MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis D-EC chromosome

Total Repeats: 22956

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017434	GGTT	2	8	23094	23101	0 %	50 %	50 %	0 %	385243227
502	NC_017434	TGC	2	6	23120	23125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243227
503	NC_017434	ATT	2	6	23172	23177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385243227
504	NC_017434	AAT	2	6	23214	23219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385243227
505	NC_017434	TTG	2	6	23277	23282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385243227
506	NC_017434	TTCT	2	8	23464	23471	0 %	75 %	0 %	25 %	385243227
507	NC_017434	TGC	2	6	23528	23533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243227
508	NC_017434	TAAC	2	8	23566	23573	50 %	25 %	0 %	25 %	385243227
509	NC_017434	GCA	2	6	23634	23639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243227
510	NC_017434	CATT	2	8	23689	23696	25 %	50 %	0 %	25 %	385243227
511	NC_017434	AGA	2	6	23708	23713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243227
512	NC_017434	GAG	2	6	23731	23736	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385243227
513	NC_017434	TTC	2	6	23794	23799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243227
514	NC_017434	GGAAA	2	10	23807	23816	60 %	0 %	40 %	0 %	385243227
515	NC_017434	GA	3	6	23830	23835	50 %	0 %	50 %	0 %	385243227
516	NC_017434	GA	3	6	23922	23927	50 %	0 %	50 %	0 %	385243227
517	NC_017434	AGG	2	6	23929	23934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385243227
518	NC_017434	GAA	2	6	24053	24058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243227
519	NC_017434	GGTA	2	8	24059	24066	25 %	25 %	50 %	0 %	385243227
520	NC_017434	GTT	2	6	24147	24152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385243227
521	NC_017434	CTT	2	6	24241	24246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243227
522	NC_017434	AG	3	6	24303	24308	50 %	0 %	50 %	0 %	385243227
523	NC_017434	TAA	2	6	24314	24319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385243227
524	NC_017434	GAA	2	6	24334	24339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243227
525	NC_017434	AAG	2	6	24475	24480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243227
526	NC_017434	A	7	7	24560	24566	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_017434	TTA	2	6	24573	24578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_017434	T	9	9	24588	24596	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_017434	T	6	6	24620	24625	0 %	100 %	0 %	0 %	385243228
530	NC_017434	AGA	2	6	24747	24752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243228
531	NC_017434	TAA	2	6	24879	24884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385243228
532	NC_017434	GGA	3	9	24911	24919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385243228
533	NC_017434	GAT	2	6	24956	24961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243228
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535	NC_017434	TAGG	2	8	25278	25285	25 %	25 %	50 %	0 %	385243228
536	NC_017434	TGT	2	6	25369	25374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385243228
537	NC_017434	TTA	2	6	25379	25384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385243228
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539	NC_017434	TAG	2	6	25440	25445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243228
540	NC_017434	GTGAGG	2	12	25474	25485	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	385243228
541	NC_017434	TAGG	2	8	25516	25523	25 %	25 %	50 %	0 %	385243228
542	NC_017434	AGAGG	2	10	25532	25541	40 %	0 %	60 %	0 %	385243228
543	NC_017434	AGC	2	6	25558	25563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243228
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545	NC_017434	T	6	6	25598	25603	0 %	100 %	0 %	0 %	385243228
546	NC_017434	AAG	2	6	25704	25709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243228
547	NC_017434	GA	3	6	25720	25725	50 %	0 %	50 %	0 %	385243228
548	NC_017434	GT	3	6	25740	25745	0 %	50 %	50 %	0 %	385243228
549	NC_017434	TA	3	6	25942	25947	50 %	50 %	0 %	0 %	385243228
550	NC_017434	T	6	6	25951	25956	0 %	100 %	0 %	0 %	385243228
551	NC_017434	GAT	2	6	25963	25968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243228
552	NC_017434	TGT	2	6	26098	26103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385243228
553	NC_017434	TAG	2	6	26136	26141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243228
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555	NC_017434	GCA	2	6	26210	26215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243228
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557	NC_017434	GCTT	2	8	26288	26295	0 %	50 %	25 %	25 %	385243228
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560	NC_017434	GAA	2	6	26423	26428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243228
561	NC_017434	GAA	2	6	26430	26435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243228
562	NC_017434	CGA	2	6	26438	26443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243228
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564	NC_017434	CT	3	6	26519	26524	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
565	NC_017434	ACT	2	6	26527	26532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_017434	A	6	6	26543	26548	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_017434	T	7	7	26555	26561	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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571	NC_017434	T	7	7	26818	26824	0 %	100 %	0 %	0 %	385243229
572	NC_017434	GAA	2	6	26836	26841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243229
573	NC_017434	GGAA	2	8	26871	26878	50 %	0 %	50 %	0 %	385243229
574	NC_017434	TTAA	2	8	26944	26951	50 %	50 %	0 %	0 %	385243229
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587	NC_017434	A	7	7	27361	27367	100 %	0 %	0 %	0 %	385243229
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601	NC_017434	TAA	2	6	27880	27885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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603	NC_017434	ATTG	2	8	27938	27945	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
604	NC_017434	AG	3	6	27970	27975	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
605	NC_017434	AGA	2	6	27992	27997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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611	NC_017434	GAT	3	9	28318	28326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243231
612	NC_017434	GAG	2	6	28361	28366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385243231
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614	NC_017434	GCA	2	6	28417	28422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243231
615	NC_017434	TC	3	6	28446	28451	0 %	50 %	0 %	50 %	385243231
616	NC_017434	AGGGT	2	10	28580	28589	20 %	20 %	60 %	0 %	385243231
617	NC_017434	TTC	2	6	28616	28621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243231
618	NC_017434	CAG	2	6	28628	28633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243231
619	NC_017434	GAA	2	6	28642	28647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243231
620	NC_017434	TGA	2	6	28656	28661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243231
621	NC_017434	TTC	2	6	28689	28694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243231
622	NC_017434	GC	4	8	28860	28867	0 %	0 %	50 %	50 %	385243231
623	NC_017434	AAG	2	6	28868	28873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243231
624	NC_017434	TA	3	6	28982	28987	50 %	50 %	0 %	0 %	385243231
625	NC_017434	GAA	2	6	29071	29076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243231
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628	NC_017434	ACA	2	6	29399	29404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385243232
629	NC_017434	ATG	2	6	29409	29414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243232
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631	NC_017434	TTTG	2	8	29566	29573	0 %	75 %	25 %	0 %	385243232
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