MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis A2497 chromosome

Total Repeats: 23059

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
23001	NC_017437	TA	3	6	1042022	1042027	50 %	50 %	0 %	0 %	385270622
23002	NC_017437	TAA	2	6	1042048	1042053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385270622
23003	NC_017437	AGAA	2	8	1042096	1042103	75 %	0 %	25 %	0 %	385270622
23004	NC_017437	ATG	2	6	1042154	1042159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385270622
23005	NC_017437	CAG	2	6	1042213	1042218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385270622
23006	NC_017437	ATAG	2	8	1042234	1042241	50 %	25 %	25 %	0 %	385270622
23007	NC_017437	CTC	2	6	1042243	1042248	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385270622
23008	NC_017437	TGT	2	6	1042256	1042261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385270622
23009	NC_017437	ATC	2	6	1042266	1042271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385270622
23010	NC_017437	TCA	2	6	1042392	1042397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385270622
23011	NC_017437	AG	3	6	1042445	1042450	50 %	0 %	50 %	0 %	385270622
23012	NC_017437	AG	4	8	1042487	1042494	50 %	0 %	50 %	0 %	385270622
23013	NC_017437	AG	3	6	1042568	1042573	50 %	0 %	50 %	0 %	385270622
23014	NC_017437	T	6	6	1042618	1042623	0 %	100 %	0 %	0 %	385270622
23015	NC_017437	AAG	2	6	1042687	1042692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385270622
23016	NC_017437	GAG	2	6	1042709	1042714	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385270622
23017	NC_017437	GA	5	10	1042729	1042738	50 %	0 %	50 %	0 %	385270622
23018	NC_017437	GCT	2	6	1042798	1042803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385270622
23019	NC_017437	T	6	6	1042831	1042836	0 %	100 %	0 %	0 %	385270622
23020	NC_017437	CTT	2	6	1042837	1042842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385270622
23021	NC_017437	AGG	2	6	1042948	1042953	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385270622
23022	NC_017437	TGC	2	6	1042969	1042974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385270622
23023	NC_017437	AAAGA	2	10	1042997	1043006	80 %	0 %	20 %	0 %	385270622
23024	NC_017437	GAA	2	6	1043031	1043036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385270622
23025	NC_017437	GAACA	2	10	1043111	1043120	60 %	0 %	20 %	20 %	385270622
23026	NC_017437	AG	3	6	1043141	1043146	50 %	0 %	50 %	0 %	385270622
23027	NC_017437	CTCC	2	8	1043148	1043155	0 %	25 %	0 %	75 %	385270622
23028	NC_017437	TGT	2	6	1043191	1043196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385270622
23029	NC_017437	TTGC	2	8	1043274	1043281	0 %	50 %	25 %	25 %	385270622
23030	NC_017437	CAAG	2	8	1043301	1043308	50 %	0 %	25 %	25 %	385270622
23031	NC_017437	AG	6	12	1043307	1043318	50 %	0 %	50 %	0 %	385270622
23032	NC_017437	ACA	2	6	1043348	1043353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385270622
23033	NC_017437	AG	3	6	1043392	1043397	50 %	0 %	50 %	0 %	385270622
23034	NC_017437	TAC	2	6	1043425	1043430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385270622
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23036	NC_017437	GAAA	2	8	1043471	1043478	75 %	0 %	25 %	0 %	385270622
23037	NC_017437	AGA	2	6	1043540	1043545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385270622
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23040	NC_017437	TGA	2	6	1043685	1043690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385270622
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23042	NC_017437	AAGGA	2	10	1043730	1043739	60 %	0 %	40 %	0 %	385270622
23043	NC_017437	TACA	2	8	1043843	1043850	50 %	25 %	0 %	25 %	385270622
23044	NC_017437	ATC	2	6	1043855	1043860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385270622
23045	NC_017437	A	6	6	1043915	1043920	100 %	0 %	0 %	0 %	385270622
23046	NC_017437	GAC	2	6	1043927	1043932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385270622
23047	NC_017437	GAG	2	6	1043951	1043956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385270622
23048	NC_017437	AGC	2	6	1044011	1044016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385270622
23049	NC_017437	ACA	2	6	1044023	1044028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385270622
23050	NC_017437	AGA	2	6	1044076	1044081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23051	NC_017437	A	8	8	1044091	1044098	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23052	NC_017437	TAA	2	6	1044100	1044105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23053	NC_017437	A	6	6	1044220	1044225	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23054	NC_017437	AAT	2	6	1044229	1044234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23055	NC_017437	TATT	2	8	1044251	1044258	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23056	NC_017437	T	7	7	1044264	1044270	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23057	NC_017437	TAAAAT	2	12	1044283	1044294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23058	NC_017437	TTTTA	2	10	1044299	1044308	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23059	NC_017437	GGTT	2	8	1044315	1044322	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.