MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis 1/06-A chromosome

Total Repeats: 43087

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017308	ACG	2	6	261394	261399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387139900
5002	NC_017308	CAGA	2	8	261456	261463	50 %	0 %	25 %	25 %	387139900
5003	NC_017308	TGGC	2	8	261572	261579	0 %	25 %	50 %	25 %	387139900
5004	NC_017308	GTG	2	6	261625	261630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387139900
5005	NC_017308	GTA	2	6	261666	261671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387139900
5006	NC_017308	CAA	2	6	261986	261991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5007	NC_017308	GCG	2	6	262084	262089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387139901
5008	NC_017308	CGT	2	6	262140	262145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139901
5009	NC_017308	AGG	2	6	262264	262269	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387139901
5010	NC_017308	CCCA	2	8	262275	262282	25 %	0 %	0 %	75 %	387139901
5011	NC_017308	GCA	2	6	262287	262292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387139901
5012	NC_017308	CGGG	2	8	262297	262304	0 %	0 %	75 %	25 %	387139901
5013	NC_017308	ATT	2	6	262357	262362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387139901
5014	NC_017308	GGTGG	2	10	262376	262385	0 %	20 %	80 %	0 %	387139901
5015	NC_017308	CCG	2	6	262490	262495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387139901
5016	NC_017308	AGC	2	6	262504	262509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387139901
5017	NC_017308	TGG	2	6	262513	262518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387139901
5018	NC_017308	CAT	2	6	262572	262577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387139901
5019	NC_017308	ACGCA	2	10	262647	262656	40 %	0 %	20 %	40 %	387139901
5020	NC_017308	GCT	2	6	262758	262763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139901
5021	NC_017308	CGC	2	6	262779	262784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387139901
5022	NC_017308	GGC	2	6	262943	262948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387139901
5023	NC_017308	TTG	2	6	262954	262959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387139901
5024	NC_017308	TTG	2	6	262990	262995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387139901
5025	NC_017308	G	6	6	263042	263047	0 %	0 %	100 %	0 %	387139901
5026	NC_017308	GCT	2	6	263132	263137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139901
5027	NC_017308	GGA	2	6	263168	263173	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387139901
5028	NC_017308	GCC	2	6	263205	263210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387139901
5029	NC_017308	AGG	2	6	263227	263232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387139901
5030	NC_017308	TTGATG	2	12	263254	263265	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	387139901
5031	NC_017308	TTC	2	6	263437	263442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387139902
5032	NC_017308	CGAGGC	2	12	263519	263530	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	387139902
5033	NC_017308	GCG	3	9	263536	263544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387139902
5034	NC_017308	CAA	2	6	263556	263561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387139902
5035	NC_017308	TGT	2	6	263576	263581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387139902
5036	NC_017308	CTTCT	2	10	263587	263596	0 %	60 %	0 %	40 %	387139902
5037	NC_017308	TCG	2	6	263597	263602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139902
5038	NC_017308	CGG	2	6	263635	263640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387139902
5039	NC_017308	CTC	2	6	263782	263787	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387139902
5040	NC_017308	AGGA	2	8	264070	264077	50 %	0 %	50 %	0 %	387139902
5041	NC_017308	TACC	2	8	264098	264105	25 %	25 %	0 %	50 %	387139902
5042	NC_017308	GGCAGC	2	12	264116	264127	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	387139902
5043	NC_017308	TGC	2	6	264143	264148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139902
5044	NC_017308	GGC	2	6	264153	264158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387139902
5045	NC_017308	GGTC	2	8	264260	264267	0 %	25 %	50 %	25 %	387139903
5046	NC_017308	ACC	2	6	264314	264319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387139903
5047	NC_017308	TGC	2	6	264330	264335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139903
5048	NC_017308	GTG	2	6	264371	264376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387139903
5049	NC_017308	TTG	2	6	264395	264400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387139903
5050	NC_017308	GA	3	6	264492	264497	50 %	0 %	50 %	0 %	387139903
5051	NC_017308	TGA	2	6	264610	264615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387139903
5052	NC_017308	GCC	2	6	264638	264643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387139903
5053	NC_017308	GGC	2	6	264692	264697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387139903
5054	NC_017308	ATT	2	6	264881	264886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387139903
5055	NC_017308	GCC	2	6	264914	264919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387139903
5056	NC_017308	GAA	2	6	264949	264954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387139903
5057	NC_017308	GCG	2	6	264957	264962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387139903
5058	NC_017308	CGG	2	6	264996	265001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387139903
5059	NC_017308	TCA	2	6	265011	265016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387139903
5060	NC_017308	ATTA	2	8	265025	265032	50 %	50 %	0 %	0 %	387139903
5061	NC_017308	AATGC	2	10	265040	265049	40 %	20 %	20 %	20 %	387139903
5062	NC_017308	CAGAG	2	10	265136	265145	40 %	0 %	40 %	20 %	387139903
5063	NC_017308	TTC	2	6	265157	265162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387139903
5064	NC_017308	GGA	2	6	265193	265198	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387139903
5065	NC_017308	TGC	2	6	265231	265236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139903
5066	NC_017308	TTG	2	6	265367	265372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387139903
5067	NC_017308	TTC	2	6	265434	265439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387139904
5068	NC_017308	AAGG	2	8	265490	265497	50 %	0 %	50 %	0 %	387139904
5069	NC_017308	GTT	2	6	265508	265513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387139904
5070	NC_017308	GACATC	2	12	265556	265567	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387139904
5071	NC_017308	TTA	2	6	265571	265576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387139904
5072	NC_017308	TG	3	6	265609	265614	0 %	50 %	50 %	0 %	387139904
5073	NC_017308	CCGC	2	8	265659	265666	0 %	0 %	25 %	75 %	387139904
5074	NC_017308	AGT	2	6	265684	265689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387139904
5075	NC_017308	CGG	2	6	265777	265782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387139904
5076	NC_017308	GAG	2	6	265805	265810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387139904
5077	NC_017308	CGA	2	6	265816	265821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387139904
5078	NC_017308	TACCGT	2	12	265864	265875	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387139904
5079	NC_017308	GAA	2	6	266051	266056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387139904
5080	NC_017308	CTT	2	6	266061	266066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387139904
5081	NC_017308	AAGACT	2	12	266112	266123	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387139904
5082	NC_017308	AGC	3	9	266137	266145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387139905
5083	NC_017308	CGC	2	6	266184	266189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387139905
5084	NC_017308	GAG	2	6	266240	266245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387139905
5085	NC_017308	GTG	2	6	266321	266326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387139905
5086	NC_017308	CGC	2	6	266346	266351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387139905
5087	NC_017308	TGG	2	6	266385	266390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387139905
5088	NC_017308	TGG	2	6	266510	266515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387139905
5089	NC_017308	ACC	2	6	266576	266581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387139905
5090	NC_017308	GTC	3	9	266614	266622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139905
5091	NC_017308	ACCA	2	8	266636	266643	50 %	0 %	0 %	50 %	387139905
5092	NC_017308	TCG	2	6	266663	266668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139905
5093	NC_017308	CGTC	2	8	266682	266689	0 %	25 %	25 %	50 %	387139905
5094	NC_017308	TCT	2	6	266690	266695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387139905
5095	NC_017308	AGC	2	6	266741	266746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387139905
5096	NC_017308	TCG	3	9	266759	266767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139905
5097	NC_017308	GCA	2	6	266788	266793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387139905
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5099	NC_017308	CGC	2	6	266958	266963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387139905
5100	NC_017308	GA	3	6	266985	266990	50 %	0 %	50 %	0 %	387139905
5101	NC_017308	AGT	2	6	267077	267082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387139906
5102	NC_017308	AAC	2	6	267179	267184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387139906
5103	NC_017308	TGG	2	6	267193	267198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387139906
5104	NC_017308	CAG	2	6	267282	267287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387139906
5105	NC_017308	CGG	2	6	267322	267327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387139906
5106	NC_017308	AACT	2	8	267338	267345	50 %	25 %	0 %	25 %	387139906
5107	NC_017308	TGA	2	6	267347	267352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387139906
5108	NC_017308	CCTT	2	8	267427	267434	0 %	50 %	0 %	50 %	387139906
5109	NC_017308	CGG	3	9	267488	267496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387139906
5110	NC_017308	TCG	2	6	267498	267503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139906
5111	NC_017308	GCG	2	6	267504	267509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387139906
5112	NC_017308	GCA	2	6	267548	267553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387139906
5113	NC_017308	TTG	2	6	267571	267576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387139906
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5115	NC_017308	GA	3	6	267697	267702	50 %	0 %	50 %	0 %	387139906
5116	NC_017308	GA	3	6	267708	267713	50 %	0 %	50 %	0 %	387139907
5117	NC_017308	AAC	2	6	267723	267728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387139907
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5119	NC_017308	CGG	2	6	267766	267771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387139907
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5121	NC_017308	TGG	2	6	267814	267819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387139907
5122	NC_017308	GCA	2	6	267843	267848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387139907
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5241	NC_017308	AGGA	2	8	273022	273029	50 %	0 %	50 %	0 %	387139915
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5366	NC_017308	A	6	6	279176	279181	100 %	0 %	0 %	0 %	387139920
5367	NC_017308	ACCA	2	8	279204	279211	50 %	0 %	0 %	50 %	387139921
5368	NC_017308	GC	3	6	279296	279301	0 %	0 %	50 %	50 %	387139921
5369	NC_017308	TG	3	6	279318	279323	0 %	50 %	50 %	0 %	387139921
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5371	NC_017308	ATC	2	6	279339	279344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387139921
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5373	NC_017308	CAA	2	6	279365	279370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387139921
5374	NC_017308	GCA	2	6	279441	279446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387139921
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5378	NC_017308	GC	3	6	279549	279554	0 %	0 %	50 %	50 %	387139921
5379	NC_017308	TATT	2	8	279575	279582	25 %	75 %	0 %	0 %	387139921
5380	NC_017308	CTG	2	6	279609	279614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139921
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5382	NC_017308	TCG	2	6	279694	279699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139921
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5384	NC_017308	GC	3	6	279773	279778	0 %	0 %	50 %	50 %	387139921
5385	NC_017308	GCT	2	6	279874	279879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5386	NC_017308	GAA	2	6	279925	279930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5387	NC_017308	GCT	4	12	279934	279945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5390	NC_017308	TCG	2	6	280165	280170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139922
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5392	NC_017308	AGGA	2	8	280202	280209	50 %	0 %	50 %	0 %	387139922
5393	NC_017308	CGC	2	6	280228	280233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387139922
5394	NC_017308	GAG	2	6	280270	280275	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387139922
5395	NC_017308	AGCT	2	8	280289	280296	25 %	25 %	25 %	25 %	387139922
5396	NC_017308	GCAGG	2	10	280298	280307	20 %	0 %	60 %	20 %	387139922
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5398	NC_017308	CGC	2	6	280318	280323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387139922
5399	NC_017308	CTG	2	6	280352	280357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139922
5400	NC_017308	CCGC	2	8	280367	280374	0 %	0 %	25 %	75 %	387139922
5401	NC_017308	TGA	2	6	280379	280384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387139922
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5403	NC_017308	TGGC	2	8	280464	280471	0 %	25 %	50 %	25 %	387139922
5404	NC_017308	TCG	2	6	280582	280587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139922
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5406	NC_017308	CTT	2	6	280750	280755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387139922
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5415	NC_017308	CCA	2	6	281174	281179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387139922
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5420	NC_017308	GAT	2	6	281611	281616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387139922
5421	NC_017308	AGGA	2	8	281660	281667	50 %	0 %	50 %	0 %	387139922
5422	NC_017308	GAA	2	6	281716	281721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387139922
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5427	NC_017308	GTG	2	6	281843	281848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387139922
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5429	NC_017308	GCTG	2	8	281994	282001	0 %	25 %	50 %	25 %	387139922
5430	NC_017308	GGA	2	6	282087	282092	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387139922
5431	NC_017308	GCGCTT	2	12	282151	282162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139922
5432	NC_017308	GCA	2	6	282172	282177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387139922
5433	NC_017308	CTG	2	6	282289	282294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139922
5434	NC_017308	GGC	2	6	282303	282308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387139922
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5438	NC_017308	GTAG	2	8	282402	282409	25 %	25 %	50 %	0 %	387139922
5439	NC_017308	TCA	2	6	282452	282457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5440	NC_017308	TGA	2	6	282468	282473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387139923
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5442	NC_017308	TGT	2	6	282519	282524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387139923
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5444	NC_017308	CGT	2	6	282596	282601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139923
5445	NC_017308	GCCG	2	8	282623	282630	0 %	0 %	50 %	50 %	387139923
5446	NC_017308	CTT	2	6	282698	282703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387139923
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5450	NC_017308	ATG	2	6	283037	283042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387139923
5451	NC_017308	GCT	2	6	283340	283345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139923
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5453	NC_017308	TGC	2	6	283380	283385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139923
5454	NC_017308	GAC	2	6	283421	283426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387139923
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5457	NC_017308	TCAT	2	8	283569	283576	25 %	50 %	0 %	25 %	387139923
5458	NC_017308	CTCG	2	8	283591	283598	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5459	NC_017308	AAGG	2	8	283637	283644	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5460	NC_017308	CAT	2	6	283664	283669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387139924
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5462	NC_017308	GGC	2	6	283764	283769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387139924
5463	NC_017308	GAG	2	6	283875	283880	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387139924
5464	NC_017308	CTT	2	6	283906	283911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387139924
5465	NC_017308	TGA	2	6	284102	284107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387139924
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5467	NC_017308	TTC	2	6	284150	284155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387139924
5468	NC_017308	GAT	2	6	284163	284168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387139924
5469	NC_017308	GC	3	6	284177	284182	0 %	0 %	50 %	50 %	387139924
5470	NC_017308	AGA	2	6	284222	284227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387139924
5471	NC_017308	A	6	6	284292	284297	100 %	0 %	0 %	0 %	387139924
5472	NC_017308	GGC	2	6	284334	284339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387139924
5473	NC_017308	TTA	2	6	284401	284406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387139924
5474	NC_017308	CGG	2	6	284494	284499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387139924
5475	NC_017308	CTG	2	6	284502	284507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139924
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5478	NC_017308	CG	4	8	284756	284763	0 %	0 %	50 %	50 %	387139924
5479	NC_017308	AGACGA	2	12	284765	284776	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	387139924
5480	NC_017308	CGA	2	6	284795	284800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387139924
5481	NC_017308	GACG	2	8	284823	284830	25 %	0 %	50 %	25 %	387139924
5482	NC_017308	TGC	2	6	284831	284836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139924
5483	NC_017308	CGG	2	6	284870	284875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387139924
5484	NC_017308	GCA	2	6	284913	284918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387139924
5485	NC_017308	TGC	2	6	285002	285007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139924
5486	NC_017308	AGC	2	6	285011	285016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387139924
5487	NC_017308	CTG	2	6	285099	285104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139925
5488	NC_017308	TTC	2	6	285108	285113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387139925
5489	NC_017308	CTG	2	6	285197	285202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139925
5490	NC_017308	ACA	2	6	285235	285240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387139925
5491	NC_017308	AGGCC	2	10	285266	285275	20 %	0 %	40 %	40 %	387139925
5492	NC_017308	TCC	2	6	285301	285306	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387139925
5493	NC_017308	GAG	2	6	285330	285335	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387139925
5494	NC_017308	CCT	2	6	285341	285346	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387139925
5495	NC_017308	GCG	2	6	285412	285417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387139925
5496	NC_017308	CGA	2	6	285455	285460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387139925
5497	NC_017308	GCA	2	6	285463	285468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387139925
5498	NC_017308	GCC	2	6	285495	285500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387139925
5499	NC_017308	CAC	2	6	285546	285551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387139925
5500	NC_017308	TAA	2	6	285659	285664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387139925

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