MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis E/150 chromosome

Total Repeats: 2384

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017439	TC	3	6	225	230	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017439	AG	3	6	247	252	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017439	TC	3	6	1670	1675	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017439	AG	3	6	2153	2158	50 %	0 %	50 %	0 %	385244971
5	NC_017439	GA	3	6	2821	2826	50 %	0 %	50 %	0 %	385244971
6	NC_017439	AT	3	6	4514	4519	50 %	50 %	0 %	0 %	385244972
7	NC_017439	TC	3	6	5264	5269	0 %	50 %	0 %	50 %	385244973
8	NC_017439	GA	3	6	5275	5280	50 %	0 %	50 %	0 %	385244973
9	NC_017439	AT	3	6	5379	5384	50 %	50 %	0 %	0 %	385244973
10	NC_017439	TG	3	6	5532	5537	0 %	50 %	50 %	0 %	385244973
11	NC_017439	AG	3	6	5940	5945	50 %	0 %	50 %	0 %	385244973
12	NC_017439	GA	3	6	6998	7003	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017439	AC	3	6	7648	7653	50 %	0 %	0 %	50 %	385244975
14	NC_017439	AG	3	6	8391	8396	50 %	0 %	50 %	0 %	385244976
15	NC_017439	CT	4	8	8510	8517	0 %	50 %	0 %	50 %	385244976
16	NC_017439	GT	3	6	8592	8597	0 %	50 %	50 %	0 %	385244976
17	NC_017439	GA	3	6	9866	9871	50 %	0 %	50 %	0 %	385244978
18	NC_017439	AG	3	6	10083	10088	50 %	0 %	50 %	0 %	385244978
19	NC_017439	TA	3	6	11248	11253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017439	AG	3	6	11309	11314	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017439	TA	3	6	11859	11864	50 %	50 %	0 %	0 %	385244979
22	NC_017439	TG	3	6	12762	12767	0 %	50 %	50 %	0 %	385244980
23	NC_017439	AG	3	6	12911	12916	50 %	0 %	50 %	0 %	385244980
24	NC_017439	AG	4	8	13067	13074	50 %	0 %	50 %	0 %	385244980
25	NC_017439	TA	3	6	13329	13334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017439	TA	4	8	13553	13560	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017439	AC	3	6	14396	14401	50 %	0 %	0 %	50 %	385244981
28	NC_017439	AG	3	6	15735	15740	50 %	0 %	50 %	0 %	385244982
29	NC_017439	TC	3	6	15775	15780	0 %	50 %	0 %	50 %	385244982
30	NC_017439	GA	3	6	16304	16309	50 %	0 %	50 %	0 %	385244983
31	NC_017439	AG	3	6	16375	16380	50 %	0 %	50 %	0 %	385244983
32	NC_017439	GA	3	6	17159	17164	50 %	0 %	50 %	0 %	385244983
33	NC_017439	AG	3	6	17505	17510	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017439	GA	3	6	17518	17523	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017439	GA	3	6	17762	17767	50 %	0 %	50 %	0 %	385244984
36	NC_017439	TC	3	6	18212	18217	0 %	50 %	0 %	50 %	385244984
37	NC_017439	CT	3	6	18440	18445	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017439	TC	3	6	18640	18645	0 %	50 %	0 %	50 %	385244985
39	NC_017439	GA	3	6	18655	18660	50 %	0 %	50 %	0 %	385244985
40	NC_017439	GA	3	6	18754	18759	50 %	0 %	50 %	0 %	385244985
41	NC_017439	AG	3	6	19220	19225	50 %	0 %	50 %	0 %	385244985
42	NC_017439	AG	4	8	19506	19513	50 %	0 %	50 %	0 %	385244985
43	NC_017439	GT	3	6	19769	19774	0 %	50 %	50 %	0 %	385244985
44	NC_017439	AG	3	6	19997	20002	50 %	0 %	50 %	0 %	385244986
45	NC_017439	TG	3	6	20110	20115	0 %	50 %	50 %	0 %	385244986
46	NC_017439	AG	3	6	20506	20511	50 %	0 %	50 %	0 %	385244987
47	NC_017439	GA	3	6	20664	20669	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017439	AG	3	6	21181	21186	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017439	CT	3	6	21249	21254	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_017439	CT	4	8	21906	21913	0 %	50 %	0 %	50 %	385244988
51	NC_017439	AT	3	6	22176	22181	50 %	50 %	0 %	0 %	385244988
52	NC_017439	AT	3	6	22500	22505	50 %	50 %	0 %	0 %	385244988
53	NC_017439	GA	3	6	23819	23824	50 %	0 %	50 %	0 %	385244988
54	NC_017439	GA	3	6	23911	23916	50 %	0 %	50 %	0 %	385244988
55	NC_017439	AG	3	6	24292	24297	50 %	0 %	50 %	0 %	385244988
56	NC_017439	GA	3	6	25709	25714	50 %	0 %	50 %	0 %	385244989
57	NC_017439	GT	3	6	25729	25734	0 %	50 %	50 %	0 %	385244989
58	NC_017439	GA	3	6	26377	26382	50 %	0 %	50 %	0 %	385244989
59	NC_017439	GA	3	6	26501	26506	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017439	CT	3	6	26508	26513	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_017439	AT	3	6	26794	26799	50 %	50 %	0 %	0 %	385244990
62	NC_017439	GA	3	6	27008	27013	50 %	0 %	50 %	0 %	385244990
63	NC_017439	TC	3	6	27876	27881	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_017439	AG	3	6	27959	27964	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017439	TG	3	6	28382	28387	0 %	50 %	50 %	0 %	385244992
66	NC_017439	TC	3	6	28435	28440	0 %	50 %	0 %	50 %	385244992
67	NC_017439	GC	4	8	28849	28856	0 %	0 %	50 %	50 %	385244992
68	NC_017439	TA	3	6	28971	28976	50 %	50 %	0 %	0 %	385244992
69	NC_017439	GA	3	6	29922	29927	50 %	0 %	50 %	0 %	385244993
70	NC_017439	AG	3	6	30020	30025	50 %	0 %	50 %	0 %	385244994
71	NC_017439	TC	3	6	30129	30134	0 %	50 %	0 %	50 %	385244994
72	NC_017439	GA	3	6	30750	30755	50 %	0 %	50 %	0 %	385244994
73	NC_017439	GA	3	6	31218	31223	50 %	0 %	50 %	0 %	385244994
74	NC_017439	TC	3	6	31644	31649	0 %	50 %	0 %	50 %	385244996
75	NC_017439	CT	3	6	32124	32129	0 %	50 %	0 %	50 %	385244996
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81	NC_017439	GA	4	8	34620	34627	50 %	0 %	50 %	0 %	385245000
82	NC_017439	TG	3	6	35445	35450	0 %	50 %	50 %	0 %	385245001
83	NC_017439	GA	3	6	36373	36378	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017439	AT	3	6	36475	36480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017439	GA	3	6	36523	36528	50 %	0 %	50 %	0 %	385245002
86	NC_017439	CT	3	6	37007	37012	0 %	50 %	0 %	50 %	385245002
87	NC_017439	AG	3	6	37518	37523	50 %	0 %	50 %	0 %	385245002
88	NC_017439	AG	3	6	38064	38069	50 %	0 %	50 %	0 %	385245002
89	NC_017439	AG	3	6	38591	38596	50 %	0 %	50 %	0 %	385245002
90	NC_017439	CT	3	6	38742	38747	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_017439	GA	3	6	39375	39380	50 %	0 %	50 %	0 %	385245003
92	NC_017439	AG	3	6	39512	39517	50 %	0 %	50 %	0 %	385245003
93	NC_017439	AG	3	6	39612	39617	50 %	0 %	50 %	0 %	385245003
94	NC_017439	CT	3	6	40112	40117	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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96	NC_017439	GC	3	6	40637	40642	0 %	0 %	50 %	50 %	385245004
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98	NC_017439	TC	3	6	40811	40816	0 %	50 %	0 %	50 %	385245004
99	NC_017439	GC	3	6	40876	40881	0 %	0 %	50 %	50 %	385245004
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103	NC_017439	GA	4	8	42002	42009	50 %	0 %	50 %	0 %	385245005
104	NC_017439	AG	3	6	42238	42243	50 %	0 %	50 %	0 %	385245005
105	NC_017439	CT	3	6	42304	42309	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_017439	GA	5	10	42579	42588	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017439	AG	3	6	42703	42708	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017439	TG	3	6	43066	43071	0 %	50 %	50 %	0 %	385245007
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110	NC_017439	TC	3	6	43630	43635	0 %	50 %	0 %	50 %	385245008
111	NC_017439	TC	3	6	43795	43800	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_017439	TA	3	6	43948	43953	50 %	50 %	0 %	0 %	385245009
113	NC_017439	TC	3	6	44860	44865	0 %	50 %	0 %	50 %	385245010
114	NC_017439	GA	3	6	45343	45348	50 %	0 %	50 %	0 %	385245011
115	NC_017439	TG	3	6	45561	45566	0 %	50 %	50 %	0 %	385245011
116	NC_017439	AG	3	6	45572	45577	50 %	0 %	50 %	0 %	385245011
117	NC_017439	AG	4	8	46014	46021	50 %	0 %	50 %	0 %	385245012
118	NC_017439	CT	3	6	46205	46210	0 %	50 %	0 %	50 %	385245012
119	NC_017439	TG	3	6	46406	46411	0 %	50 %	50 %	0 %	385245012
120	NC_017439	AG	3	6	46459	46464	50 %	0 %	50 %	0 %	385245012
121	NC_017439	AG	3	6	48031	48036	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017439	AG	3	6	49383	49388	50 %	0 %	50 %	0 %	385245014
123	NC_017439	CA	3	6	50049	50054	50 %	0 %	0 %	50 %	385245015
124	NC_017439	TG	4	8	51378	51385	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017439	TC	3	6	52999	53004	0 %	50 %	0 %	50 %	385245017
126	NC_017439	CA	3	6	53050	53055	50 %	0 %	0 %	50 %	385245017
127	NC_017439	GA	3	6	53471	53476	50 %	0 %	50 %	0 %	385245018
128	NC_017439	CT	3	6	53788	53793	0 %	50 %	0 %	50 %	385245018
129	NC_017439	CT	3	6	54457	54462	0 %	50 %	0 %	50 %	385245019
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131	NC_017439	GA	3	6	55702	55707	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017439	AG	3	6	56301	56306	50 %	0 %	50 %	0 %	385245020
133	NC_017439	CT	3	6	56600	56605	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_017439	GT	3	6	56650	56655	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017439	TG	3	6	57288	57293	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017439	CT	3	6	58169	58174	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_017439	GA	3	6	59736	59741	50 %	0 %	50 %	0 %	385245022
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142	NC_017439	AT	3	6	61498	61503	50 %	50 %	0 %	0 %	385245025
143	NC_017439	GA	3	6	61521	61526	50 %	0 %	50 %	0 %	385245025
144	NC_017439	GA	3	6	61647	61652	50 %	0 %	50 %	0 %	385245025
145	NC_017439	GA	3	6	62462	62467	50 %	0 %	50 %	0 %	385245025
146	NC_017439	GA	3	6	62721	62726	50 %	0 %	50 %	0 %	385245025
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