MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis D-LC chromosome

Total Repeats: 22956

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017436	TAT	2	6	70026	70031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385244147
1502	NC_017436	CTT	2	6	70050	70055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244147
1503	NC_017436	GA	3	6	70059	70064	50 %	0 %	50 %	0 %	385244147
1504	NC_017436	CTCTT	2	10	70065	70074	0 %	60 %	0 %	40 %	385244147
1505	NC_017436	AGAA	2	8	70077	70084	75 %	0 %	25 %	0 %	385244147
1506	NC_017436	TGA	2	6	70105	70110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244147
1507	NC_017436	TTG	2	6	70194	70199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385244147
1508	NC_017436	TCT	2	6	70217	70222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244147
1509	NC_017436	GA	3	6	70258	70263	50 %	0 %	50 %	0 %	385244147
1510	NC_017436	AGCT	2	8	70299	70306	25 %	25 %	25 %	25 %	385244147
1511	NC_017436	TGA	2	6	70345	70350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244147
1512	NC_017436	GCAT	2	8	70360	70367	25 %	25 %	25 %	25 %	385244147
1513	NC_017436	AGA	2	6	70378	70383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244147
1514	NC_017436	GT	3	6	70534	70539	0 %	50 %	50 %	0 %	385244147
1515	NC_017436	CT	3	6	70615	70620	0 %	50 %	0 %	50 %	385244147
1516	NC_017436	GA	3	6	70636	70641	50 %	0 %	50 %	0 %	385244147
1517	NC_017436	AGT	2	6	70678	70683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244147
1518	NC_017436	AGGGG	2	10	70711	70720	20 %	0 %	80 %	0 %	385244147
1519	NC_017436	AAGAA	2	10	70753	70762	80 %	0 %	20 %	0 %	385244147
1520	NC_017436	AGA	2	6	70825	70830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244147
1521	NC_017436	TGA	2	6	70861	70866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244147
1522	NC_017436	TAT	2	6	70872	70877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385244147
1523	NC_017436	T	6	6	70961	70966	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_017436	T	8	8	70982	70989	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_017436	CAT	2	6	71047	71052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385244148
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1527	NC_017436	GCTT	2	8	71106	71113	0 %	50 %	25 %	25 %	385244148
1528	NC_017436	A	6	6	71201	71206	100 %	0 %	0 %	0 %	385244148
1529	NC_017436	ATT	2	6	71251	71256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385244148
1530	NC_017436	CAA	2	6	71398	71403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385244148
1531	NC_017436	TCC	2	6	71422	71427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385244148
1532	NC_017436	TTCT	2	8	71444	71451	0 %	75 %	0 %	25 %	385244148
1533	NC_017436	ATG	2	6	71456	71461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244148
1534	NC_017436	GCTT	2	8	71490	71497	0 %	50 %	25 %	25 %	385244148
1535	NC_017436	AGA	2	6	71499	71504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244148
1536	NC_017436	GAGC	2	8	71518	71525	25 %	0 %	50 %	25 %	385244148
1537	NC_017436	TCA	2	6	71543	71548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385244148
1538	NC_017436	A	7	7	71550	71556	100 %	0 %	0 %	0 %	385244148
1539	NC_017436	CTATTT	2	12	71561	71572	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385244148
1540	NC_017436	TGA	2	6	71595	71600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244148
1541	NC_017436	ATG	2	6	71633	71638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244148
1542	NC_017436	AGA	2	6	71763	71768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_017436	CT	3	6	71771	71776	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1544	NC_017436	CGT	2	6	71811	71816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1545	NC_017436	T	7	7	71816	71822	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_017436	CTTGC	2	10	71842	71851	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1547	NC_017436	GATA	2	8	71866	71873	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_017436	TTC	2	6	71957	71962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244149
1549	NC_017436	CTT	2	6	72025	72030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244149
1550	NC_017436	ATTGG	2	10	72043	72052	20 %	40 %	40 %	0 %	385244149
1551	NC_017436	T	6	6	72059	72064	0 %	100 %	0 %	0 %	385244149
1552	NC_017436	AGC	2	6	72074	72079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385244149
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1554	NC_017436	ATA	2	6	72187	72192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385244149
1555	NC_017436	GCT	2	6	72207	72212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385244149
1556	NC_017436	GCTA	2	8	72216	72223	25 %	25 %	25 %	25 %	385244149
1557	NC_017436	AAT	2	6	72246	72251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385244149
1558	NC_017436	TGG	2	6	72277	72282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385244149
1559	NC_017436	T	6	6	72284	72289	0 %	100 %	0 %	0 %	385244149
1560	NC_017436	AGC	2	6	72346	72351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385244149
1561	NC_017436	TTAT	2	8	72392	72399	25 %	75 %	0 %	0 %	385244149
1562	NC_017436	TGC	2	6	72400	72405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385244149
1563	NC_017436	TGT	2	6	72443	72448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385244149
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1565	NC_017436	GATT	2	8	72494	72501	25 %	50 %	25 %	0 %	385244149
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1567	NC_017436	CTGG	2	8	72602	72609	0 %	25 %	50 %	25 %	385244149
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1569	NC_017436	ACTCTT	2	12	72690	72701	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	385244149
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1571	NC_017436	TGA	2	6	72728	72733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244149
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1573	NC_017436	T	6	6	72843	72848	0 %	100 %	0 %	0 %	385244149
1574	NC_017436	TAG	2	6	72883	72888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244149
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1592	NC_017436	TGGGA	2	10	73532	73541	20 %	20 %	60 %	0 %	385244150
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1603	NC_017436	TGC	2	6	74179	74184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385244150
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1610	NC_017436	ACT	2	6	74619	74624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1611	NC_017436	T	6	6	74630	74635	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_017436	AGT	2	6	74655	74660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_017436	CAA	2	6	74681	74686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385244151
1614	NC_017436	T	6	6	74739	74744	0 %	100 %	0 %	0 %	385244151
1615	NC_017436	CCA	2	6	74782	74787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385244151
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1622	NC_017436	CTC	2	6	75249	75254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385244151
1623	NC_017436	T	6	6	75319	75324	0 %	100 %	0 %	0 %	385244151
1624	NC_017436	GAC	2	6	75327	75332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385244151
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1626	NC_017436	TC	3	6	75390	75395	0 %	50 %	0 %	50 %	385244151
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