MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis G/11222 chromosome

Total Repeats: 22974

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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502	NC_017430	GGTT	2	8	23094	23101	0 %	50 %	50 %	0 %	385240451
503	NC_017430	TGC	2	6	23120	23125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385240451
504	NC_017430	ATT	2	6	23172	23177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385240451
505	NC_017430	AAT	2	6	23214	23219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385240451
506	NC_017430	TTG	2	6	23277	23282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385240451
507	NC_017430	TTCT	2	8	23464	23471	0 %	75 %	0 %	25 %	385240451
508	NC_017430	TGC	2	6	23528	23533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385240451
509	NC_017430	TAAC	2	8	23566	23573	50 %	25 %	0 %	25 %	385240451
510	NC_017430	GCA	2	6	23634	23639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385240451
511	NC_017430	CATT	2	8	23689	23696	25 %	50 %	0 %	25 %	385240451
512	NC_017430	AGA	2	6	23708	23713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240451
513	NC_017430	GAG	2	6	23731	23736	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385240451
514	NC_017430	TTC	2	6	23794	23799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240451
515	NC_017430	GGAAA	2	10	23807	23816	60 %	0 %	40 %	0 %	385240451
516	NC_017430	GA	3	6	23830	23835	50 %	0 %	50 %	0 %	385240451
517	NC_017430	GA	3	6	23922	23927	50 %	0 %	50 %	0 %	385240451
518	NC_017430	GAA	2	6	24053	24058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240451
519	NC_017430	GGTA	2	8	24059	24066	25 %	25 %	50 %	0 %	385240451
520	NC_017430	GTT	2	6	24147	24152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385240451
521	NC_017430	CTT	2	6	24241	24246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240451
522	NC_017430	AG	3	6	24303	24308	50 %	0 %	50 %	0 %	385240451
523	NC_017430	TAA	2	6	24314	24319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385240451
524	NC_017430	GAA	2	6	24334	24339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240451
525	NC_017430	AAG	2	6	24475	24480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240451
526	NC_017430	A	7	7	24560	24566	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_017430	TTA	2	6	24573	24578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_017430	T	9	9	24588	24596	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_017430	T	6	6	24620	24625	0 %	100 %	0 %	0 %	385240452
530	NC_017430	AGA	2	6	24747	24752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240452
531	NC_017430	TAA	2	6	24879	24884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385240452
532	NC_017430	GGA	3	9	24911	24919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385240452
533	NC_017430	GAT	2	6	24956	24961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385240452
534	NC_017430	TTCG	2	8	25199	25206	0 %	50 %	25 %	25 %	385240452
535	NC_017430	TAGG	2	8	25278	25285	25 %	25 %	50 %	0 %	385240452
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537	NC_017430	TTA	2	6	25379	25384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385240452
538	NC_017430	TTCC	2	8	25402	25409	0 %	50 %	0 %	50 %	385240452
539	NC_017430	TAG	2	6	25440	25445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385240452
540	NC_017430	TAGG	2	8	25516	25523	25 %	25 %	50 %	0 %	385240452
541	NC_017430	AGAGG	2	10	25532	25541	40 %	0 %	60 %	0 %	385240452
542	NC_017430	AGC	2	6	25558	25563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385240452
543	NC_017430	T	6	6	25567	25572	0 %	100 %	0 %	0 %	385240452
544	NC_017430	T	6	6	25598	25603	0 %	100 %	0 %	0 %	385240452
545	NC_017430	AAG	2	6	25704	25709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240452
546	NC_017430	GA	3	6	25720	25725	50 %	0 %	50 %	0 %	385240452
547	NC_017430	GT	3	6	25740	25745	0 %	50 %	50 %	0 %	385240452
548	NC_017430	TA	3	6	25942	25947	50 %	50 %	0 %	0 %	385240452
549	NC_017430	T	6	6	25951	25956	0 %	100 %	0 %	0 %	385240452
550	NC_017430	GAT	2	6	25963	25968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385240452
551	NC_017430	TGT	2	6	26098	26103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385240452
552	NC_017430	TAG	2	6	26136	26141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385240452
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555	NC_017430	T	6	6	26271	26276	0 %	100 %	0 %	0 %	385240452
556	NC_017430	GCTT	2	8	26288	26295	0 %	50 %	25 %	25 %	385240452
557	NC_017430	CTT	2	6	26358	26363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240452
558	NC_017430	GA	3	6	26388	26393	50 %	0 %	50 %	0 %	385240452
559	NC_017430	GAA	2	6	26423	26428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240452
560	NC_017430	GAA	2	6	26430	26435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240452
561	NC_017430	CGA	2	6	26438	26443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385240452
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563	NC_017430	CT	3	6	26519	26524	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
564	NC_017430	ACT	2	6	26527	26532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_017430	A	6	6	26543	26548	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_017430	T	7	7	26555	26561	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_017430	AGG	3	9	26696	26704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385240453
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570	NC_017430	T	7	7	26818	26824	0 %	100 %	0 %	0 %	385240453
571	NC_017430	GAA	2	6	26836	26841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240453
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573	NC_017430	TTAA	2	8	26944	26951	50 %	50 %	0 %	0 %	385240453
574	NC_017430	AAAG	2	8	26994	27001	75 %	0 %	25 %	0 %	385240453
575	NC_017430	GA	3	6	27019	27024	50 %	0 %	50 %	0 %	385240453
576	NC_017430	T	7	7	27093	27099	0 %	100 %	0 %	0 %	385240453
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585	NC_017430	GGATA	2	10	27337	27346	40 %	20 %	40 %	0 %	385240453
586	NC_017430	A	7	7	27361	27367	100 %	0 %	0 %	0 %	385240453
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589	NC_017430	A	8	8	27495	27502	100 %	0 %	0 %	0 %	385240454
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602	NC_017430	ATTG	2	8	27938	27945	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
603	NC_017430	AG	3	6	27970	27975	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
604	NC_017430	AGA	2	6	27992	27997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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610	NC_017430	GAT	3	9	28318	28326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385240455
611	NC_017430	GAG	2	6	28361	28366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385240455
612	NC_017430	TG	3	6	28393	28398	0 %	50 %	50 %	0 %	385240455
613	NC_017430	GCA	2	6	28417	28422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385240455
614	NC_017430	TC	3	6	28446	28451	0 %	50 %	0 %	50 %	385240455
615	NC_017430	AGGGT	2	10	28580	28589	20 %	20 %	60 %	0 %	385240455
616	NC_017430	TTC	2	6	28616	28621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240455
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619	NC_017430	TGA	2	6	28656	28661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385240455
620	NC_017430	TTC	2	6	28689	28694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240455
621	NC_017430	GC	4	8	28860	28867	0 %	0 %	50 %	50 %	385240455
622	NC_017430	AAG	2	6	28868	28873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240455
623	NC_017430	TA	3	6	28982	28987	50 %	50 %	0 %	0 %	385240455
624	NC_017430	GAA	2	6	29071	29076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240455
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627	NC_017430	ACA	2	6	29399	29404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385240456
628	NC_017430	ATG	2	6	29409	29414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385240456
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630	NC_017430	TTTG	2	8	29566	29573	0 %	75 %	25 %	0 %	385240456
631	NC_017430	TTGT	2	8	29601	29608	0 %	75 %	25 %	0 %	385240456
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633	NC_017430	T	6	6	29636	29641	0 %	100 %	0 %	0 %	385240456
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