MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis E/11023 chromosome

Total Repeats: 22973

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017431	GCT	2	6	206444	206449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385241546
4502	NC_017431	CAA	3	9	206493	206501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385241547
4503	NC_017431	T	6	6	206504	206509	0 %	100 %	0 %	0 %	385241547
4504	NC_017431	A	6	6	206526	206531	100 %	0 %	0 %	0 %	385241547
4505	NC_017431	CT	3	6	206603	206608	0 %	50 %	0 %	50 %	385241547
4506	NC_017431	TAT	2	6	206636	206641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385241547
4507	NC_017431	AGT	2	6	206663	206668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385241547
4508	NC_017431	TTC	2	6	206858	206863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241547
4509	NC_017431	GA	4	8	206953	206960	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4510	NC_017431	T	7	7	206983	206989	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4511	NC_017431	CT	4	8	207001	207008	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4512	NC_017431	A	6	6	207010	207015	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_017431	GAA	2	6	207044	207049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241548
4514	NC_017431	TCC	2	6	207082	207087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385241548
4515	NC_017431	AGGA	2	8	207165	207172	50 %	0 %	50 %	0 %	385241548
4516	NC_017431	TTTG	2	8	207188	207195	0 %	75 %	25 %	0 %	385241548
4517	NC_017431	GAA	2	6	207239	207244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241548
4518	NC_017431	TC	3	6	207267	207272	0 %	50 %	0 %	50 %	385241548
4519	NC_017431	ACC	2	6	207327	207332	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385241548
4520	NC_017431	CTCTG	2	10	207361	207370	0 %	40 %	20 %	40 %	385241548
4521	NC_017431	CAA	2	6	207395	207400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385241548
4522	NC_017431	T	6	6	207423	207428	0 %	100 %	0 %	0 %	385241548
4523	NC_017431	ACC	2	6	207439	207444	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385241548
4524	NC_017431	ATT	2	6	207447	207452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385241548
4525	NC_017431	ATC	2	6	207461	207466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385241548
4526	NC_017431	CAA	2	6	207581	207586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385241548
4527	NC_017431	TGA	2	6	207604	207609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385241548
4528	NC_017431	ATT	2	6	207633	207638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385241548
4529	NC_017431	CT	3	6	207687	207692	0 %	50 %	0 %	50 %	385241548
4530	NC_017431	TTC	2	6	207776	207781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241548
4531	NC_017431	GCT	2	6	207829	207834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385241548
4532	NC_017431	CCT	2	6	207854	207859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385241548
4533	NC_017431	GAA	2	6	207875	207880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241548
4534	NC_017431	A	7	7	207883	207889	100 %	0 %	0 %	0 %	385241548
4535	NC_017431	A	6	6	207891	207896	100 %	0 %	0 %	0 %	385241548
4536	NC_017431	TTC	2	6	207915	207920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241548
4537	NC_017431	GAA	2	6	207929	207934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241548
4538	NC_017431	GAA	2	6	208001	208006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241548
4539	NC_017431	ATT	2	6	208051	208056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385241548
4540	NC_017431	TTAC	2	8	208090	208097	25 %	50 %	0 %	25 %	385241548
4541	NC_017431	AAC	2	6	208123	208128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385241548
4542	NC_017431	A	6	6	208148	208153	100 %	0 %	0 %	0 %	385241548
4543	NC_017431	TTA	2	6	208215	208220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385241548
4544	NC_017431	GAA	2	6	208409	208414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241548
4545	NC_017431	AAG	2	6	208512	208517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241548
4546	NC_017431	TGA	2	6	208519	208524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385241548
4547	NC_017431	TAT	2	6	208527	208532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385241548
4548	NC_017431	GGC	2	6	208551	208556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385241548
4549	NC_017431	TTA	2	6	208599	208604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385241549
4550	NC_017431	ATG	2	6	208611	208616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385241549
4551	NC_017431	AAG	2	6	208644	208649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241549
4552	NC_017431	GGA	2	6	208736	208741	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385241549
4553	NC_017431	GAA	2	6	208774	208779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241549
4554	NC_017431	GC	3	6	208780	208785	0 %	0 %	50 %	50 %	385241549
4555	NC_017431	GC	3	6	208831	208836	0 %	0 %	50 %	50 %	385241549
4556	NC_017431	AGA	2	6	208906	208911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241549
4557	NC_017431	TC	3	6	209042	209047	0 %	50 %	0 %	50 %	385241549
4558	NC_017431	GAA	2	6	209069	209074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241549
4559	NC_017431	CCG	2	6	209119	209124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385241549
4560	NC_017431	TAGG	2	8	209226	209233	25 %	25 %	50 %	0 %	385241549
4561	NC_017431	CTC	2	6	209262	209267	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385241549
4562	NC_017431	TCT	2	6	209291	209296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241549
4563	NC_017431	CTT	3	9	209360	209368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241550
4564	NC_017431	TGT	2	6	209387	209392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385241550
4565	NC_017431	AGA	2	6	209446	209451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241550
4566	NC_017431	TGA	2	6	209481	209486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385241550
4567	NC_017431	CTT	2	6	209496	209501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241550
4568	NC_017431	T	6	6	209573	209578	0 %	100 %	0 %	0 %	385241550
4569	NC_017431	GCA	2	6	209643	209648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385241550
4570	NC_017431	TCA	2	6	209660	209665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385241550
4571	NC_017431	ACTA	2	8	209749	209756	50 %	25 %	0 %	25 %	385241550
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4574	NC_017431	TAG	2	6	209805	209810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385241550
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4577	NC_017431	ATAA	2	8	209923	209930	75 %	25 %	0 %	0 %	385241550
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4582	NC_017431	CT	3	6	210192	210197	0 %	50 %	0 %	50 %	385241550
4583	NC_017431	AGC	2	6	210214	210219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385241550
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4585	NC_017431	TGG	2	6	210369	210374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385241551
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4587	NC_017431	TAG	2	6	210562	210567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385241551
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4591	NC_017431	T	6	6	210685	210690	0 %	100 %	0 %	0 %	385241551
4592	NC_017431	AGA	2	6	210702	210707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241551
4593	NC_017431	AG	3	6	210729	210734	50 %	0 %	50 %	0 %	385241551
4594	NC_017431	CT	3	6	210746	210751	0 %	50 %	0 %	50 %	385241551
4595	NC_017431	CTT	2	6	210772	210777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241551
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4602	NC_017431	GAAC	2	8	211135	211142	50 %	0 %	25 %	25 %	385241552
4603	NC_017431	CA	4	8	211208	211215	50 %	0 %	0 %	50 %	385241552
4604	NC_017431	T	6	6	211273	211278	0 %	100 %	0 %	0 %	385241552
4605	NC_017431	CTC	2	6	211295	211300	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385241552
4606	NC_017431	AGC	2	6	211302	211307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385241552
4607	NC_017431	AGC	2	6	211404	211409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385241552
4608	NC_017431	CAT	2	6	211424	211429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385241552
4609	NC_017431	T	6	6	211452	211457	0 %	100 %	0 %	0 %	385241552
4610	NC_017431	ACA	2	6	211495	211500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385241552
4611	NC_017431	CTT	2	6	211503	211508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241552
4612	NC_017431	GCA	2	6	211561	211566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385241552
4613	NC_017431	TTCC	2	8	211586	211593	0 %	50 %	0 %	50 %	385241552
4614	NC_017431	TAA	2	6	211601	211606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385241552
4615	NC_017431	AGTA	2	8	211690	211697	50 %	25 %	25 %	0 %	385241552
4616	NC_017431	TTC	2	6	211744	211749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241552
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4620	NC_017431	TCT	2	6	211870	211875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241552
4621	NC_017431	ACG	2	6	211914	211919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385241552
4622	NC_017431	TTC	2	6	211953	211958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241552
4623	NC_017431	TAAC	2	8	211973	211980	50 %	25 %	0 %	25 %	385241552
4624	NC_017431	TCT	2	6	211981	211986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241552
4625	NC_017431	ATA	2	6	212004	212009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385241552
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4627	NC_017431	TAC	2	6	212184	212189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385241552
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4630	NC_017431	TTC	3	9	212270	212278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241552
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4633	NC_017431	ATTT	2	8	212555	212562	25 %	75 %	0 %	0 %	385241552
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4639	NC_017431	TTG	2	6	212825	212830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385241552
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4655	NC_017431	TTC	2	6	213764	213769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241553
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4657	NC_017431	TTC	2	6	213812	213817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241553
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4662	NC_017431	AACG	2	8	214004	214011	50 %	0 %	25 %	25 %	385241553
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4666	NC_017431	GA	3	6	214113	214118	50 %	0 %	50 %	0 %	385241553
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4695	NC_017431	GAAATA	2	12	215574	215585	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385241553
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4733	NC_017431	C	6	6	217555	217560	0 %	0 %	0 %	100 %	385241556
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4735	NC_017431	T	6	6	217595	217600	0 %	100 %	0 %	0 %	385241556
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4743	NC_017431	TAA	2	6	217914	217919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385241556
4744	NC_017431	CCAC	2	8	217952	217959	25 %	0 %	0 %	75 %	385241556
4745	NC_017431	AGC	2	6	217960	217965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385241556
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