MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis D-EC chromosome

Total Repeats: 22956

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1003	NC_017434	ATGG	2	8	47365	47372	25 %	25 %	50 %	0 %	385243249
1004	NC_017434	AGGA	2	8	47396	47403	50 %	0 %	50 %	0 %	385243249
1005	NC_017434	GTT	2	6	47425	47430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385243249
1006	NC_017434	GGT	2	6	47434	47439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385243249
1007	NC_017434	T	6	6	47443	47448	0 %	100 %	0 %	0 %	385243249
1008	NC_017434	ATA	2	6	47451	47456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385243249
1009	NC_017434	AGA	2	6	47804	47809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243249
1010	NC_017434	CTG	2	6	47861	47866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243249
1011	NC_017434	GAA	2	6	47874	47879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243249
1012	NC_017434	GAAC	2	8	47943	47950	50 %	0 %	25 %	25 %	385243249
1013	NC_017434	AAGT	2	8	47978	47985	50 %	25 %	25 %	0 %	385243249
1014	NC_017434	TAA	2	6	47987	47992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385243249
1015	NC_017434	GAA	2	6	48003	48008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243249
1016	NC_017434	GAAGA	2	10	48011	48020	60 %	0 %	40 %	0 %	385243249
1017	NC_017434	AG	3	6	48043	48048	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_017434	TGT	2	6	48062	48067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_017434	CTG	2	6	48097	48102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243250
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1022	NC_017434	AACA	2	8	48187	48194	75 %	0 %	0 %	25 %	385243250
1023	NC_017434	TAG	2	6	48304	48309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243250
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1032	NC_017434	T	8	8	48608	48615	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1035	NC_017434	TAT	2	6	48791	48796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1052	NC_017434	AGA	2	6	49561	49566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_017434	CTATT	2	10	49590	49599	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1054	NC_017434	AAG	2	6	49623	49628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_017434	TCT	2	6	49637	49642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_017434	ACT	2	6	49678	49683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_017434	T	7	7	49698	49704	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1059	NC_017434	TGT	2	6	49735	49740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1062	NC_017434	CAA	2	6	49850	49855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1070	NC_017434	A	6	6	50074	50079	100 %	0 %	0 %	0 %	385243252
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1099	NC_017434	T	6	6	51432	51437	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_017434	AGT	3	9	51476	51484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_017434	GCA	2	6	51532	51537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_017434	CTG	2	6	51547	51552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_017434	GTA	2	6	51564	51569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_017434	AAG	2	6	51585	51590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_017434	A	6	6	51600	51605	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_017434	AAG	2	6	51630	51635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_017434	A	7	7	51660	51666	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1109	NC_017434	A	6	6	51708	51713	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_017434	AAG	2	6	51738	51743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_017434	A	7	7	51768	51774	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_017434	AGC	2	6	51779	51784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_017434	AAG	2	6	51846	51851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_017434	A	7	7	51876	51882	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_017434	AGC	2	6	51887	51892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_017434	CAA	2	6	51922	51927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_017434	A	7	7	51926	51932	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_017434	A	6	6	51966	51971	100 %	0 %	0 %	0 %	385243253
1119	NC_017434	GCT	2	6	52002	52007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243253
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1121	NC_017434	GAT	2	6	52129	52134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_017434	T	6	6	52173	52178	0 %	100 %	0 %	0 %	385243254
1123	NC_017434	TATT	2	8	52180	52187	25 %	75 %	0 %	0 %	385243254
1124	NC_017434	AAG	2	6	52207	52212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243254
1125	NC_017434	AAT	2	6	52234	52239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385243254
1126	NC_017434	ATT	2	6	52246	52251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385243254
1127	NC_017434	CTA	2	6	52304	52309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243254
1128	NC_017434	TGAACG	2	12	52329	52340	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385243254
1129	NC_017434	GTGATT	2	12	52348	52359	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385243254
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1131	NC_017434	T	6	6	52423	52428	0 %	100 %	0 %	0 %	385243254
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1257	NC_017434	CAA	2	6	58389	58394	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385243258
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