MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis G/9301 chromosome

Total Repeats: 22971

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017432	TGC	2	6	23120	23125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242306
502	NC_017432	ATT	2	6	23172	23177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242306
503	NC_017432	AAT	2	6	23214	23219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242306
504	NC_017432	TTG	2	6	23277	23282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242306
505	NC_017432	TTCT	2	8	23464	23471	0 %	75 %	0 %	25 %	385242306
506	NC_017432	TGC	2	6	23528	23533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242306
507	NC_017432	TAAC	2	8	23566	23573	50 %	25 %	0 %	25 %	385242306
508	NC_017432	GCA	2	6	23634	23639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242306
509	NC_017432	CATT	2	8	23689	23696	25 %	50 %	0 %	25 %	385242306
510	NC_017432	AGA	2	6	23708	23713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242306
511	NC_017432	GAG	2	6	23731	23736	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385242306
512	NC_017432	TTC	2	6	23794	23799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242306
513	NC_017432	GGAAA	2	10	23807	23816	60 %	0 %	40 %	0 %	385242306
514	NC_017432	GA	3	6	23830	23835	50 %	0 %	50 %	0 %	385242306
515	NC_017432	GA	3	6	23922	23927	50 %	0 %	50 %	0 %	385242306
516	NC_017432	GAA	2	6	24053	24058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242306
517	NC_017432	GGTA	2	8	24059	24066	25 %	25 %	50 %	0 %	385242306
518	NC_017432	GTT	2	6	24147	24152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242306
519	NC_017432	CTT	2	6	24241	24246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242306
520	NC_017432	AG	3	6	24303	24308	50 %	0 %	50 %	0 %	385242306
521	NC_017432	TAA	2	6	24314	24319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242306
522	NC_017432	GAA	2	6	24334	24339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242306
523	NC_017432	AAG	2	6	24475	24480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242306
524	NC_017432	A	7	7	24560	24566	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_017432	TTA	2	6	24573	24578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_017432	T	9	9	24588	24596	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_017432	T	6	6	24620	24625	0 %	100 %	0 %	0 %	385242307
528	NC_017432	AGA	2	6	24747	24752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242307
529	NC_017432	TAA	2	6	24879	24884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242307
530	NC_017432	GGA	3	9	24911	24919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385242307
531	NC_017432	GAT	2	6	24956	24961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242307
532	NC_017432	TTCG	2	8	25199	25206	0 %	50 %	25 %	25 %	385242307
533	NC_017432	TAGG	2	8	25278	25285	25 %	25 %	50 %	0 %	385242307
534	NC_017432	TGT	2	6	25369	25374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242307
535	NC_017432	TTA	2	6	25379	25384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242307
536	NC_017432	TTCC	2	8	25402	25409	0 %	50 %	0 %	50 %	385242307
537	NC_017432	TAG	2	6	25440	25445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242307
538	NC_017432	GTGAGG	2	12	25474	25485	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	385242307
539	NC_017432	TAGG	2	8	25516	25523	25 %	25 %	50 %	0 %	385242307
540	NC_017432	AGAGG	2	10	25532	25541	40 %	0 %	60 %	0 %	385242307
541	NC_017432	AGC	2	6	25558	25563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242307
542	NC_017432	T	6	6	25567	25572	0 %	100 %	0 %	0 %	385242307
543	NC_017432	T	6	6	25598	25603	0 %	100 %	0 %	0 %	385242307
544	NC_017432	AAG	2	6	25704	25709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242307
545	NC_017432	GA	3	6	25720	25725	50 %	0 %	50 %	0 %	385242307
546	NC_017432	GT	3	6	25740	25745	0 %	50 %	50 %	0 %	385242307
547	NC_017432	TA	3	6	25942	25947	50 %	50 %	0 %	0 %	385242307
548	NC_017432	T	6	6	25951	25956	0 %	100 %	0 %	0 %	385242307
549	NC_017432	GAT	2	6	25963	25968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242307
550	NC_017432	TGT	2	6	26098	26103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242307
551	NC_017432	TAG	2	6	26136	26141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242307
552	NC_017432	A	6	6	26195	26200	100 %	0 %	0 %	0 %	385242307
553	NC_017432	GCA	2	6	26210	26215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242307
554	NC_017432	T	6	6	26271	26276	0 %	100 %	0 %	0 %	385242307
555	NC_017432	GCTT	2	8	26288	26295	0 %	50 %	25 %	25 %	385242307
556	NC_017432	CTT	2	6	26358	26363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242307
557	NC_017432	GA	3	6	26388	26393	50 %	0 %	50 %	0 %	385242307
558	NC_017432	GAA	2	6	26423	26428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242307
559	NC_017432	GAA	2	6	26430	26435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242307
560	NC_017432	CGA	2	6	26438	26443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242307
561	NC_017432	GA	3	6	26512	26517	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
562	NC_017432	CT	3	6	26519	26524	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
563	NC_017432	ACT	2	6	26527	26532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_017432	A	6	6	26543	26548	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_017432	T	7	7	26555	26561	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_017432	AGG	3	9	26696	26704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385242308
567	NC_017432	TAA	2	6	26732	26737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242308
568	NC_017432	AT	3	6	26805	26810	50 %	50 %	0 %	0 %	385242308
569	NC_017432	T	7	7	26818	26824	0 %	100 %	0 %	0 %	385242308
570	NC_017432	GAA	2	6	26836	26841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242308
571	NC_017432	GGAA	2	8	26871	26878	50 %	0 %	50 %	0 %	385242308
572	NC_017432	TTAA	2	8	26944	26951	50 %	50 %	0 %	0 %	385242308
573	NC_017432	AAAG	2	8	26994	27001	75 %	0 %	25 %	0 %	385242308
574	NC_017432	GA	3	6	27019	27024	50 %	0 %	50 %	0 %	385242308
575	NC_017432	T	7	7	27093	27099	0 %	100 %	0 %	0 %	385242308
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580	NC_017432	GGGC	2	8	27274	27281	0 %	0 %	75 %	25 %	385242308
581	NC_017432	T	6	6	27290	27295	0 %	100 %	0 %	0 %	385242308
582	NC_017432	TGA	2	6	27303	27308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242308
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584	NC_017432	GGATA	2	10	27337	27346	40 %	20 %	40 %	0 %	385242308
585	NC_017432	A	7	7	27361	27367	100 %	0 %	0 %	0 %	385242308
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588	NC_017432	A	8	8	27495	27502	100 %	0 %	0 %	0 %	385242309
589	NC_017432	TTC	2	6	27539	27544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242309
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597	NC_017432	A	6	6	27810	27815	100 %	0 %	0 %	0 %	385242309
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599	NC_017432	TAA	2	6	27880	27885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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601	NC_017432	ATTG	2	8	27938	27945	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
602	NC_017432	AG	3	6	27970	27975	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
603	NC_017432	AGA	2	6	27992	27997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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605	NC_017432	ATCCG	2	10	28062	28071	20 %	20 %	20 %	40 %	385242310
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612	NC_017432	GCA	2	6	28417	28422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242310
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614	NC_017432	AGGGT	2	10	28580	28589	20 %	20 %	60 %	0 %	385242310
615	NC_017432	TTC	2	6	28616	28621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242310
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617	NC_017432	GAA	2	6	28642	28647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242310
618	NC_017432	TGA	2	6	28656	28661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242310
619	NC_017432	TTC	2	6	28689	28694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242310
620	NC_017432	GC	4	8	28860	28867	0 %	0 %	50 %	50 %	385242310
621	NC_017432	AAG	2	6	28868	28873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242310
622	NC_017432	TA	3	6	28982	28987	50 %	50 %	0 %	0 %	385242310
623	NC_017432	GAA	2	6	29071	29076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242310
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629	NC_017432	TTTG	2	8	29566	29573	0 %	75 %	25 %	0 %	385242311
630	NC_017432	TTGT	2	8	29601	29608	0 %	75 %	25 %	0 %	385242311
631	NC_017432	CCTAT	2	10	29620	29629	20 %	40 %	0 %	40 %	385242311
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633	NC_017432	ATC	2	6	29715	29720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242311
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