MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis G/9768 chromosome

Total Repeats: 22972

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2502	NC_017429	CGA	2	6	113721	113726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385239609
2503	NC_017429	A	6	6	113739	113744	100 %	0 %	0 %	0 %	385239609
2504	NC_017429	GCA	2	6	113813	113818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385239609
2505	NC_017429	CTA	2	6	113844	113849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385239609
2506	NC_017429	TC	3	6	113871	113876	0 %	50 %	0 %	50 %	385239609
2507	NC_017429	CTC	2	6	113922	113927	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2508	NC_017429	A	7	7	113941	113947	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2509	NC_017429	A	8	8	113950	113957	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2510	NC_017429	GCTCT	2	10	113984	113993	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2511	NC_017429	ATT	2	6	114018	114023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2512	NC_017429	AGA	2	6	114046	114051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239610
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2514	NC_017429	AG	3	6	114172	114177	50 %	0 %	50 %	0 %	385239610
2515	NC_017429	TAC	2	6	114286	114291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385239610
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2518	NC_017429	ACAG	2	8	114395	114402	50 %	0 %	25 %	25 %	385239610
2519	NC_017429	T	6	6	114427	114432	0 %	100 %	0 %	0 %	385239610
2520	NC_017429	T	6	6	114457	114462	0 %	100 %	0 %	0 %	385239610
2521	NC_017429	CTG	2	6	114552	114557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385239610
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2523	NC_017429	TGTTT	2	10	114608	114617	0 %	80 %	20 %	0 %	385239610
2524	NC_017429	GA	4	8	114628	114635	50 %	0 %	50 %	0 %	385239610
2525	NC_017429	AGAA	2	8	114658	114665	75 %	0 %	25 %	0 %	385239610
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2531	NC_017429	GGA	2	6	114833	114838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385239610
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2549	NC_017429	TCT	2	6	115673	115678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385239610
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2552	NC_017429	T	6	6	115706	115711	0 %	100 %	0 %	0 %	385239610
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2555	NC_017429	A	6	6	115802	115807	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2556	NC_017429	TAA	2	6	115833	115838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2557	NC_017429	A	7	7	115855	115861	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2558	NC_017429	TTTTAG	2	12	115883	115894	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2559	NC_017429	TG	3	6	115899	115904	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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2561	NC_017429	T	7	7	116030	116036	0 %	100 %	0 %	0 %	385239611
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2592	NC_017429	CAA	2	6	117544	117549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2594	NC_017429	AAG	2	6	117596	117601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2596	NC_017429	T	6	6	117630	117635	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2597	NC_017429	CA	3	6	117817	117822	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2598	NC_017429	ATC	2	6	117865	117870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2600	NC_017429	TAA	2	6	117936	117941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2601	NC_017429	AT	3	6	118023	118028	50 %	50 %	0 %	0 %	385239613
2602	NC_017429	T	6	6	118033	118038	0 %	100 %	0 %	0 %	385239613
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2606	NC_017429	G	6	6	118169	118174	0 %	0 %	100 %	0 %	385239613
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2609	NC_017429	GA	3	6	118319	118324	50 %	0 %	50 %	0 %	385239613
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2617	NC_017429	CTT	2	6	118493	118498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2622	NC_017429	TTTA	2	8	118737	118744	25 %	75 %	0 %	0 %	385239614
2623	NC_017429	CTG	2	6	118935	118940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385239614
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2626	NC_017429	GA	4	8	119010	119017	50 %	0 %	50 %	0 %	385239614
2627	NC_017429	GAA	2	6	119024	119029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239614
2628	NC_017429	TTC	2	6	119063	119068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385239614
2629	NC_017429	TACT	2	8	119125	119132	25 %	50 %	0 %	25 %	385239614
2630	NC_017429	GTT	2	6	119169	119174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385239614
2631	NC_017429	TAT	2	6	119204	119209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385239614
2632	NC_017429	GAT	2	6	119220	119225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385239614
2633	NC_017429	GAG	2	6	119251	119256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385239614
2634	NC_017429	TC	3	6	119342	119347	0 %	50 %	0 %	50 %	385239614
2635	NC_017429	AG	3	6	119445	119450	50 %	0 %	50 %	0 %	385239615
2636	NC_017429	GCTA	2	8	119467	119474	25 %	25 %	25 %	25 %	385239615
2637	NC_017429	GA	3	6	119478	119483	50 %	0 %	50 %	0 %	385239615
2638	NC_017429	AAG	2	6	119486	119491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239615
2639	NC_017429	GCT	3	9	119492	119500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385239615
2640	NC_017429	GTA	2	6	119551	119556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385239615
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2642	NC_017429	TC	3	6	119566	119571	0 %	50 %	0 %	50 %	385239615
2643	NC_017429	GCTA	2	8	119599	119606	25 %	25 %	25 %	25 %	385239615
2644	NC_017429	CGGC	2	8	119648	119655	0 %	0 %	50 %	50 %	385239615
2645	NC_017429	AGC	2	6	119689	119694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385239615
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2647	NC_017429	TCC	2	6	119710	119715	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385239615
2648	NC_017429	AG	3	6	119756	119761	50 %	0 %	50 %	0 %	385239615
2649	NC_017429	GA	4	8	119799	119806	50 %	0 %	50 %	0 %	385239615
2650	NC_017429	GGC	2	6	119839	119844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385239615
2651	NC_017429	T	6	6	119938	119943	0 %	100 %	0 %	0 %	385239615
2652	NC_017429	TCT	2	6	120023	120028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385239615
2653	NC_017429	GA	3	6	120132	120137	50 %	0 %	50 %	0 %	385239615
2654	NC_017429	ATC	2	6	120226	120231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385239615
2655	NC_017429	TCT	2	6	120300	120305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2656	NC_017429	GA	3	6	120307	120312	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2657	NC_017429	TAT	2	6	120331	120336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2658	NC_017429	ATA	2	6	120352	120357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2659	NC_017429	CTGG	2	8	120375	120382	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2660	NC_017429	TAAAAA	2	12	120479	120490	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2661	NC_017429	TTGGTA	2	12	120527	120538	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385239616
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2663	NC_017429	TCA	2	6	120574	120579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385239616
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2666	NC_017429	TGC	2	6	120645	120650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385239616
2667	NC_017429	CTG	2	6	120653	120658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385239616
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2701	NC_017429	TA	3	6	122542	122547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2702	NC_017429	T	6	6	122588	122593	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2703	NC_017429	ACT	2	6	122643	122648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385239617
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2707	NC_017429	AGCT	2	8	122788	122795	25 %	25 %	25 %	25 %	385239617
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2712	NC_017429	TAA	2	6	123142	123147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385239617
2713	NC_017429	TGA	2	6	123231	123236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385239617
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2719	NC_017429	T	6	6	123575	123580	0 %	100 %	0 %	0 %	385239618
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2732	NC_017429	A	7	7	123976	123982	100 %	0 %	0 %	0 %	385239618
2733	NC_017429	CTG	2	6	123985	123990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385239618
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2736	NC_017429	ATCG	2	8	124044	124051	25 %	25 %	25 %	25 %	385239618
2737	NC_017429	AG	3	6	124065	124070	50 %	0 %	50 %	0 %	385239618
2738	NC_017429	AGC	2	6	124253	124258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385239618
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2740	NC_017429	TGA	2	6	124312	124317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385239618
2741	NC_017429	AAGAGA	2	12	124327	124338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239618
2742	NC_017429	TAC	2	6	124365	124370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385239618
2743	NC_017429	AGA	2	6	124382	124387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239618
2744	NC_017429	TTG	2	6	124388	124393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385239618
2745	NC_017429	GA	3	6	124435	124440	50 %	0 %	50 %	0 %	385239618
2746	NC_017429	TAG	2	6	124454	124459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385239618
2747	NC_017429	CTTC	2	8	124461	124468	0 %	50 %	0 %	50 %	385239618
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2998	NC_017429	AAC	2	6	135332	135337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385239626
2999	NC_017429	CAG	2	6	135351	135356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385239626
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