MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis G/9301 chromosome

Total Repeats: 22971

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_017432	ACA	2	6	251111	251116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242508
5502	NC_017432	CTT	2	6	251118	251123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242508
5503	NC_017432	AAG	2	6	251149	251154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242508
5504	NC_017432	GCA	2	6	251168	251173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242508
5505	NC_017432	TTG	2	6	251188	251193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5506	NC_017432	CAAA	2	8	251352	251359	75 %	0 %	0 %	25 %	385242509
5507	NC_017432	ATA	2	6	251375	251380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242509
5508	NC_017432	CAAT	2	8	251462	251469	50 %	25 %	0 %	25 %	385242509
5509	NC_017432	CTTT	3	12	251514	251525	0 %	75 %	0 %	25 %	385242509
5510	NC_017432	CGA	2	6	251556	251561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242509
5511	NC_017432	CTT	2	6	251567	251572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242509
5512	NC_017432	ACA	2	6	251589	251594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242509
5513	NC_017432	CTC	2	6	251608	251613	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5514	NC_017432	CAA	2	6	251652	251657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5515	NC_017432	AG	3	6	251697	251702	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5516	NC_017432	A	8	8	251703	251710	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5517	NC_017432	AAG	2	6	251721	251726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5518	NC_017432	CAT	4	12	251771	251782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242510
5519	NC_017432	TTA	2	6	251917	251922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242510
5520	NC_017432	CTC	2	6	251948	251953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385242510
5521	NC_017432	AGT	2	6	251972	251977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242510
5522	NC_017432	GCAG	2	8	252019	252026	25 %	0 %	50 %	25 %	385242510
5523	NC_017432	TCTT	2	8	252036	252043	0 %	75 %	0 %	25 %	385242510
5524	NC_017432	C	7	7	252048	252054	0 %	0 %	0 %	100 %	385242510
5525	NC_017432	AGA	2	6	252064	252069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242510
5526	NC_017432	CTT	2	6	252080	252085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242510
5527	NC_017432	ACA	2	6	252096	252101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242510
5528	NC_017432	TC	3	6	252138	252143	0 %	50 %	0 %	50 %	385242510
5529	NC_017432	TTG	2	6	252195	252200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242510
5530	NC_017432	TCT	2	6	252217	252222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242510
5531	NC_017432	T	7	7	252257	252263	0 %	100 %	0 %	0 %	385242510
5532	NC_017432	CAA	2	6	252274	252279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242510
5533	NC_017432	AGA	3	9	252347	252355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242510
5534	NC_017432	GGC	2	6	252358	252363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385242510
5535	NC_017432	ACA	2	6	252388	252393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242510
5536	NC_017432	CAC	2	6	252395	252400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385242510
5537	NC_017432	CAG	2	6	252401	252406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242510
5538	NC_017432	T	8	8	252470	252477	0 %	100 %	0 %	0 %	385242510
5539	NC_017432	TCC	2	6	252561	252566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5540	NC_017432	GAAA	2	8	252582	252589	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5541	NC_017432	T	7	7	252603	252609	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5542	NC_017432	GCAG	2	8	252631	252638	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5543	NC_017432	AGAA	2	8	252664	252671	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5544	NC_017432	AG	3	6	252706	252711	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5545	NC_017432	TAT	2	6	252729	252734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5546	NC_017432	ACA	2	6	252770	252775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5547	NC_017432	A	6	6	252819	252824	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_017432	TTG	2	6	252999	253004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242511
5549	NC_017432	TCT	2	6	253021	253026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242511
5550	NC_017432	TC	3	6	253068	253073	0 %	50 %	0 %	50 %	385242511
5551	NC_017432	T	7	7	253104	253110	0 %	100 %	0 %	0 %	385242511
5552	NC_017432	CCA	2	6	253117	253122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385242511
5553	NC_017432	AAC	2	6	253170	253175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242511
5554	NC_017432	AATA	2	8	253224	253231	75 %	25 %	0 %	0 %	385242511
5555	NC_017432	GCT	2	6	253234	253239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242511
5556	NC_017432	ACA	2	6	253299	253304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242511
5557	NC_017432	CCA	2	6	253331	253336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385242511
5558	NC_017432	CAA	2	6	253379	253384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242511
5559	NC_017432	CCCA	2	8	253487	253494	25 %	0 %	0 %	75 %	385242512
5560	NC_017432	CTT	2	6	253616	253621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242512
5561	NC_017432	AAT	2	6	253695	253700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242512
5562	NC_017432	CTC	2	6	253706	253711	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385242512
5563	NC_017432	ACT	2	6	253714	253719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242512
5564	NC_017432	GAA	2	6	253732	253737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242512
5565	NC_017432	CTC	2	6	253763	253768	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385242512
5566	NC_017432	GCAA	2	8	253777	253784	50 %	0 %	25 %	25 %	385242512
5567	NC_017432	AAC	2	6	253794	253799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242512
5568	NC_017432	GTT	2	6	253839	253844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242512
5569	NC_017432	AAC	2	6	253878	253883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5570	NC_017432	A	6	6	253892	253897	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5571	NC_017432	TAA	2	6	253943	253948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5572	NC_017432	TTC	2	6	253961	253966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242513
5573	NC_017432	GCT	2	6	253993	253998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242513
5574	NC_017432	T	7	7	254002	254008	0 %	100 %	0 %	0 %	385242513
5575	NC_017432	AGCA	2	8	254039	254046	50 %	0 %	25 %	25 %	385242513
5576	NC_017432	CTT	2	6	254056	254061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242513
5577	NC_017432	TCT	3	9	254067	254075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242513
5578	NC_017432	GATAA	2	10	254095	254104	60 %	20 %	20 %	0 %	385242513
5579	NC_017432	TCG	2	6	254161	254166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242513
5580	NC_017432	CATA	2	8	254182	254189	50 %	25 %	0 %	25 %	385242513
5581	NC_017432	TCC	2	6	254201	254206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385242513
5582	NC_017432	TAA	2	6	254234	254239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242513
5583	NC_017432	AG	3	6	254259	254264	50 %	0 %	50 %	0 %	385242513
5584	NC_017432	A	6	6	254278	254283	100 %	0 %	0 %	0 %	385242513
5585	NC_017432	AGA	2	6	254289	254294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242513
5586	NC_017432	CAC	2	6	254296	254301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385242513
5587	NC_017432	CAA	2	6	254342	254347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242513
5588	NC_017432	GTA	2	6	254364	254369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242513
5589	NC_017432	ACA	2	6	254423	254428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242513
5590	NC_017432	A	8	8	254463	254470	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5591	NC_017432	TA	3	6	254512	254517	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5592	NC_017432	CCAA	2	8	254547	254554	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5593	NC_017432	A	7	7	254571	254577	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5594	NC_017432	TAT	2	6	254590	254595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242514
5595	NC_017432	TTCA	2	8	254622	254629	25 %	50 %	0 %	25 %	385242514
5596	NC_017432	AGA	2	6	254658	254663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242514
5597	NC_017432	TGTT	2	8	254696	254703	0 %	75 %	25 %	0 %	385242514
5598	NC_017432	CGA	2	6	254817	254822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242514
5599	NC_017432	GCAAA	2	10	254829	254838	60 %	0 %	20 %	20 %	385242514
5600	NC_017432	AATA	2	8	254915	254922	75 %	25 %	0 %	0 %	385242514
5601	NC_017432	A	6	6	254981	254986	100 %	0 %	0 %	0 %	385242514
5602	NC_017432	A	7	7	255012	255018	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5603	NC_017432	ATA	2	6	255025	255030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5604	NC_017432	AACCCT	2	12	255071	255082	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
5605	NC_017432	AAAC	2	8	255154	255161	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5606	NC_017432	AAG	2	6	255278	255283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242515
5607	NC_017432	AGC	2	6	255312	255317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242515
5608	NC_017432	CAAT	2	8	255418	255425	50 %	25 %	0 %	25 %	385242515
5609	NC_017432	TTA	2	6	255490	255495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242515
5610	NC_017432	CTTCT	2	10	255522	255531	0 %	60 %	0 %	40 %	385242515
5611	NC_017432	T	6	6	255565	255570	0 %	100 %	0 %	0 %	385242515
5612	NC_017432	CA	3	6	255624	255629	50 %	0 %	0 %	50 %	385242515
5613	NC_017432	AAT	2	6	255639	255644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242515
5614	NC_017432	GCA	2	6	255649	255654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242515
5615	NC_017432	ACA	2	6	255715	255720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242515
5616	NC_017432	TTG	2	6	255779	255784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242515
5617	NC_017432	AGA	2	6	255834	255839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242515
5618	NC_017432	TAG	2	6	255854	255859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242515
5619	NC_017432	ATTTTT	2	12	255875	255886	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5620	NC_017432	GAG	2	6	256003	256008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5621	NC_017432	ATT	2	6	256015	256020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242516
5622	NC_017432	T	6	6	256019	256024	0 %	100 %	0 %	0 %	385242516
5623	NC_017432	ACG	2	6	256025	256030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242516
5624	NC_017432	CCTGCA	2	12	256036	256047	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	385242516
5625	NC_017432	CTG	2	6	256093	256098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242516
5626	NC_017432	TTG	2	6	256124	256129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242516
5627	NC_017432	TCTG	2	8	256149	256156	0 %	50 %	25 %	25 %	385242516
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5753	NC_017432	TGT	2	6	261893	261898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242521
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