
44	NC_017933	AGCGG	2	10	88237	88246	20 %	0 %	60 %	20 %	389839076
45	NC_017933	CATTC	2	10	89830	89839	20 %	40 %	0 %	40 %	389839077
46	NC_017933	CAAAG	2	10	89853	89862	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_017933	CCGCG	2	10	90799	90808	0 %	0 %	40 %	60 %	389839078
48	NC_017933	GGTGG	2	10	91645	91654	0 %	20 %	80 %	0 %	389839079
49	NC_017933	CAGCG	2	10	92646	92655	20 %	0 %	40 %	40 %	389839080
50	NC_017933	CCATG	2	10	94068	94077	20 %	20 %	20 %	40 %	389839081
51	NC_017933	CGGTG	2	10	95142	95151	0 %	20 %	60 %	20 %	389839082
52	NC_017933	CATCA	2	10	95353	95362	40 %	20 %	0 %	40 %	389839082
53	NC_017933	AAAGC	2	10	97072	97081	60 %	0 %	20 %	20 %	389839084
54	NC_017933	TCTCT	2	10	97446	97455	0 %	60 %	0 %	40 %	389839084
55	NC_017933	TGAAA	2	10	97836	97845	60 %	20 %	20 %	0 %	389839085
56	NC_017933	TATGC	2	10	99564	99573	20 %	40 %	20 %	20 %	389839086
57	NC_017933	CGCGG	2	10	100382	100391	0 %	0 %	60 %	40 %	389839087
58	NC_017933	GACCA	2	10	101371	101380	40 %	0 %	20 %	40 %	389839088
59	NC_017933	CGAGC	2	10	101551	101560	20 %	0 %	40 %	40 %	389839088
60	NC_017933	GCGAT	2	10	101708	101717	20 %	20 %	40 %	20 %	389839088
61	NC_017933	GCCTG	2	10	102632	102641	0 %	20 %	40 %	40 %	389839089
62	NC_017933	AACAA	2	10	105021	105030	80 %	0 %	0 %	20 %	389839092
63	NC_017933	GCGCG	2	10	107221	107230	0 %	0 %	60 %	40 %	389839094
64	NC_017933	CGGCG	2	10	107795	107804	0 %	0 %	60 %	40 %	389839095
65	NC_017933	AGCGC	2	10	108323	108332	20 %	0 %	40 %	40 %	389839096
66	NC_017933	TTAAC	2	10	110407	110416	40 %	40 %	0 %	20 %	389839098
67	NC_017933	CTGGC	2	10	111612	111621	0 %	20 %	40 %	40 %	389839099
68	NC_017933	CCGTG	2	10	112278	112287	0 %	20 %	40 %	40 %	389839100
69	NC_017933	TTACT	2	10	113184	113193	20 %	60 %	0 %	20 %	389839101
70	NC_017933	GCCGA	2	10	113873	113882	20 %	0 %	40 %	40 %	389839101
71	NC_017933	CAGAG	2	10	119975	119984	40 %	0 %	40 %	20 %	389839108
72	NC_017933	AGCGC	2	10	122032	122041	20 %	0 %	40 %	40 %	389839111
73	NC_017933	CGCGC	2	10	122330	122339	0 %	0 %	40 %	60 %	389839111
74	NC_017933	GCTCG	2	10	125594	125603	0 %	20 %	40 %	40 %	389839114
75	NC_017933	CAGGC	2	10	126920	126929	20 %	0 %	40 %	40 %	389839116
76	NC_017933	CGCAA	2	10	127605	127614	40 %	0 %	20 %	40 %	389839116
77	NC_017933	CGCGG	2	10	128762	128771	0 %	0 %	60 %	40 %	389839116
78	NC_017933	TTGCG	2	10	130809	130818	0 %	40 %	40 %	20 %	389839119
79	NC_017933	TGGCG	2	10	131946	131955	0 %	20 %	60 %	20 %	389839120
80	NC_017933	TTGCG	2	10	132978	132987	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
81	NC_017933	GCCTG	2	10	134330	134339	0 %	20 %	40 %	40 %	389839123
82	NC_017933	GCCGC	2	10	136450	136459	0 %	0 %	40 %	60 %	389839125
83	NC_017933	CAGGG	2	10	137489	137498	20 %	0 %	60 %	20 %	389839125
84	NC_017933	TGTGG	2	10	137616	137625	0 %	40 %	60 %	0 %	389839125
85	NC_017933	GGTCG	2	10	141561	141570	0 %	20 %	60 %	20 %	389839127
86	NC_017933	AATGG	2	10	142877	142886	40 %	20 %	40 %	0 %	389839128
87	NC_017933	CCAGC	2	10	145596	145605	20 %	0 %	20 %	60 %	389839130
88	NC_017933	GCAAT	2	10	148727	148736	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_017933	CCACG	2	10	149695	149704	20 %	0 %	20 %	60 %	389839133
90	NC_017933	CCAGG	2	10	150989	150998	20 %	0 %	40 %	40 %	389839134
91	NC_017933	AGCGA	2	10	152230	152239	40 %	0 %	40 %	20 %	389839135
92	NC_017933	ACGCG	2	10	156967	156976	20 %	0 %	40 %	40 %	389839140
93	NC_017933	TTATT	2	10	157955	157964	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017933	CAGGC	2	10	159529	159538	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
95	NC_017933	GCGCG	2	10	159667	159676	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
96	NC_017933	CCGGC	2	10	160222	160231	0 %	0 %	40 %	60 %	389839143
97	NC_017933	GCGCG	2	10	161147	161156	0 %	0 %	60 %	40 %	389839144
98	NC_017933	CGAGC	2	10	161732	161741	20 %	0 %	40 %	40 %	389839145
99	NC_017933	CACGC	2	10	163714	163723	20 %	0 %	20 %	60 %	389839146
100	NC_017933	CATAA	2	10	164738	164747	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_017933	CGCGG	2	10	165793	165802	0 %	0 %	60 %	40 %	389839148
102	NC_017933	CGCGC	2	10	166540	166549	0 %	0 %	40 %	60 %	389839149
103	NC_017933	ACCAG	2	10	167712	167721	40 %	0 %	20 %	40 %	389839151
104	NC_017933	TCGCC	2	10	167771	167780	0 %	20 %	20 %	60 %	389839151
105	NC_017933	ATGGA	2	10	168277	168286	40 %	20 %	40 %	0 %	389839151
106	NC_017933	CGACG	2	10	168677	168686	20 %	0 %	40 %	40 %	389839151
107	NC_017933	TGGCG	2	10	172518	172527	0 %	20 %	60 %	20 %	389839155
108	NC_017933	AATGA	2	10	172723	172732	60 %	20 %	20 %	0 %	389839155
109	NC_017933	GCCGC	2	10	172983	172992	0 %	0 %	40 %	60 %	389839155
110	NC_017933	CGCTG	2	10	174672	174681	0 %	20 %	40 %	40 %	389839157
111	NC_017933	AGAAC	2	10	174733	174742	60 %	0 %	20 %	20 %	389839157
112	NC_017933	GCACG	2	10	175207	175216	20 %	0 %	40 %	40 %	389839157
113	NC_017933	GATGT	2	10	181090	181099	20 %	40 %	40 %	0 %	389839162
114	NC_017933	TGCGC	2	10	183897	183906	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
115	NC_017933	TGCGC	2	10	183981	183990	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
116	NC_017933	GCGCC	2	10	184369	184378	0 %	0 %	40 %	60 %	389839165
117	NC_017933	GGCCG	2	10	184868	184877	0 %	0 %	60 %	40 %	389839165
118	NC_017933	GCCGC	2	10	185175	185184	0 %	0 %	40 %	60 %	389839166
119	NC_017933	TCACA	2	10	193740	193749	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
120	NC_017933	GTCGC	2	10	196142	196151	0 %	20 %	40 %	40 %	389839172
121	NC_017933	AGCGC	2	10	196926	196935	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
122	NC_017933	AGCCC	2	10	197510	197519	20 %	0 %	20 %	60 %	389839173
123	NC_017933	GCCGC	2	10	197926	197935	0 %	0 %	40 %	60 %	389839173
124	NC_017933	GGTCG	2	10	198186	198195	0 %	20 %	60 %	20 %	389839173
125	NC_017933	CCGCG	2	10	199143	199152	0 %	0 %	40 %	60 %	389839174
126	NC_017933	GCGAG	2	10	199365	199374	20 %	0 %	60 %	20 %	389839174
127	NC_017933	CGGCG	2	10	199832	199841	0 %	0 %	60 %	40 %	389839175
128	NC_017933	CGGCG	2	10	201419	201428	0 %	0 %	60 %	40 %	389839176
129	NC_017933	TTGCC	2	10	201511	201520	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
130	NC_017933	TGCGC	2	10	202048	202057	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
131	NC_017933	TGCGC	2	10	203392	203401	0 %	20 %	40 %	40 %	389839180
132	NC_017933	TTATG	2	10	204721	204730	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017933	TTGCT	2	10	206988	206997	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
134	NC_017933	ACGGC	2	10	207440	207449	20 %	0 %	40 %	40 %	389839184
135	NC_017933	ACGCA	2	10	214449	214458	40 %	0 %	20 %	40 %	389839192
136	NC_017933	GCTGC	2	10	214926	214935	0 %	20 %	40 %	40 %	389839192
137	NC_017933	GGCAG	2	10	216234	216243	20 %	0 %	60 %	20 %	389839193
138	NC_017933	CCGGC	2	10	216878	216887	0 %	0 %	40 %	60 %	389839193
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140	NC_017933	GCAGG	2	10	217820	217829	20 %	0 %	60 %	20 %	389839194
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144	NC_017933	GCTGC	2	10	223716	223725	0 %	20 %	40 %	40 %	389839200
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146	NC_017933	TCGGC	2	10	225549	225558	0 %	20 %	40 %	40 %	389839202
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148	NC_017933	AAGCG	2	10	227173	227182	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
149	NC_017933	AAGCG	2	10	227224	227233	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
150	NC_017933	AAGCG	2	10	227275	227284	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
151	NC_017933	CGCGT	2	10	227801	227810	0 %	20 %	40 %	40 %	389839204
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167	NC_017933	TGCGC	2	10	249252	249261	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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258	NC_017933	CGATC	2	10	376306	376315	20 %	20 %	20 %	40 %	389839355
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260	NC_017933	TTAGC	2	10	380144	380153	20 %	40 %	20 %	20 %	389839361
261	NC_017933	AGCTG	2	10	381768	381777	20 %	20 %	40 %	20 %	389839362
262	NC_017933	TTCTA	2	10	383014	383023	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
263	NC_017933	GCGCT	2	10	383288	383297	0 %	20 %	40 %	40 %	389839364
264	NC_017933	GAAAA	2	10	385151	385160	80 %	0 %	20 %	0 %	389839366
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266	NC_017933	GCAAC	2	10	386496	386505	40 %	0 %	20 %	40 %	389839368
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382	NC_017933	GTCGC	2	10	542917	542926	0 %	20 %	40 %	40 %	389839510
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