MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis G/11222 chromosome

Total Repeats: 22974

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_017430	AG	3	6	135236	135241	50 %	0 %	50 %	0 %	385240546
3003	NC_017430	TGG	2	6	135283	135288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385240546
3004	NC_017430	GTT	2	6	135327	135332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385240546
3005	NC_017430	TTG	2	6	135339	135344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385240546
3006	NC_017430	TGT	2	6	135374	135379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385240546
3007	NC_017430	TTC	2	6	135393	135398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240546
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3012	NC_017430	CAG	2	6	135520	135525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385240546
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3019	NC_017430	ATTGT	2	10	135916	135925	20 %	60 %	20 %	0 %	385240547
3020	NC_017430	TGG	2	6	135965	135970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385240547
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3025	NC_017430	TG	3	6	136265	136270	0 %	50 %	50 %	0 %	385240548
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3054	NC_017430	T	9	9	137036	137044	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_017430	TTGCA	2	10	137132	137141	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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3059	NC_017430	TTC	2	6	137333	137338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240550
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3105	NC_017430	AAGA	2	8	139805	139812	75 %	0 %	25 %	0 %	385240554
3106	NC_017430	AG	3	6	139854	139859	50 %	0 %	50 %	0 %	385240554
3107	NC_017430	GAA	2	6	139866	139871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240554
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3111	NC_017430	TCCAG	2	10	140088	140097	20 %	20 %	20 %	40 %	385240554
3112	NC_017430	GAA	2	6	140139	140144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240555
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3119	NC_017430	GCT	2	6	140335	140340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385240555
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3122	NC_017430	GTACA	2	10	140819	140828	40 %	20 %	20 %	20 %	385240555
3123	NC_017430	AGA	2	6	140850	140855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240555
3124	NC_017430	GAA	2	6	141034	141039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240555
3125	NC_017430	TAA	2	6	141168	141173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385240555
3126	NC_017430	TAGAT	2	10	141192	141201	40 %	40 %	20 %	0 %	385240555
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3129	NC_017430	CTG	2	6	141224	141229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385240555
3130	NC_017430	CCT	2	6	141268	141273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385240555
3131	NC_017430	TAT	2	6	141274	141279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385240555
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3133	NC_017430	TCA	2	6	141396	141401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240555
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3136	NC_017430	T	8	8	141514	141521	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3137	NC_017430	T	6	6	141559	141564	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3138	NC_017430	AAG	2	6	141568	141573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3139	NC_017430	AAAAG	2	10	141604	141613	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3140	NC_017430	T	6	6	141628	141633	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3141	NC_017430	GCT	2	6	141664	141669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3143	NC_017430	ATC	2	6	141688	141693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3153	NC_017430	A	6	6	142547	142552	100 %	0 %	0 %	0 %	385240557
3154	NC_017430	AT	3	6	142615	142620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3155	NC_017430	CTT	2	6	142642	142647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3156	NC_017430	AAG	2	6	142652	142657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240558
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3158	NC_017430	T	6	6	142776	142781	0 %	100 %	0 %	0 %	385240558
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3161	NC_017430	TCA	2	6	142815	142820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240558
3162	NC_017430	TGCT	2	8	142842	142849	0 %	50 %	25 %	25 %	385240558
3163	NC_017430	TCC	2	6	142867	142872	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385240558
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3202	NC_017430	T	7	7	144465	144471	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3233	NC_017430	AAG	2	6	145852	145857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240561
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3235	NC_017430	GA	3	6	145915	145920	50 %	0 %	50 %	0 %	385240562
3236	NC_017430	ATG	2	6	145948	145953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385240562
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3241	NC_017430	TC	3	6	146162	146167	0 %	50 %	0 %	50 %	385240562
3242	NC_017430	AAG	2	6	146380	146385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240562
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3245	NC_017430	TAA	2	6	146755	146760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385240562
3246	NC_017430	A	6	6	146818	146823	100 %	0 %	0 %	0 %	385240562
3247	NC_017430	AAT	2	6	146843	146848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385240562
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3383	NC_017430	TGC	2	6	152467	152472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385240566
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3484	NC_017430	ACAT	2	8	157328	157335	50 %	25 %	0 %	25 %	385240570
3485	NC_017430	TTCTA	2	10	157387	157396	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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3487	NC_017430	TAA	2	6	157432	157437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3492	NC_017430	A	7	7	157754	157760	100 %	0 %	0 %	0 %	385240571
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3495	NC_017430	CTCCAT	2	12	157812	157823	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	385240571
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3499	NC_017430	A	6	6	157959	157964	100 %	0 %	0 %	0 %	385240571
3500	NC_017430	T	6	6	158038	158043	0 %	100 %	0 %	0 %	385240571

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