MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis A2497 plasmid0001

Total Repeats: 28

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017438	T	7	7	375	381	0 %	100 %	0 %	0 %	385270624
2	NC_017438	A	6	6	409	414	100 %	0 %	0 %	0 %	385270624
3	NC_017438	A	8	8	520	527	100 %	0 %	0 %	0 %	385270624
4	NC_017438	A	6	6	580	585	100 %	0 %	0 %	0 %	385270624
5	NC_017438	T	6	6	845	850	0 %	100 %	0 %	0 %	385270624
6	NC_017438	T	6	6	991	996	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017438	T	6	6	1627	1632	0 %	100 %	0 %	0 %	385270625
8	NC_017438	T	8	8	1854	1861	0 %	100 %	0 %	0 %	385270625
9	NC_017438	A	6	6	1862	1867	100 %	0 %	0 %	0 %	385270625
10	NC_017438	T	7	7	1880	1886	0 %	100 %	0 %	0 %	385270625
11	NC_017438	A	6	6	2067	2072	100 %	0 %	0 %	0 %	385270626
12	NC_017438	T	7	7	2452	2458	0 %	100 %	0 %	0 %	385270626
13	NC_017438	T	6	6	2590	2595	0 %	100 %	0 %	0 %	385270626
14	NC_017438	A	6	6	2670	2675	100 %	0 %	0 %	0 %	385270626
15	NC_017438	T	6	6	2771	2776	0 %	100 %	0 %	0 %	385270627
16	NC_017438	T	6	6	2965	2970	0 %	100 %	0 %	0 %	385270627
17	NC_017438	A	6	6	3122	3127	100 %	0 %	0 %	0 %	385270628
18	NC_017438	T	6	6	3899	3904	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017438	T	6	6	4043	4048	0 %	100 %	0 %	0 %	385270629
20	NC_017438	T	7	7	4147	4153	0 %	100 %	0 %	0 %	385270629
21	NC_017438	T	6	6	5017	5022	0 %	100 %	0 %	0 %	385270630
22	NC_017438	T	8	8	5808	5815	0 %	100 %	0 %	0 %	385270630
23	NC_017438	A	7	7	6372	6378	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017438	T	6	6	6650	6655	0 %	100 %	0 %	0 %	385270631
25	NC_017438	A	6	6	6744	6749	100 %	0 %	0 %	0 %	385270631
26	NC_017438	T	6	6	6894	6899	0 %	100 %	0 %	0 %	385270631
27	NC_017438	A	8	8	6968	6975	100 %	0 %	0 %	0 %	385270631
28	NC_017438	T	6	6	7465	7470	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.