MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis D-EC chromosome

Total Repeats: 22956

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017434	ATT	2	6	227831	227836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385243410
5002	NC_017434	TTC	2	6	227915	227920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243410
5003	NC_017434	GAA	2	6	227989	227994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243410
5004	NC_017434	TGA	2	6	228021	228026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243410
5005	NC_017434	ATT	2	6	228100	228105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385243410
5006	NC_017434	AGA	2	6	228162	228167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243410
5007	NC_017434	TC	3	6	228168	228173	0 %	50 %	0 %	50 %	385243410
5008	NC_017434	TGA	2	6	228195	228200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243410
5009	NC_017434	TCG	2	6	228284	228289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243410
5010	NC_017434	A	7	7	228356	228362	100 %	0 %	0 %	0 %	385243410
5011	NC_017434	CCTT	2	8	228364	228371	0 %	50 %	0 %	50 %	385243410
5012	NC_017434	TTG	2	6	228386	228391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385243410
5013	NC_017434	T	6	6	228422	228427	0 %	100 %	0 %	0 %	385243410
5014	NC_017434	GATA	2	8	228459	228466	50 %	25 %	25 %	0 %	385243410
5015	NC_017434	ATT	2	6	228499	228504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385243410
5016	NC_017434	GAA	2	6	228508	228513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243410
5017	NC_017434	TCCTC	2	10	228539	228548	0 %	40 %	0 %	60 %	385243410
5018	NC_017434	AGA	2	6	228573	228578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243410
5019	NC_017434	CTT	2	6	228665	228670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243411
5020	NC_017434	TAC	2	6	228767	228772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243411
5021	NC_017434	TAT	2	6	228776	228781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385243411
5022	NC_017434	TCT	2	6	228836	228841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243411
5023	NC_017434	TTTC	2	8	228912	228919	0 %	75 %	0 %	25 %	385243411
5024	NC_017434	CTT	2	6	228974	228979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243411
5025	NC_017434	TTA	2	6	229041	229046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385243411
5026	NC_017434	TGT	2	6	229097	229102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385243411
5027	NC_017434	T	6	6	229166	229171	0 %	100 %	0 %	0 %	385243411
5028	NC_017434	TAT	2	6	229241	229246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385243411
5029	NC_017434	ATT	2	6	229320	229325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385243411
5030	NC_017434	CAC	2	6	229366	229371	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385243411
5031	NC_017434	GAA	2	6	229386	229391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243411
5032	NC_017434	ATT	2	6	229452	229457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385243411
5033	NC_017434	CAA	2	6	229519	229524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385243411
5034	NC_017434	TTCT	2	8	229588	229595	0 %	75 %	0 %	25 %	385243411
5035	NC_017434	ACT	2	6	229599	229604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243411
5036	NC_017434	ATG	2	6	229641	229646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243411
5037	NC_017434	CTTC	2	8	229648	229655	0 %	50 %	0 %	50 %	385243411
5038	NC_017434	TTAT	2	8	229750	229757	25 %	75 %	0 %	0 %	385243411
5039	NC_017434	CTAT	2	8	229769	229776	25 %	50 %	0 %	25 %	385243411
5040	NC_017434	TCTT	2	8	229816	229823	0 %	75 %	0 %	25 %	385243411
5041	NC_017434	TGC	2	6	229859	229864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243411
5042	NC_017434	CTTAGC	2	12	229865	229876	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385243411
5043	NC_017434	GGA	2	6	229896	229901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385243411
5044	NC_017434	CA	3	6	229904	229909	50 %	0 %	0 %	50 %	385243411
5045	NC_017434	TGG	2	6	229968	229973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385243411
5046	NC_017434	TTGG	2	8	230012	230019	0 %	50 %	50 %	0 %	385243411
5047	NC_017434	TGG	3	9	230031	230039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385243411
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5049	NC_017434	CTT	2	6	230123	230128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243412
5050	NC_017434	AGA	2	6	230169	230174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243412
5051	NC_017434	CTT	2	6	230191	230196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243412
5052	NC_017434	CTA	2	6	230250	230255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243412
5053	NC_017434	ATTT	2	8	230259	230266	25 %	75 %	0 %	0 %	385243412
5054	NC_017434	TGG	2	6	230337	230342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385243412
5055	NC_017434	AAT	3	9	230437	230445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385243412
5056	NC_017434	GAA	2	6	230536	230541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243412
5057	NC_017434	GC	3	6	230548	230553	0 %	0 %	50 %	50 %	385243412
5058	NC_017434	ATT	2	6	230596	230601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385243412
5059	NC_017434	GCA	2	6	230709	230714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243412
5060	NC_017434	CTA	2	6	230750	230755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243412
5061	NC_017434	CATC	2	8	230765	230772	25 %	25 %	0 %	50 %	385243412
5062	NC_017434	TTA	2	6	230822	230827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385243412
5063	NC_017434	TCT	3	9	230842	230850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243412
5064	NC_017434	A	6	6	230918	230923	100 %	0 %	0 %	0 %	385243412
5065	NC_017434	GCT	2	6	230977	230982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243412
5066	NC_017434	TCT	2	6	231112	231117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243412
5067	NC_017434	T	6	6	231291	231296	0 %	100 %	0 %	0 %	385243412
5068	NC_017434	GC	3	6	231450	231455	0 %	0 %	50 %	50 %	385243412
5069	NC_017434	GAC	2	6	231477	231482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243412
5070	NC_017434	A	8	8	231519	231526	100 %	0 %	0 %	0 %	385243412
5071	NC_017434	TAA	2	6	231555	231560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385243412
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5073	NC_017434	GGA	2	6	231636	231641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385243412
5074	NC_017434	TGA	2	6	231651	231656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243412
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5081	NC_017434	A	6	6	231889	231894	100 %	0 %	0 %	0 %	385243413
5082	NC_017434	AAG	2	6	231985	231990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243413
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5088	NC_017434	C	6	6	232286	232291	0 %	0 %	0 %	100 %	385243413
5089	NC_017434	A	6	6	232326	232331	100 %	0 %	0 %	0 %	385243413
5090	NC_017434	AAG	2	6	232387	232392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243413
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5093	NC_017434	AT	3	6	232491	232496	50 %	50 %	0 %	0 %	385243413
5094	NC_017434	TCA	2	6	232508	232513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243413
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5098	NC_017434	GCTA	2	8	232720	232727	25 %	25 %	25 %	25 %	385243414
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5104	NC_017434	TA	3	6	232944	232949	50 %	50 %	0 %	0 %	385243414
5105	NC_017434	ATT	2	6	232977	232982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385243414
5106	NC_017434	CT	3	6	233006	233011	0 %	50 %	0 %	50 %	385243414
5107	NC_017434	A	6	6	233022	233027	100 %	0 %	0 %	0 %	385243414
5108	NC_017434	CAAAA	2	10	233029	233038	80 %	0 %	0 %	20 %	385243414
5109	NC_017434	AGA	2	6	233043	233048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243414
5110	NC_017434	A	8	8	233068	233075	100 %	0 %	0 %	0 %	385243414
5111	NC_017434	AGG	2	6	233101	233106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385243414
5112	NC_017434	CAG	2	6	233169	233174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243414
5113	NC_017434	A	6	6	233209	233214	100 %	0 %	0 %	0 %	385243414
5114	NC_017434	TTCT	2	8	233295	233302	0 %	75 %	0 %	25 %	385243414
5115	NC_017434	CAT	2	6	233315	233320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243414
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5117	NC_017434	CAAA	2	8	233527	233534	75 %	0 %	0 %	25 %	385243414
5118	NC_017434	CAA	2	6	233612	233617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385243414
5119	NC_017434	TCTCT	2	10	233643	233652	0 %	60 %	0 %	40 %	385243414
5120	NC_017434	CTT	2	6	233742	233747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243414
5121	NC_017434	GCT	2	6	233879	233884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243414
5122	NC_017434	TC	3	6	233885	233890	0 %	50 %	0 %	50 %	385243414
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5124	NC_017434	TCAA	2	8	234009	234016	50 %	25 %	0 %	25 %	385243414
5125	NC_017434	TTA	2	6	234098	234103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385243414
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5241	NC_017434	T	7	7	240726	240732	0 %	100 %	0 %	0 %	385243419
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5477	NC_017434	T	6	6	250492	250497	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5478	NC_017434	T	7	7	250511	250517	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5479	NC_017434	A	6	6	250519	250524	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5488	NC_017434	CTTT	3	12	251022	251033	0 %	75 %	0 %	25 %	385243429
5489	NC_017434	CGA	2	6	251064	251069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243429
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5493	NC_017434	CAA	2	6	251160	251165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5494	NC_017434	AG	3	6	251205	251210	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5495	NC_017434	A	8	8	251211	251218	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5496	NC_017434	AAG	2	6	251229	251234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5497	NC_017434	CAT	4	12	251279	251290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243430
5498	NC_017434	TTA	2	6	251425	251430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385243430
5499	NC_017434	CTC	2	6	251456	251461	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385243430
5500	NC_017434	AGT	2	6	251480	251485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243430

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