MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis E/11023 chromosome

Total Repeats: 322

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017431	GAAGGA	2	12	760	771	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017431	AAAGCT	2	12	4941	4952	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385241363
3	NC_017431	CAAAAA	2	12	6250	6261	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_017431	TAGCAA	2	12	10829	10840	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385241370
5	NC_017431	AAAGCT	2	12	10960	10971	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385241370
6	NC_017431	TAGTGA	2	12	12106	12117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385241371
7	NC_017431	GTTCCT	2	12	19391	19402	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	385241377
8	NC_017431	CTTTTT	2	12	21545	21556	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385241379
9	NC_017431	GTGAGG	2	12	25475	25486	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	385241380
10	NC_017431	GGATTT	2	12	35952	35963	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385241392
11	NC_017431	AATTAG	2	12	37373	37384	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385241393
12	NC_017431	TTCCTG	2	12	37672	37683	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	385241393
13	NC_017431	TTTTGA	2	12	44980	44991	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385241401
14	NC_017431	TAGCAT	2	12	48622	48633	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_017431	TGAACG	2	12	52443	52454	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385241408
16	NC_017431	GTGATT	2	12	52462	52473	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385241408
17	NC_017431	GATCTG	2	12	55095	55106	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385241410
18	NC_017431	GTGTAA	2	12	55143	55154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385241410
19	NC_017431	GGTTCA	2	12	55232	55243	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385241410
20	NC_017431	CCAAGA	2	12	57664	57675	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017431	AGTTGT	2	12	57770	57781	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017431	TCCTAA	2	12	59500	59511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385241413
23	NC_017431	AAAAAT	2	12	60995	61006	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017431	GTTCTT	2	12	63414	63425	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	385241415
25	NC_017431	CTATTT	2	12	71736	71747	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385241422
26	NC_017431	ACTCTT	2	12	72865	72876	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	385241424
27	NC_017431	TTTCTG	2	12	73415	73426	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	385241425
28	NC_017431	GATCAT	2	12	73545	73556	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385241425
29	NC_017431	TAGTAC	2	12	76539	76550	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385241426
30	NC_017431	ATCTAG	2	12	76718	76729	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_017431	GGTTTA	2	12	80190	80201	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385241430
32	NC_017431	GTCTGT	2	12	83234	83245	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	385241433
33	NC_017431	TTCTGA	2	12	88848	88859	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385241437
34	NC_017431	AAAAGA	2	12	93911	93922	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385241443
35	NC_017431	AGCTGT	2	12	96005	96016	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385241444
36	NC_017431	TCTTTT	2	12	96664	96675	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385241446
37	NC_017431	GGGGCT	2	12	97612	97623	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	385241446
38	NC_017431	TTTGAG	2	12	99816	99827	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385241448
39	NC_017431	TCAGAA	2	12	106457	106468	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385241453
40	NC_017431	CATAAC	2	12	109501	109512	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385241456
41	NC_017431	TGTTCT	2	12	112268	112279	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	385241458
42	NC_017431	ACTTCG	2	12	115561	115572	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385241460
43	NC_017431	TTTTAG	2	12	115996	116007	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017431	TAAAAA	2	12	120593	120604	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017431	TTGGTA	2	12	120641	120652	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385241467
46	NC_017431	AGGATC	2	12	121020	121031	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385241467
47	NC_017431	AAGGGT	2	12	122827	122838	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	385241468
48	NC_017431	GGGTTT	2	12	123790	123801	0 %	50 %	50 %	0 %	385241469
49	NC_017431	TTGCAT	2	12	124072	124083	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385241469
50	NC_017431	AAGAGA	2	12	124441	124452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241469
51	NC_017431	TTAAAA	2	12	133377	133388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385241476
52	NC_017431	AGGTTG	2	12	134619	134630	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	385241477
53	NC_017431	GAGTTA	2	12	139670	139681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385241486
54	NC_017431	TGGAAT	2	12	143098	143109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385241491
55	NC_017431	ATGGTT	2	12	143342	143353	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385241491
56	NC_017431	TGCTCT	2	12	145533	145544	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	385241494
57	NC_017431	GAAAGG	2	12	149271	149282	50 %	0 %	50 %	0 %	385241496
58	NC_017431	GCTTTG	2	12	149514	149525	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	385241496
59	NC_017431	TGTGCG	2	12	153636	153647	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	385241500
60	NC_017431	CCTCAT	2	12	154934	154945	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	385241501
61	NC_017431	TGGAGA	2	12	156392	156403	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	385241503
62	NC_017431	CTCCAT	2	12	157761	157772	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	385241504
63	NC_017431	TCCTTG	2	12	158357	158368	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	385241505
64	NC_017431	AACAGC	2	12	160993	161004	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385241508
65	NC_017431	AAAAAG	2	12	173583	173594	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385241515
66	NC_017431	AGAAAA	2	12	182210	182221	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017431	ACTTCT	2	12	189270	189281	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	385241528
68	NC_017431	ATTTGC	2	12	191963	191974	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385241529
69	NC_017431	AAACAT	2	12	193053	193064	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385241533
70	NC_017431	AGCAAC	2	12	193388	193399	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385241533
71	NC_017431	TATGAA	2	12	194982	194993	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017431	TCTGGA	2	12	199658	199669	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385241540
73	NC_017431	CTGGAT	2	12	215251	215262	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385241553
74	NC_017431	GAAATA	2	12	215574	215585	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385241553
75	NC_017431	TTTTAC	2	12	221267	221278	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_017431	GATGCA	2	12	222428	222439	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385241560
77	NC_017431	ACTCCA	2	12	223318	223329	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	385241561
78	NC_017431	CTGCTT	2	12	223550	223561	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	385241561
79	NC_017431	ATTGCT	2	12	226859	226870	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385241564
80	NC_017431	TCCTAG	2	12	227149	227160	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385241564
81	NC_017431	GCAACG	2	12	227637	227648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385241565
82	NC_017431	CTTAGC	2	12	230270	230281	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385241567
83	NC_017431	TTCCTT	2	12	237102	237113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241572
84	NC_017431	TCTCCT	2	12	239983	239994	0 %	50 %	0 %	50 %	385241573
85	NC_017431	AAACCA	2	12	240558	240569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385241574
86	NC_017431	AACCCT	2	12	254984	254995	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_017431	ATTTTT	2	12	255779	255790	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017431	CCTGCA	2	12	255940	255951	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	385241593
89	NC_017431	ACCTTT	2	12	261135	261146	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	385241598
90	NC_017431	TCATAA	2	12	268979	268990	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385241606
91	NC_017431	AAGTGT	2	12	269705	269716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385241606
92	NC_017431	AGGAGA	2	12	270878	270889	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017431	ATCTAA	2	12	272983	272994	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385241609
94	NC_017431	TGGAAT	2	12	275181	275192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385241611
95	NC_017431	GGAACA	2	12	279068	279079	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	385241613
96	NC_017431	ATATTA	2	12	279776	279787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017431	CACGCG	2	12	281441	281452	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	385241615
98	NC_017431	TTTCTT	2	12	281620	281631	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385241615
99	NC_017431	CTCCTA	2	12	285782	285793	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	385241618
100	NC_017431	GCAATG	2	12	291901	291912	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385241624
101	NC_017431	CGACAT	2	12	292574	292585	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385241626
102	NC_017431	CCCTTA	2	12	294028	294039	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	385241628
103	NC_017431	AAAATA	2	12	296126	296137	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385241630
104	NC_017431	ACCACT	2	12	298481	298492	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	385241632
105	NC_017431	CATTGC	2	12	301727	301738	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385241635
106	NC_017431	CCAAAA	2	12	302906	302917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385241636
107	NC_017431	TCTTTT	2	12	304791	304802	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385241638
108	NC_017431	CAAGAC	2	12	305882	305893	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385241639
109	NC_017431	AGCTTA	2	12	307163	307174	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385241641
110	NC_017431	CAAAGA	2	12	312548	312559	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	385241646
111	NC_017431	ATGGCT	2	12	313164	313175	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385241647
112	NC_017431	TACAAA	2	12	317354	317365	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385241650
113	NC_017431	TTAATT	2	12	319033	319044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385241652
114	NC_017431	AAAAAT	2	12	322126	322137	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385241654
115	NC_017431	AAAACA	2	12	322518	322529	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	385241655
116	NC_017431	AAAAAG	2	12	323944	323955	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017431	CAGAAC	2	12	344503	344514	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385241673
118	NC_017431	ATTCAA	2	12	349481	349492	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385241678
119	NC_017431	AGAATA	2	12	361438	361449	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017431	TTCTTA	2	12	361458	361469	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385241686
121	NC_017431	CAGCCT	2	12	373521	373532	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	385241700
122	NC_017431	AGCTGA	2	12	373571	373582	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385241700
123	NC_017431	ATGCTA	2	12	377438	377449	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385241702
124	NC_017431	CAATAG	2	12	384044	384055	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385241705
125	NC_017431	ACTGAA	2	12	384185	384196	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385241705
126	NC_017431	CTGCAC	2	12	384378	384389	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	385241705
127	NC_017431	TCCATA	2	12	394737	394748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385241714
128	NC_017431	TTAGGT	2	12	396095	396106	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385241716
129	NC_017431	AGGGAA	2	12	397421	397432	50 %	0 %	50 %	0 %	385241717
130	NC_017431	CTGAAG	2	12	398256	398267	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385241718
131	NC_017431	TAATCT	2	12	403673	403684	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385241721
132	NC_017431	GAACAA	2	12	404175	404186	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	385241722
133	NC_017431	CTAAAG	2	12	404558	404569	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385241723
134	NC_017431	CCTTTC	2	12	405722	405733	0 %	50 %	0 %	50 %	385241724
135	NC_017431	TTTTAA	2	12	409586	409597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017431	ACATGC	2	12	415263	415274	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385241735
137	NC_017431	GGCTCT	2	12	415998	416009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385241736
138	NC_017431	ATCTTG	2	12	417592	417603	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385241737
139	NC_017431	CCCCCA	2	12	418927	418938	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	385241738
140	NC_017431	TTCCTC	2	12	422992	423003	0 %	50 %	0 %	50 %	385241742
141	NC_017431	CTCTAC	2	12	426240	426251	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	385241744
142	NC_017431	ACATCA	2	12	426885	426896	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385241745
143	NC_017431	CGGAAT	2	12	427147	427158	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385241746
144	NC_017431	AGCTAA	2	12	431426	431437	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385241749
145	NC_017431	TTCTCC	2	12	443471	443482	0 %	50 %	0 %	50 %	385241759
146	NC_017431	ATGAAG	2	12	452518	452529	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385241767
147	NC_017431	TAACTC	2	12	453035	453046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385241767
148	NC_017431	ATCCGC	2	12	453960	453971	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	385241767
149	NC_017431	CTGTAT	2	12	455310	455321	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385241768
150	NC_017431	CTAAAG	2	12	456378	456389	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385241768
151	NC_017431	CCAATA	2	12	461363	461374	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385241772
152	NC_017431	ATCGGC	2	12	467210	467221	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385241780
153	NC_017431	TATTGG	2	12	467803	467814	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385241780
154	NC_017431	AAATAC	2	12	478147	478158	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385241784
155	NC_017431	TCTTCA	2	12	480586	480597	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	385241785
156	NC_017431	CTACAA	2	12	484391	484402	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385241785
157	NC_017431	CCAATC	2	12	488859	488870	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	385241789
158	NC_017431	TTCTTT	2	12	492680	492691	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385241796
159	NC_017431	CTGAAG	2	12	495739	495750	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385241798
160	NC_017431	TGAGTA	2	12	496193	496204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385241798
161	NC_017431	AAACTG	2	12	499640	499651	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385241802
162	NC_017431	TAACTA	2	12	503163	503174	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
163	NC_017431	AAGAAA	2	12	503176	503187	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
164	NC_017431	GGTAAT	2	12	507981	507992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385241811
165	NC_017431	AGTTTT	2	12	508989	509000	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385241813
166	NC_017431	AGAATA	2	12	509154	509165	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
167	NC_017431	GGTTGT	2	12	511118	511129	0 %	50 %	50 %	0 %	385241815
168	NC_017431	AACTAA	2	12	514891	514902	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
169	NC_017431	TCTCTA	2	12	516977	516988	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	385241821
170	NC_017431	TGAACT	2	12	517485	517496	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385241821
171	NC_017431	TAATTC	2	12	518815	518826	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385241822
172	NC_017431	ACTCCT	2	12	519084	519095	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	385241822
173	NC_017431	GATGAA	2	12	519604	519615	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385241822
174	NC_017431	CAAAGC	2	12	523964	523975	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385241824
175	NC_017431	CAGGAA	2	12	526953	526964	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	385241830
176	NC_017431	ACTGTA	2	12	531739	531750	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385241834
177	NC_017431	AGCCAC	2	12	531774	531785	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	385241834
178	NC_017431	AATGTC	2	12	532951	532962	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385241834
179	NC_017431	CAAATC	2	12	535419	535430	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385241836
180	NC_017431	AGGGAA	2	12	539860	539871	50 %	0 %	50 %	0 %	385241841
181	NC_017431	AAAGAA	2	12	541716	541727	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385241844
182	NC_017431	CTTCCT	2	12	542365	542376	0 %	50 %	0 %	50 %	385241845
183	NC_017431	ACAAGA	2	12	543868	543879	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	385241846
184	NC_017431	TAATTG	2	12	545914	545925	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385241849
185	NC_017431	TCCCTC	2	12	548780	548791	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
186	NC_017431	ATTACA	2	12	550960	550971	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385241853
187	NC_017431	CGGAAA	2	12	556446	556457	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	385241858
188	NC_017431	ATATAG	2	12	556917	556928	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385241858
189	NC_017431	GCATAG	2	12	559951	559962	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385241862
190	NC_017431	TTTCAA	2	12	561123	561134	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385241865
191	NC_017431	CAAAAA	2	12	561502	561513	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	385241865
192	NC_017431	AGATCC	2	12	564333	564344	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385241868
193	NC_017431	AAAAAT	2	12	566752	566763	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
194	NC_017431	TTTTGC	2	12	573620	573631	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	385241876
195	NC_017431	TCATAT	2	12	577718	577729	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385241880
196	NC_017431	TGGAGA	2	12	578986	578997	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	385241880
197	NC_017431	CTCCAT	2	12	579509	579520	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	385241881
198	NC_017431	TTCAAA	2	12	585855	585866	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385241889
199	NC_017431	TTTGTT	2	12	586637	586648	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	385241891
200	NC_017431	TCTCCG	2	12	595348	595359	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	385241908
201	NC_017431	CAGCCG	2	12	597714	597725	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	385241911
202	NC_017431	CTGATA	2	12	600977	600988	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385241915
203	NC_017431	CTGCTC	2	12	601025	601036	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	385241915
204	NC_017431	AGTCCA	2	12	602937	602948	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385241916
205	NC_017431	TAGGGG	2	12	605905	605916	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
206	NC_017431	CAAAGA	2	12	606719	606730	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	385241921
207	NC_017431	CCAAAA	2	12	610226	610237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385241925
208	NC_017431	GGATGG	2	12	611998	612009	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	385241926
209	NC_017431	CGATAT	3	18	614326	614343	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385241927
210	NC_017431	TCTTTT	2	12	617890	617901	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
211	NC_017431	ACTGTA	2	12	619582	619593	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385241931
212	NC_017431	CACTCT	2	12	619898	619909	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	385241931
213	NC_017431	CCTTAG	2	12	623684	623695	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385241936
214	NC_017431	AACCTC	2	12	631749	631760	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	385241940
215	NC_017431	CTCTTT	2	12	638761	638772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241950
216	NC_017431	ATATCC	2	12	638778	638789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385241950
217	NC_017431	TAAACA	2	12	638889	638900	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385241950
218	NC_017431	ATAAAC	2	12	642600	642611	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385241955
219	NC_017431	ATCTTG	2	12	643293	643304	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385241955
220	NC_017431	TTAAAT	2	12	646063	646074	50 %	50 %	0 %	0 %	385241957
221	NC_017431	TTATTT	2	12	649102	649113	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
222	NC_017431	GCTTCT	2	12	650455	650466	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	385241961
223	NC_017431	TAGGAG	2	12	651422	651433	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	385241961
224	NC_017431	CCAAGC	2	12	652302	652313	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	385241962
225	NC_017431	CACAGG	2	12	653415	653426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385241963
226	NC_017431	AGAAAG	2	12	669565	669576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241973
227	NC_017431	AGCTGG	2	12	687608	687619	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385241991
228	NC_017431	GCATCA	2	12	689450	689461	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385241992
229	NC_017431	ATCAAT	2	12	693775	693786	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385241996
230	NC_017431	CCGCAA	2	12	698655	698666	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	385242001
231	NC_017431	TGCTTG	2	12	700929	700940	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	385242002
232	NC_017431	AAATGC	2	12	704612	704623	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385242003
233	NC_017431	GAAAGA	2	12	706730	706741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242004
234	NC_017431	TCTTGA	2	12	711841	711852	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385242009
235	NC_017431	TATCCA	2	12	722024	722035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242021
236	NC_017431	GAGAGG	2	12	730651	730662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385242026
237	NC_017431	GCGATT	2	12	733594	733605	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385242027
238	NC_017431	TATTGA	2	12	737920	737931	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385242030
239	NC_017431	TGTGAT	2	12	746218	746229	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385242038
240	NC_017431	TATTTT	2	12	755051	755062	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
241	NC_017431	GGGAAG	2	12	759173	759184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385242051
242	NC_017431	GGAAGA	2	12	762839	762850	50 %	0 %	50 %	0 %	385242053
243	NC_017431	ATGCAA	2	12	765151	765162	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385242057
244	NC_017431	GAGAAA	2	12	765380	765391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242057
245	NC_017431	TATATT	2	12	770817	770828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242062
246	NC_017431	CAATTA	2	12	778476	778487	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385242069
247	NC_017431	TAGCTG	2	12	779594	779605	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385242070
248	NC_017431	ATGAAG	2	12	784241	784252	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385242071
249	NC_017431	ATTAGG	2	12	790025	790036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242077
250	NC_017431	TAAACC	2	12	790864	790875	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385242078
251	NC_017431	CCCTGA	2	12	793021	793032	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	385242080
252	NC_017431	AGAATT	2	12	795943	795954	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385242083
253	NC_017431	AAGCTC	2	12	796182	796193	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385242083
254	NC_017431	TTTCTT	2	12	799048	799059	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385242085
255	NC_017431	AGAAAT	2	12	802238	802249	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385242088
256	NC_017431	GAAATT	2	12	803851	803862	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385242090
257	NC_017431	GCTGAG	2	12	804533	804544	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385242090
258	NC_017431	TTTTCT	2	12	804966	804977	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
259	NC_017431	TAGCCT	2	12	807480	807491	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385242091
260	NC_017431	ATTTTT	2	12	808745	808756	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
261	NC_017431	AAGAGG	2	12	827921	827932	50 %	0 %	50 %	0 %	385242106
262	NC_017431	GAAAGG	2	12	832798	832809	50 %	0 %	50 %	0 %	385242112
263	NC_017431	AGCTTC	2	12	834252	834263	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385242113
264	NC_017431	ATTTTT	2	12	835224	835235	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
265	NC_017431	ATCACA	2	12	838357	838368	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385242119
266	NC_017431	GATCCG	2	12	842966	842977	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385242123
267	NC_017431	TTATGC	2	12	849904	849915	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385242129
268	NC_017431	ATGGGG	2	12	852938	852949	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	385242132
269	NC_017431	AAAGAA	2	12	853417	853428	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385242132
270	NC_017431	GGCTAG	2	12	853800	853811	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385242132
271	NC_017431	GAGAAA	2	12	853847	853858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242132
272	NC_017431	TAAGGA	2	12	856188	856199	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
273	NC_017431	CCGGAG	2	12	857106	857117	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
274	NC_017431	CTTCTA	2	12	861037	861048	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	385242134
275	NC_017431	CTTTTT	2	12	861721	861732	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385242135
276	NC_017431	GACCTG	2	12	866682	866693	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385242139
277	NC_017431	CCTCTA	2	12	870257	870268	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
278	NC_017431	TAAGGA	2	12	878239	878250	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
279	NC_017431	CCGGAG	2	12	879157	879168	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
280	NC_017431	TTTTCT	2	12	889539	889550	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385242152
281	NC_017431	CTGTTC	2	12	889852	889863	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	385242152
282	NC_017431	GTTTTT	2	12	890506	890517	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	385242153
283	NC_017431	GTGTAT	2	12	891418	891429	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385242154
284	NC_017431	TATTGG	2	12	895491	895502	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385242158
285	NC_017431	CCAACG	2	12	897819	897830	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	385242158
286	NC_017431	TCCAGA	2	12	900457	900468	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385242162
287	NC_017431	TTTTGG	2	12	905661	905672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242166
288	NC_017431	CAATTT	2	12	906328	906339	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385242168
289	NC_017431	ATCGCC	2	12	906599	906610	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	385242168
290	NC_017431	GACGGC	2	12	921581	921592	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
291	NC_017431	CTTCTC	2	12	922490	922501	0 %	50 %	0 %	50 %	385242184
292	NC_017431	AAACAA	2	12	923269	923280	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
293	NC_017431	GAGCAA	2	12	925093	925104	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	385242189
294	NC_017431	ATAGGG	2	12	945852	945863	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	385242208
295	NC_017431	CGGAGG	2	12	946173	946184	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	385242209
296	NC_017431	GGATTA	2	12	956088	956099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242216
297	NC_017431	GAAAAA	2	12	956634	956645	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385242216
298	NC_017431	TTAAAA	2	12	960522	960533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242220
299	NC_017431	GCTATT	2	12	968142	968153	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385242228
300	NC_017431	CAAATG	2	12	970675	970686	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385242229
301	NC_017431	GGCTGG	2	12	981786	981797	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	385242238
302	NC_017431	ACAGGA	2	12	981898	981909	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	385242238
303	NC_017431	TTAAGC	2	12	982947	982958	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385242239
304	NC_017431	CAGGGA	2	12	991919	991930	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	385242247
305	NC_017431	CTCCAT	2	12	994443	994454	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	385242248
306	NC_017431	TCAGTA	2	12	995631	995642	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385242249
307	NC_017431	CAGAAT	2	12	996904	996915	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385242252
308	NC_017431	TACTAG	2	12	997417	997428	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385242252
309	NC_017431	TAATGT	2	12	998795	998806	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385242256
310	NC_017431	AATTAA	2	12	1007143	1007154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242264
311	NC_017431	GCAATA	2	12	1008089	1008100	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385242264
312	NC_017431	CTTTAT	2	12	1011482	1011493	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385242266
313	NC_017431	AGCTGG	2	12	1011910	1011921	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385242266
314	NC_017431	TTGTAA	2	12	1014779	1014790	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
315	NC_017431	CGTTGA	2	12	1024089	1024100	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385242276
316	NC_017431	GAAAAA	2	12	1029021	1029032	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385242278
317	NC_017431	TTTCTT	2	12	1029685	1029696	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385242279
318	NC_017431	GTTTCC	2	12	1030972	1030983	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	385242279
319	NC_017431	CAGCAC	2	12	1035866	1035877	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	385242281
320	NC_017431	GTAATA	2	12	1036031	1036042	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385242281
321	NC_017431	ACCATC	2	12	1036773	1036784	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	385242281
322	NC_017431	TAAAAT	2	12	1042382	1042393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.