MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis G/9301 chromosome

Total Repeats: 22971

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_017432	ATGG	2	8	47365	47372	25 %	25 %	50 %	0 %	385242330
1003	NC_017432	AGGA	2	8	47396	47403	50 %	0 %	50 %	0 %	385242330
1004	NC_017432	GTT	2	6	47425	47430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242330
1005	NC_017432	GGT	2	6	47434	47439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385242330
1006	NC_017432	T	6	6	47443	47448	0 %	100 %	0 %	0 %	385242330
1007	NC_017432	ATA	2	6	47451	47456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242330
1008	NC_017432	AGA	2	6	47804	47809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242330
1009	NC_017432	CTG	2	6	47861	47866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242330
1010	NC_017432	GAA	2	6	47874	47879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242330
1011	NC_017432	AGC	2	6	47900	47905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242330
1012	NC_017432	GAAC	2	8	47943	47950	50 %	0 %	25 %	25 %	385242330
1013	NC_017432	AAGT	2	8	47978	47985	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_017432	TAA	2	6	47987	47992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_017432	GAA	2	6	48003	48008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_017432	GAAGA	2	10	48011	48020	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_017432	AG	3	6	48043	48048	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_017432	TGT	2	6	48062	48067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_017432	CTG	2	6	48097	48102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242331
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1023	NC_017432	TAG	2	6	48304	48309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242331
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1030	NC_017432	TAT	2	6	48502	48507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242331
1031	NC_017432	T	6	6	48552	48557	0 %	100 %	0 %	0 %	385242331
1032	NC_017432	T	8	8	48608	48615	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_017432	GTC	2	6	48740	48745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_017432	AAG	2	6	48762	48767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_017432	TAT	2	6	48791	48796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1052	NC_017432	AGA	2	6	49561	49566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_017432	CTATT	2	10	49590	49599	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1054	NC_017432	AAG	2	6	49623	49628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_017432	TCT	2	6	49637	49642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1057	NC_017432	T	7	7	49698	49704	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_017432	AAT	2	6	49713	49718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1062	NC_017432	CAA	2	6	49850	49855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1069	NC_017432	CA	3	6	50061	50066	50 %	0 %	0 %	50 %	385242333
1070	NC_017432	A	6	6	50074	50079	100 %	0 %	0 %	0 %	385242333
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1094	NC_017432	GCA	2	6	51169	51174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242333
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1098	NC_017432	TAA	2	6	51408	51413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_017432	T	6	6	51432	51437	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_017432	AGT	3	9	51476	51484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_017432	GCA	2	6	51532	51537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242334
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1103	NC_017432	GTA	2	6	51564	51569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242334
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1107	NC_017432	A	6	6	51660	51665	100 %	0 %	0 %	0 %	385242334
1108	NC_017432	AAG	2	6	51690	51695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242334
1109	NC_017432	A	7	7	51720	51726	100 %	0 %	0 %	0 %	385242334
1110	NC_017432	AGC	2	6	51731	51736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242334
1111	NC_017432	AAG	2	6	51798	51803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242334
1112	NC_017432	A	7	7	51828	51834	100 %	0 %	0 %	0 %	385242334
1113	NC_017432	AGC	2	6	51839	51844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242334
1114	NC_017432	CAA	2	6	51874	51879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242334
1115	NC_017432	A	7	7	51878	51884	100 %	0 %	0 %	0 %	385242334
1116	NC_017432	A	6	6	51918	51923	100 %	0 %	0 %	0 %	385242334
1117	NC_017432	GCT	2	6	51954	51959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242334
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1119	NC_017432	GAT	2	6	52081	52086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_017432	T	6	6	52125	52130	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_017432	TATT	2	8	52132	52139	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_017432	AAG	2	6	52159	52164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_017432	AAT	2	6	52186	52191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_017432	ATT	2	6	52198	52203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_017432	CTA	2	6	52256	52261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242335
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1127	NC_017432	GTGATT	2	12	52300	52311	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385242335
1128	NC_017432	GGAA	2	8	52363	52370	50 %	0 %	50 %	0 %	385242335
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1130	NC_017432	CAA	2	6	52399	52404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242335
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1143	NC_017432	T	6	6	53199	53204	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1144	NC_017432	TCT	2	6	53272	53277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242336
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1161	NC_017432	TATT	2	8	53955	53962	25 %	75 %	0 %	0 %	385242336
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1231	NC_017432	GTT	2	6	56661	56666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1232	NC_017432	T	6	6	56665	56670	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1242	NC_017432	GAA	3	9	57292	57300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1243	NC_017432	ATT	2	6	57303	57308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1244	NC_017432	T	6	6	57307	57312	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1245	NC_017432	ATT	2	6	57322	57327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1250	NC_017432	GGA	2	6	57500	57505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1251	NC_017432	GTT	2	6	57506	57511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1252	NC_017432	GCT	2	6	57545	57550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1253	NC_017432	GAT	2	6	57563	57568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1255	NC_017432	TCC	2	6	57595	57600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1256	NC_017432	AGTTGT	2	12	57659	57670	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1257	NC_017432	AGA	2	6	57730	57735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1258	NC_017432	CTA	2	6	57746	57751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1259	NC_017432	TGA	2	6	57916	57921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242339
1260	NC_017432	TGT	2	6	57988	57993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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