MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis E/11023 chromosome

Total Repeats: 22973

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017431	GGTT	2	8	23095	23102	0 %	50 %	50 %	0 %	385241379
502	NC_017431	TGC	2	6	23121	23126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385241379
503	NC_017431	ATT	2	6	23173	23178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385241379
504	NC_017431	AAT	2	6	23215	23220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385241379
505	NC_017431	TTG	2	6	23278	23283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385241379
506	NC_017431	TTCT	2	8	23465	23472	0 %	75 %	0 %	25 %	385241379
507	NC_017431	TGC	2	6	23529	23534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385241379
508	NC_017431	TAAC	2	8	23567	23574	50 %	25 %	0 %	25 %	385241379
509	NC_017431	GCA	2	6	23635	23640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385241379
510	NC_017431	CATT	2	8	23690	23697	25 %	50 %	0 %	25 %	385241379
511	NC_017431	AGA	2	6	23709	23714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241379
512	NC_017431	GAG	2	6	23732	23737	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385241379
513	NC_017431	TTC	2	6	23795	23800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241379
514	NC_017431	GGAAA	2	10	23808	23817	60 %	0 %	40 %	0 %	385241379
515	NC_017431	GA	3	6	23831	23836	50 %	0 %	50 %	0 %	385241379
516	NC_017431	GA	3	6	23923	23928	50 %	0 %	50 %	0 %	385241379
517	NC_017431	GAA	2	6	24054	24059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241379
518	NC_017431	GGTA	2	8	24060	24067	25 %	25 %	50 %	0 %	385241379
519	NC_017431	GTT	2	6	24148	24153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385241379
520	NC_017431	CTT	2	6	24242	24247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241379
521	NC_017431	AG	3	6	24304	24309	50 %	0 %	50 %	0 %	385241379
522	NC_017431	TAA	2	6	24315	24320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385241379
523	NC_017431	GAA	2	6	24335	24340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241379
524	NC_017431	AAG	2	6	24476	24481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241379
525	NC_017431	A	7	7	24561	24567	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_017431	TTA	2	6	24574	24579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_017431	T	9	9	24589	24597	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_017431	T	6	6	24621	24626	0 %	100 %	0 %	0 %	385241380
529	NC_017431	AGA	2	6	24748	24753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241380
530	NC_017431	TAA	2	6	24880	24885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385241380
531	NC_017431	GGA	3	9	24912	24920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385241380
532	NC_017431	GAT	2	6	24957	24962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385241380
533	NC_017431	TTGA	2	8	25055	25062	25 %	50 %	25 %	0 %	385241380
534	NC_017431	TTCG	2	8	25200	25207	0 %	50 %	25 %	25 %	385241380
535	NC_017431	TAGG	2	8	25279	25286	25 %	25 %	50 %	0 %	385241380
536	NC_017431	TGT	2	6	25370	25375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385241380
537	NC_017431	TTA	2	6	25380	25385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385241380
538	NC_017431	TTCC	2	8	25403	25410	0 %	50 %	0 %	50 %	385241380
539	NC_017431	TAG	2	6	25441	25446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385241380
540	NC_017431	GTGAGG	2	12	25475	25486	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	385241380
541	NC_017431	TAGG	2	8	25517	25524	25 %	25 %	50 %	0 %	385241380
542	NC_017431	AGAGG	2	10	25533	25542	40 %	0 %	60 %	0 %	385241380
543	NC_017431	AGC	2	6	25559	25564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385241380
544	NC_017431	T	6	6	25568	25573	0 %	100 %	0 %	0 %	385241380
545	NC_017431	T	6	6	25599	25604	0 %	100 %	0 %	0 %	385241380
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547	NC_017431	GA	3	6	25721	25726	50 %	0 %	50 %	0 %	385241380
548	NC_017431	GT	3	6	25741	25746	0 %	50 %	50 %	0 %	385241380
549	NC_017431	TTTC	2	8	25952	25959	0 %	75 %	0 %	25 %	385241380
550	NC_017431	GAT	2	6	25964	25969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385241380
551	NC_017431	CTC	2	6	26032	26037	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385241380
552	NC_017431	TGT	2	6	26099	26104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385241380
553	NC_017431	A	6	6	26196	26201	100 %	0 %	0 %	0 %	385241380
554	NC_017431	GCA	2	6	26211	26216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385241380
555	NC_017431	AGT	2	6	26243	26248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385241380
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557	NC_017431	GCTT	2	8	26289	26296	0 %	50 %	25 %	25 %	385241380
558	NC_017431	CTT	2	6	26359	26364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241380
559	NC_017431	GA	3	6	26389	26394	50 %	0 %	50 %	0 %	385241380
560	NC_017431	GAA	2	6	26424	26429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241380
561	NC_017431	GAA	2	6	26431	26436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241380
562	NC_017431	CGA	2	6	26439	26444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385241380
563	NC_017431	GA	3	6	26513	26518	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
564	NC_017431	CT	3	6	26520	26525	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
565	NC_017431	ACT	2	6	26528	26533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_017431	A	6	6	26544	26549	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_017431	T	7	7	26556	26562	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_017431	GGC	2	6	26704	26709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385241381
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571	NC_017431	T	7	7	26819	26825	0 %	100 %	0 %	0 %	385241381
572	NC_017431	GAA	2	6	26837	26842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241381
573	NC_017431	GGAA	2	8	26872	26879	50 %	0 %	50 %	0 %	385241381
574	NC_017431	TTAA	2	8	26945	26952	50 %	50 %	0 %	0 %	385241381
575	NC_017431	AAAG	2	8	26995	27002	75 %	0 %	25 %	0 %	385241381
576	NC_017431	GA	3	6	27020	27025	50 %	0 %	50 %	0 %	385241381
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581	NC_017431	GAA	2	6	27209	27214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241381
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583	NC_017431	T	6	6	27291	27296	0 %	100 %	0 %	0 %	385241381
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589	NC_017431	A	8	8	27496	27503	100 %	0 %	0 %	0 %	385241382
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593	NC_017431	TTC	2	6	27658	27663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241382
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598	NC_017431	A	6	6	27811	27816	100 %	0 %	0 %	0 %	385241382
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600	NC_017431	TAA	2	6	27881	27886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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602	NC_017431	ATTG	2	8	27939	27946	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
603	NC_017431	AG	3	6	27971	27976	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
604	NC_017431	AGA	2	6	27993	27998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
605	NC_017431	GAA	2	6	28043	28048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241383
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612	NC_017431	TG	3	6	28394	28399	0 %	50 %	50 %	0 %	385241383
613	NC_017431	GCA	2	6	28418	28423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385241383
614	NC_017431	TC	3	6	28447	28452	0 %	50 %	0 %	50 %	385241383
615	NC_017431	AGGGT	2	10	28581	28590	20 %	20 %	60 %	0 %	385241383
616	NC_017431	TTC	2	6	28617	28622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241383
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619	NC_017431	TGA	2	6	28657	28662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385241383
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621	NC_017431	GC	4	8	28861	28868	0 %	0 %	50 %	50 %	385241383
622	NC_017431	AAG	2	6	28869	28874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241383
623	NC_017431	TA	3	6	28983	28988	50 %	50 %	0 %	0 %	385241383
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630	NC_017431	TTTG	2	8	29567	29574	0 %	75 %	25 %	0 %	385241384
631	NC_017431	TTGT	2	8	29602	29609	0 %	75 %	25 %	0 %	385241384
632	NC_017431	CCTAT	2	10	29621	29630	20 %	40 %	0 %	40 %	385241384
633	NC_017431	T	6	6	29637	29642	0 %	100 %	0 %	0 %	385241384
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637	NC_017431	ATG	2	6	29896	29901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385241384
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650	NC_017431	AAGGA	2	10	30421	30430	60 %	0 %	40 %	0 %	385241385
651	NC_017431	GGC	2	6	30448	30453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385241385
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654	NC_017431	TAG	2	6	30549	30554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385241385
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672	NC_017431	GAGCT	2	10	31460	31469	20 %	20 %	40 %	20 %	385241386
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674	NC_017431	A	6	6	31565	31570	100 %	0 %	0 %	0 %	385241386
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759	NC_017431	TCCTA	2	10	36181	36190	20 %	40 %	0 %	40 %	385241392
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