MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis D-LC chromosome

Total Repeats: 22956

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017436	CTG	2	6	205761	205766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385244270
4502	NC_017436	CTT	2	6	205821	205826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244270
4503	NC_017436	AGA	2	6	205840	205845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244270
4504	NC_017436	TTG	2	6	205896	205901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385244270
4505	NC_017436	GATG	2	8	205917	205924	25 %	25 %	50 %	0 %	385244270
4506	NC_017436	ATTC	2	8	205990	205997	25 %	50 %	0 %	25 %	385244270
4507	NC_017436	GCT	2	6	206000	206005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385244270
4508	NC_017436	CAA	3	9	206049	206057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385244271
4509	NC_017436	T	6	6	206060	206065	0 %	100 %	0 %	0 %	385244271
4510	NC_017436	A	6	6	206082	206087	100 %	0 %	0 %	0 %	385244271
4511	NC_017436	CT	3	6	206159	206164	0 %	50 %	0 %	50 %	385244271
4512	NC_017436	TAT	2	6	206192	206197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385244271
4513	NC_017436	AGT	2	6	206219	206224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244271
4514	NC_017436	GA	4	8	206509	206516	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_017436	T	7	7	206539	206545	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_017436	CT	4	8	206557	206564	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4517	NC_017436	A	6	6	206566	206571	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4518	NC_017436	GAA	2	6	206600	206605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244272
4519	NC_017436	TCC	2	6	206638	206643	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385244272
4520	NC_017436	AGGA	2	8	206721	206728	50 %	0 %	50 %	0 %	385244272
4521	NC_017436	TTTG	2	8	206744	206751	0 %	75 %	25 %	0 %	385244272
4522	NC_017436	GAA	2	6	206795	206800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244272
4523	NC_017436	TC	3	6	206823	206828	0 %	50 %	0 %	50 %	385244272
4524	NC_017436	ACC	2	6	206883	206888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385244272
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4527	NC_017436	ACC	2	6	206995	207000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385244272
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4529	NC_017436	ATC	2	6	207017	207022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385244272
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4531	NC_017436	TGA	2	6	207160	207165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244272
4532	NC_017436	ATT	2	6	207189	207194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385244272
4533	NC_017436	CT	3	6	207243	207248	0 %	50 %	0 %	50 %	385244272
4534	NC_017436	TTC	2	6	207332	207337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244272
4535	NC_017436	GCT	2	6	207385	207390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385244272
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4537	NC_017436	T	7	7	207422	207428	0 %	100 %	0 %	0 %	385244272
4538	NC_017436	GAA	2	6	207431	207436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244272
4539	NC_017436	A	7	7	207439	207445	100 %	0 %	0 %	0 %	385244272
4540	NC_017436	A	6	6	207447	207452	100 %	0 %	0 %	0 %	385244272
4541	NC_017436	TTC	2	6	207471	207476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244272
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4543	NC_017436	GAA	2	6	207557	207562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244272
4544	NC_017436	TTC	2	6	207577	207582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244272
4545	NC_017436	ATT	2	6	207607	207612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385244272
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4552	NC_017436	TGA	2	6	208075	208080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244272
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4555	NC_017436	TTA	2	6	208155	208160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385244273
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4558	NC_017436	GGA	2	6	208292	208297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385244273
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4606	NC_017436	TG	3	6	210550	210555	0 %	50 %	50 %	0 %	385244276
4607	NC_017436	GAAC	2	8	210691	210698	50 %	0 %	25 %	25 %	385244276
4608	NC_017436	CA	4	8	210764	210771	50 %	0 %	0 %	50 %	385244276
4609	NC_017436	T	6	6	210829	210834	0 %	100 %	0 %	0 %	385244276
4610	NC_017436	CTC	2	6	210851	210856	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385244276
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4612	NC_017436	ATAAC	2	10	210923	210932	60 %	20 %	0 %	20 %	385244276
4613	NC_017436	AGC	2	6	210960	210965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385244276
4614	NC_017436	CAT	2	6	210980	210985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385244276
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