MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis G/11222 chromosome

Total Repeats: 22974

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_017430	T	7	7	250681	250687	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5502	NC_017430	A	6	6	250689	250694	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5503	NC_017430	ACA	2	6	250789	250794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385240653
5504	NC_017430	CTT	2	6	250796	250801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240653
5505	NC_017430	AAG	2	6	250827	250832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240653
5506	NC_017430	GCA	2	6	250846	250851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385240653
5507	NC_017430	TTG	2	6	250866	250871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5508	NC_017430	CAAA	2	8	251030	251037	75 %	0 %	0 %	25 %	385240654
5509	NC_017430	ATA	2	6	251053	251058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385240654
5510	NC_017430	CAAT	2	8	251140	251147	50 %	25 %	0 %	25 %	385240654
5511	NC_017430	CTTT	3	12	251192	251203	0 %	75 %	0 %	25 %	385240654
5512	NC_017430	CGA	2	6	251234	251239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385240654
5513	NC_017430	CTT	2	6	251245	251250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240654
5514	NC_017430	ACA	2	6	251267	251272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385240654
5515	NC_017430	CTC	2	6	251286	251291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5516	NC_017430	CAA	2	6	251330	251335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5517	NC_017430	AG	3	6	251375	251380	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5518	NC_017430	A	8	8	251381	251388	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5519	NC_017430	AG	3	6	251400	251405	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5520	NC_017430	CAT	4	12	251448	251459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240655
5521	NC_017430	TTA	2	6	251594	251599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385240655
5522	NC_017430	CTC	2	6	251625	251630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385240655
5523	NC_017430	AGT	2	6	251649	251654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385240655
5524	NC_017430	GCAG	2	8	251696	251703	25 %	0 %	50 %	25 %	385240655
5525	NC_017430	TCTT	2	8	251713	251720	0 %	75 %	0 %	25 %	385240655
5526	NC_017430	C	7	7	251725	251731	0 %	0 %	0 %	100 %	385240655
5527	NC_017430	AGA	2	6	251741	251746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240655
5528	NC_017430	CTT	2	6	251757	251762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240655
5529	NC_017430	ACA	2	6	251773	251778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385240655
5530	NC_017430	TC	3	6	251815	251820	0 %	50 %	0 %	50 %	385240655
5531	NC_017430	TTG	2	6	251872	251877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385240655
5532	NC_017430	TCT	2	6	251894	251899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240655
5533	NC_017430	T	7	7	251934	251940	0 %	100 %	0 %	0 %	385240655
5534	NC_017430	CAA	2	6	251951	251956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385240655
5535	NC_017430	AGA	3	9	252024	252032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240655
5536	NC_017430	GGC	2	6	252035	252040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385240655
5537	NC_017430	ACA	2	6	252065	252070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385240655
5538	NC_017430	CAC	2	6	252072	252077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385240655
5539	NC_017430	CAG	2	6	252078	252083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385240655
5540	NC_017430	T	8	8	252147	252154	0 %	100 %	0 %	0 %	385240655
5541	NC_017430	TCC	2	6	252238	252243	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5542	NC_017430	GAAA	2	8	252259	252266	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5543	NC_017430	T	7	7	252280	252286	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5544	NC_017430	GCAG	2	8	252308	252315	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5545	NC_017430	AGAA	2	8	252341	252348	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5546	NC_017430	AG	3	6	252383	252388	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_017430	TAT	2	6	252406	252411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_017430	ACA	2	6	252447	252452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5549	NC_017430	A	6	6	252496	252501	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_017430	TTG	2	6	252676	252681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385240656
5551	NC_017430	TCT	2	6	252698	252703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240656
5552	NC_017430	TC	3	6	252745	252750	0 %	50 %	0 %	50 %	385240656
5553	NC_017430	T	7	7	252781	252787	0 %	100 %	0 %	0 %	385240656
5554	NC_017430	CCA	2	6	252794	252799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385240656
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5556	NC_017430	AATA	2	8	252901	252908	75 %	25 %	0 %	0 %	385240656
5557	NC_017430	GCT	2	6	252911	252916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385240656
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5559	NC_017430	CCA	2	6	253008	253013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385240656
5560	NC_017430	CAA	2	6	253056	253061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385240656
5561	NC_017430	CCCA	2	8	253164	253171	25 %	0 %	0 %	75 %	385240657
5562	NC_017430	CTT	2	6	253293	253298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240657
5563	NC_017430	AAT	2	6	253372	253377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385240657
5564	NC_017430	CTC	2	6	253383	253388	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385240657
5565	NC_017430	ACT	2	6	253391	253396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240657
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5568	NC_017430	GCAA	2	8	253454	253461	50 %	0 %	25 %	25 %	385240657
5569	NC_017430	AAC	2	6	253471	253476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385240657
5570	NC_017430	GTT	2	6	253516	253521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385240657
5571	NC_017430	AAC	2	6	253555	253560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5572	NC_017430	A	6	6	253569	253574	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5573	NC_017430	TAA	2	6	253620	253625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5574	NC_017430	TTC	2	6	253638	253643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240658
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5577	NC_017430	AGCA	2	8	253716	253723	50 %	0 %	25 %	25 %	385240658
5578	NC_017430	CTT	2	6	253733	253738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240658
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5583	NC_017430	TCC	2	6	253878	253883	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385240658
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5590	NC_017430	GTA	2	6	254041	254046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385240658
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5592	NC_017430	A	8	8	254140	254147	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5593	NC_017430	TA	3	6	254189	254194	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5594	NC_017430	CCAA	2	8	254224	254231	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5595	NC_017430	A	7	7	254248	254254	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5596	NC_017430	TAT	2	6	254267	254272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385240659
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5598	NC_017430	AGA	2	6	254335	254340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240659
5599	NC_017430	TGTT	2	8	254373	254380	0 %	75 %	25 %	0 %	385240659
5600	NC_017430	CGA	2	6	254494	254499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385240659
5601	NC_017430	GCAAA	2	10	254506	254515	60 %	0 %	20 %	20 %	385240659
5602	NC_017430	AATA	2	8	254592	254599	75 %	25 %	0 %	0 %	385240659
5603	NC_017430	A	6	6	254658	254663	100 %	0 %	0 %	0 %	385240659
5604	NC_017430	A	7	7	254689	254695	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5605	NC_017430	ATA	2	6	254702	254707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5606	NC_017430	AACCCT	2	12	254748	254759	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
5607	NC_017430	AAAC	2	8	254831	254838	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5608	NC_017430	AAG	2	6	254955	254960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240660
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5610	NC_017430	AATC	2	8	255096	255103	50 %	25 %	0 %	25 %	385240660
5611	NC_017430	TTA	2	6	255167	255172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385240660
5612	NC_017430	CTTCT	2	10	255199	255208	0 %	60 %	0 %	40 %	385240660
5613	NC_017430	T	6	6	255242	255247	0 %	100 %	0 %	0 %	385240660
5614	NC_017430	CA	3	6	255301	255306	50 %	0 %	0 %	50 %	385240660
5615	NC_017430	AAT	2	6	255316	255321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385240660
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5622	NC_017430	GAG	2	6	255680	255685	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5623	NC_017430	ATT	2	6	255692	255697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385240661
5624	NC_017430	T	6	6	255696	255701	0 %	100 %	0 %	0 %	385240661
5625	NC_017430	ACG	2	6	255702	255707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385240661
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