MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis E/11023 chromosome

Total Repeats: 22973

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017431	AGA	2	6	69833	69838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241421
1502	NC_017431	GCGAT	2	10	69886	69895	20 %	20 %	40 %	20 %	385241421
1503	NC_017431	GTT	2	6	69908	69913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385241421
1504	NC_017431	GCT	2	6	69930	69935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385241421
1505	NC_017431	GCA	3	9	70032	70040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385241421
1506	NC_017431	AAAG	2	8	70065	70072	75 %	0 %	25 %	0 %	385241421
1507	NC_017431	GCA	2	6	70079	70084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385241421
1508	NC_017431	ATT	2	6	70093	70098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385241421
1509	NC_017431	TAT	2	6	70201	70206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385241421
1510	NC_017431	CTT	2	6	70225	70230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241421
1511	NC_017431	GA	3	6	70234	70239	50 %	0 %	50 %	0 %	385241421
1512	NC_017431	CTCTT	2	10	70240	70249	0 %	60 %	0 %	40 %	385241421
1513	NC_017431	AGAA	2	8	70252	70259	75 %	0 %	25 %	0 %	385241421
1514	NC_017431	TGA	2	6	70280	70285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385241421
1515	NC_017431	TTG	2	6	70369	70374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385241421
1516	NC_017431	TCT	2	6	70392	70397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241421
1517	NC_017431	GA	3	6	70433	70438	50 %	0 %	50 %	0 %	385241421
1518	NC_017431	AGCT	2	8	70474	70481	25 %	25 %	25 %	25 %	385241421
1519	NC_017431	TGA	2	6	70520	70525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385241421
1520	NC_017431	GCAT	2	8	70535	70542	25 %	25 %	25 %	25 %	385241421
1521	NC_017431	AGA	2	6	70553	70558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241421
1522	NC_017431	TCAA	2	8	70679	70686	50 %	25 %	0 %	25 %	385241421
1523	NC_017431	GT	3	6	70709	70714	0 %	50 %	50 %	0 %	385241421
1524	NC_017431	CT	3	6	70790	70795	0 %	50 %	0 %	50 %	385241421
1525	NC_017431	GA	3	6	70811	70816	50 %	0 %	50 %	0 %	385241421
1526	NC_017431	AGT	2	6	70853	70858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385241421
1527	NC_017431	AGGGG	2	10	70886	70895	20 %	0 %	80 %	0 %	385241421
1528	NC_017431	AAGAA	2	10	70928	70937	80 %	0 %	20 %	0 %	385241421
1529	NC_017431	AGA	2	6	71000	71005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241421
1530	NC_017431	TGA	2	6	71036	71041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385241421
1531	NC_017431	TAT	2	6	71047	71052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385241421
1532	NC_017431	T	6	6	71136	71141	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_017431	T	8	8	71157	71164	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_017431	CAT	2	6	71222	71227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385241422
1535	NC_017431	CCTT	2	8	71251	71258	0 %	50 %	0 %	50 %	385241422
1536	NC_017431	GCTT	2	8	71281	71288	0 %	50 %	25 %	25 %	385241422
1537	NC_017431	A	6	6	71376	71381	100 %	0 %	0 %	0 %	385241422
1538	NC_017431	ATT	2	6	71426	71431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385241422
1539	NC_017431	CAA	2	6	71573	71578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385241422
1540	NC_017431	TCC	2	6	71597	71602	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385241422
1541	NC_017431	TTCT	2	8	71619	71626	0 %	75 %	0 %	25 %	385241422
1542	NC_017431	ATG	2	6	71631	71636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385241422
1543	NC_017431	GCTT	2	8	71665	71672	0 %	50 %	25 %	25 %	385241422
1544	NC_017431	AGA	2	6	71674	71679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241422
1545	NC_017431	GAGC	2	8	71693	71700	25 %	0 %	50 %	25 %	385241422
1546	NC_017431	TCA	2	6	71718	71723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385241422
1547	NC_017431	A	7	7	71725	71731	100 %	0 %	0 %	0 %	385241422
1548	NC_017431	CTATTT	2	12	71736	71747	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385241422
1549	NC_017431	TGA	2	6	71770	71775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385241422
1550	NC_017431	ATG	2	6	71808	71813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385241422
1551	NC_017431	AGA	2	6	71938	71943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_017431	CGT	2	6	71986	71991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385241423
1553	NC_017431	T	7	7	71991	71997	0 %	100 %	0 %	0 %	385241423
1554	NC_017431	CTTGC	2	10	72017	72026	0 %	40 %	20 %	40 %	385241423
1555	NC_017431	GATA	2	8	72041	72048	50 %	25 %	25 %	0 %	385241423
1556	NC_017431	TTC	2	6	72132	72137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241424
1557	NC_017431	CTT	2	6	72200	72205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241424
1558	NC_017431	ATTGG	2	10	72218	72227	20 %	40 %	40 %	0 %	385241424
1559	NC_017431	T	6	6	72234	72239	0 %	100 %	0 %	0 %	385241424
1560	NC_017431	AGC	2	6	72249	72254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385241424
1561	NC_017431	TTG	2	6	72278	72283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385241424
1562	NC_017431	ATA	2	6	72362	72367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385241424
1563	NC_017431	GCT	2	6	72382	72387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385241424
1564	NC_017431	GCTA	2	8	72391	72398	25 %	25 %	25 %	25 %	385241424
1565	NC_017431	AAT	2	6	72421	72426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385241424
1566	NC_017431	TGG	2	6	72452	72457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385241424
1567	NC_017431	T	6	6	72459	72464	0 %	100 %	0 %	0 %	385241424
1568	NC_017431	AGC	2	6	72521	72526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385241424
1569	NC_017431	TTAT	2	8	72567	72574	25 %	75 %	0 %	0 %	385241424
1570	NC_017431	TGC	2	6	72575	72580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385241424
1571	NC_017431	TGT	2	6	72618	72623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385241424
1572	NC_017431	GGAG	2	8	72634	72641	25 %	0 %	75 %	0 %	385241424
1573	NC_017431	GATT	2	8	72669	72676	25 %	50 %	25 %	0 %	385241424
1574	NC_017431	GAA	2	6	72744	72749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241424
1575	NC_017431	CTGG	2	8	72777	72784	0 %	25 %	50 %	25 %	385241424
1576	NC_017431	CTC	2	6	72797	72802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385241424
1577	NC_017431	ACTCTT	2	12	72865	72876	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	385241424
1578	NC_017431	GAA	2	6	72886	72891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241424
1579	NC_017431	TGA	2	6	72903	72908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385241424
1580	NC_017431	GAA	2	6	72936	72941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241424
1581	NC_017431	T	6	6	73018	73023	0 %	100 %	0 %	0 %	385241424
1582	NC_017431	TAG	2	6	73058	73063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385241424
1583	NC_017431	TAG	2	6	73067	73072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385241424
1584	NC_017431	AGA	2	6	73174	73179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241424
1585	NC_017431	ATCA	2	8	73204	73211	50 %	25 %	0 %	25 %	385241424
1586	NC_017431	TGT	2	6	73277	73282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385241424
1587	NC_017431	GAAAA	2	10	73290	73299	80 %	0 %	20 %	0 %	385241424
1588	NC_017431	A	7	7	73296	73302	100 %	0 %	0 %	0 %	385241424
1589	NC_017431	AGG	2	6	73322	73327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385241424
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1591	NC_017431	TTTCTG	2	12	73415	73426	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	385241425
1592	NC_017431	AGA	2	6	73452	73457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241425
1593	NC_017431	GA	3	6	73475	73480	50 %	0 %	50 %	0 %	385241425
1594	NC_017431	TAC	2	6	73500	73505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385241425
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1596	NC_017431	TGA	2	6	73578	73583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385241425
1597	NC_017431	G	6	6	73636	73641	0 %	0 %	100 %	0 %	385241425
1598	NC_017431	TAT	2	6	73648	73653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385241425
1599	NC_017431	A	6	6	73684	73689	100 %	0 %	0 %	0 %	385241425
1600	NC_017431	TGGGA	2	10	73707	73716	20 %	20 %	60 %	0 %	385241425
1601	NC_017431	GCT	2	6	73816	73821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385241425
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1603	NC_017431	AGG	2	6	73860	73865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385241425
1604	NC_017431	TC	3	6	73962	73967	0 %	50 %	0 %	50 %	385241425
1605	NC_017431	T	6	6	73990	73995	0 %	100 %	0 %	0 %	385241425
1606	NC_017431	AGC	3	9	74034	74042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385241425
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1608	NC_017431	ATT	2	6	74173	74178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385241425
1609	NC_017431	AAG	2	6	74213	74218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241425
1610	NC_017431	AAG	2	6	74276	74281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241425
1611	NC_017431	TGC	2	6	74354	74359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385241425
1612	NC_017431	TC	3	6	74369	74374	0 %	50 %	0 %	50 %	385241425
1613	NC_017431	TCA	2	6	74463	74468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385241425
1614	NC_017431	ATT	2	6	74513	74518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385241425
1615	NC_017431	TCT	2	6	74605	74610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241425
1616	NC_017431	ATG	2	6	74624	74629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385241425
1617	NC_017431	AAG	2	6	74779	74784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_017431	ACT	2	6	74794	74799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1619	NC_017431	T	6	6	74805	74810	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_017431	AGT	2	6	74830	74835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_017431	CAA	2	6	74856	74861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385241426
1622	NC_017431	T	6	6	74914	74919	0 %	100 %	0 %	0 %	385241426
1623	NC_017431	CCA	2	6	74957	74962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385241426
1624	NC_017431	TC	3	6	75003	75008	0 %	50 %	0 %	50 %	385241426
1625	NC_017431	AAT	2	6	75013	75018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385241426
1626	NC_017431	GCC	2	6	75032	75037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385241426
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