MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis D-LC chromosome

Total Repeats: 22956

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017436	GGTT	2	8	23094	23101	0 %	50 %	50 %	0 %	385244107
502	NC_017436	TGC	2	6	23120	23125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385244107
503	NC_017436	ATT	2	6	23172	23177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385244107
504	NC_017436	AAT	2	6	23214	23219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385244107
505	NC_017436	TTG	2	6	23277	23282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385244107
506	NC_017436	TTCT	2	8	23464	23471	0 %	75 %	0 %	25 %	385244107
507	NC_017436	TGC	2	6	23528	23533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385244107
508	NC_017436	TAAC	2	8	23566	23573	50 %	25 %	0 %	25 %	385244107
509	NC_017436	GCA	2	6	23634	23639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385244107
510	NC_017436	CATT	2	8	23689	23696	25 %	50 %	0 %	25 %	385244107
511	NC_017436	AGA	2	6	23708	23713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244107
512	NC_017436	GAG	2	6	23731	23736	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385244107
513	NC_017436	TTC	2	6	23794	23799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244107
514	NC_017436	GGAAA	2	10	23807	23816	60 %	0 %	40 %	0 %	385244107
515	NC_017436	GA	3	6	23830	23835	50 %	0 %	50 %	0 %	385244107
516	NC_017436	GA	3	6	23922	23927	50 %	0 %	50 %	0 %	385244107
517	NC_017436	AGG	2	6	23929	23934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385244107
518	NC_017436	GAA	2	6	24053	24058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244107
519	NC_017436	GGTA	2	8	24059	24066	25 %	25 %	50 %	0 %	385244107
520	NC_017436	GTT	2	6	24147	24152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385244107
521	NC_017436	CTT	2	6	24241	24246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244107
522	NC_017436	AG	3	6	24303	24308	50 %	0 %	50 %	0 %	385244107
523	NC_017436	TAA	2	6	24314	24319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385244107
524	NC_017436	GAA	2	6	24334	24339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244107
525	NC_017436	AAG	2	6	24475	24480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244107
526	NC_017436	A	7	7	24560	24566	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_017436	TTA	2	6	24573	24578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_017436	T	9	9	24588	24596	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_017436	T	6	6	24620	24625	0 %	100 %	0 %	0 %	385244108
530	NC_017436	AGA	2	6	24747	24752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244108
531	NC_017436	TAA	2	6	24879	24884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385244108
532	NC_017436	GGA	3	9	24911	24919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385244108
533	NC_017436	GAT	2	6	24956	24961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244108
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535	NC_017436	TAGG	2	8	25278	25285	25 %	25 %	50 %	0 %	385244108
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537	NC_017436	TTA	2	6	25379	25384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385244108
538	NC_017436	TTCC	2	8	25402	25409	0 %	50 %	0 %	50 %	385244108
539	NC_017436	TAG	2	6	25440	25445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244108
540	NC_017436	GTGAGG	2	12	25474	25485	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	385244108
541	NC_017436	TAGG	2	8	25516	25523	25 %	25 %	50 %	0 %	385244108
542	NC_017436	AGAGG	2	10	25532	25541	40 %	0 %	60 %	0 %	385244108
543	NC_017436	AGC	2	6	25558	25563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385244108
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545	NC_017436	T	6	6	25598	25603	0 %	100 %	0 %	0 %	385244108
546	NC_017436	AAG	2	6	25704	25709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244108
547	NC_017436	GA	3	6	25720	25725	50 %	0 %	50 %	0 %	385244108
548	NC_017436	GT	3	6	25740	25745	0 %	50 %	50 %	0 %	385244108
549	NC_017436	TA	3	6	25942	25947	50 %	50 %	0 %	0 %	385244108
550	NC_017436	T	6	6	25951	25956	0 %	100 %	0 %	0 %	385244108
551	NC_017436	GAT	2	6	25963	25968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244108
552	NC_017436	TGT	2	6	26098	26103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385244108
553	NC_017436	TAG	2	6	26136	26141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244108
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555	NC_017436	GCA	2	6	26210	26215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385244108
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557	NC_017436	GCTT	2	8	26288	26295	0 %	50 %	25 %	25 %	385244108
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560	NC_017436	GAA	2	6	26423	26428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244108
561	NC_017436	GAA	2	6	26430	26435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244108
562	NC_017436	CGA	2	6	26438	26443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385244108
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564	NC_017436	CT	3	6	26519	26524	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
565	NC_017436	ACT	2	6	26527	26532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_017436	A	6	6	26543	26548	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_017436	T	7	7	26555	26561	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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571	NC_017436	T	7	7	26818	26824	0 %	100 %	0 %	0 %	385244109
572	NC_017436	GAA	2	6	26836	26841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244109
573	NC_017436	GGAA	2	8	26871	26878	50 %	0 %	50 %	0 %	385244109
574	NC_017436	TTAA	2	8	26944	26951	50 %	50 %	0 %	0 %	385244109
575	NC_017436	AAAG	2	8	26994	27001	75 %	0 %	25 %	0 %	385244109
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587	NC_017436	A	7	7	27361	27367	100 %	0 %	0 %	0 %	385244109
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603	NC_017436	ATTG	2	8	27938	27945	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
604	NC_017436	AG	3	6	27970	27975	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
605	NC_017436	AGA	2	6	27992	27997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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611	NC_017436	GAT	3	9	28318	28326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244111
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615	NC_017436	TC	3	6	28446	28451	0 %	50 %	0 %	50 %	385244111
616	NC_017436	AGGGT	2	10	28580	28589	20 %	20 %	60 %	0 %	385244111
617	NC_017436	TTC	2	6	28616	28621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244111
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619	NC_017436	GAA	2	6	28642	28647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244111
620	NC_017436	TGA	2	6	28656	28661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244111
621	NC_017436	TTC	2	6	28689	28694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244111
622	NC_017436	GC	4	8	28860	28867	0 %	0 %	50 %	50 %	385244111
623	NC_017436	AAG	2	6	28868	28873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244111
624	NC_017436	TA	3	6	28982	28987	50 %	50 %	0 %	0 %	385244111
625	NC_017436	GAA	2	6	29071	29076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244111
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628	NC_017436	ACA	2	6	29399	29404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385244112
629	NC_017436	ATG	2	6	29409	29414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244112
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631	NC_017436	TTTG	2	8	29566	29573	0 %	75 %	25 %	0 %	385244112
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633	NC_017436	CCTAT	2	10	29620	29629	20 %	40 %	0 %	40 %	385244112
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