MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis D-EC chromosome

Total Repeats: 22956

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017434	TAT	2	6	70026	70031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385243267
1502	NC_017434	CTT	2	6	70050	70055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243267
1503	NC_017434	GA	3	6	70059	70064	50 %	0 %	50 %	0 %	385243267
1504	NC_017434	CTCTT	2	10	70065	70074	0 %	60 %	0 %	40 %	385243267
1505	NC_017434	AGAA	2	8	70077	70084	75 %	0 %	25 %	0 %	385243267
1506	NC_017434	TGA	2	6	70105	70110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243267
1507	NC_017434	TTG	2	6	70194	70199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385243267
1508	NC_017434	TCT	2	6	70217	70222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243267
1509	NC_017434	GA	3	6	70258	70263	50 %	0 %	50 %	0 %	385243267
1510	NC_017434	AGCT	2	8	70299	70306	25 %	25 %	25 %	25 %	385243267
1511	NC_017434	TGA	2	6	70345	70350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243267
1512	NC_017434	GCAT	2	8	70360	70367	25 %	25 %	25 %	25 %	385243267
1513	NC_017434	AGA	2	6	70378	70383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243267
1514	NC_017434	GT	3	6	70534	70539	0 %	50 %	50 %	0 %	385243267
1515	NC_017434	CT	3	6	70615	70620	0 %	50 %	0 %	50 %	385243267
1516	NC_017434	GA	3	6	70636	70641	50 %	0 %	50 %	0 %	385243267
1517	NC_017434	AGT	2	6	70678	70683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243267
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1519	NC_017434	AAGAA	2	10	70753	70762	80 %	0 %	20 %	0 %	385243267
1520	NC_017434	AGA	2	6	70825	70830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243267
1521	NC_017434	TGA	2	6	70861	70866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243267
1522	NC_017434	TAT	2	6	70872	70877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385243267
1523	NC_017434	T	6	6	70961	70966	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_017434	T	8	8	70982	70989	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_017434	CAT	2	6	71047	71052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243268
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1527	NC_017434	GCTT	2	8	71106	71113	0 %	50 %	25 %	25 %	385243268
1528	NC_017434	A	6	6	71201	71206	100 %	0 %	0 %	0 %	385243268
1529	NC_017434	ATT	2	6	71251	71256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385243268
1530	NC_017434	CAA	2	6	71398	71403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385243268
1531	NC_017434	TCC	2	6	71422	71427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385243268
1532	NC_017434	TTCT	2	8	71444	71451	0 %	75 %	0 %	25 %	385243268
1533	NC_017434	ATG	2	6	71456	71461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243268
1534	NC_017434	GCTT	2	8	71490	71497	0 %	50 %	25 %	25 %	385243268
1535	NC_017434	AGA	2	6	71499	71504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243268
1536	NC_017434	GAGC	2	8	71518	71525	25 %	0 %	50 %	25 %	385243268
1537	NC_017434	TCA	2	6	71543	71548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243268
1538	NC_017434	A	7	7	71550	71556	100 %	0 %	0 %	0 %	385243268
1539	NC_017434	CTATTT	2	12	71561	71572	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385243268
1540	NC_017434	TGA	2	6	71595	71600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243268
1541	NC_017434	ATG	2	6	71633	71638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243268
1542	NC_017434	AGA	2	6	71763	71768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_017434	CT	3	6	71771	71776	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1544	NC_017434	CGT	2	6	71811	71816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1545	NC_017434	T	7	7	71816	71822	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_017434	CTTGC	2	10	71842	71851	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1547	NC_017434	GATA	2	8	71866	71873	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_017434	TTC	2	6	71957	71962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243269
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1550	NC_017434	ATTGG	2	10	72043	72052	20 %	40 %	40 %	0 %	385243269
1551	NC_017434	T	6	6	72059	72064	0 %	100 %	0 %	0 %	385243269
1552	NC_017434	AGC	2	6	72074	72079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243269
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1554	NC_017434	ATA	2	6	72187	72192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385243269
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1557	NC_017434	AAT	2	6	72246	72251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385243269
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1559	NC_017434	T	6	6	72284	72289	0 %	100 %	0 %	0 %	385243269
1560	NC_017434	AGC	2	6	72346	72351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243269
1561	NC_017434	TTAT	2	8	72392	72399	25 %	75 %	0 %	0 %	385243269
1562	NC_017434	TGC	2	6	72400	72405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243269
1563	NC_017434	TGT	2	6	72443	72448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385243269
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1565	NC_017434	GATT	2	8	72494	72501	25 %	50 %	25 %	0 %	385243269
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1569	NC_017434	ACTCTT	2	12	72690	72701	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	385243269
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1571	NC_017434	TGA	2	6	72728	72733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243269
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1603	NC_017434	TGC	2	6	74179	74184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243270
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1610	NC_017434	ACT	2	6	74619	74624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1611	NC_017434	T	6	6	74630	74635	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_017434	AGT	2	6	74655	74660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_017434	CAA	2	6	74681	74686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385243271
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1615	NC_017434	CCA	2	6	74782	74787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385243271
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1623	NC_017434	T	6	6	75319	75324	0 %	100 %	0 %	0 %	385243271
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