MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis E/11023 chromosome

Total Repeats: 22973

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_017431	ATTT	2	8	274654	274661	25 %	75 %	0 %	0 %	385241610
6002	NC_017431	CAC	2	6	274692	274697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385241610
6003	NC_017431	CAA	2	6	274701	274706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385241610
6004	NC_017431	TAT	2	6	274718	274723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385241610
6005	NC_017431	TCT	2	6	274805	274810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241610
6006	NC_017431	ATCCT	2	10	274819	274828	20 %	40 %	0 %	40 %	385241610
6007	NC_017431	GAT	2	6	274872	274877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385241610
6008	NC_017431	AGA	2	6	274967	274972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241610
6009	NC_017431	TGA	2	6	275031	275036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385241611
6010	NC_017431	AGGAG	2	10	275070	275079	40 %	0 %	60 %	0 %	385241611
6011	NC_017431	GCT	2	6	275170	275175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385241611
6012	NC_017431	TGGAAT	2	12	275181	275192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385241611
6013	NC_017431	AGC	2	6	275196	275201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385241611
6014	NC_017431	ATT	2	6	275221	275226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385241611
6015	NC_017431	TC	3	6	275246	275251	0 %	50 %	0 %	50 %	385241611
6016	NC_017431	TGC	2	6	275256	275261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385241611
6017	NC_017431	GCA	2	6	275281	275286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385241611
6018	NC_017431	TAT	2	6	275293	275298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385241611
6019	NC_017431	GCT	2	6	275350	275355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385241611
6020	NC_017431	CTT	2	6	275458	275463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241611
6021	NC_017431	AAC	2	6	275482	275487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385241611
6022	NC_017431	AGA	2	6	275544	275549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241611
6023	NC_017431	AAG	2	6	275585	275590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241611
6024	NC_017431	GCT	2	6	275644	275649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385241611
6025	NC_017431	AAC	2	6	275660	275665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385241611
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6027	NC_017431	ACGA	2	8	275697	275704	50 %	0 %	25 %	25 %	385241611
6028	NC_017431	CTC	2	6	275728	275733	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385241611
6029	NC_017431	A	7	7	275743	275749	100 %	0 %	0 %	0 %	385241611
6030	NC_017431	TTGTC	2	10	275757	275766	0 %	60 %	20 %	20 %	385241611
6031	NC_017431	GAA	2	6	275770	275775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241611
6032	NC_017431	ATT	2	6	275780	275785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385241611
6033	NC_017431	ACG	2	6	275812	275817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385241611
6034	NC_017431	ATC	2	6	275846	275851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385241611
6035	NC_017431	CTC	2	6	275852	275857	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385241611
6036	NC_017431	ATA	2	6	275891	275896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385241611
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6038	NC_017431	A	6	6	276041	276046	100 %	0 %	0 %	0 %	385241612
6039	NC_017431	TGGT	2	8	276130	276137	0 %	50 %	50 %	0 %	385241612
6040	NC_017431	AAG	2	6	276156	276161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241612
6041	NC_017431	GAA	2	6	276248	276253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241612
6042	NC_017431	TGT	2	6	276256	276261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385241612
6043	NC_017431	ATG	2	6	276341	276346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385241612
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6045	NC_017431	ACC	2	6	276361	276366	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385241612
6046	NC_017431	CTC	2	6	276375	276380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385241612
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6048	NC_017431	CT	3	6	276458	276463	0 %	50 %	0 %	50 %	385241612
6049	NC_017431	GGA	2	6	276485	276490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385241612
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6051	NC_017431	CTC	2	6	276519	276524	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385241612
6052	NC_017431	TA	3	6	276581	276586	50 %	50 %	0 %	0 %	385241612
6053	NC_017431	GAA	2	6	276587	276592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241612
6054	NC_017431	GCT	2	6	276635	276640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385241612
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6057	NC_017431	CT	3	6	276734	276739	0 %	50 %	0 %	50 %	385241612
6058	NC_017431	ATTGT	2	10	276747	276756	20 %	60 %	20 %	0 %	385241612
6059	NC_017431	AATT	2	8	276793	276800	50 %	50 %	0 %	0 %	385241612
6060	NC_017431	ATT	2	6	276827	276832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385241612
6061	NC_017431	A	6	6	276913	276918	100 %	0 %	0 %	0 %	385241612
6062	NC_017431	CAG	2	6	276968	276973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385241612
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6074	NC_017431	TCT	2	6	277284	277289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241613
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6119	NC_017431	GTTT	2	8	279753	279760	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6120	NC_017431	ATATTA	2	12	279776	279787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6121	NC_017431	AAAG	2	8	279788	279795	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6122	NC_017431	A	6	6	279843	279848	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6123	NC_017431	T	6	6	279867	279872	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6124	NC_017431	AGG	2	6	279878	279883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6125	NC_017431	GCA	2	6	279962	279967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385241614
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6135	NC_017431	TCT	2	6	280296	280301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241615
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6162	NC_017431	TAC	2	6	281715	281720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6217	NC_017431	C	6	6	284331	284336	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6218	NC_017431	AT	4	8	284390	284397	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6219	NC_017431	CAT	2	6	284410	284415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385241617
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6226	NC_017431	CAC	2	6	284895	284900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385241617
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6229	NC_017431	AAGC	2	8	284999	285006	50 %	0 %	25 %	25 %	385241617
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6232	NC_017431	CTC	2	6	285078	285083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385241617
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6234	NC_017431	A	7	7	285133	285139	100 %	0 %	0 %	0 %	385241617
6235	NC_017431	AG	3	6	285200	285205	50 %	0 %	50 %	0 %	385241617
6236	NC_017431	CT	3	6	285242	285247	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6237	NC_017431	AGA	2	6	285253	285258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6238	NC_017431	TAAA	2	8	285266	285273	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6239	NC_017431	A	6	6	285271	285276	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6240	NC_017431	T	6	6	285291	285296	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6241	NC_017431	A	6	6	285311	285316	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6242	NC_017431	TC	4	8	285333	285340	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6243	NC_017431	T	6	6	285461	285466	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6244	NC_017431	CTT	2	6	285503	285508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241618
6245	NC_017431	ACT	2	6	285532	285537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385241618
6246	NC_017431	GCTGT	2	10	285545	285554	0 %	40 %	40 %	20 %	385241618
6247	NC_017431	GTC	2	6	285613	285618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385241618
6248	NC_017431	T	6	6	285632	285637	0 %	100 %	0 %	0 %	385241618
6249	NC_017431	ACT	2	6	285660	285665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385241618
6250	NC_017431	ACT	2	6	285729	285734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385241618
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6497	NC_017431	CTA	2	6	296448	296453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385241630
6498	NC_017431	AG	3	6	296497	296502	50 %	0 %	50 %	0 %	385241630
6499	NC_017431	CCT	2	6	296537	296542	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385241630
6500	NC_017431	CAA	2	6	296598	296603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385241630

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