MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis 31 chromosome

Total Repeats: 31120

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017730	AAG	2	6	38	43	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386739354
2	NC_017730	GCT	2	6	54	59	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386739354
3	NC_017730	ACT	2	6	202	207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386739354
4	NC_017730	TGC	2	6	321	326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386739354
5	NC_017730	CAA	2	6	400	405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386739354
6	NC_017730	TTC	3	9	456	464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386739354
7	NC_017730	TCA	2	6	513	518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386739354
8	NC_017730	TGC	2	6	627	632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386739354
9	NC_017730	CTG	2	6	698	703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386739354
10	NC_017730	CGC	2	6	722	727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386739354
11	NC_017730	AGC	2	6	737	742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386739354
12	NC_017730	CAG	2	6	833	838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386739354
13	NC_017730	TCC	2	6	1094	1099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386739354
14	NC_017730	AAG	2	6	1106	1111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386739354
15	NC_017730	GAA	2	6	1120	1125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386739354
16	NC_017730	ACT	2	6	1204	1209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386739354
17	NC_017730	TGA	2	6	1295	1300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386739354
18	NC_017730	GGC	2	6	1305	1310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386739354
19	NC_017730	TTG	2	6	1322	1327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386739354
20	NC_017730	ATG	2	6	1489	1494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386739354
21	NC_017730	CGA	2	6	1523	1528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386739354
22	NC_017730	CTG	2	6	1544	1549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386739354
23	NC_017730	GAA	2	6	1746	1751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386739354
24	NC_017730	ATG	2	6	1760	1765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386739354
25	NC_017730	GCT	2	6	1773	1778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386739354
26	NC_017730	GCA	2	6	1782	1787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386739354
27	NC_017730	TTC	2	6	1797	1802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386739354
28	NC_017730	AGT	2	6	1905	1910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017730	TTA	2	6	2195	2200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017730	AAC	2	6	2250	2255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017730	TGC	2	6	2309	2314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017730	GAG	2	6	2379	2384	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017730	TAC	2	6	2496	2501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386739355
34	NC_017730	TCA	2	6	2511	2516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386739355
35	NC_017730	GAT	2	6	2522	2527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386739355
36	NC_017730	GCT	2	6	2626	2631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386739355
37	NC_017730	CAT	2	6	2638	2643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386739355
38	NC_017730	GCA	3	9	2828	2836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386739355
39	NC_017730	GCT	2	6	3169	3174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386739355
40	NC_017730	CGG	2	6	3306	3311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386739355
41	NC_017730	AGA	2	6	3334	3339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386739355
42	NC_017730	GAG	2	6	3491	3496	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386739355
43	NC_017730	CTG	2	6	3592	3597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017730	TTG	2	6	3764	3769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386739356
45	NC_017730	CTG	2	6	3866	3871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386739356
46	NC_017730	TTG	2	6	4064	4069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386739356
47	NC_017730	GAT	2	6	4183	4188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386739356
48	NC_017730	GAG	2	6	4387	4392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386739356
49	NC_017730	TCA	2	6	4396	4401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386739356
50	NC_017730	GAC	2	6	4507	4512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386739356
51	NC_017730	CGA	2	6	4647	4652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386739356
52	NC_017730	GCC	2	6	4732	4737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386739356
53	NC_017730	CTG	2	6	4866	4871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386739357
54	NC_017730	AGA	2	6	4882	4887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386739357
55	NC_017730	GCG	2	6	4930	4935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386739357
56	NC_017730	TGG	2	6	5175	5180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386739357
57	NC_017730	AGC	2	6	5191	5196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386739357
58	NC_017730	ATG	2	6	5276	5281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386739357
59	NC_017730	TAA	2	6	5542	5547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017730	TGG	2	6	5867	5872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386739358
61	NC_017730	TGG	2	6	5903	5908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386739358
62	NC_017730	ACC	2	6	6057	6062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386739358
63	NC_017730	ACC	3	9	6096	6104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386739358
64	NC_017730	CAT	2	6	6116	6121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386739358
65	NC_017730	CGT	2	6	6126	6131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386739358
66	NC_017730	TGA	2	6	6224	6229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386739358
67	NC_017730	CTG	2	6	6298	6303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386739358
68	NC_017730	GAA	2	6	6308	6313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386739358
69	NC_017730	GAA	2	6	6320	6325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386739358
70	NC_017730	TTA	2	6	6335	6340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386739358
71	NC_017730	TGA	2	6	6428	6433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386739358
72	NC_017730	GAA	2	6	6531	6536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386739358
73	NC_017730	TGA	2	6	6562	6567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386739358
74	NC_017730	TCT	2	6	6816	6821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386739358
75	NC_017730	GGC	2	6	6836	6841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386739358
76	NC_017730	TGG	2	6	6887	6892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386739358
77	NC_017730	ATT	2	6	7095	7100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386739358
78	NC_017730	ATG	2	6	7123	7128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386739358
79	NC_017730	CAA	2	6	7139	7144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386739358
80	NC_017730	GCT	3	9	7208	7216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386739358
81	NC_017730	TTG	2	6	7221	7226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386739358
82	NC_017730	CCG	2	6	7278	7283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386739358
83	NC_017730	GAA	2	6	7356	7361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386739358
84	NC_017730	CAA	2	6	7385	7390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386739358
85	NC_017730	GAT	2	6	7392	7397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386739358
86	NC_017730	ATG	2	6	7498	7503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386739358
87	NC_017730	TGA	2	6	7514	7519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386739358
88	NC_017730	TCG	2	6	7556	7561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386739358
89	NC_017730	TAG	3	9	7671	7679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017730	CAG	2	6	7748	7753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386739359
91	NC_017730	TTC	2	6	7896	7901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386739359
92	NC_017730	GAG	2	6	7944	7949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386739359
93	NC_017730	AGC	2	6	7956	7961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386739359
94	NC_017730	TGC	2	6	7992	7997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386739359
95	NC_017730	GAG	2	6	8103	8108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386739359
96	NC_017730	ATG	2	6	8148	8153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017730	GTT	2	6	8206	8211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017730	ACG	2	6	8238	8243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_017730	TTC	2	6	8263	8268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017730	ATT	2	6	8301	8306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386739360
101	NC_017730	TTA	2	6	8408	8413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017730	CTG	2	6	8544	8549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386739361
103	NC_017730	TGT	2	6	8589	8594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386739361
104	NC_017730	CTG	2	6	8597	8602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386739361
105	NC_017730	TGC	2	6	8648	8653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386739361
106	NC_017730	GTC	2	6	8658	8663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386739361
107	NC_017730	GCG	2	6	8720	8725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386739362
108	NC_017730	TGA	2	6	8806	8811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386739362
109	NC_017730	GCT	2	6	8823	8828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386739362
110	NC_017730	CGA	2	6	9083	9088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017730	GCG	2	6	9097	9102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017730	GAG	2	6	9138	9143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017730	CCG	2	6	9230	9235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_017730	ACG	2	6	9436	9441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017730	CGC	2	6	9446	9451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_017730	TTC	2	6	9568	9573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_017730	TGA	2	6	9595	9600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017730	TCT	2	6	9676	9681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_017730	GAA	3	9	9852	9860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017730	ACA	2	6	9913	9918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017730	TGC	2	6	10153	10158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017730	TTA	2	6	10160	10165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017730	TCG	2	6	10193	10198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_017730	GAA	2	6	10215	10220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017730	CGA	2	6	10274	10279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017730	AGA	2	6	10417	10422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017730	CGT	2	6	10551	10556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_017730	ATT	2	6	10563	10568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017730	GAA	2	6	10590	10595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017730	GTG	2	6	10617	10622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017730	CGT	2	6	10683	10688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017730	CTT	2	6	10742	10747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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260	NC_017730	TCC	2	6	18686	18691	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386739371
261	NC_017730	GTG	2	6	18745	18750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386739371
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299	NC_017730	TGT	2	6	21849	21854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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301	NC_017730	GGT	2	6	22028	22033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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315	NC_017730	ACC	2	6	22706	22711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
316	NC_017730	CCA	2	6	22713	22718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
317	NC_017730	AGG	2	6	22750	22755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
318	NC_017730	AGC	2	6	22757	22762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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374	NC_017730	CAT	2	6	27256	27261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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500	NC_017730	AGA	2	6	35798	35803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386739388

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