MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis 1/06-A chromosome

Total Repeats: 43087

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017308	GGA	2	6	209208	209213	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387139856
4002	NC_017308	GGA	2	6	209267	209272	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387139856
4003	NC_017308	TCG	2	6	209285	209290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139856
4004	NC_017308	AAG	2	6	209407	209412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387139856
4005	NC_017308	GCA	2	6	209474	209479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387139856
4006	NC_017308	AGC	2	6	209578	209583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387139856
4007	NC_017308	ACC	2	6	209676	209681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4008	NC_017308	GC	3	6	209714	209719	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4009	NC_017308	TCC	2	6	209737	209742	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4010	NC_017308	ATC	2	6	209774	209779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387139857
4011	NC_017308	TGC	2	6	209878	209883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139857
4012	NC_017308	GGT	2	6	209893	209898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387139857
4013	NC_017308	TTC	2	6	209955	209960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387139857
4014	NC_017308	TGG	2	6	210051	210056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387139857
4015	NC_017308	TTG	2	6	210174	210179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387139857
4016	NC_017308	GCC	2	6	210250	210255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387139857
4017	NC_017308	GAA	2	6	210380	210385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387139857
4018	NC_017308	CGG	2	6	210392	210397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387139857
4019	NC_017308	TGA	2	6	210421	210426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387139857
4020	NC_017308	TAC	2	6	210518	210523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387139857
4021	NC_017308	CTGCCC	2	12	210657	210668	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	387139857
4022	NC_017308	TGG	2	6	210783	210788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387139857
4023	NC_017308	CAG	2	6	210835	210840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387139857
4024	NC_017308	TACT	2	8	210855	210862	25 %	50 %	0 %	25 %	387139857
4025	NC_017308	AAG	2	6	210867	210872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387139857
4026	NC_017308	TGG	2	6	210882	210887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387139857
4027	NC_017308	TG	3	6	210929	210934	0 %	50 %	50 %	0 %	387139857
4028	NC_017308	TAG	2	6	210944	210949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387139857
4029	NC_017308	GCA	2	6	210962	210967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387139858
4030	NC_017308	GAGG	2	8	211147	211154	25 %	0 %	75 %	0 %	387139858
4031	NC_017308	GAA	2	6	211191	211196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387139858
4032	NC_017308	TCGA	2	8	211204	211211	25 %	25 %	25 %	25 %	387139858
4033	NC_017308	ACG	2	6	211221	211226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387139858
4034	NC_017308	CGCT	2	8	211249	211256	0 %	25 %	25 %	50 %	387139858
4035	NC_017308	GGT	2	6	211275	211280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387139858
4036	NC_017308	CAT	2	6	211356	211361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387139858
4037	NC_017308	GAA	2	6	211370	211375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387139858
4038	NC_017308	A	6	6	211382	211387	100 %	0 %	0 %	0 %	387139858
4039	NC_017308	CCA	2	6	211699	211704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387139858
4040	NC_017308	CG	3	6	211775	211780	0 %	0 %	50 %	50 %	387139858
4041	NC_017308	GCA	2	6	211784	211789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387139858
4042	NC_017308	TGG	3	9	211792	211800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387139858
4043	NC_017308	TTC	2	6	211849	211854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387139858
4044	NC_017308	ACG	2	6	211904	211909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4045	NC_017308	TCT	2	6	212053	212058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387139859
4046	NC_017308	CTT	2	6	212063	212068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387139859
4047	NC_017308	CTA	2	6	212074	212079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387139859
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4050	NC_017308	AGA	2	6	212182	212187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387139859
4051	NC_017308	TA	3	6	212194	212199	50 %	50 %	0 %	0 %	387139859
4052	NC_017308	CCG	2	6	212232	212237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387139859
4053	NC_017308	T	6	6	212246	212251	0 %	100 %	0 %	0 %	387139859
4054	NC_017308	GCA	2	6	212259	212264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387139859
4055	NC_017308	AAC	2	6	212298	212303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387139859
4056	NC_017308	TGG	2	6	212356	212361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387139859
4057	NC_017308	TCAG	2	8	212370	212377	25 %	25 %	25 %	25 %	387139859
4058	NC_017308	CG	3	6	212506	212511	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4059	NC_017308	TAGA	2	8	212527	212534	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_017308	TTG	2	6	212535	212540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_017308	GTA	2	6	212548	212553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_017308	ACC	2	6	212576	212581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387139860
4063	NC_017308	CT	3	6	212608	212613	0 %	50 %	0 %	50 %	387139860
4064	NC_017308	CCT	2	6	212681	212686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387139860
4065	NC_017308	GC	3	6	212705	212710	0 %	0 %	50 %	50 %	387139860
4066	NC_017308	TGC	2	6	212718	212723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139860
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4068	NC_017308	TGT	2	6	212949	212954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387139860
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4070	NC_017308	AGTGC	2	10	213112	213121	20 %	20 %	40 %	20 %	387139860
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4073	NC_017308	TCCG	2	8	213285	213292	0 %	25 %	25 %	50 %	387139861
4074	NC_017308	CCA	2	6	213299	213304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387139861
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4081	NC_017308	CCA	2	6	213694	213699	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387139861
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4085	NC_017308	ATGC	2	8	213749	213756	25 %	25 %	25 %	25 %	387139861
4086	NC_017308	AATG	2	8	213798	213805	50 %	25 %	25 %	0 %	387139861
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4090	NC_017308	GAT	2	6	214016	214021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387139861
4091	NC_017308	A	7	7	214037	214043	100 %	0 %	0 %	0 %	387139861
4092	NC_017308	GAA	2	6	214056	214061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387139861
4093	NC_017308	CGG	2	6	214063	214068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387139861
4094	NC_017308	ATC	2	6	214097	214102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387139861
4095	NC_017308	CGGGG	2	10	214114	214123	0 %	0 %	80 %	20 %	387139861
4096	NC_017308	GCG	2	6	214204	214209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4097	NC_017308	GAAAA	2	10	214253	214262	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_017308	A	6	6	214259	214264	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_017308	AAT	2	6	214311	214316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_017308	GCCC	2	8	214357	214364	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4101	NC_017308	C	6	6	214362	214367	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4102	NC_017308	GGC	2	6	214379	214384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4103	NC_017308	C	6	6	214394	214399	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4104	NC_017308	GCC	2	6	214408	214413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4105	NC_017308	TG	3	6	214418	214423	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_017308	AAC	2	6	214472	214477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387139862
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4109	NC_017308	TAG	2	6	214688	214693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_017308	GTCT	2	8	214714	214721	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4111	NC_017308	CGAGA	2	10	214893	214902	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4112	NC_017308	GCT	2	6	215107	215112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139863
4113	NC_017308	CAA	2	6	215129	215134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387139863
4114	NC_017308	CGCA	2	8	215141	215148	25 %	0 %	25 %	50 %	387139863
4115	NC_017308	TCT	2	6	215178	215183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387139863
4116	NC_017308	ATTG	2	8	215203	215210	25 %	50 %	25 %	0 %	387139863
4117	NC_017308	GCA	2	6	215239	215244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387139863
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4119	NC_017308	CCA	2	6	215305	215310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387139863
4120	NC_017308	CTT	2	6	215417	215422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387139863
4121	NC_017308	TCT	2	6	215436	215441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387139863
4122	NC_017308	GAC	2	6	215512	215517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387139863
4123	NC_017308	GCG	2	6	215524	215529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387139863
4124	NC_017308	TGA	2	6	215595	215600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387139863
4125	NC_017308	CGC	2	6	215697	215702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387139863
4126	NC_017308	CCG	2	6	215726	215731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387139863
4127	NC_017308	CG	3	6	215737	215742	0 %	0 %	50 %	50 %	387139863
4128	NC_017308	GCA	3	9	215746	215754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387139863
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4130	NC_017308	GTC	2	6	215794	215799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139863
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4143	NC_017308	GAT	2	6	216288	216293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387139864
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4221	NC_017308	TGA	2	6	219815	219820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4230	NC_017308	AAG	2	6	220429	220434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4231	NC_017308	GAT	2	6	220443	220448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4232	NC_017308	TCA	2	6	220472	220477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4233	NC_017308	TGCT	2	8	220528	220535	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4234	NC_017308	TAC	2	6	220573	220578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4235	NC_017308	AGC	2	6	220637	220642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4237	NC_017308	ATG	2	6	220841	220846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4238	NC_017308	GGC	2	6	220849	220854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4240	NC_017308	ATG	2	6	220931	220936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4242	NC_017308	GAG	2	6	220990	220995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4243	NC_017308	GTT	2	6	221017	221022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4244	NC_017308	GGA	2	6	221079	221084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4245	NC_017308	GCC	2	6	221085	221090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4246	NC_017308	GCA	2	6	221091	221096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4247	NC_017308	CTC	2	6	221121	221126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4248	NC_017308	TCG	2	6	221141	221146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4249	NC_017308	TGA	2	6	221189	221194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4251	NC_017308	CTT	2	6	221343	221348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4252	NC_017308	CAAGA	2	10	221436	221445	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
4253	NC_017308	GGA	2	6	221479	221484	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4255	NC_017308	CTT	2	6	221535	221540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4256	NC_017308	CTT	2	6	221583	221588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4257	NC_017308	GC	3	6	221626	221631	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4258	NC_017308	TGGCT	2	10	221632	221641	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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4271	NC_017308	G	6	6	222303	222308	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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4359	NC_017308	TGAA	2	8	226457	226464	50 %	25 %	25 %	0 %	387139872
4360	NC_017308	CAA	2	6	226512	226517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387139872
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4490	NC_017308	A	6	6	232844	232849	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4491	NC_017308	TTTA	2	8	232852	232859	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4492	NC_017308	GAT	2	6	232862	232867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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