MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis D-LC chromosome

Total Repeats: 22956

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_017436	GAA	2	6	47316	47321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244129
1003	NC_017436	ATGG	2	8	47365	47372	25 %	25 %	50 %	0 %	385244129
1004	NC_017436	AGGA	2	8	47396	47403	50 %	0 %	50 %	0 %	385244129
1005	NC_017436	GTT	2	6	47425	47430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385244129
1006	NC_017436	GGT	2	6	47434	47439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385244129
1007	NC_017436	T	6	6	47443	47448	0 %	100 %	0 %	0 %	385244129
1008	NC_017436	ATA	2	6	47451	47456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385244129
1009	NC_017436	AGA	2	6	47804	47809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244129
1010	NC_017436	CTG	2	6	47861	47866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385244129
1011	NC_017436	GAA	2	6	47874	47879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244129
1012	NC_017436	GAAC	2	8	47943	47950	50 %	0 %	25 %	25 %	385244129
1013	NC_017436	AAGT	2	8	47978	47985	50 %	25 %	25 %	0 %	385244129
1014	NC_017436	TAA	2	6	47987	47992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385244129
1015	NC_017436	GAA	2	6	48003	48008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244129
1016	NC_017436	GAAGA	2	10	48011	48020	60 %	0 %	40 %	0 %	385244129
1017	NC_017436	AG	3	6	48043	48048	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_017436	TGT	2	6	48062	48067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_017436	CTG	2	6	48097	48102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385244130
1020	NC_017436	GAG	2	6	48103	48108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385244130
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1022	NC_017436	AACA	2	8	48187	48194	75 %	0 %	0 %	25 %	385244130
1023	NC_017436	TAG	2	6	48304	48309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244130
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1029	NC_017436	CAA	2	6	48484	48489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385244130
1030	NC_017436	TAT	2	6	48502	48507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385244130
1031	NC_017436	T	6	6	48552	48557	0 %	100 %	0 %	0 %	385244130
1032	NC_017436	T	8	8	48608	48615	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_017436	GTC	2	6	48740	48745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_017436	AAG	2	6	48762	48767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_017436	TAT	2	6	48791	48796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_017436	T	8	8	48885	48892	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_017436	A	6	6	48936	48941	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_017436	T	6	6	49046	49051	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_017436	TGT	2	6	49053	49058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385244131
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1051	NC_017436	AG	3	6	49395	49400	50 %	0 %	50 %	0 %	385244131
1052	NC_017436	AGA	2	6	49561	49566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_017436	CTATT	2	10	49590	49599	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1054	NC_017436	AAG	2	6	49623	49628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_017436	TCT	2	6	49637	49642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_017436	ACT	2	6	49678	49683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_017436	T	7	7	49698	49704	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_017436	AAT	2	6	49713	49718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_017436	TGT	2	6	49735	49740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1061	NC_017436	ATT	2	6	49831	49836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_017436	CAA	2	6	49850	49855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1069	NC_017436	CA	3	6	50061	50066	50 %	0 %	0 %	50 %	385244132
1070	NC_017436	A	6	6	50074	50079	100 %	0 %	0 %	0 %	385244132
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1093	NC_017436	TTCA	2	8	51136	51143	25 %	50 %	0 %	25 %	385244132
1094	NC_017436	GCA	2	6	51169	51174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385244132
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1098	NC_017436	TAA	2	6	51408	51413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_017436	T	6	6	51432	51437	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_017436	AGT	3	9	51476	51484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_017436	GCA	2	6	51532	51537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_017436	CTG	2	6	51547	51552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_017436	GTA	2	6	51564	51569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_017436	AAG	2	6	51585	51590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_017436	A	6	6	51600	51605	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_017436	AAG	2	6	51630	51635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_017436	A	7	7	51660	51666	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_017436	AGC	2	6	51671	51676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_017436	A	6	6	51708	51713	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_017436	AAG	2	6	51738	51743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_017436	A	7	7	51768	51774	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_017436	AGC	2	6	51779	51784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_017436	AAG	2	6	51846	51851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_017436	A	7	7	51876	51882	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_017436	AGC	2	6	51887	51892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_017436	CAA	2	6	51922	51927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_017436	A	7	7	51926	51932	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_017436	A	6	6	51966	51971	100 %	0 %	0 %	0 %	385244133
1119	NC_017436	GCT	2	6	52002	52007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385244133
1120	NC_017436	CAA	2	6	52086	52091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385244133
1121	NC_017436	GAT	2	6	52129	52134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_017436	T	6	6	52173	52178	0 %	100 %	0 %	0 %	385244134
1123	NC_017436	TATT	2	8	52180	52187	25 %	75 %	0 %	0 %	385244134
1124	NC_017436	AAG	2	6	52207	52212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244134
1125	NC_017436	AAT	2	6	52234	52239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385244134
1126	NC_017436	ATT	2	6	52246	52251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385244134
1127	NC_017436	CTA	2	6	52304	52309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385244134
1128	NC_017436	TGAACG	2	12	52329	52340	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385244134
1129	NC_017436	GTGATT	2	12	52348	52359	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385244134
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1131	NC_017436	T	6	6	52423	52428	0 %	100 %	0 %	0 %	385244134
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1250	NC_017436	CT	3	6	57999	58004	0 %	50 %	0 %	50 %	385244138
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1257	NC_017436	CAA	2	6	58389	58394	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385244138
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