MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis E/11023 chromosome

Total Repeats: 22973

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_017431	AGA	2	6	114159	114164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241460
2502	NC_017431	TTC	3	9	114165	114173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241460
2503	NC_017431	AG	3	6	114285	114290	50 %	0 %	50 %	0 %	385241460
2504	NC_017431	TAC	2	6	114399	114404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385241460
2505	NC_017431	T	7	7	114488	114494	0 %	100 %	0 %	0 %	385241460
2506	NC_017431	CTTT	2	8	114496	114503	0 %	75 %	0 %	25 %	385241460
2507	NC_017431	ACAG	2	8	114508	114515	50 %	0 %	25 %	25 %	385241460
2508	NC_017431	T	6	6	114540	114545	0 %	100 %	0 %	0 %	385241460
2509	NC_017431	T	6	6	114570	114575	0 %	100 %	0 %	0 %	385241460
2510	NC_017431	CTG	2	6	114665	114670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385241460
2511	NC_017431	TTC	2	6	114696	114701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241460
2512	NC_017431	TGTTT	2	10	114721	114730	0 %	80 %	20 %	0 %	385241460
2513	NC_017431	GA	4	8	114741	114748	50 %	0 %	50 %	0 %	385241460
2514	NC_017431	AGAA	2	8	114771	114778	75 %	0 %	25 %	0 %	385241460
2515	NC_017431	ACT	2	6	114781	114786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385241460
2516	NC_017431	TCA	2	6	114793	114798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385241460
2517	NC_017431	TTG	2	6	114802	114807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385241460
2518	NC_017431	CTT	2	6	114878	114883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241460
2519	NC_017431	AAGG	2	8	114905	114912	50 %	0 %	50 %	0 %	385241460
2520	NC_017431	GGA	2	6	114946	114951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385241460
2521	NC_017431	TCT	2	6	114956	114961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241460
2522	NC_017431	TTTG	2	8	114989	114996	0 %	75 %	25 %	0 %	385241460
2523	NC_017431	GAT	2	6	115038	115043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385241460
2524	NC_017431	CATGT	2	10	115099	115108	20 %	40 %	20 %	20 %	385241460
2525	NC_017431	TCT	2	6	115260	115265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241460
2526	NC_017431	ACA	2	6	115270	115275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385241460
2527	NC_017431	CGA	2	6	115282	115287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385241460
2528	NC_017431	ATC	2	6	115335	115340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385241460
2529	NC_017431	TCT	2	6	115352	115357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241460
2530	NC_017431	GGAA	2	8	115378	115385	50 %	0 %	50 %	0 %	385241460
2531	NC_017431	ACC	2	6	115413	115418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385241460
2532	NC_017431	TTG	2	6	115499	115504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385241460
2533	NC_017431	AAC	2	6	115521	115526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385241460
2534	NC_017431	ACTTCG	2	12	115561	115572	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385241460
2535	NC_017431	ACA	3	9	115651	115659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385241460
2536	NC_017431	CAA	2	6	115676	115681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385241460
2537	NC_017431	TTC	3	9	115725	115733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241460
2538	NC_017431	TCT	2	6	115786	115791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241460
2539	NC_017431	AAGC	2	8	115795	115802	50 %	0 %	25 %	25 %	385241460
2540	NC_017431	TATCG	2	10	115803	115812	20 %	40 %	20 %	20 %	385241460
2541	NC_017431	T	6	6	115819	115824	0 %	100 %	0 %	0 %	385241460
2542	NC_017431	ATG	2	6	115860	115865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2543	NC_017431	AGT	2	6	115894	115899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2544	NC_017431	A	6	6	115915	115920	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2545	NC_017431	TAA	2	6	115946	115951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2546	NC_017431	A	7	7	115968	115974	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2547	NC_017431	TTTTAG	2	12	115996	116007	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2548	NC_017431	TG	3	6	116012	116017	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2549	NC_017431	GGTT	2	8	116127	116134	0 %	50 %	50 %	0 %	385241461
2550	NC_017431	T	7	7	116143	116149	0 %	100 %	0 %	0 %	385241461
2551	NC_017431	GCT	2	6	116269	116274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385241461
2552	NC_017431	TTTCT	2	10	116319	116328	0 %	80 %	0 %	20 %	385241461
2553	NC_017431	ACA	2	6	116356	116361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385241461
2554	NC_017431	GGAGA	2	10	116515	116524	40 %	0 %	60 %	0 %	385241461
2555	NC_017431	TAT	2	6	116544	116549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385241461
2556	NC_017431	TATC	2	8	116576	116583	25 %	50 %	0 %	25 %	385241461
2557	NC_017431	TTTG	2	8	116673	116680	0 %	75 %	25 %	0 %	385241461
2558	NC_017431	AGG	3	9	116685	116693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385241461
2559	NC_017431	AGA	2	6	116706	116711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241461
2560	NC_017431	GA	3	6	116760	116765	50 %	0 %	50 %	0 %	385241461
2561	NC_017431	A	6	6	116813	116818	100 %	0 %	0 %	0 %	385241461
2562	NC_017431	GTTC	2	8	116869	116876	0 %	50 %	25 %	25 %	385241461
2563	NC_017431	TAA	2	6	116889	116894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385241461
2564	NC_017431	ACC	2	6	116905	116910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385241461
2565	NC_017431	GCT	2	6	116923	116928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385241461
2566	NC_017431	AGG	2	6	116973	116978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385241461
2567	NC_017431	ATT	2	6	117007	117012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385241461
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2569	NC_017431	TGC	2	6	117054	117059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385241461
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2572	NC_017431	TGC	2	6	117317	117322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385241462
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2574	NC_017431	GAAA	2	8	117377	117384	75 %	0 %	25 %	0 %	385241462
2575	NC_017431	GTT	2	6	117420	117425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385241462
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2587	NC_017431	CA	3	6	117931	117936	50 %	0 %	0 %	50 %	385241463
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2590	NC_017431	TAA	2	6	118050	118055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2591	NC_017431	AT	3	6	118137	118142	50 %	50 %	0 %	0 %	385241464
2592	NC_017431	T	6	6	118147	118152	0 %	100 %	0 %	0 %	385241464
2593	NC_017431	AGA	3	9	118153	118161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241464
2594	NC_017431	CTTT	2	8	118190	118197	0 %	75 %	0 %	25 %	385241464
2595	NC_017431	G	6	6	118283	118288	0 %	0 %	100 %	0 %	385241464
2596	NC_017431	T	6	6	118306	118311	0 %	100 %	0 %	0 %	385241464
2597	NC_017431	GTT	2	6	118424	118429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385241464
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2600	NC_017431	A	8	8	118509	118516	100 %	0 %	0 %	0 %	385241464
2601	NC_017431	CTC	2	6	118524	118529	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385241464
2602	NC_017431	AAAGA	2	10	118565	118574	80 %	0 %	20 %	0 %	385241464
2603	NC_017431	AAT	2	6	118575	118580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385241464
2604	NC_017431	AG	4	8	118599	118606	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2605	NC_017431	CTT	2	6	118607	118612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2606	NC_017431	TTA	2	6	118629	118634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385241465
2607	NC_017431	T	6	6	118734	118739	0 %	100 %	0 %	0 %	385241465
2608	NC_017431	TTC	2	6	118820	118825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241465
2609	NC_017431	TCC	2	6	118833	118838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385241465
2610	NC_017431	TTTA	2	8	118851	118858	25 %	75 %	0 %	0 %	385241465
2611	NC_017431	CTG	2	6	119049	119054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385241465
2612	NC_017431	AGA	2	6	119078	119083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241465
2613	NC_017431	T	6	6	119115	119120	0 %	100 %	0 %	0 %	385241465
2614	NC_017431	GA	4	8	119124	119131	50 %	0 %	50 %	0 %	385241465
2615	NC_017431	GAA	2	6	119138	119143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241465
2616	NC_017431	TTC	2	6	119177	119182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241465
2617	NC_017431	TACT	2	8	119239	119246	25 %	50 %	0 %	25 %	385241465
2618	NC_017431	GTT	2	6	119283	119288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385241465
2619	NC_017431	TAT	2	6	119318	119323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385241465
2620	NC_017431	GAT	2	6	119334	119339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385241465
2621	NC_017431	GAG	2	6	119365	119370	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385241465
2622	NC_017431	TC	3	6	119456	119461	0 %	50 %	0 %	50 %	385241465
2623	NC_017431	AG	3	6	119559	119564	50 %	0 %	50 %	0 %	385241466
2624	NC_017431	GCTA	2	8	119581	119588	25 %	25 %	25 %	25 %	385241466
2625	NC_017431	GA	3	6	119592	119597	50 %	0 %	50 %	0 %	385241466
2626	NC_017431	AAG	2	6	119600	119605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241466
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2631	NC_017431	GCTA	2	8	119713	119720	25 %	25 %	25 %	25 %	385241466
2632	NC_017431	CGGC	2	8	119762	119769	0 %	0 %	50 %	50 %	385241466
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2645	NC_017431	TAT	2	6	120445	120450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2739	NC_017431	T	7	7	124825	124831	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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