MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis G/11222 chromosome

Total Repeats: 22974

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017430	TCTA	2	8	204515	204522	25 %	50 %	0 %	25 %	385240613
4502	NC_017430	TATT	2	8	204593	204600	25 %	75 %	0 %	0 %	385240613
4503	NC_017430	TCT	2	6	204640	204645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240614
4504	NC_017430	CT	3	6	204669	204674	0 %	50 %	0 %	50 %	385240614
4505	NC_017430	CTA	2	6	204682	204687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240614
4506	NC_017430	GA	3	6	204688	204693	50 %	0 %	50 %	0 %	385240614
4507	NC_017430	CGA	2	6	204789	204794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385240614
4508	NC_017430	ATC	2	6	204827	204832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240614
4509	NC_017430	TCT	2	6	204838	204843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240614
4510	NC_017430	ATT	2	6	204967	204972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385240614
4511	NC_017430	AAACC	2	10	205163	205172	60 %	0 %	0 %	40 %	385240614
4512	NC_017430	GCA	2	6	205199	205204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385240614
4513	NC_017430	CTT	2	6	205380	205385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240614
4514	NC_017430	TAAA	2	8	205388	205395	75 %	25 %	0 %	0 %	385240614
4515	NC_017430	TTG	2	6	205490	205495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385240614
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4518	NC_017430	GATG	2	8	205636	205643	25 %	25 %	50 %	0 %	385240614
4519	NC_017430	AAG	2	6	205668	205673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240614
4520	NC_017430	GGGAA	2	10	205676	205685	40 %	0 %	60 %	0 %	385240614
4521	NC_017430	CAG	2	6	205691	205696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385240614
4522	NC_017430	TAG	2	6	205757	205762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385240614
4523	NC_017430	AAAT	2	8	205811	205818	75 %	25 %	0 %	0 %	385240614
4524	NC_017430	GTC	2	6	205837	205842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385240614
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4529	NC_017430	TTG	2	6	206069	206074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385240614
4530	NC_017430	GATG	2	8	206090	206097	25 %	25 %	50 %	0 %	385240614
4531	NC_017430	ATTC	2	8	206163	206170	25 %	50 %	0 %	25 %	385240614
4532	NC_017430	GCT	2	6	206173	206178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385240614
4533	NC_017430	CAA	3	9	206222	206230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385240615
4534	NC_017430	T	6	6	206233	206238	0 %	100 %	0 %	0 %	385240615
4535	NC_017430	A	6	6	206255	206260	100 %	0 %	0 %	0 %	385240615
4536	NC_017430	CT	3	6	206332	206337	0 %	50 %	0 %	50 %	385240615
4537	NC_017430	TAT	2	6	206365	206370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385240615
4538	NC_017430	AGT	2	6	206392	206397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385240615
4539	NC_017430	GA	4	8	206682	206689	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4540	NC_017430	T	7	7	206712	206718	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4541	NC_017430	CT	4	8	206730	206737	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4542	NC_017430	A	6	6	206739	206744	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_017430	GAA	2	6	206773	206778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240616
4544	NC_017430	TCC	2	6	206811	206816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385240616
4545	NC_017430	AGGA	2	8	206894	206901	50 %	0 %	50 %	0 %	385240616
4546	NC_017430	TTTG	2	8	206917	206924	0 %	75 %	25 %	0 %	385240616
4547	NC_017430	GAA	2	6	206968	206973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240616
4548	NC_017430	TC	3	6	206996	207001	0 %	50 %	0 %	50 %	385240616
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4552	NC_017430	ACC	2	6	207168	207173	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385240616
4553	NC_017430	ATT	2	6	207176	207181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385240616
4554	NC_017430	ATC	2	6	207190	207195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240616
4555	NC_017430	CAA	2	6	207310	207315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385240616
4556	NC_017430	TGA	2	6	207333	207338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385240616
4557	NC_017430	ATT	2	6	207362	207367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385240616
4558	NC_017430	CT	3	6	207416	207421	0 %	50 %	0 %	50 %	385240616
4559	NC_017430	TTC	2	6	207505	207510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240616
4560	NC_017430	GCT	2	6	207558	207563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385240616
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4562	NC_017430	GAA	2	6	207604	207609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240616
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4564	NC_017430	A	6	6	207620	207625	100 %	0 %	0 %	0 %	385240616
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4624	NC_017430	AGA	2	6	210431	210436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240619
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4626	NC_017430	CT	3	6	210475	210480	0 %	50 %	0 %	50 %	385240619
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4633	NC_017430	GAAC	2	8	210864	210871	50 %	0 %	25 %	25 %	385240620
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4691	NC_017430	TTC	2	6	213541	213546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240621
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4712	NC_017430	CT	3	6	214323	214328	0 %	50 %	0 %	50 %	385240621
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4720	NC_017430	CTTGT	2	10	214653	214662	0 %	60 %	20 %	20 %	385240621
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4728	NC_017430	CTTG	2	8	215247	215254	0 %	50 %	25 %	25 %	385240621
4729	NC_017430	GAAATA	2	12	215303	215314	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385240621
4730	NC_017430	AAC	2	6	215335	215340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385240621
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4732	NC_017430	CGT	2	6	215496	215501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385240621
4733	NC_017430	TTTCT	2	10	215503	215512	0 %	80 %	0 %	20 %	385240621
4734	NC_017430	TAA	2	6	215532	215537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385240622
4735	NC_017430	CTG	2	6	215570	215575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385240622
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4739	NC_017430	GAA	2	6	215926	215931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4740	NC_017430	TTG	2	6	215943	215948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4741	NC_017430	A	6	6	215955	215960	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4742	NC_017430	ACA	2	6	216085	216090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385240623
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4744	NC_017430	CTT	2	6	216180	216185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240623
4745	NC_017430	AAC	2	6	216188	216193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385240623
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4747	NC_017430	TCC	2	6	216323	216328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385240623
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4861	NC_017430	ATTTC	2	10	221175	221184	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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4863	NC_017430	AATT	2	8	221208	221215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4864	NC_017430	CAA	2	6	221237	221242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385240627
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4866	NC_017430	GCT	2	6	221302	221307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385240627
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4870	NC_017430	GCA	2	6	221419	221424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385240627
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4872	NC_017430	TCG	2	6	221459	221464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385240627
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4994	NC_017430	AGA	2	6	226506	226511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240632
4995	NC_017430	ATTGCT	2	12	226624	226635	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385240632
4996	NC_017430	ATT	2	6	226657	226662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385240632
4997	NC_017430	CTA	2	6	226753	226758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240632
4998	NC_017430	TCA	2	6	226760	226765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240632
4999	NC_017430	TG	3	6	226793	226798	0 %	50 %	50 %	0 %	385240632
5000	NC_017430	TCCTAG	2	12	226914	226925	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385240632

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