MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis D-LC chromosome

Total Repeats: 22956

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017436	TTG	2	6	182609	182614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385244244
4002	NC_017436	ACT	2	6	182619	182624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385244244
4003	NC_017436	GAT	2	6	182648	182653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244244
4004	NC_017436	GA	3	6	182674	182679	50 %	0 %	50 %	0 %	385244244
4005	NC_017436	GCG	2	6	182682	182687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385244244
4006	NC_017436	ACT	2	6	182730	182735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385244244
4007	NC_017436	TAG	2	6	182764	182769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244244
4008	NC_017436	TCGC	2	8	182862	182869	0 %	25 %	25 %	50 %	385244245
4009	NC_017436	AGA	2	6	182873	182878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244245
4010	NC_017436	GCA	2	6	182882	182887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385244245
4011	NC_017436	TA	3	6	182917	182922	50 %	50 %	0 %	0 %	385244245
4012	NC_017436	GAA	2	6	182952	182957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244245
4013	NC_017436	AGA	2	6	182991	182996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244245
4014	NC_017436	GA	3	6	183030	183035	50 %	0 %	50 %	0 %	385244245
4015	NC_017436	GTT	2	6	183047	183052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385244245
4016	NC_017436	GTT	2	6	183082	183087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385244245
4017	NC_017436	CTT	2	6	183090	183095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244245
4018	NC_017436	GA	3	6	183133	183138	50 %	0 %	50 %	0 %	385244245
4019	NC_017436	GTT	2	6	183144	183149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385244245
4020	NC_017436	GAG	2	6	183165	183170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385244245
4021	NC_017436	GAA	2	6	183185	183190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244245
4022	NC_017436	TTG	2	6	183196	183201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385244245
4023	NC_017436	AGG	2	6	183235	183240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385244245
4024	NC_017436	AGA	2	6	183331	183336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244245
4025	NC_017436	TGA	2	6	183353	183358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244245
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4027	NC_017436	GTA	2	6	183469	183474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244245
4028	NC_017436	GTTG	2	8	183509	183516	0 %	50 %	50 %	0 %	385244245
4029	NC_017436	GGA	3	9	183524	183532	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385244245
4030	NC_017436	TC	3	6	183540	183545	0 %	50 %	0 %	50 %	385244245
4031	NC_017436	ATT	2	6	183559	183564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385244245
4032	NC_017436	A	7	7	183589	183595	100 %	0 %	0 %	0 %	385244245
4033	NC_017436	T	8	8	183601	183608	0 %	100 %	0 %	0 %	385244245
4034	NC_017436	ATA	2	6	183651	183656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385244245
4035	NC_017436	A	6	6	183656	183661	100 %	0 %	0 %	0 %	385244245
4036	NC_017436	TAT	2	6	183732	183737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_017436	GA	3	6	183772	183777	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_017436	AGA	2	6	183814	183819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244246
4039	NC_017436	TGT	2	6	183873	183878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385244246
4040	NC_017436	TCT	3	9	183942	183950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244246
4041	NC_017436	TTTC	2	8	184015	184022	0 %	75 %	0 %	25 %	385244246
4042	NC_017436	CTG	2	6	184063	184068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385244246
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4044	NC_017436	TAG	2	6	184115	184120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244246
4045	NC_017436	AGT	2	6	184245	184250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244246
4046	NC_017436	ATCG	2	8	184272	184279	25 %	25 %	25 %	25 %	385244246
4047	NC_017436	TCA	2	6	184355	184360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385244247
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4049	NC_017436	AGAGA	2	10	184463	184472	60 %	0 %	40 %	0 %	385244247
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4053	NC_017436	ATA	2	6	184985	184990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385244247
4054	NC_017436	TCTA	2	8	185026	185033	25 %	50 %	0 %	25 %	385244247
4055	NC_017436	GTT	2	6	185094	185099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_017436	TGC	2	6	185227	185232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385244248
4057	NC_017436	CA	3	6	185248	185253	50 %	0 %	0 %	50 %	385244248
4058	NC_017436	AGA	2	6	185363	185368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244248
4059	NC_017436	GTT	4	12	185492	185503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_017436	T	6	6	185509	185514	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_017436	T	7	7	185517	185523	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_017436	T	6	6	185529	185534	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_017436	T	7	7	185579	185585	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_017436	A	7	7	185601	185607	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_017436	T	6	6	185624	185629	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_017436	T	7	7	185719	185725	0 %	100 %	0 %	0 %	385244249
4067	NC_017436	TCT	2	6	185743	185748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244249
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4069	NC_017436	GTC	2	6	185844	185849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385244249
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4074	NC_017436	GAA	2	6	186017	186022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244249
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4081	NC_017436	GCTT	2	8	186268	186275	0 %	50 %	25 %	25 %	385244249
4082	NC_017436	CAC	2	6	186300	186305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385244249
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4086	NC_017436	ACGAT	2	10	186535	186544	40 %	20 %	20 %	20 %	385244249
4087	NC_017436	TTTA	2	8	186553	186560	25 %	75 %	0 %	0 %	385244249
4088	NC_017436	AAG	2	6	186564	186569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244249
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4094	NC_017436	T	7	7	186766	186772	0 %	100 %	0 %	0 %	385244249
4095	NC_017436	A	6	6	186807	186812	100 %	0 %	0 %	0 %	385244249
4096	NC_017436	GCT	2	6	186896	186901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385244249
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4098	NC_017436	GCTT	2	8	187201	187208	0 %	50 %	25 %	25 %	385244249
4099	NC_017436	TAG	2	6	187239	187244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244249
4100	NC_017436	GAT	2	6	187277	187282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244249
4101	NC_017436	T	7	7	187282	187288	0 %	100 %	0 %	0 %	385244249
4102	NC_017436	TTA	2	6	187312	187317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385244249
4103	NC_017436	ATC	2	6	187319	187324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4104	NC_017436	CGATA	2	10	187347	187356	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4105	NC_017436	T	6	6	187360	187365	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_017436	TCC	2	6	187380	187385	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385244250
4107	NC_017436	ACA	3	9	187386	187394	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385244250
4108	NC_017436	AGT	2	6	187404	187409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244250
4109	NC_017436	AAAC	2	8	187429	187436	75 %	0 %	0 %	25 %	385244250
4110	NC_017436	TGC	2	6	187495	187500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385244250
4111	NC_017436	AGT	2	6	187563	187568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244250
4112	NC_017436	AGT	2	6	187586	187591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244250
4113	NC_017436	TTG	2	6	187594	187599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385244250
4114	NC_017436	TAT	2	6	187674	187679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_017436	T	6	6	187693	187698	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_017436	GCA	2	6	187746	187751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4117	NC_017436	CTT	2	6	187761	187766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4118	NC_017436	GGAC	2	8	187788	187795	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4119	NC_017436	AAG	2	6	187898	187903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_017436	TTG	2	6	187920	187925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_017436	CAT	2	6	187930	187935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4122	NC_017436	T	7	7	187969	187975	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_017436	TAA	2	6	188048	188053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_017436	TTG	2	6	188076	188081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_017436	CTC	2	6	188151	188156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385244251
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4127	NC_017436	TAC	2	6	188278	188283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385244251
4128	NC_017436	CAT	2	6	188294	188299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385244251
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4130	NC_017436	CCT	2	6	188402	188407	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385244251
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4155	NC_017436	GAC	2	6	189312	189317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385244252
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4165	NC_017436	CAGAT	2	10	189740	189749	40 %	20 %	20 %	20 %	385244252
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4210	NC_017436	CTGG	2	8	192297	192304	0 %	25 %	50 %	25 %	385244255
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4221	NC_017436	AAG	2	6	192791	192796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4225	NC_017436	AAACAT	2	12	192917	192928	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385244256
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4231	NC_017436	TGCT	2	8	193188	193195	0 %	50 %	25 %	25 %	385244256
4232	NC_017436	ACA	2	6	193240	193245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385244256
4233	NC_017436	AGCAAC	2	12	193252	193263	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385244256
4234	NC_017436	GTA	2	6	193292	193297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244256
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4244	NC_017436	GATTA	2	10	193809	193818	40 %	40 %	20 %	0 %	385244256
4245	NC_017436	T	6	6	193906	193911	0 %	100 %	0 %	0 %	385244256
4246	NC_017436	ATT	2	6	193934	193939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385244256
4247	NC_017436	ATC	2	6	194057	194062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385244256
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4499	NC_017436	GTC	2	6	205664	205669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385244270
4500	NC_017436	ATG	2	6	205673	205678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244270

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