MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis G/11222 chromosome

Total Repeats: 2358

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017430	TC	3	6	225	230	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017430	AG	3	6	247	252	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017430	TC	3	6	1670	1675	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017430	AG	3	6	2153	2158	50 %	0 %	50 %	0 %	385240434
5	NC_017430	GA	3	6	2821	2826	50 %	0 %	50 %	0 %	385240434
6	NC_017430	AT	3	6	4514	4519	50 %	50 %	0 %	0 %	385240435
7	NC_017430	TC	3	6	5264	5269	0 %	50 %	0 %	50 %	385240436
8	NC_017430	GA	3	6	5275	5280	50 %	0 %	50 %	0 %	385240436
9	NC_017430	AT	3	6	5379	5384	50 %	50 %	0 %	0 %	385240436
10	NC_017430	TG	3	6	5532	5537	0 %	50 %	50 %	0 %	385240436
11	NC_017430	AG	3	6	5940	5945	50 %	0 %	50 %	0 %	385240436
12	NC_017430	GA	3	6	6998	7003	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017430	AC	3	6	7648	7653	50 %	0 %	0 %	50 %	385240438
14	NC_017430	AG	3	6	8391	8396	50 %	0 %	50 %	0 %	385240439
15	NC_017430	CT	4	8	8510	8517	0 %	50 %	0 %	50 %	385240439
16	NC_017430	GT	3	6	8592	8597	0 %	50 %	50 %	0 %	385240439
17	NC_017430	GA	3	6	9866	9871	50 %	0 %	50 %	0 %	385240441
18	NC_017430	AG	3	6	10083	10088	50 %	0 %	50 %	0 %	385240441
19	NC_017430	TA	3	6	11248	11253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017430	AG	3	6	11309	11314	50 %	0 %	50 %	0 %	385240442
21	NC_017430	TA	3	6	11869	11874	50 %	50 %	0 %	0 %	385240442
22	NC_017430	TG	3	6	12772	12777	0 %	50 %	50 %	0 %	385240443
23	NC_017430	AG	3	6	12921	12926	50 %	0 %	50 %	0 %	385240443
24	NC_017430	AG	4	8	13077	13084	50 %	0 %	50 %	0 %	385240443
25	NC_017430	TA	3	6	13339	13344	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017430	TA	4	8	13563	13570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017430	AC	3	6	14406	14411	50 %	0 %	0 %	50 %	385240444
28	NC_017430	AG	3	6	15745	15750	50 %	0 %	50 %	0 %	385240445
29	NC_017430	TC	3	6	15785	15790	0 %	50 %	0 %	50 %	385240445
30	NC_017430	GA	3	6	16314	16319	50 %	0 %	50 %	0 %	385240446
31	NC_017430	AG	3	6	16385	16390	50 %	0 %	50 %	0 %	385240446
32	NC_017430	GA	3	6	17169	17174	50 %	0 %	50 %	0 %	385240446
33	NC_017430	AG	3	6	17515	17520	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017430	GA	3	6	17528	17533	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017430	GA	3	6	17772	17777	50 %	0 %	50 %	0 %	385240447
36	NC_017430	TC	3	6	18222	18227	0 %	50 %	0 %	50 %	385240447
37	NC_017430	CT	3	6	18450	18455	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017430	TC	3	6	18650	18655	0 %	50 %	0 %	50 %	385240448
39	NC_017430	GA	3	6	18665	18670	50 %	0 %	50 %	0 %	385240448
40	NC_017430	GA	3	6	18764	18769	50 %	0 %	50 %	0 %	385240448
41	NC_017430	AG	3	6	19230	19235	50 %	0 %	50 %	0 %	385240448
42	NC_017430	AG	4	8	19516	19523	50 %	0 %	50 %	0 %	385240448
43	NC_017430	GT	3	6	19779	19784	0 %	50 %	50 %	0 %	385240448
44	NC_017430	AG	3	6	20007	20012	50 %	0 %	50 %	0 %	385240449
45	NC_017430	TG	3	6	20120	20125	0 %	50 %	50 %	0 %	385240449
46	NC_017430	AG	3	6	20516	20521	50 %	0 %	50 %	0 %	385240450
47	NC_017430	GA	3	6	20674	20679	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017430	AG	3	6	21191	21196	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017430	CT	3	6	21260	21265	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_017430	CT	4	8	21917	21924	0 %	50 %	0 %	50 %	385240451
51	NC_017430	AT	3	6	22187	22192	50 %	50 %	0 %	0 %	385240451
52	NC_017430	AT	3	6	22511	22516	50 %	50 %	0 %	0 %	385240451
53	NC_017430	GA	3	6	23830	23835	50 %	0 %	50 %	0 %	385240451
54	NC_017430	GA	3	6	23922	23927	50 %	0 %	50 %	0 %	385240451
55	NC_017430	AG	3	6	24303	24308	50 %	0 %	50 %	0 %	385240451
56	NC_017430	GA	3	6	25720	25725	50 %	0 %	50 %	0 %	385240452
57	NC_017430	GT	3	6	25740	25745	0 %	50 %	50 %	0 %	385240452
58	NC_017430	TA	3	6	25942	25947	50 %	50 %	0 %	0 %	385240452
59	NC_017430	GA	3	6	26388	26393	50 %	0 %	50 %	0 %	385240452
60	NC_017430	GA	3	6	26512	26517	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017430	CT	3	6	26519	26524	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_017430	AT	3	6	26805	26810	50 %	50 %	0 %	0 %	385240453
63	NC_017430	GA	3	6	27019	27024	50 %	0 %	50 %	0 %	385240453
64	NC_017430	TC	3	6	27887	27892	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_017430	AG	3	6	27970	27975	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017430	TG	3	6	28393	28398	0 %	50 %	50 %	0 %	385240455
67	NC_017430	TC	3	6	28446	28451	0 %	50 %	0 %	50 %	385240455
68	NC_017430	GC	4	8	28860	28867	0 %	0 %	50 %	50 %	385240455
69	NC_017430	TA	3	6	28982	28987	50 %	50 %	0 %	0 %	385240455
70	NC_017430	GA	3	6	29933	29938	50 %	0 %	50 %	0 %	385240456
71	NC_017430	AG	3	6	30031	30036	50 %	0 %	50 %	0 %	385240457
72	NC_017430	TC	3	6	30140	30145	0 %	50 %	0 %	50 %	385240457
73	NC_017430	GA	3	6	30761	30766	50 %	0 %	50 %	0 %	385240457
74	NC_017430	GA	3	6	31229	31234	50 %	0 %	50 %	0 %	385240457
75	NC_017430	AT	3	6	31370	31375	50 %	50 %	0 %	0 %	385240458
76	NC_017430	TC	3	6	31655	31660	0 %	50 %	0 %	50 %	385240459
77	NC_017430	GC	3	6	32085	32090	0 %	0 %	50 %	50 %	385240459
78	NC_017430	CT	3	6	32135	32140	0 %	50 %	0 %	50 %	385240459
79	NC_017430	AG	3	6	32267	32272	50 %	0 %	50 %	0 %	385240459
80	NC_017430	TC	3	6	33764	33769	0 %	50 %	0 %	50 %	385240461
81	NC_017430	AG	3	6	33777	33782	50 %	0 %	50 %	0 %	385240461
82	NC_017430	AG	3	6	33915	33920	50 %	0 %	50 %	0 %	385240462
83	NC_017430	GA	4	8	34607	34614	50 %	0 %	50 %	0 %	385240463
84	NC_017430	GA	4	8	34631	34638	50 %	0 %	50 %	0 %	385240463
85	NC_017430	GA	3	6	36384	36389	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017430	AT	3	6	36486	36491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017430	GA	3	6	36534	36539	50 %	0 %	50 %	0 %	385240465
88	NC_017430	CT	3	6	37018	37023	0 %	50 %	0 %	50 %	385240465
89	NC_017430	AG	3	6	37529	37534	50 %	0 %	50 %	0 %	385240465
90	NC_017430	AG	3	6	38075	38080	50 %	0 %	50 %	0 %	385240465
91	NC_017430	AG	3	6	38602	38607	50 %	0 %	50 %	0 %	385240465
92	NC_017430	CT	3	6	38753	38758	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_017430	GA	3	6	39386	39391	50 %	0 %	50 %	0 %	385240466
94	NC_017430	AG	3	6	39523	39528	50 %	0 %	50 %	0 %	385240466
95	NC_017430	AG	3	6	39623	39628	50 %	0 %	50 %	0 %	385240466
96	NC_017430	CT	3	6	40124	40129	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_017430	AG	3	6	40600	40605	50 %	0 %	50 %	0 %	385240467
98	NC_017430	GC	3	6	40649	40654	0 %	0 %	50 %	50 %	385240467
99	NC_017430	GA	3	6	40814	40819	50 %	0 %	50 %	0 %	385240467
100	NC_017430	TC	3	6	40823	40828	0 %	50 %	0 %	50 %	385240467
101	NC_017430	GC	3	6	40888	40893	0 %	0 %	50 %	50 %	385240467
102	NC_017430	GA	3	6	41028	41033	50 %	0 %	50 %	0 %	385240467
103	NC_017430	GT	3	6	41466	41471	0 %	50 %	50 %	0 %	385240468
104	NC_017430	GA	3	6	42004	42009	50 %	0 %	50 %	0 %	385240468
105	NC_017430	GA	4	8	42014	42021	50 %	0 %	50 %	0 %	385240468
106	NC_017430	AG	3	6	42250	42255	50 %	0 %	50 %	0 %	385240468
107	NC_017430	CT	3	6	42316	42321	0 %	50 %	0 %	50 %	385240469
108	NC_017430	GA	5	10	42592	42601	50 %	0 %	50 %	0 %	385240469
109	NC_017430	AC	3	6	43474	43479	50 %	0 %	0 %	50 %	385240471
110	NC_017430	TC	3	6	43643	43648	0 %	50 %	0 %	50 %	385240471
111	NC_017430	TC	3	6	43808	43813	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_017430	TA	3	6	43961	43966	50 %	50 %	0 %	0 %	385240472
113	NC_017430	TC	3	6	44873	44878	0 %	50 %	0 %	50 %	385240473
114	NC_017430	GA	3	6	45356	45361	50 %	0 %	50 %	0 %	385240474
115	NC_017430	TG	3	6	45574	45579	0 %	50 %	50 %	0 %	385240474
116	NC_017430	AG	3	6	45585	45590	50 %	0 %	50 %	0 %	385240474
117	NC_017430	AG	4	8	46026	46033	50 %	0 %	50 %	0 %	385240475
118	NC_017430	CT	3	6	46217	46222	0 %	50 %	0 %	50 %	385240475
119	NC_017430	TG	3	6	46418	46423	0 %	50 %	50 %	0 %	385240475
120	NC_017430	AG	3	6	46471	46476	50 %	0 %	50 %	0 %	385240475
121	NC_017430	AG	3	6	48043	48048	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017430	AG	3	6	49395	49400	50 %	0 %	50 %	0 %	385240477
123	NC_017430	CA	3	6	50061	50066	50 %	0 %	0 %	50 %	385240478
124	NC_017430	TG	4	8	51391	51398	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017430	TC	3	6	52904	52909	0 %	50 %	0 %	50 %	385240480
126	NC_017430	CA	3	6	52955	52960	50 %	0 %	0 %	50 %	385240480
127	NC_017430	GA	3	6	53376	53381	50 %	0 %	50 %	0 %	385240481
128	NC_017430	CT	3	6	53693	53698	0 %	50 %	0 %	50 %	385240481
129	NC_017430	CT	3	6	54389	54394	0 %	50 %	0 %	50 %	385240482
130	NC_017430	AT	3	6	55579	55584	50 %	50 %	0 %	0 %	385240482
131	NC_017430	GA	3	6	55616	55621	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017430	CT	3	6	56514	56519	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_017430	GT	3	6	56564	56569	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017430	TG	3	6	57271	57276	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017430	CT	3	6	58152	58157	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_017430	GA	3	6	59718	59723	50 %	0 %	50 %	0 %	385240485
137	NC_017430	GT	3	6	59856	59861	0 %	50 %	50 %	0 %	385240485
138	NC_017430	TC	3	6	60604	60609	0 %	50 %	0 %	50 %	385240486
139	NC_017430	GA	3	6	60832	60837	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017430	CA	3	6	61230	61235	50 %	0 %	0 %	50 %	385240487
141	NC_017430	AT	3	6	61480	61485	50 %	50 %	0 %	0 %	385240487
142	NC_017430	GA	3	6	61503	61508	50 %	0 %	50 %	0 %	385240487
143	NC_017430	GA	3	6	61629	61634	50 %	0 %	50 %	0 %	385240487
144	NC_017430	GA	3	6	62444	62449	50 %	0 %	50 %	0 %	385240487
145	NC_017430	TC	3	6	62865	62870	0 %	50 %	0 %	50 %	385240487
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