MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis 1/06-A chromosome

Total Repeats: 43087

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_017308	GCA	2	6	311796	311801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387139948
6002	NC_017308	GAA	2	6	311870	311875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387139948
6003	NC_017308	ATC	2	6	311895	311900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387139948
6004	NC_017308	TGCG	2	8	311947	311954	0 %	25 %	50 %	25 %	387139948
6005	NC_017308	CTT	2	6	312054	312059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387139948
6006	NC_017308	GTT	2	6	312108	312113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387139948
6007	NC_017308	GCAAC	2	10	312154	312163	40 %	0 %	20 %	40 %	387139948
6008	NC_017308	CGG	2	6	312224	312229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387139948
6009	NC_017308	AGGTTG	2	12	312298	312309	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	387139948
6010	NC_017308	GC	3	6	312346	312351	0 %	0 %	50 %	50 %	387139948
6011	NC_017308	T	6	6	312614	312619	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_017308	AGC	2	6	312662	312667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6013	NC_017308	GTT	2	6	312677	312682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6014	NC_017308	AGT	2	6	312714	312719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6015	NC_017308	ACT	3	9	312744	312752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6016	NC_017308	GAA	3	9	312784	312792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387139949
6017	NC_017308	TTA	2	6	312804	312809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387139949
6018	NC_017308	CAT	2	6	312883	312888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387139949
6019	NC_017308	TGC	2	6	312910	312915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139949
6020	NC_017308	GTT	2	6	312938	312943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387139949
6021	NC_017308	CAG	2	6	313002	313007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387139949
6022	NC_017308	TGC	2	6	313014	313019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139949
6023	NC_017308	GCT	2	6	313025	313030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139949
6024	NC_017308	GCT	2	6	313151	313156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139949
6025	NC_017308	CAT	2	6	313159	313164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387139949
6026	NC_017308	GTT	2	6	313193	313198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387139949
6027	NC_017308	CA	3	6	313251	313256	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6028	NC_017308	CAA	2	6	313291	313296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387139950
6029	NC_017308	A	6	6	313295	313300	100 %	0 %	0 %	0 %	387139950
6030	NC_017308	CGC	3	9	313315	313323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387139950
6031	NC_017308	GCT	2	6	313364	313369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139950
6032	NC_017308	TCC	2	6	313388	313393	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387139950
6033	NC_017308	ACG	2	6	313401	313406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387139950
6034	NC_017308	GCA	2	6	313553	313558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387139950
6035	NC_017308	ACC	2	6	313577	313582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387139950
6036	NC_017308	CCAGA	2	10	313640	313649	40 %	0 %	20 %	40 %	387139950
6037	NC_017308	ACC	2	6	313724	313729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387139950
6038	NC_017308	GCT	2	6	313790	313795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139950
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6041	NC_017308	GAA	2	6	313975	313980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387139950
6042	NC_017308	CCT	2	6	314031	314036	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6043	NC_017308	CA	3	6	314042	314047	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6044	NC_017308	AGG	2	6	314054	314059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6045	NC_017308	T	6	6	314062	314067	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_017308	GCT	2	6	314158	314163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6047	NC_017308	TGA	2	6	314164	314169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6048	NC_017308	GCT	2	6	314174	314179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6049	NC_017308	TGA	2	6	314215	314220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6050	NC_017308	CGC	2	6	314221	314226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6051	NC_017308	AG	3	6	314234	314239	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6052	NC_017308	GACC	2	8	314293	314300	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6053	NC_017308	TGC	2	6	314329	314334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6054	NC_017308	A	6	6	314362	314367	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_017308	AATTTT	2	12	314381	314392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6056	NC_017308	GCT	2	6	314499	314504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6057	NC_017308	GCC	2	6	314760	314765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6058	NC_017308	GAC	2	6	314797	314802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6059	NC_017308	AAC	2	6	314866	314871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6060	NC_017308	TGCT	2	8	314879	314886	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6061	NC_017308	TGG	2	6	314927	314932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6062	NC_017308	GTT	2	6	314947	314952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6063	NC_017308	TG	3	6	315036	315041	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6064	NC_017308	TCC	2	6	315093	315098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6065	NC_017308	TGGCG	2	10	315118	315127	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
6066	NC_017308	A	6	6	315273	315278	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6067	NC_017308	CCA	2	6	315303	315308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6069	NC_017308	CTA	2	6	315576	315581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387139951
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6071	NC_017308	CCA	2	6	315630	315635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387139951
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6075	NC_017308	ACT	2	6	315798	315803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387139951
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6080	NC_017308	CAG	2	6	315967	315972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387139951
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6088	NC_017308	TGT	2	6	316291	316296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387139951
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6094	NC_017308	GA	3	6	316814	316819	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6095	NC_017308	ATG	2	6	316833	316838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6096	NC_017308	TTAT	2	8	316872	316879	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6097	NC_017308	GGC	2	6	316965	316970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387139952
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6099	NC_017308	GC	3	6	317009	317014	0 %	0 %	50 %	50 %	387139952
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6108	NC_017308	GAG	2	6	317623	317628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387139952
6109	NC_017308	TC	3	6	317685	317690	0 %	50 %	0 %	50 %	387139952
6110	NC_017308	TCA	2	6	317724	317729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387139952
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6125	NC_017308	TTA	2	6	318551	318556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387139953
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6370	NC_017308	CAT	2	6	330921	330926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387139962
6371	NC_017308	TCG	2	6	330948	330953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139962
6372	NC_017308	TTGG	3	12	330986	330997	0 %	50 %	50 %	0 %	387139962
6373	NC_017308	CTG	2	6	330998	331003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139962
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6379	NC_017308	TACATG	2	12	331261	331272	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387139962
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6381	NC_017308	TGA	2	6	331293	331298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387139962
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6383	NC_017308	CAG	2	6	331342	331347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387139962
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6385	NC_017308	TGA	2	6	331461	331466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387139962
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6393	NC_017308	CTT	2	6	331835	331840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387139963
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6398	NC_017308	CAT	2	6	332036	332041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387139963
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6474	NC_017308	GTT	2	6	335968	335973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6475	NC_017308	GGAT	2	8	336032	336039	25 %	25 %	50 %	0 %	387139964
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6482	NC_017308	CCTGGG	2	12	336238	336249	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	387139964
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6487	NC_017308	TTGGG	2	10	336487	336496	0 %	40 %	60 %	0 %	387139964
6488	NC_017308	ATT	2	6	336512	336517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387139964
6489	NC_017308	ATC	3	9	336518	336526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387139964
6490	NC_017308	TGG	2	6	336539	336544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387139964
6491	NC_017308	GGA	2	6	336583	336588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387139964
6492	NC_017308	AGCTG	2	10	336601	336610	20 %	20 %	40 %	20 %	387139964
6493	NC_017308	GCG	2	6	336611	336616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387139964
6494	NC_017308	AGAA	2	8	336622	336629	75 %	0 %	25 %	0 %	387139964
6495	NC_017308	GTA	2	6	336677	336682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387139964
6496	NC_017308	GCAG	2	8	336688	336695	25 %	0 %	50 %	25 %	387139964
6497	NC_017308	GAA	2	6	336715	336720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387139964
6498	NC_017308	GA	3	6	336811	336816	50 %	0 %	50 %	0 %	387139964
6499	NC_017308	AGGC	2	8	336874	336881	25 %	0 %	50 %	25 %	387139964
6500	NC_017308	CCG	2	6	336900	336905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387139964

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