MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis E/11023 chromosome

Total Repeats: 22973

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_017431	CAA	2	6	252187	252192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385241587
5502	NC_017431	AGA	3	9	252260	252268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241587
5503	NC_017431	GGC	2	6	252271	252276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385241587
5504	NC_017431	ACA	2	6	252301	252306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385241587
5505	NC_017431	CAC	2	6	252308	252313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385241587
5506	NC_017431	CAG	2	6	252314	252319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385241587
5507	NC_017431	T	8	8	252383	252390	0 %	100 %	0 %	0 %	385241587
5508	NC_017431	TCC	2	6	252474	252479	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5509	NC_017431	GAAA	2	8	252495	252502	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5510	NC_017431	T	7	7	252516	252522	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5511	NC_017431	GCAG	2	8	252544	252551	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5512	NC_017431	AGAA	2	8	252577	252584	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5513	NC_017431	AG	3	6	252619	252624	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5514	NC_017431	TAT	2	6	252642	252647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5515	NC_017431	ACA	2	6	252683	252688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5516	NC_017431	A	6	6	252732	252737	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5517	NC_017431	TTG	2	6	252912	252917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385241588
5518	NC_017431	TCT	2	6	252934	252939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241588
5519	NC_017431	TC	3	6	252981	252986	0 %	50 %	0 %	50 %	385241588
5520	NC_017431	T	7	7	253017	253023	0 %	100 %	0 %	0 %	385241588
5521	NC_017431	CCA	2	6	253030	253035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385241588
5522	NC_017431	AAC	2	6	253083	253088	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385241588
5523	NC_017431	AATA	2	8	253137	253144	75 %	25 %	0 %	0 %	385241588
5524	NC_017431	GCT	2	6	253147	253152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385241588
5525	NC_017431	ACA	2	6	253212	253217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385241588
5526	NC_017431	CCA	2	6	253244	253249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385241588
5527	NC_017431	CAA	2	6	253292	253297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385241588
5528	NC_017431	CCCA	2	8	253400	253407	25 %	0 %	0 %	75 %	385241589
5529	NC_017431	CTT	2	6	253529	253534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241589
5530	NC_017431	AAT	2	6	253608	253613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385241589
5531	NC_017431	CTC	2	6	253619	253624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385241589
5532	NC_017431	ACT	2	6	253627	253632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385241589
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5534	NC_017431	CTC	2	6	253676	253681	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385241589
5535	NC_017431	GCAA	2	8	253690	253697	50 %	0 %	25 %	25 %	385241589
5536	NC_017431	AAC	2	6	253707	253712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385241589
5537	NC_017431	GTT	2	6	253752	253757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385241589
5538	NC_017431	AAC	2	6	253791	253796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5539	NC_017431	A	6	6	253805	253810	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5540	NC_017431	TAA	2	6	253856	253861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5541	NC_017431	TTC	2	6	253874	253879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241590
5542	NC_017431	T	7	7	253915	253921	0 %	100 %	0 %	0 %	385241590
5543	NC_017431	AGCA	2	8	253952	253959	50 %	0 %	25 %	25 %	385241590
5544	NC_017431	CTT	2	6	253969	253974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241590
5545	NC_017431	TCT	3	9	253980	253988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241590
5546	NC_017431	GATAA	2	10	254008	254017	60 %	20 %	20 %	0 %	385241590
5547	NC_017431	TCG	2	6	254074	254079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385241590
5548	NC_017431	CATA	2	8	254095	254102	50 %	25 %	0 %	25 %	385241590
5549	NC_017431	TCC	2	6	254114	254119	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385241590
5550	NC_017431	TAA	2	6	254147	254152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385241590
5551	NC_017431	AG	3	6	254172	254177	50 %	0 %	50 %	0 %	385241590
5552	NC_017431	A	6	6	254191	254196	100 %	0 %	0 %	0 %	385241590
5553	NC_017431	AGA	2	6	254202	254207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241590
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5555	NC_017431	CAA	2	6	254255	254260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385241590
5556	NC_017431	GTA	2	6	254277	254282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385241590
5557	NC_017431	ACA	2	6	254336	254341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385241590
5558	NC_017431	A	8	8	254376	254383	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_017431	TA	3	6	254425	254430	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5560	NC_017431	CCAA	2	8	254460	254467	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5561	NC_017431	A	7	7	254484	254490	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5562	NC_017431	TAT	2	6	254503	254508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385241591
5563	NC_017431	TTCA	2	8	254535	254542	25 %	50 %	0 %	25 %	385241591
5564	NC_017431	AGA	2	6	254571	254576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241591
5565	NC_017431	TGTT	2	8	254609	254616	0 %	75 %	25 %	0 %	385241591
5566	NC_017431	CGA	2	6	254730	254735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385241591
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5568	NC_017431	AATA	2	8	254828	254835	75 %	25 %	0 %	0 %	385241591
5569	NC_017431	A	6	6	254894	254899	100 %	0 %	0 %	0 %	385241591
5570	NC_017431	A	7	7	254925	254931	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5571	NC_017431	ATA	2	6	254938	254943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5572	NC_017431	AACCCT	2	12	254984	254995	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
5573	NC_017431	AAAC	2	8	255058	255065	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5574	NC_017431	AAG	2	6	255182	255187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241592
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5577	NC_017431	TTA	2	6	255394	255399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385241592
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5579	NC_017431	T	6	6	255469	255474	0 %	100 %	0 %	0 %	385241592
5580	NC_017431	CA	3	6	255528	255533	50 %	0 %	0 %	50 %	385241592
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5588	NC_017431	GAG	2	6	255907	255912	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5589	NC_017431	ATT	2	6	255919	255924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385241593
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5591	NC_017431	ACG	2	6	255929	255934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385241593
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5593	NC_017431	CTG	2	6	255997	256002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385241593
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5595	NC_017431	TCTG	2	8	256053	256060	0 %	50 %	25 %	25 %	385241593
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5601	NC_017431	AACC	2	8	256324	256331	50 %	0 %	0 %	50 %	385241593
5602	NC_017431	AAG	2	6	256357	256362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241593
5603	NC_017431	CTG	2	6	256381	256386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385241593
5604	NC_017431	GCT	2	6	256509	256514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385241593
5605	NC_017431	ATTT	2	8	256566	256573	25 %	75 %	0 %	0 %	385241593
5606	NC_017431	TAT	2	6	256611	256616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5607	NC_017431	ATA	2	6	256620	256625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5608	NC_017431	AAT	2	6	256644	256649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5609	NC_017431	A	8	8	256724	256731	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5610	NC_017431	TC	3	6	256732	256737	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5611	NC_017431	TC	3	6	256818	256823	0 %	50 %	0 %	50 %	385241594
5612	NC_017431	A	6	6	256827	256832	100 %	0 %	0 %	0 %	385241594
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5615	NC_017431	T	7	7	256929	256935	0 %	100 %	0 %	0 %	385241594
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5625	NC_017431	TC	3	6	257391	257396	0 %	50 %	0 %	50 %	385241594
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