MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis E/11023 chromosome

Total Repeats: 22973

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_017431	AGA	2	6	46964	46969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241403
1003	NC_017431	AGT	2	6	47049	47054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385241403
1004	NC_017431	ATA	2	6	47124	47129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385241403
1005	NC_017431	A	6	6	47305	47310	100 %	0 %	0 %	0 %	385241403
1006	NC_017431	GAA	2	6	47317	47322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241403
1007	NC_017431	ATGG	2	8	47366	47373	25 %	25 %	50 %	0 %	385241403
1008	NC_017431	AGGA	2	8	47397	47404	50 %	0 %	50 %	0 %	385241403
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1012	NC_017431	ATA	2	6	47452	47457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385241403
1013	NC_017431	AGA	2	6	47805	47810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241403
1014	NC_017431	CTG	2	6	47862	47867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385241403
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1018	NC_017431	AAGT	2	8	47979	47986	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1021	NC_017431	G	6	6	48022	48027	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_017431	AG	3	6	48044	48049	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_017431	TGT	2	6	48063	48068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_017431	CTG	2	6	48098	48103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385241404
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1041	NC_017431	TAT	2	6	48798	48803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1059	NC_017431	CTATT	2	10	49597	49606	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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1061	NC_017431	TCT	2	6	49644	49649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_017431	ACT	2	6	49685	49690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_017431	T	7	7	49705	49711	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_017431	AAT	2	6	49720	49725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1106	NC_017431	TAA	2	6	51414	51419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_017431	T	6	6	51438	51443	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_017431	AGT	3	9	51482	51490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_017431	GCA	2	6	51538	51543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385241407
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1113	NC_017431	A	6	6	51606	51611	100 %	0 %	0 %	0 %	385241407
1114	NC_017431	AAG	2	6	51636	51641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241407
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1128	NC_017431	A	6	6	52080	52085	100 %	0 %	0 %	0 %	385241407
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1130	NC_017431	CAA	2	6	52200	52205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385241407
1131	NC_017431	GAT	2	6	52243	52248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_017431	T	6	6	52287	52292	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_017431	TATT	2	8	52294	52301	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_017431	AAG	2	6	52321	52326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_017431	AAT	2	6	52348	52353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_017431	ATT	2	6	52360	52365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_017431	CTA	2	6	52418	52423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385241408
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1154	NC_017431	T	6	6	53346	53351	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1155	NC_017431	T	6	6	53361	53366	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1156	NC_017431	TCT	2	6	53434	53439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241409
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1173	NC_017431	TATT	2	8	54117	54124	25 %	75 %	0 %	0 %	385241409
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1176	NC_017431	TGTT	2	8	54162	54169	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1179	NC_017431	TAAT	2	8	54206	54213	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1233	NC_017431	AGT	2	6	56682	56687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1234	NC_017431	GTT	2	6	56775	56780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1249	NC_017431	T	6	6	57445	57450	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1250	NC_017431	GCT	2	6	57656	57661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1251	NC_017431	CCAAGA	2	12	57664	57675	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1254	NC_017431	GAG	2	6	57728	57733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1255	NC_017431	AGTTGT	2	12	57770	57781	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1256	NC_017431	AGA	2	6	57844	57849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241412
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