MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis G/9301 chromosome

Total Repeats: 22971

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017432	AAGA	2	8	182492	182499	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_017432	T	8	8	182516	182523	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_017432	AGAAAA	2	12	182534	182545	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_017432	A	7	7	182542	182548	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_017432	TCG	2	6	182583	182588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242443
4006	NC_017432	TGT	2	6	182595	182600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242443
4007	NC_017432	T	6	6	182613	182618	0 %	100 %	0 %	0 %	385242443
4008	NC_017432	T	7	7	182620	182626	0 %	100 %	0 %	0 %	385242443
4009	NC_017432	AAG	2	6	182673	182678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242443
4010	NC_017432	GATG	2	8	182704	182711	25 %	25 %	50 %	0 %	385242443
4011	NC_017432	TCT	2	6	182721	182726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242443
4012	NC_017432	AGG	2	6	182775	182780	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385242443
4013	NC_017432	GGA	2	6	182809	182814	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385242443
4014	NC_017432	TTGAG	2	10	182854	182863	20 %	40 %	40 %	0 %	385242443
4015	NC_017432	GAATG	2	10	182879	182888	40 %	20 %	40 %	0 %	385242443
4016	NC_017432	CT	3	6	182929	182934	0 %	50 %	0 %	50 %	385242443
4017	NC_017432	TGA	2	6	182943	182948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242443
4018	NC_017432	GA	4	8	182971	182978	50 %	0 %	50 %	0 %	385242443
4019	NC_017432	AAC	2	6	183026	183031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242443
4020	NC_017432	TGA	2	6	183045	183050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242443
4021	NC_017432	TGC	2	6	183081	183086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242443
4022	NC_017432	CCAG	2	8	183101	183108	25 %	0 %	25 %	50 %	385242443
4023	NC_017432	TTG	2	6	183110	183115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242443
4024	NC_017432	ACT	2	6	183120	183125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242443
4025	NC_017432	GAT	2	6	183149	183154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242443
4026	NC_017432	GA	3	6	183175	183180	50 %	0 %	50 %	0 %	385242443
4027	NC_017432	GCG	2	6	183183	183188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385242443
4028	NC_017432	ACT	2	6	183231	183236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242444
4029	NC_017432	TAG	2	6	183265	183270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242444
4030	NC_017432	TCGC	2	8	183363	183370	0 %	25 %	25 %	50 %	385242444
4031	NC_017432	AGA	2	6	183374	183379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242444
4032	NC_017432	GCA	2	6	183383	183388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242444
4033	NC_017432	TA	3	6	183418	183423	50 %	50 %	0 %	0 %	385242444
4034	NC_017432	GAA	2	6	183453	183458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242444
4035	NC_017432	AGA	2	6	183492	183497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242444
4036	NC_017432	GA	3	6	183531	183536	50 %	0 %	50 %	0 %	385242444
4037	NC_017432	GTT	2	6	183548	183553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242444
4038	NC_017432	GTT	2	6	183583	183588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242444
4039	NC_017432	CTT	2	6	183591	183596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242444
4040	NC_017432	GA	3	6	183634	183639	50 %	0 %	50 %	0 %	385242444
4041	NC_017432	GTT	2	6	183645	183650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242444
4042	NC_017432	GAG	2	6	183666	183671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385242444
4043	NC_017432	GAA	2	6	183686	183691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242444
4044	NC_017432	TTG	2	6	183697	183702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242444
4045	NC_017432	AGG	2	6	183736	183741	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385242444
4046	NC_017432	AGA	2	6	183832	183837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242444
4047	NC_017432	TGA	2	6	183854	183859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242444
4048	NC_017432	CAG	3	9	183927	183935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242444
4049	NC_017432	GTA	2	6	183970	183975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242444
4050	NC_017432	GTTG	2	8	184010	184017	0 %	50 %	50 %	0 %	385242444
4051	NC_017432	GGA	3	9	184025	184033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385242444
4052	NC_017432	TC	3	6	184041	184046	0 %	50 %	0 %	50 %	385242444
4053	NC_017432	ATT	2	6	184060	184065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242444
4054	NC_017432	A	7	7	184090	184096	100 %	0 %	0 %	0 %	385242444
4055	NC_017432	T	8	8	184102	184109	0 %	100 %	0 %	0 %	385242444
4056	NC_017432	ATA	2	6	184152	184157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242444
4057	NC_017432	A	6	6	184157	184162	100 %	0 %	0 %	0 %	385242444
4058	NC_017432	TAT	2	6	184233	184238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_017432	GA	3	6	184273	184278	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_017432	AGA	2	6	184315	184320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242445
4061	NC_017432	TGT	2	6	184374	184379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242445
4062	NC_017432	TCT	3	9	184443	184451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242445
4063	NC_017432	TTTC	2	8	184516	184523	0 %	75 %	0 %	25 %	385242445
4064	NC_017432	CTG	2	6	184564	184569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242445
4065	NC_017432	GGA	2	6	184591	184596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385242445
4066	NC_017432	TAG	2	6	184616	184621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242445
4067	NC_017432	AGT	2	6	184746	184751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242445
4068	NC_017432	ATCG	2	8	184773	184780	25 %	25 %	25 %	25 %	385242445
4069	NC_017432	TCA	2	6	184856	184861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242446
4070	NC_017432	GGA	2	6	184871	184876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385242446
4071	NC_017432	AGAGA	2	10	184964	184973	60 %	0 %	40 %	0 %	385242446
4072	NC_017432	GCA	2	6	185060	185065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242446
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4074	NC_017432	GAA	2	6	185426	185431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242446
4075	NC_017432	ATA	2	6	185486	185491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242446
4076	NC_017432	TCTA	2	8	185527	185534	25 %	50 %	0 %	25 %	385242446
4077	NC_017432	GTT	2	6	185595	185600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_017432	TGC	2	6	185728	185733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242447
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4080	NC_017432	AGA	2	6	185864	185869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242447
4081	NC_017432	GTT	4	12	185993	186004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_017432	T	6	6	186010	186015	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_017432	T	7	7	186018	186024	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_017432	T	6	6	186030	186035	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_017432	T	7	7	186080	186086	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_017432	A	7	7	186102	186108	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_017432	T	6	6	186125	186130	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_017432	T	7	7	186220	186226	0 %	100 %	0 %	0 %	385242448
4089	NC_017432	TCT	2	6	186244	186249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242448
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4091	NC_017432	GTC	2	6	186345	186350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242448
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4098	NC_017432	TA	3	6	186672	186677	50 %	50 %	0 %	0 %	385242448
4099	NC_017432	CTT	2	6	186693	186698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242448
4100	NC_017432	TAG	2	6	186699	186704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242448
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4103	NC_017432	GCTT	2	8	186769	186776	0 %	50 %	25 %	25 %	385242448
4104	NC_017432	CAC	2	6	186801	186806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385242448
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4107	NC_017432	TGT	2	6	186964	186969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242448
4108	NC_017432	ACGAT	2	10	187036	187045	40 %	20 %	20 %	20 %	385242448
4109	NC_017432	TTTA	2	8	187054	187061	25 %	75 %	0 %	0 %	385242448
4110	NC_017432	AAG	2	6	187065	187070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242448
4111	NC_017432	AGA	2	6	187150	187155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242448
4112	NC_017432	CTT	2	6	187187	187192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242448
4113	NC_017432	A	6	6	187205	187210	100 %	0 %	0 %	0 %	385242448
4114	NC_017432	AGG	2	6	187233	187238	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385242448
4115	NC_017432	GCTT	2	8	187261	187268	0 %	50 %	25 %	25 %	385242448
4116	NC_017432	T	7	7	187267	187273	0 %	100 %	0 %	0 %	385242448
4117	NC_017432	A	6	6	187308	187313	100 %	0 %	0 %	0 %	385242448
4118	NC_017432	GCT	2	6	187397	187402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242448
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4120	NC_017432	GCTT	2	8	187696	187703	0 %	50 %	25 %	25 %	385242448
4121	NC_017432	TAG	2	6	187734	187739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242448
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4123	NC_017432	T	7	7	187777	187783	0 %	100 %	0 %	0 %	385242448
4124	NC_017432	TTA	2	6	187807	187812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242448
4125	NC_017432	ATC	2	6	187814	187819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4126	NC_017432	CGATA	2	10	187842	187851	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4127	NC_017432	T	6	6	187855	187860	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_017432	TCC	2	6	187875	187880	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4129	NC_017432	ACA	3	9	187881	187889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4130	NC_017432	AGT	2	6	187899	187904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_017432	AAAC	2	8	187924	187931	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4132	NC_017432	TGC	2	6	187990	187995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4133	NC_017432	AGT	2	6	188058	188063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_017432	AGT	2	6	188081	188086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4135	NC_017432	TTG	2	6	188089	188094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4136	NC_017432	TAT	2	6	188169	188174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4137	NC_017432	T	6	6	188188	188193	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4138	NC_017432	GCA	2	6	188241	188246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4139	NC_017432	CTT	2	6	188256	188261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4140	NC_017432	GGAC	2	8	188283	188290	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4141	NC_017432	AAG	2	6	188393	188398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4143	NC_017432	CAT	2	6	188425	188430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4145	NC_017432	TAA	2	6	188542	188547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4146	NC_017432	TTG	2	6	188572	188577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4147	NC_017432	CTC	2	6	188646	188651	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4149	NC_017432	TAC	2	6	188773	188778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4150	NC_017432	CAT	2	6	188789	188794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4151	NC_017432	TTC	2	6	188817	188822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4152	NC_017432	GGT	2	6	188836	188841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385242449
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4158	NC_017432	G	10	10	189071	189080	0 %	0 %	100 %	0 %	385242449
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4222	NC_017432	ATTTGC	2	12	192323	192334	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385242451
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4229	NC_017432	AAGAA	2	10	192704	192713	80 %	0 %	20 %	0 %	385242452
4230	NC_017432	AAT	2	6	192714	192719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242452
4231	NC_017432	AT	3	6	192725	192730	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4232	NC_017432	TGT	2	6	192739	192744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4233	NC_017432	CTGG	2	8	192793	192800	0 %	25 %	50 %	25 %	385242453
4234	NC_017432	AAAAG	2	10	192833	192842	80 %	0 %	20 %	0 %	385242453
4235	NC_017432	T	6	6	192856	192861	0 %	100 %	0 %	0 %	385242453
4236	NC_017432	TATCA	2	10	192906	192915	40 %	40 %	0 %	20 %	385242453
4237	NC_017432	CTCA	2	8	192939	192946	25 %	25 %	0 %	50 %	385242453
4238	NC_017432	AG	3	6	192948	192953	50 %	0 %	50 %	0 %	385242453
4239	NC_017432	GATCT	2	10	193052	193061	20 %	40 %	20 %	20 %	385242453
4240	NC_017432	ATGC	2	8	193099	193106	25 %	25 %	25 %	25 %	385242454
4241	NC_017432	GTT	2	6	193107	193112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242454
4242	NC_017432	GCA	2	6	193160	193165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242454
4243	NC_017432	CTTT	2	8	193240	193247	0 %	75 %	0 %	25 %	385242454
4244	NC_017432	AAG	2	6	193287	193292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4245	NC_017432	T	6	6	193337	193342	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4246	NC_017432	ATT	2	6	193350	193355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4247	NC_017432	T	6	6	193366	193371	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4248	NC_017432	AAACAT	2	12	193413	193424	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385242455
4249	NC_017432	TTCC	2	8	193440	193447	0 %	50 %	0 %	50 %	385242455
4250	NC_017432	GAA	2	6	193449	193454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242455
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4384	NC_017432	TCTGGA	2	12	199711	199722	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385242463
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4444	NC_017432	TGC	2	6	202073	202078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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