MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis G/9301 chromosome

Total Repeats: 2358

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017432	TC	3	6	225	230	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017432	AG	3	6	247	252	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017432	TC	3	6	1670	1675	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017432	AG	3	6	2153	2158	50 %	0 %	50 %	0 %	385242289
5	NC_017432	GA	3	6	2821	2826	50 %	0 %	50 %	0 %	385242289
6	NC_017432	AT	3	6	4514	4519	50 %	50 %	0 %	0 %	385242290
7	NC_017432	TC	3	6	5264	5269	0 %	50 %	0 %	50 %	385242291
8	NC_017432	GA	3	6	5275	5280	50 %	0 %	50 %	0 %	385242291
9	NC_017432	AT	3	6	5379	5384	50 %	50 %	0 %	0 %	385242291
10	NC_017432	TG	3	6	5532	5537	0 %	50 %	50 %	0 %	385242291
11	NC_017432	AG	3	6	5940	5945	50 %	0 %	50 %	0 %	385242291
12	NC_017432	GA	3	6	6998	7003	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017432	AC	3	6	7648	7653	50 %	0 %	0 %	50 %	385242293
14	NC_017432	AG	3	6	8391	8396	50 %	0 %	50 %	0 %	385242294
15	NC_017432	CT	4	8	8510	8517	0 %	50 %	0 %	50 %	385242294
16	NC_017432	GT	3	6	8592	8597	0 %	50 %	50 %	0 %	385242294
17	NC_017432	GA	3	6	9866	9871	50 %	0 %	50 %	0 %	385242296
18	NC_017432	AG	3	6	10083	10088	50 %	0 %	50 %	0 %	385242296
19	NC_017432	TA	3	6	11248	11253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017432	AG	3	6	11309	11314	50 %	0 %	50 %	0 %	385242297
21	NC_017432	TA	3	6	11869	11874	50 %	50 %	0 %	0 %	385242297
22	NC_017432	TG	3	6	12772	12777	0 %	50 %	50 %	0 %	385242298
23	NC_017432	AG	3	6	12921	12926	50 %	0 %	50 %	0 %	385242298
24	NC_017432	AG	4	8	13077	13084	50 %	0 %	50 %	0 %	385242298
25	NC_017432	TA	3	6	13339	13344	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017432	TA	4	8	13563	13570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017432	AC	3	6	14406	14411	50 %	0 %	0 %	50 %	385242299
28	NC_017432	AG	3	6	15745	15750	50 %	0 %	50 %	0 %	385242300
29	NC_017432	TC	3	6	15785	15790	0 %	50 %	0 %	50 %	385242300
30	NC_017432	GA	3	6	16314	16319	50 %	0 %	50 %	0 %	385242301
31	NC_017432	AG	3	6	16385	16390	50 %	0 %	50 %	0 %	385242301
32	NC_017432	GA	3	6	17169	17174	50 %	0 %	50 %	0 %	385242301
33	NC_017432	AG	3	6	17515	17520	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017432	GA	3	6	17528	17533	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017432	GA	3	6	17772	17777	50 %	0 %	50 %	0 %	385242302
36	NC_017432	TC	3	6	18222	18227	0 %	50 %	0 %	50 %	385242302
37	NC_017432	CT	3	6	18450	18455	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017432	TC	3	6	18650	18655	0 %	50 %	0 %	50 %	385242303
39	NC_017432	GA	3	6	18665	18670	50 %	0 %	50 %	0 %	385242303
40	NC_017432	GA	3	6	18764	18769	50 %	0 %	50 %	0 %	385242303
41	NC_017432	AG	3	6	19230	19235	50 %	0 %	50 %	0 %	385242303
42	NC_017432	AG	4	8	19516	19523	50 %	0 %	50 %	0 %	385242303
43	NC_017432	GT	3	6	19779	19784	0 %	50 %	50 %	0 %	385242303
44	NC_017432	AG	3	6	20007	20012	50 %	0 %	50 %	0 %	385242304
45	NC_017432	TG	3	6	20120	20125	0 %	50 %	50 %	0 %	385242304
46	NC_017432	AG	3	6	20516	20521	50 %	0 %	50 %	0 %	385242305
47	NC_017432	GA	3	6	20674	20679	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017432	AG	3	6	21191	21196	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017432	CT	3	6	21260	21265	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_017432	CT	4	8	21917	21924	0 %	50 %	0 %	50 %	385242306
51	NC_017432	AT	3	6	22187	22192	50 %	50 %	0 %	0 %	385242306
52	NC_017432	AT	3	6	22511	22516	50 %	50 %	0 %	0 %	385242306
53	NC_017432	GA	3	6	23830	23835	50 %	0 %	50 %	0 %	385242306
54	NC_017432	GA	3	6	23922	23927	50 %	0 %	50 %	0 %	385242306
55	NC_017432	AG	3	6	24303	24308	50 %	0 %	50 %	0 %	385242306
56	NC_017432	GA	3	6	25720	25725	50 %	0 %	50 %	0 %	385242307
57	NC_017432	GT	3	6	25740	25745	0 %	50 %	50 %	0 %	385242307
58	NC_017432	TA	3	6	25942	25947	50 %	50 %	0 %	0 %	385242307
59	NC_017432	GA	3	6	26388	26393	50 %	0 %	50 %	0 %	385242307
60	NC_017432	GA	3	6	26512	26517	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017432	CT	3	6	26519	26524	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_017432	AT	3	6	26805	26810	50 %	50 %	0 %	0 %	385242308
63	NC_017432	GA	3	6	27019	27024	50 %	0 %	50 %	0 %	385242308
64	NC_017432	TC	3	6	27887	27892	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_017432	AG	3	6	27970	27975	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017432	TG	3	6	28393	28398	0 %	50 %	50 %	0 %	385242310
67	NC_017432	TC	3	6	28446	28451	0 %	50 %	0 %	50 %	385242310
68	NC_017432	GC	4	8	28860	28867	0 %	0 %	50 %	50 %	385242310
69	NC_017432	TA	3	6	28982	28987	50 %	50 %	0 %	0 %	385242310
70	NC_017432	GA	3	6	29933	29938	50 %	0 %	50 %	0 %	385242311
71	NC_017432	AG	3	6	30031	30036	50 %	0 %	50 %	0 %	385242312
72	NC_017432	TC	3	6	30140	30145	0 %	50 %	0 %	50 %	385242312
73	NC_017432	GA	3	6	30761	30766	50 %	0 %	50 %	0 %	385242312
74	NC_017432	GA	3	6	31229	31234	50 %	0 %	50 %	0 %	385242312
75	NC_017432	AT	3	6	31370	31375	50 %	50 %	0 %	0 %	385242313
76	NC_017432	TC	3	6	31655	31660	0 %	50 %	0 %	50 %	385242314
77	NC_017432	GC	3	6	32085	32090	0 %	0 %	50 %	50 %	385242314
78	NC_017432	CT	3	6	32135	32140	0 %	50 %	0 %	50 %	385242314
79	NC_017432	AG	3	6	32267	32272	50 %	0 %	50 %	0 %	385242314
80	NC_017432	TC	3	6	33764	33769	0 %	50 %	0 %	50 %	385242316
81	NC_017432	AG	3	6	33777	33782	50 %	0 %	50 %	0 %	385242316
82	NC_017432	AG	3	6	33915	33920	50 %	0 %	50 %	0 %	385242317
83	NC_017432	GA	4	8	34607	34614	50 %	0 %	50 %	0 %	385242318
84	NC_017432	GA	4	8	34631	34638	50 %	0 %	50 %	0 %	385242318
85	NC_017432	GA	3	6	36384	36389	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017432	AT	3	6	36486	36491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017432	GA	3	6	36534	36539	50 %	0 %	50 %	0 %	385242320
88	NC_017432	CT	3	6	37018	37023	0 %	50 %	0 %	50 %	385242320
89	NC_017432	AG	3	6	37529	37534	50 %	0 %	50 %	0 %	385242320
90	NC_017432	AG	3	6	38075	38080	50 %	0 %	50 %	0 %	385242320
91	NC_017432	AG	3	6	38602	38607	50 %	0 %	50 %	0 %	385242320
92	NC_017432	CT	3	6	38753	38758	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_017432	GA	3	6	39386	39391	50 %	0 %	50 %	0 %	385242321
94	NC_017432	AG	3	6	39523	39528	50 %	0 %	50 %	0 %	385242321
95	NC_017432	AG	3	6	39623	39628	50 %	0 %	50 %	0 %	385242321
96	NC_017432	CT	3	6	40124	40129	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_017432	AG	3	6	40600	40605	50 %	0 %	50 %	0 %	385242322
98	NC_017432	GC	3	6	40649	40654	0 %	0 %	50 %	50 %	385242322
99	NC_017432	GA	3	6	40814	40819	50 %	0 %	50 %	0 %	385242322
100	NC_017432	TC	3	6	40823	40828	0 %	50 %	0 %	50 %	385242322
101	NC_017432	GC	3	6	40888	40893	0 %	0 %	50 %	50 %	385242322
102	NC_017432	GA	3	6	41028	41033	50 %	0 %	50 %	0 %	385242322
103	NC_017432	GT	3	6	41466	41471	0 %	50 %	50 %	0 %	385242323
104	NC_017432	GA	3	6	42004	42009	50 %	0 %	50 %	0 %	385242323
105	NC_017432	GA	4	8	42014	42021	50 %	0 %	50 %	0 %	385242323
106	NC_017432	AG	3	6	42250	42255	50 %	0 %	50 %	0 %	385242323
107	NC_017432	CT	3	6	42316	42321	0 %	50 %	0 %	50 %	385242324
108	NC_017432	GA	5	10	42592	42601	50 %	0 %	50 %	0 %	385242324
109	NC_017432	AC	3	6	43474	43479	50 %	0 %	0 %	50 %	385242326
110	NC_017432	TC	3	6	43643	43648	0 %	50 %	0 %	50 %	385242326
111	NC_017432	TC	3	6	43808	43813	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_017432	TA	3	6	43961	43966	50 %	50 %	0 %	0 %	385242327
113	NC_017432	TC	3	6	44873	44878	0 %	50 %	0 %	50 %	385242328
114	NC_017432	GA	3	6	45356	45361	50 %	0 %	50 %	0 %	385242329
115	NC_017432	TG	3	6	45574	45579	0 %	50 %	50 %	0 %	385242329
116	NC_017432	AG	3	6	45585	45590	50 %	0 %	50 %	0 %	385242329
117	NC_017432	AG	4	8	46026	46033	50 %	0 %	50 %	0 %	385242330
118	NC_017432	CT	3	6	46217	46222	0 %	50 %	0 %	50 %	385242330
119	NC_017432	TG	3	6	46418	46423	0 %	50 %	50 %	0 %	385242330
120	NC_017432	AG	3	6	46471	46476	50 %	0 %	50 %	0 %	385242330
121	NC_017432	AG	3	6	48043	48048	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017432	AG	3	6	49395	49400	50 %	0 %	50 %	0 %	385242332
123	NC_017432	CA	3	6	50061	50066	50 %	0 %	0 %	50 %	385242333
124	NC_017432	TG	4	8	51391	51398	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017432	TC	3	6	52856	52861	0 %	50 %	0 %	50 %	385242335
126	NC_017432	CA	3	6	52907	52912	50 %	0 %	0 %	50 %	385242335
127	NC_017432	GA	3	6	53328	53333	50 %	0 %	50 %	0 %	385242336
128	NC_017432	CT	3	6	53645	53650	0 %	50 %	0 %	50 %	385242336
129	NC_017432	CT	3	6	54308	54313	0 %	50 %	0 %	50 %	385242337
130	NC_017432	AT	3	6	55498	55503	50 %	50 %	0 %	0 %	385242337
131	NC_017432	GA	3	6	55535	55540	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017432	CT	3	6	56433	56438	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_017432	GT	3	6	56483	56488	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017432	TG	3	6	57187	57192	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017432	CT	3	6	58068	58073	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_017432	GA	3	6	59633	59638	50 %	0 %	50 %	0 %	385242340
137	NC_017432	GT	3	6	59771	59776	0 %	50 %	50 %	0 %	385242340
138	NC_017432	TC	3	6	60519	60524	0 %	50 %	0 %	50 %	385242341
139	NC_017432	GA	3	6	60747	60752	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017432	CA	3	6	61145	61150	50 %	0 %	0 %	50 %	385242342
141	NC_017432	AT	3	6	61395	61400	50 %	50 %	0 %	0 %	385242342
142	NC_017432	GA	3	6	61418	61423	50 %	0 %	50 %	0 %	385242342
143	NC_017432	GA	3	6	61544	61549	50 %	0 %	50 %	0 %	385242342
144	NC_017432	GA	3	6	62359	62364	50 %	0 %	50 %	0 %	385242342
145	NC_017432	TC	3	6	62780	62785	0 %	50 %	0 %	50 %	385242342
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