MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis D-LC chromosome

Total Repeats: 22956

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_017436	CAT	2	6	159162	159167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385244229
3502	NC_017436	TCAA	2	8	159223	159230	50 %	25 %	0 %	25 %	385244229
3503	NC_017436	TGA	2	6	159420	159425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244229
3504	NC_017436	GAA	2	6	159448	159453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244229
3505	NC_017436	TC	3	6	159483	159488	0 %	50 %	0 %	50 %	385244229
3506	NC_017436	GT	3	6	159521	159526	0 %	50 %	50 %	0 %	385244229
3507	NC_017436	AAT	2	6	159565	159570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385244229
3508	NC_017436	GGA	2	6	159577	159582	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385244229
3509	NC_017436	AGGAA	2	10	159606	159615	60 %	0 %	40 %	0 %	385244229
3510	NC_017436	TAG	2	6	159636	159641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244229
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3512	NC_017436	CTG	2	6	159662	159667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385244229
3513	NC_017436	AG	3	6	159693	159698	50 %	0 %	50 %	0 %	385244229
3514	NC_017436	TCT	2	6	159721	159726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244229
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3519	NC_017436	AGG	2	6	160051	160056	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385244230
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3521	NC_017436	CT	3	6	160164	160169	0 %	50 %	0 %	50 %	385244230
3522	NC_017436	GA	3	6	160174	160179	50 %	0 %	50 %	0 %	385244230
3523	NC_017436	ATT	2	6	160194	160199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385244230
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3527	NC_017436	ATG	2	6	160440	160445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244230
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3542	NC_017436	ATTG	2	8	161475	161482	25 %	50 %	25 %	0 %	385244231
3543	NC_017436	TCT	2	6	161506	161511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244231
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3546	NC_017436	GCTT	2	8	161579	161586	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3547	NC_017436	CAAAA	2	10	161609	161618	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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3549	NC_017436	GAG	2	6	161730	161735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3554	NC_017436	GAA	3	9	162063	162071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244232
3555	NC_017436	TTTC	2	8	162166	162173	0 %	75 %	0 %	25 %	385244232
3556	NC_017436	ATCT	2	8	162192	162199	25 %	50 %	0 %	25 %	385244232
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3571	NC_017436	AGAGA	2	10	162837	162846	60 %	0 %	40 %	0 %	385244232
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3574	NC_017436	TC	3	6	162898	162903	0 %	50 %	0 %	50 %	385244232
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3581	NC_017436	AGCAA	2	10	163272	163281	60 %	0 %	20 %	20 %	385244232
3582	NC_017436	TAC	2	6	163298	163303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385244232
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3589	NC_017436	GAT	2	6	163609	163614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244233
3590	NC_017436	TAT	2	6	163657	163662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385244233
3591	NC_017436	TCAA	2	8	163667	163674	50 %	25 %	0 %	25 %	385244233
3592	NC_017436	CGA	2	6	163676	163681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385244233
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3599	NC_017436	GGA	2	6	164194	164199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385244233
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3603	NC_017436	GA	3	6	164387	164392	50 %	0 %	50 %	0 %	385244233
3604	NC_017436	GC	3	6	164403	164408	0 %	0 %	50 %	50 %	385244233
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3608	NC_017436	A	8	8	164669	164676	100 %	0 %	0 %	0 %	385244233
3609	NC_017436	AGG	2	6	164712	164717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385244233
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3612	NC_017436	TGT	2	6	164817	164822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385244233
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3619	NC_017436	ATCG	2	8	165240	165247	25 %	25 %	25 %	25 %	385244233
3620	NC_017436	TTC	2	6	165253	165258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244233
3621	NC_017436	AG	3	6	165274	165279	50 %	0 %	50 %	0 %	385244233
3622	NC_017436	TCG	2	6	165285	165290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385244233
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3998	NC_017436	TGA	2	6	182544	182549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244244
3999	NC_017436	TGC	2	6	182580	182585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385244244
4000	NC_017436	CCAG	2	8	182600	182607	25 %	0 %	25 %	50 %	385244244

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