MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis G/11074 chromosome

Total Repeats: 22969

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017440	TGC	2	6	23120	23125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385245916
502	NC_017440	ATT	2	6	23172	23177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385245916
503	NC_017440	AAT	2	6	23214	23219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385245916
504	NC_017440	TTG	2	6	23277	23282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385245916
505	NC_017440	TTCT	2	8	23464	23471	0 %	75 %	0 %	25 %	385245916
506	NC_017440	TGC	2	6	23528	23533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385245916
507	NC_017440	TAAC	2	8	23566	23573	50 %	25 %	0 %	25 %	385245916
508	NC_017440	GCA	2	6	23634	23639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385245916
509	NC_017440	CATT	2	8	23689	23696	25 %	50 %	0 %	25 %	385245916
510	NC_017440	AGA	2	6	23708	23713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385245916
511	NC_017440	GAG	2	6	23731	23736	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385245916
512	NC_017440	TTC	2	6	23794	23799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385245916
513	NC_017440	GGAAA	2	10	23807	23816	60 %	0 %	40 %	0 %	385245916
514	NC_017440	GA	3	6	23830	23835	50 %	0 %	50 %	0 %	385245916
515	NC_017440	GA	3	6	23922	23927	50 %	0 %	50 %	0 %	385245916
516	NC_017440	GAA	2	6	24053	24058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385245916
517	NC_017440	GGTA	2	8	24059	24066	25 %	25 %	50 %	0 %	385245916
518	NC_017440	GTT	2	6	24147	24152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385245916
519	NC_017440	CTT	2	6	24241	24246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385245916
520	NC_017440	AG	3	6	24303	24308	50 %	0 %	50 %	0 %	385245916
521	NC_017440	TAA	2	6	24314	24319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385245916
522	NC_017440	GAA	2	6	24334	24339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385245916
523	NC_017440	AAG	2	6	24475	24480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385245916
524	NC_017440	A	7	7	24560	24566	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_017440	TTA	2	6	24573	24578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_017440	T	9	9	24588	24596	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_017440	T	6	6	24620	24625	0 %	100 %	0 %	0 %	385245917
528	NC_017440	AGA	2	6	24747	24752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385245917
529	NC_017440	TAA	2	6	24879	24884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385245917
530	NC_017440	GGA	3	9	24911	24919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385245917
531	NC_017440	GAT	2	6	24956	24961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385245917
532	NC_017440	TTCG	2	8	25199	25206	0 %	50 %	25 %	25 %	385245917
533	NC_017440	TAGG	2	8	25278	25285	25 %	25 %	50 %	0 %	385245917
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535	NC_017440	TTA	2	6	25379	25384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385245917
536	NC_017440	TTCC	2	8	25402	25409	0 %	50 %	0 %	50 %	385245917
537	NC_017440	TAG	2	6	25440	25445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385245917
538	NC_017440	GTGAGG	2	12	25474	25485	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	385245917
539	NC_017440	TAGG	2	8	25516	25523	25 %	25 %	50 %	0 %	385245917
540	NC_017440	AGAGG	2	10	25532	25541	40 %	0 %	60 %	0 %	385245917
541	NC_017440	AGC	2	6	25558	25563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385245917
542	NC_017440	T	6	6	25567	25572	0 %	100 %	0 %	0 %	385245917
543	NC_017440	T	6	6	25598	25603	0 %	100 %	0 %	0 %	385245917
544	NC_017440	AAG	2	6	25704	25709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385245917
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546	NC_017440	GT	3	6	25740	25745	0 %	50 %	50 %	0 %	385245917
547	NC_017440	TA	3	6	25942	25947	50 %	50 %	0 %	0 %	385245917
548	NC_017440	T	6	6	25951	25956	0 %	100 %	0 %	0 %	385245917
549	NC_017440	GAT	2	6	25963	25968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385245917
550	NC_017440	TGT	2	6	26098	26103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385245917
551	NC_017440	TAG	2	6	26136	26141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385245917
552	NC_017440	A	6	6	26195	26200	100 %	0 %	0 %	0 %	385245917
553	NC_017440	GCA	2	6	26210	26215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385245917
554	NC_017440	T	6	6	26271	26276	0 %	100 %	0 %	0 %	385245917
555	NC_017440	GCTT	2	8	26288	26295	0 %	50 %	25 %	25 %	385245917
556	NC_017440	CTT	2	6	26358	26363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385245917
557	NC_017440	GA	3	6	26388	26393	50 %	0 %	50 %	0 %	385245917
558	NC_017440	GAA	2	6	26423	26428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385245917
559	NC_017440	GAA	2	6	26430	26435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385245917
560	NC_017440	CGA	2	6	26438	26443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385245917
561	NC_017440	GA	3	6	26512	26517	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
562	NC_017440	CT	3	6	26519	26524	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
563	NC_017440	ACT	2	6	26527	26532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_017440	A	6	6	26543	26548	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_017440	T	7	7	26555	26561	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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569	NC_017440	T	7	7	26818	26824	0 %	100 %	0 %	0 %	385245918
570	NC_017440	GAA	2	6	26836	26841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385245918
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572	NC_017440	TTAA	2	8	26944	26951	50 %	50 %	0 %	0 %	385245918
573	NC_017440	AAAG	2	8	26994	27001	75 %	0 %	25 %	0 %	385245918
574	NC_017440	GA	3	6	27019	27024	50 %	0 %	50 %	0 %	385245918
575	NC_017440	T	7	7	27093	27099	0 %	100 %	0 %	0 %	385245918
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584	NC_017440	GGATA	2	10	27337	27346	40 %	20 %	40 %	0 %	385245918
585	NC_017440	A	7	7	27361	27367	100 %	0 %	0 %	0 %	385245918
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602	NC_017440	AG	3	6	27970	27975	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
603	NC_017440	AGA	2	6	27992	27997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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614	NC_017440	AGGGT	2	10	28580	28589	20 %	20 %	60 %	0 %	385245920
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618	NC_017440	TGA	2	6	28656	28661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385245920
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620	NC_017440	GC	4	8	28860	28867	0 %	0 %	50 %	50 %	385245920
621	NC_017440	AAG	2	6	28868	28873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385245920
622	NC_017440	TA	3	6	28982	28987	50 %	50 %	0 %	0 %	385245920
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629	NC_017440	TTTG	2	8	29566	29573	0 %	75 %	25 %	0 %	385245921
630	NC_017440	TTGT	2	8	29601	29608	0 %	75 %	25 %	0 %	385245921
631	NC_017440	CCTAT	2	10	29620	29629	20 %	40 %	0 %	40 %	385245921
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