MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis D-LC chromosome

Total Repeats: 22956

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_017436	TTC	2	6	227913	227918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244290
5003	NC_017436	GAA	2	6	227987	227992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244290
5004	NC_017436	TGA	2	6	228019	228024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244290
5005	NC_017436	ATT	2	6	228098	228103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385244290
5006	NC_017436	AGA	2	6	228160	228165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244290
5007	NC_017436	TC	3	6	228166	228171	0 %	50 %	0 %	50 %	385244290
5008	NC_017436	TGA	2	6	228193	228198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244290
5009	NC_017436	TCG	2	6	228282	228287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385244290
5010	NC_017436	A	7	7	228354	228360	100 %	0 %	0 %	0 %	385244290
5011	NC_017436	CCTT	2	8	228362	228369	0 %	50 %	0 %	50 %	385244290
5012	NC_017436	TTG	2	6	228384	228389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385244290
5013	NC_017436	T	6	6	228420	228425	0 %	100 %	0 %	0 %	385244290
5014	NC_017436	GATA	2	8	228457	228464	50 %	25 %	25 %	0 %	385244290
5015	NC_017436	ATT	2	6	228497	228502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385244290
5016	NC_017436	GAA	2	6	228506	228511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244290
5017	NC_017436	TCCTC	2	10	228537	228546	0 %	40 %	0 %	60 %	385244290
5018	NC_017436	AGA	2	6	228571	228576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244290
5019	NC_017436	CTT	2	6	228663	228668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244291
5020	NC_017436	TAC	2	6	228765	228770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385244291
5021	NC_017436	TAT	2	6	228774	228779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385244291
5022	NC_017436	TCT	2	6	228834	228839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244291
5023	NC_017436	TTTC	2	8	228910	228917	0 %	75 %	0 %	25 %	385244291
5024	NC_017436	CTT	2	6	228972	228977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244291
5025	NC_017436	TTA	2	6	229039	229044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385244291
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5027	NC_017436	T	6	6	229164	229169	0 %	100 %	0 %	0 %	385244291
5028	NC_017436	TAT	2	6	229239	229244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385244291
5029	NC_017436	ATT	2	6	229318	229323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385244291
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5032	NC_017436	ATT	2	6	229450	229455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385244291
5033	NC_017436	CAA	2	6	229517	229522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385244291
5034	NC_017436	TTCT	2	8	229586	229593	0 %	75 %	0 %	25 %	385244291
5035	NC_017436	ACT	2	6	229597	229602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385244291
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5038	NC_017436	TTAT	2	8	229748	229755	25 %	75 %	0 %	0 %	385244291
5039	NC_017436	CTAT	2	8	229767	229774	25 %	50 %	0 %	25 %	385244291
5040	NC_017436	TCTT	2	8	229814	229821	0 %	75 %	0 %	25 %	385244291
5041	NC_017436	TGC	2	6	229857	229862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385244291
5042	NC_017436	CTTAGC	2	12	229863	229874	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385244291
5043	NC_017436	GGA	2	6	229894	229899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385244291
5044	NC_017436	CA	3	6	229902	229907	50 %	0 %	0 %	50 %	385244291
5045	NC_017436	TGG	2	6	229966	229971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385244291
5046	NC_017436	TTGG	2	8	230010	230017	0 %	50 %	50 %	0 %	385244291
5047	NC_017436	TGG	3	9	230029	230037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385244291
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5052	NC_017436	CTA	2	6	230248	230253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385244292
5053	NC_017436	ATTT	2	8	230257	230264	25 %	75 %	0 %	0 %	385244292
5054	NC_017436	TGG	2	6	230335	230340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385244292
5055	NC_017436	AAT	3	9	230435	230443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385244292
5056	NC_017436	GAA	2	6	230534	230539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244292
5057	NC_017436	GC	3	6	230546	230551	0 %	0 %	50 %	50 %	385244292
5058	NC_017436	ATT	2	6	230594	230599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385244292
5059	NC_017436	GCA	2	6	230707	230712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385244292
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5061	NC_017436	CATC	2	8	230763	230770	25 %	25 %	0 %	50 %	385244292
5062	NC_017436	TTA	2	6	230820	230825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385244292
5063	NC_017436	TCT	3	9	230840	230848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244292
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5065	NC_017436	GCT	2	6	230975	230980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385244292
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5068	NC_017436	GC	3	6	231448	231453	0 %	0 %	50 %	50 %	385244292
5069	NC_017436	GAC	2	6	231475	231480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385244292
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5081	NC_017436	A	6	6	231887	231892	100 %	0 %	0 %	0 %	385244293
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5090	NC_017436	AAG	2	6	232385	232390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244293
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5094	NC_017436	TCA	2	6	232506	232511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385244293
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5105	NC_017436	ATT	2	6	232975	232980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385244294
5106	NC_017436	CT	3	6	233004	233009	0 %	50 %	0 %	50 %	385244294
5107	NC_017436	A	6	6	233020	233025	100 %	0 %	0 %	0 %	385244294
5108	NC_017436	CAAAA	2	10	233027	233036	80 %	0 %	0 %	20 %	385244294
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5110	NC_017436	A	8	8	233066	233073	100 %	0 %	0 %	0 %	385244294
5111	NC_017436	AGG	2	6	233099	233104	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385244294
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5113	NC_017436	A	6	6	233207	233212	100 %	0 %	0 %	0 %	385244294
5114	NC_017436	TTCT	2	8	233293	233300	0 %	75 %	0 %	25 %	385244294
5115	NC_017436	CAT	2	6	233313	233318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385244294
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5118	NC_017436	CAA	2	6	233610	233615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385244294
5119	NC_017436	TCTCT	2	10	233641	233650	0 %	60 %	0 %	40 %	385244294
5120	NC_017436	CTT	2	6	233740	233745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244294
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5122	NC_017436	TC	3	6	233883	233888	0 %	50 %	0 %	50 %	385244294
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5476	NC_017436	AATA	2	8	250468	250475	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5477	NC_017436	T	6	6	250490	250495	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5478	NC_017436	T	7	7	250509	250515	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5479	NC_017436	A	6	6	250517	250522	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5480	NC_017436	ACA	2	6	250617	250622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5482	NC_017436	AAG	2	6	250655	250660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5484	NC_017436	TTG	2	6	250694	250699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5485	NC_017436	CAAA	2	8	250858	250865	75 %	0 %	0 %	25 %	385244309
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5487	NC_017436	CAAT	2	8	250968	250975	50 %	25 %	0 %	25 %	385244309
5488	NC_017436	CTTT	3	12	251020	251031	0 %	75 %	0 %	25 %	385244309
5489	NC_017436	CGA	2	6	251062	251067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385244309
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5492	NC_017436	CTC	2	6	251114	251119	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385244309
5493	NC_017436	CAA	2	6	251158	251163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5494	NC_017436	AG	3	6	251203	251208	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5495	NC_017436	A	8	8	251209	251216	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5496	NC_017436	AAG	2	6	251227	251232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5497	NC_017436	CAT	4	12	251277	251288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385244310
5498	NC_017436	TTA	2	6	251423	251428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385244310
5499	NC_017436	CTC	2	6	251454	251459	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385244310
5500	NC_017436	AGT	2	6	251478	251483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244310

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