MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis G/11222 chromosome

Total Repeats: 22974

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_017430	GCT	2	6	632547	632552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385241013
14002	NC_017430	CTAC	2	8	632569	632576	25 %	25 %	0 %	50 %	385241013
14003	NC_017430	TCC	2	6	632602	632607	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385241013
14004	NC_017430	AGA	2	6	632617	632622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241013
14005	NC_017430	ATGCT	2	10	632649	632658	20 %	40 %	20 %	20 %	385241013
14006	NC_017430	GT	3	6	632769	632774	0 %	50 %	50 %	0 %	385241013
14007	NC_017430	ACGGA	2	10	632783	632792	40 %	0 %	40 %	20 %	385241013
14008	NC_017430	ATT	2	6	632802	632807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385241013
14009	NC_017430	GGA	2	6	632860	632865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385241013
14010	NC_017430	CTT	2	6	632908	632913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241013
14011	NC_017430	AGA	2	6	632932	632937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241013
14012	NC_017430	GATA	2	8	633016	633023	50 %	25 %	25 %	0 %	385241013
14013	NC_017430	TCT	2	6	633096	633101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14014	NC_017430	AT	3	6	633120	633125	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14015	NC_017430	A	9	9	633128	633136	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14016	NC_017430	T	6	6	633160	633165	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14017	NC_017430	A	6	6	633227	633232	100 %	0 %	0 %	0 %	385241014
14018	NC_017430	CCTG	2	8	633318	633325	0 %	25 %	25 %	50 %	385241014
14019	NC_017430	AT	3	6	633380	633385	50 %	50 %	0 %	0 %	385241015
14020	NC_017430	GTC	2	6	633398	633403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385241015
14021	NC_017430	TAA	2	6	633406	633411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385241015
14022	NC_017430	A	6	6	633410	633415	100 %	0 %	0 %	0 %	385241015
14023	NC_017430	TC	3	6	633418	633423	0 %	50 %	0 %	50 %	385241015
14024	NC_017430	AAG	2	6	633477	633482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241015
14025	NC_017430	GAA	2	6	633512	633517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241015
14026	NC_017430	AGGA	2	8	633558	633565	50 %	0 %	50 %	0 %	385241015
14027	NC_017430	TTA	2	6	633597	633602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385241015
14028	NC_017430	CCTC	2	8	633636	633643	0 %	25 %	0 %	75 %	385241015
14029	NC_017430	ATC	2	6	633674	633679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385241015
14030	NC_017430	AAC	2	6	633801	633806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385241015
14031	NC_017430	A	7	7	633820	633826	100 %	0 %	0 %	0 %	385241015
14032	NC_017430	CT	3	6	633854	633859	0 %	50 %	0 %	50 %	385241015
14033	NC_017430	A	6	6	633980	633985	100 %	0 %	0 %	0 %	385241015
14034	NC_017430	AAGA	2	8	634022	634029	75 %	0 %	25 %	0 %	385241015
14035	NC_017430	GATT	2	8	634050	634057	25 %	50 %	25 %	0 %	385241016
14036	NC_017430	TCT	2	6	634068	634073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241016
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14040	NC_017430	A	6	6	634191	634196	100 %	0 %	0 %	0 %	385241016
14041	NC_017430	CCT	2	6	634256	634261	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385241016
14042	NC_017430	AAG	2	6	634263	634268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241016
14043	NC_017430	TCC	2	6	634274	634279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385241016
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14049	NC_017430	TCGAG	2	10	634533	634542	20 %	20 %	40 %	20 %	385241016
14050	NC_017430	T	6	6	634560	634565	0 %	100 %	0 %	0 %	385241016
14051	NC_017430	TTG	2	6	634590	634595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385241016
14052	NC_017430	TTA	2	6	634632	634637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385241016
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14054	NC_017430	ATC	2	6	634736	634741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385241016
14055	NC_017430	TCA	2	6	634752	634757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385241016
14056	NC_017430	CTTT	2	8	634806	634813	0 %	75 %	0 %	25 %	385241016
14057	NC_017430	ATG	3	9	634856	634864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385241016
14058	NC_017430	TC	4	8	634881	634888	0 %	50 %	0 %	50 %	385241016
14059	NC_017430	CTA	2	6	634934	634939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385241016
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14062	NC_017430	TTTG	2	8	635010	635017	0 %	75 %	25 %	0 %	385241017
14063	NC_017430	TTA	2	6	635038	635043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385241017
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14065	NC_017430	TAT	2	6	635067	635072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385241017
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14089	NC_017430	CTAC	2	8	635985	635992	25 %	25 %	0 %	50 %	385241018
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14093	NC_017430	A	8	8	636142	636149	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14094	NC_017430	CTCC	2	8	636153	636160	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
14095	NC_017430	A	6	6	636161	636166	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14103	NC_017430	TG	3	6	636567	636572	0 %	50 %	50 %	0 %	385241019
14104	NC_017430	GAG	2	6	636628	636633	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385241019
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14106	NC_017430	T	7	7	636673	636679	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14107	NC_017430	ATTAA	2	10	636686	636695	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14108	NC_017430	A	6	6	636740	636745	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14109	NC_017430	TCT	2	6	636762	636767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241020
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14111	NC_017430	CTT	2	6	636858	636863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241020
14112	NC_017430	AAAG	2	8	636871	636878	75 %	0 %	25 %	0 %	385241020
14113	NC_017430	GCA	2	6	636961	636966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385241020
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14115	NC_017430	CG	3	6	637003	637008	0 %	0 %	50 %	50 %	385241020
14116	NC_017430	GAA	2	6	637076	637081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241020
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14119	NC_017430	AAT	2	6	637266	637271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385241020
14120	NC_017430	AGCA	2	8	637284	637291	50 %	0 %	25 %	25 %	385241020
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14123	NC_017430	GGC	2	6	637453	637458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385241020
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14172	NC_017430	CCT	2	6	639077	639082	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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14200	NC_017430	CCT	2	6	640267	640272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14201	NC_017430	CGGAA	2	10	640483	640492	40 %	0 %	40 %	20 %	385241025
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14210	NC_017430	GTC	2	6	640980	640985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385241025
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14220	NC_017430	AAT	2	6	641564	641569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385241025
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14222	NC_017430	T	7	7	641647	641653	0 %	100 %	0 %	0 %	385241025
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14225	NC_017430	A	6	6	641718	641723	100 %	0 %	0 %	0 %	385241025
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14229	NC_017430	TTTC	2	8	641833	641840	0 %	75 %	0 %	25 %	385241026
14230	NC_017430	AGC	2	6	641853	641858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385241026
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14242	NC_017430	GAA	2	6	642269	642274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241026
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14489	NC_017430	AAC	2	6	653531	653536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385241035
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14492	NC_017430	A	7	7	653595	653601	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14493	NC_017430	A	6	6	653611	653616	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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