MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis G/11222 chromosome

Total Repeats: 22974

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017430	CAA	2	6	226952	226957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385240632
5002	NC_017430	AAC	2	6	227029	227034	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385240633
5003	NC_017430	GAG	2	6	227068	227073	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385240633
5004	NC_017430	CT	3	6	227114	227119	0 %	50 %	0 %	50 %	385240633
5005	NC_017430	TCGA	2	8	227163	227170	25 %	25 %	25 %	25 %	385240633
5006	NC_017430	TCC	2	6	227180	227185	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385240633
5007	NC_017430	GAT	2	6	227213	227218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385240633
5008	NC_017430	ATG	2	6	227250	227255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385240633
5009	NC_017430	CAT	2	6	227288	227293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240633
5010	NC_017430	G	6	6	227294	227299	0 %	0 %	100 %	0 %	385240633
5011	NC_017430	AAG	2	6	227320	227325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240633
5012	NC_017430	TAA	2	6	227384	227389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385240633
5013	NC_017430	GCAACG	2	12	227402	227413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385240633
5014	NC_017430	GT	3	6	227436	227441	0 %	50 %	50 %	0 %	385240633
5015	NC_017430	AATT	2	8	227449	227456	50 %	50 %	0 %	0 %	385240633
5016	NC_017430	ATTT	2	8	227512	227519	25 %	75 %	0 %	0 %	385240633
5017	NC_017430	T	6	6	227549	227554	0 %	100 %	0 %	0 %	385240633
5018	NC_017430	TCA	2	6	227557	227562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240633
5019	NC_017430	CTG	2	6	227575	227580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385240633
5020	NC_017430	TAG	2	6	227626	227631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385240633
5021	NC_017430	CTT	2	6	227688	227693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240633
5022	NC_017430	T	8	8	227762	227769	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_017430	TCCT	2	8	227912	227919	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5024	NC_017430	AGA	2	6	227964	227969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_017430	ATT	2	6	228001	228006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_017430	TTC	2	6	228085	228090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240634
5027	NC_017430	GAA	2	6	228159	228164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240634
5028	NC_017430	TGA	2	6	228191	228196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385240634
5029	NC_017430	ATT	2	6	228270	228275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385240634
5030	NC_017430	AGA	2	6	228332	228337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240634
5031	NC_017430	TC	3	6	228338	228343	0 %	50 %	0 %	50 %	385240634
5032	NC_017430	TGA	2	6	228365	228370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385240634
5033	NC_017430	TCG	2	6	228454	228459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385240634
5034	NC_017430	A	7	7	228526	228532	100 %	0 %	0 %	0 %	385240634
5035	NC_017430	CCTT	2	8	228534	228541	0 %	50 %	0 %	50 %	385240634
5036	NC_017430	TTG	2	6	228556	228561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385240634
5037	NC_017430	T	6	6	228592	228597	0 %	100 %	0 %	0 %	385240634
5038	NC_017430	GATA	2	8	228629	228636	50 %	25 %	25 %	0 %	385240634
5039	NC_017430	ATT	2	6	228669	228674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385240634
5040	NC_017430	GAA	2	6	228678	228683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240634
5041	NC_017430	TCCTC	2	10	228709	228718	0 %	40 %	0 %	60 %	385240634
5042	NC_017430	AGA	2	6	228743	228748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240634
5043	NC_017430	CTT	2	6	228835	228840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240635
5044	NC_017430	TAC	2	6	228937	228942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240635
5045	NC_017430	TAT	2	6	228946	228951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385240635
5046	NC_017430	TCT	2	6	229006	229011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240635
5047	NC_017430	TTTC	2	8	229082	229089	0 %	75 %	0 %	25 %	385240635
5048	NC_017430	CTT	2	6	229144	229149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240635
5049	NC_017430	TTA	2	6	229211	229216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385240635
5050	NC_017430	TGT	2	6	229267	229272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385240635
5051	NC_017430	T	6	6	229336	229341	0 %	100 %	0 %	0 %	385240635
5052	NC_017430	TAT	2	6	229411	229416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385240635
5053	NC_017430	ATT	2	6	229490	229495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385240635
5054	NC_017430	GAA	2	6	229556	229561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240635
5055	NC_017430	ATT	2	6	229622	229627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385240635
5056	NC_017430	CAA	2	6	229689	229694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385240635
5057	NC_017430	TTCT	2	8	229758	229765	0 %	75 %	0 %	25 %	385240635
5058	NC_017430	ACT	2	6	229769	229774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240635
5059	NC_017430	ATG	2	6	229811	229816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385240635
5060	NC_017430	CTTC	2	8	229818	229825	0 %	50 %	0 %	50 %	385240635
5061	NC_017430	TTAT	2	8	229920	229927	25 %	75 %	0 %	0 %	385240635
5062	NC_017430	CTAT	2	8	229939	229946	25 %	50 %	0 %	25 %	385240635
5063	NC_017430	TCTT	2	8	229986	229993	0 %	75 %	0 %	25 %	385240635
5064	NC_017430	TGC	2	6	230029	230034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385240635
5065	NC_017430	CTTAGC	2	12	230035	230046	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385240635
5066	NC_017430	GGA	2	6	230066	230071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385240635
5067	NC_017430	CA	3	6	230074	230079	50 %	0 %	0 %	50 %	385240635
5068	NC_017430	TGG	2	6	230138	230143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385240635
5069	NC_017430	TTGG	2	8	230182	230189	0 %	50 %	50 %	0 %	385240635
5070	NC_017430	TGG	3	9	230201	230209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385240635
5071	NC_017430	GTC	2	6	230255	230260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385240636
5072	NC_017430	CTT	2	6	230293	230298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240636
5073	NC_017430	AGA	2	6	230339	230344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240636
5074	NC_017430	CTT	2	6	230361	230366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240636
5075	NC_017430	CTA	2	6	230420	230425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240636
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5077	NC_017430	TGG	2	6	230507	230512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385240636
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5079	NC_017430	GAA	2	6	230706	230711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240636
5080	NC_017430	GC	3	6	230718	230723	0 %	0 %	50 %	50 %	385240636
5081	NC_017430	ATT	2	6	230766	230771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385240636
5082	NC_017430	GCA	2	6	230879	230884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385240636
5083	NC_017430	CTA	2	6	230920	230925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240636
5084	NC_017430	CATC	2	8	230935	230942	25 %	25 %	0 %	50 %	385240636
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5089	NC_017430	TCT	2	6	231282	231287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240636
5090	NC_017430	T	6	6	231461	231466	0 %	100 %	0 %	0 %	385240636
5091	NC_017430	GC	3	6	231620	231625	0 %	0 %	50 %	50 %	385240636
5092	NC_017430	GAC	2	6	231647	231652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385240636
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5099	NC_017430	AATG	2	8	231858	231865	50 %	25 %	25 %	0 %	385240636
5100	NC_017430	ATT	2	6	231907	231912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385240636
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5102	NC_017430	CAA	2	6	231959	231964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385240637
5103	NC_017430	A	6	6	231985	231990	100 %	0 %	0 %	0 %	385240637
5104	NC_017430	A	6	6	232059	232064	100 %	0 %	0 %	0 %	385240637
5105	NC_017430	AAG	2	6	232155	232160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240637
5106	NC_017430	A	6	6	232254	232259	100 %	0 %	0 %	0 %	385240637
5107	NC_017430	AGG	2	6	232324	232329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385240637
5108	NC_017430	TGC	2	6	232375	232380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385240637
5109	NC_017430	AGA	2	6	232417	232422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240637
5110	NC_017430	CT	3	6	232444	232449	0 %	50 %	0 %	50 %	385240637
5111	NC_017430	C	6	6	232456	232461	0 %	0 %	0 %	100 %	385240637
5112	NC_017430	A	6	6	232496	232501	100 %	0 %	0 %	0 %	385240637
5113	NC_017430	AAG	2	6	232557	232562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240637
5114	NC_017430	TTAC	2	8	232573	232580	25 %	50 %	0 %	25 %	385240637
5115	NC_017430	TCA	2	6	232612	232617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240637
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5117	NC_017430	TCA	2	6	232678	232683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240637
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5119	NC_017430	CT	3	6	232762	232767	0 %	50 %	0 %	50 %	385240637
5120	NC_017430	CTT	2	6	232865	232870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240638
5121	NC_017430	GCTA	2	8	232890	232897	25 %	25 %	25 %	25 %	385240638
5122	NC_017430	CTT	3	9	232952	232960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240638
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5124	NC_017430	ATT	2	6	233031	233036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385240638
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5128	NC_017430	ATT	2	6	233147	233152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385240638
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5153	NC_017430	GAG	2	6	234447	234452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5223	NC_017430	AG	3	6	238454	238459	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5242	NC_017430	TTCT	2	8	239933	239940	0 %	75 %	0 %	25 %	385240642
5243	NC_017430	AAT	2	6	239955	239960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385240642
5244	NC_017430	GTC	2	6	240060	240065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385240642
5245	NC_017430	TCC	2	6	240105	240110	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385240642
5246	NC_017430	ACGG	2	8	240118	240125	25 %	0 %	50 %	25 %	385240642
5247	NC_017430	AGA	2	6	240138	240143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240642
5248	NC_017430	CAA	2	6	240168	240173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385240642
5249	NC_017430	TCA	2	6	240226	240231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240642
5250	NC_017430	A	6	6	240245	240250	100 %	0 %	0 %	0 %	385240642
5251	NC_017430	TCT	2	6	240253	240258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240642
5252	NC_017430	AAACCA	2	12	240323	240334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385240642
5253	NC_017430	A	6	6	240344	240349	100 %	0 %	0 %	0 %	385240642
5254	NC_017430	AATCT	2	10	240439	240448	40 %	40 %	0 %	20 %	385240643
5255	NC_017430	TCA	2	6	240464	240469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240643
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5257	NC_017430	ACT	2	6	240629	240634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240643
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5260	NC_017430	CTG	2	6	240711	240716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385240643
5261	NC_017430	T	6	6	240730	240735	0 %	100 %	0 %	0 %	385240643
5262	NC_017430	AAT	2	6	240796	240801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385240643
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5264	NC_017430	T	7	7	240896	240902	0 %	100 %	0 %	0 %	385240644
5265	NC_017430	AAT	2	6	240968	240973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385240644
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5270	NC_017430	T	6	6	241252	241257	0 %	100 %	0 %	0 %	385240644
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5273	NC_017430	CT	3	6	241472	241477	0 %	50 %	0 %	50 %	385240644
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5280	NC_017430	CT	3	6	241751	241756	0 %	50 %	0 %	50 %	385240645
5281	NC_017430	TAG	2	6	241790	241795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385240645
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5285	NC_017430	T	8	8	241878	241885	0 %	100 %	0 %	0 %	385240645
5286	NC_017430	TGA	2	6	241887	241892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385240645
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5300	NC_017430	AAG	2	6	242487	242492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240645
5301	NC_017430	AGCT	2	8	242505	242512	25 %	25 %	25 %	25 %	385240645
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5317	NC_017430	CGAT	2	8	243113	243120	25 %	25 %	25 %	25 %	385240645
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5322	NC_017430	GCT	2	6	243211	243216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385240645
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5343	NC_017430	TAAAC	2	10	244037	244046	60 %	20 %	0 %	20 %	385240646
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5351	NC_017430	TGT	2	6	244265	244270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385240646
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5356	NC_017430	TGA	2	6	244409	244414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385240646
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5360	NC_017430	TAAT	2	8	244561	244568	50 %	50 %	0 %	0 %	385240646
5361	NC_017430	TGG	2	6	244577	244582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385240646
5362	NC_017430	ATTT	2	8	244662	244669	25 %	75 %	0 %	0 %	385240646
5363	NC_017430	CAT	2	6	244711	244716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240647
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5365	NC_017430	AGT	2	6	244770	244775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385240647
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5367	NC_017430	GCA	2	6	244879	244884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385240647
5368	NC_017430	TTCA	2	8	244893	244900	25 %	50 %	0 %	25 %	385240647
5369	NC_017430	ATA	2	6	244982	244987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385240647
5370	NC_017430	AAT	2	6	245059	245064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385240647
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5372	NC_017430	TGC	2	6	245208	245213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385240647
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5495	NC_017430	GTATG	2	10	250421	250430	20 %	40 %	40 %	0 %	385240652
5496	NC_017430	GA	3	6	250463	250468	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5497	NC_017430	ACT	2	6	250523	250528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5498	NC_017430	TG	3	6	250573	250578	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5499	NC_017430	AATA	2	8	250640	250647	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5500	NC_017430	T	6	6	250662	250667	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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