MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis G/9301 chromosome

Total Repeats: 22971

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_017432	GCA	2	6	113597	113602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242385
2502	NC_017432	CGA	2	6	113721	113726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242385
2503	NC_017432	A	6	6	113739	113744	100 %	0 %	0 %	0 %	385242385
2504	NC_017432	GCA	2	6	113813	113818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242385
2505	NC_017432	CTA	2	6	113844	113849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242385
2506	NC_017432	TC	3	6	113871	113876	0 %	50 %	0 %	50 %	385242385
2507	NC_017432	CTC	2	6	113922	113927	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2508	NC_017432	A	7	7	113941	113947	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2509	NC_017432	A	8	8	113950	113957	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2510	NC_017432	GCTCT	2	10	113984	113993	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2511	NC_017432	ATT	2	6	114018	114023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2512	NC_017432	AGA	2	6	114046	114051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242386
2513	NC_017432	TTC	3	9	114052	114060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242386
2514	NC_017432	AG	3	6	114172	114177	50 %	0 %	50 %	0 %	385242386
2515	NC_017432	TAC	2	6	114286	114291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242386
2516	NC_017432	T	7	7	114375	114381	0 %	100 %	0 %	0 %	385242386
2517	NC_017432	CTTT	2	8	114383	114390	0 %	75 %	0 %	25 %	385242386
2518	NC_017432	ACAG	2	8	114395	114402	50 %	0 %	25 %	25 %	385242386
2519	NC_017432	T	6	6	114427	114432	0 %	100 %	0 %	0 %	385242386
2520	NC_017432	T	6	6	114457	114462	0 %	100 %	0 %	0 %	385242386
2521	NC_017432	CTG	2	6	114552	114557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242386
2522	NC_017432	TTC	2	6	114583	114588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242386
2523	NC_017432	TGTTT	2	10	114608	114617	0 %	80 %	20 %	0 %	385242386
2524	NC_017432	GA	4	8	114628	114635	50 %	0 %	50 %	0 %	385242386
2525	NC_017432	AGAA	2	8	114658	114665	75 %	0 %	25 %	0 %	385242386
2526	NC_017432	ACT	2	6	114668	114673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242386
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2530	NC_017432	AAGG	2	8	114792	114799	50 %	0 %	50 %	0 %	385242386
2531	NC_017432	GGA	2	6	114833	114838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385242386
2532	NC_017432	TCT	2	6	114843	114848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242386
2533	NC_017432	TTTG	2	8	114876	114883	0 %	75 %	25 %	0 %	385242386
2534	NC_017432	GAT	2	6	114925	114930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242386
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2536	NC_017432	TCT	2	6	115147	115152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242386
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2541	NC_017432	GGAA	2	8	115265	115272	50 %	0 %	50 %	0 %	385242386
2542	NC_017432	ACC	2	6	115300	115305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385242386
2543	NC_017432	TTG	2	6	115386	115391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242386
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2545	NC_017432	ACTTCG	2	12	115448	115459	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385242386
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2547	NC_017432	CAA	2	6	115563	115568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242386
2548	NC_017432	TTC	3	9	115612	115620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242386
2549	NC_017432	TCT	2	6	115673	115678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242386
2550	NC_017432	AAGC	2	8	115682	115689	50 %	0 %	25 %	25 %	385242386
2551	NC_017432	TATCG	2	10	115690	115699	20 %	40 %	20 %	20 %	385242386
2552	NC_017432	T	6	6	115706	115711	0 %	100 %	0 %	0 %	385242386
2553	NC_017432	ATG	2	6	115747	115752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2554	NC_017432	AGT	2	6	115781	115786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2555	NC_017432	A	6	6	115802	115807	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2556	NC_017432	TAA	2	6	115833	115838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2557	NC_017432	A	7	7	115855	115861	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2558	NC_017432	TTTTAG	2	12	115883	115894	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2559	NC_017432	TG	3	6	115899	115904	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2560	NC_017432	GGTT	2	8	116014	116021	0 %	50 %	50 %	0 %	385242387
2561	NC_017432	T	7	7	116030	116036	0 %	100 %	0 %	0 %	385242387
2562	NC_017432	GCT	2	6	116156	116161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242387
2563	NC_017432	TTTCT	2	10	116206	116215	0 %	80 %	0 %	20 %	385242387
2564	NC_017432	ACA	2	6	116243	116248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242387
2565	NC_017432	TAT	2	6	116431	116436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242387
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2567	NC_017432	TTTG	2	8	116560	116567	0 %	75 %	25 %	0 %	385242387
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2571	NC_017432	A	6	6	116700	116705	100 %	0 %	0 %	0 %	385242387
2572	NC_017432	GTTC	2	8	116756	116763	0 %	50 %	25 %	25 %	385242387
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2592	NC_017432	CAA	2	6	117544	117549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2593	NC_017432	AGA	2	6	117550	117555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2594	NC_017432	AAG	2	6	117596	117601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2595	NC_017432	TAA	2	6	117609	117614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2596	NC_017432	T	6	6	117630	117635	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2597	NC_017432	CA	3	6	117817	117822	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2598	NC_017432	ATC	2	6	117865	117870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2600	NC_017432	TAA	2	6	117936	117941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2601	NC_017432	AT	3	6	118023	118028	50 %	50 %	0 %	0 %	385242389
2602	NC_017432	T	6	6	118033	118038	0 %	100 %	0 %	0 %	385242389
2603	NC_017432	AGA	3	9	118039	118047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242389
2604	NC_017432	CTTT	2	8	118076	118083	0 %	75 %	0 %	25 %	385242389
2605	NC_017432	GTAG	2	8	118121	118128	25 %	25 %	50 %	0 %	385242389
2606	NC_017432	G	6	6	118169	118174	0 %	0 %	100 %	0 %	385242389
2607	NC_017432	T	6	6	118192	118197	0 %	100 %	0 %	0 %	385242389
2608	NC_017432	GTT	2	6	118310	118315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242389
2609	NC_017432	GA	3	6	118319	118324	50 %	0 %	50 %	0 %	385242389
2610	NC_017432	TTA	2	6	118340	118345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242389
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2612	NC_017432	A	8	8	118395	118402	100 %	0 %	0 %	0 %	385242389
2613	NC_017432	CTC	2	6	118410	118415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385242389
2614	NC_017432	AAAGA	2	10	118451	118460	80 %	0 %	20 %	0 %	385242389
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2616	NC_017432	AG	4	8	118485	118492	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2617	NC_017432	CTT	2	6	118493	118498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2618	NC_017432	TTA	2	6	118515	118520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242390
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2620	NC_017432	TTC	2	6	118706	118711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242390
2621	NC_017432	TCC	2	6	118719	118724	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385242390
2622	NC_017432	TTTA	2	8	118737	118744	25 %	75 %	0 %	0 %	385242390
2623	NC_017432	CTG	2	6	118935	118940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242390
2624	NC_017432	AGA	2	6	118964	118969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242390
2625	NC_017432	TTGCCA	2	12	118987	118998	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385242390
2626	NC_017432	GA	4	8	119010	119017	50 %	0 %	50 %	0 %	385242390
2627	NC_017432	GAA	2	6	119024	119029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242390
2628	NC_017432	TTC	2	6	119063	119068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242390
2629	NC_017432	TACT	2	8	119125	119132	25 %	50 %	0 %	25 %	385242390
2630	NC_017432	GTT	2	6	119169	119174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242390
2631	NC_017432	TAT	2	6	119204	119209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242390
2632	NC_017432	GAT	2	6	119220	119225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242390
2633	NC_017432	GAG	2	6	119251	119256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385242390
2634	NC_017432	TC	3	6	119342	119347	0 %	50 %	0 %	50 %	385242390
2635	NC_017432	AG	3	6	119445	119450	50 %	0 %	50 %	0 %	385242391
2636	NC_017432	GCTA	2	8	119467	119474	25 %	25 %	25 %	25 %	385242391
2637	NC_017432	GA	3	6	119478	119483	50 %	0 %	50 %	0 %	385242391
2638	NC_017432	AAG	2	6	119486	119491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242391
2639	NC_017432	GCT	3	9	119492	119500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242391
2640	NC_017432	GTA	2	6	119551	119556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242391
2641	NC_017432	CCA	2	6	119559	119564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385242391
2642	NC_017432	TC	3	6	119566	119571	0 %	50 %	0 %	50 %	385242391
2643	NC_017432	GCTA	2	8	119599	119606	25 %	25 %	25 %	25 %	385242391
2644	NC_017432	CGGC	2	8	119648	119655	0 %	0 %	50 %	50 %	385242391
2645	NC_017432	AGC	2	6	119689	119694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242391
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2647	NC_017432	TCC	2	6	119710	119715	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385242391
2648	NC_017432	AG	3	6	119756	119761	50 %	0 %	50 %	0 %	385242391
2649	NC_017432	GA	4	8	119799	119806	50 %	0 %	50 %	0 %	385242391
2650	NC_017432	GGC	2	6	119839	119844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385242391
2651	NC_017432	T	6	6	119938	119943	0 %	100 %	0 %	0 %	385242391
2652	NC_017432	TCT	2	6	120023	120028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242391
2653	NC_017432	GA	3	6	120132	120137	50 %	0 %	50 %	0 %	385242391
2654	NC_017432	ATC	2	6	120226	120231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242391
2655	NC_017432	TCT	2	6	120300	120305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2656	NC_017432	GA	3	6	120307	120312	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2657	NC_017432	TAT	2	6	120331	120336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2658	NC_017432	ATA	2	6	120352	120357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2659	NC_017432	CTGG	2	8	120375	120382	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2660	NC_017432	TAAAAA	2	12	120479	120490	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2661	NC_017432	TTGGTA	2	12	120527	120538	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385242392
2662	NC_017432	TG	3	6	120566	120571	0 %	50 %	50 %	0 %	385242392
2663	NC_017432	TCA	2	6	120574	120579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242392
2664	NC_017432	GAA	2	6	120598	120603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242392
2665	NC_017432	CGC	2	6	120627	120632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385242392
2666	NC_017432	TGC	2	6	120645	120650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242392
2667	NC_017432	CTG	2	6	120653	120658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242392
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2670	NC_017432	GTA	2	6	120883	120888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242392
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2675	NC_017432	CT	3	6	121191	121196	0 %	50 %	0 %	50 %	385242392
2676	NC_017432	GAA	2	6	121245	121250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242392
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2683	NC_017432	TTTC	2	8	121682	121689	0 %	75 %	0 %	25 %	385242392
2684	NC_017432	AAC	2	6	121733	121738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242392
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2689	NC_017432	GTT	2	6	121933	121938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242392
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2692	NC_017432	AGA	2	6	122025	122030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242392
2693	NC_017432	TGA	2	6	122037	122042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242392
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2695	NC_017432	TC	3	6	122103	122108	0 %	50 %	0 %	50 %	385242392
2696	NC_017432	ATC	2	6	122286	122291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242392
2697	NC_017432	AAAG	2	8	122413	122420	75 %	0 %	25 %	0 %	385242392
2698	NC_017432	GA	3	6	122433	122438	50 %	0 %	50 %	0 %	385242392
2699	NC_017432	GCTTC	2	10	122441	122450	0 %	40 %	20 %	40 %	385242392
2700	NC_017432	TCTA	2	8	122482	122489	25 %	50 %	0 %	25 %	385242392
2701	NC_017432	TA	3	6	122542	122547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2702	NC_017432	T	6	6	122588	122593	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2703	NC_017432	ACT	2	6	122643	122648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242393
2704	NC_017432	AAGGGT	2	12	122713	122724	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	385242393
2705	NC_017432	AG	3	6	122739	122744	50 %	0 %	50 %	0 %	385242393
2706	NC_017432	T	6	6	122755	122760	0 %	100 %	0 %	0 %	385242393
2707	NC_017432	AGCT	2	8	122788	122795	25 %	25 %	25 %	25 %	385242393
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2711	NC_017432	ATA	2	6	123013	123018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242393
2712	NC_017432	TAA	2	6	123142	123147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242393
2713	NC_017432	TGA	2	6	123231	123236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242393
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2717	NC_017432	AGA	2	6	123467	123472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242393
2718	NC_017432	GT	3	6	123531	123536	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2719	NC_017432	T	6	6	123575	123580	0 %	100 %	0 %	0 %	385242394
2720	NC_017432	GA	3	6	123653	123658	50 %	0 %	50 %	0 %	385242394
2721	NC_017432	GGGTTT	2	12	123676	123687	0 %	50 %	50 %	0 %	385242394
2722	NC_017432	CAA	2	6	123702	123707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242394
2723	NC_017432	GTG	2	6	123720	123725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385242394
2724	NC_017432	T	6	6	123734	123739	0 %	100 %	0 %	0 %	385242394
2725	NC_017432	TGGA	2	8	123744	123751	25 %	25 %	50 %	0 %	385242394
2726	NC_017432	GCAA	2	8	123779	123786	50 %	0 %	25 %	25 %	385242394
2727	NC_017432	TTA	2	6	123824	123829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242394
2728	NC_017432	TTA	2	6	123865	123870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242394
2729	NC_017432	GGA	2	6	123882	123887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385242394
2730	NC_017432	CTT	2	6	123909	123914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242394
2731	NC_017432	TTGCAT	2	12	123958	123969	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385242394
2732	NC_017432	A	7	7	123976	123982	100 %	0 %	0 %	0 %	385242394
2733	NC_017432	CTG	2	6	123985	123990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242394
2734	NC_017432	TGA	2	6	124012	124017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242394
2735	NC_017432	ATT	2	6	124022	124027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242394
2736	NC_017432	ATCG	2	8	124044	124051	25 %	25 %	25 %	25 %	385242394
2737	NC_017432	AG	3	6	124065	124070	50 %	0 %	50 %	0 %	385242394
2738	NC_017432	AGC	2	6	124253	124258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242394
2739	NC_017432	TGT	2	6	124280	124285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242394
2740	NC_017432	TGA	2	6	124312	124317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242394
2741	NC_017432	AAGAGA	2	12	124327	124338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242394
2742	NC_017432	TAC	2	6	124365	124370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242394
2743	NC_017432	AGA	2	6	124382	124387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242394
2744	NC_017432	TTG	2	6	124388	124393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242394
2745	NC_017432	GA	3	6	124435	124440	50 %	0 %	50 %	0 %	385242394
2746	NC_017432	TAG	2	6	124454	124459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242394
2747	NC_017432	CTTC	2	8	124461	124468	0 %	50 %	0 %	50 %	385242394
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2749	NC_017432	T	6	6	124610	124615	0 %	100 %	0 %	0 %	385242394
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2997	NC_017432	AG	3	6	135296	135301	50 %	0 %	50 %	0 %	385242402
2998	NC_017432	AAC	2	6	135332	135337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242402
2999	NC_017432	CAG	2	6	135351	135356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242402
3000	NC_017432	A	6	6	135429	135434	100 %	0 %	0 %	0 %	385242402

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