MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis CIP 52.97 chromosome

Total Repeats: 1309

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017307	ACCAC	2	10	1694	1703	40 %	0 %	0 %	60 %	387137614
2	NC_017307	CACGC	2	10	5735	5744	20 %	0 %	20 %	60 %	387137619
3	NC_017307	GTGGA	2	10	5772	5781	20 %	20 %	60 %	0 %	387137619
4	NC_017307	AATCT	2	10	6609	6618	40 %	40 %	0 %	20 %	387137619
5	NC_017307	TTATC	2	10	14087	14096	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_017307	CAGTA	2	10	14634	14643	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_017307	CAGTG	2	10	15505	15514	20 %	20 %	40 %	20 %	387137629
8	NC_017307	AAAAT	2	10	16765	16774	80 %	20 %	0 %	0 %	387137630
9	NC_017307	TAGCG	2	10	18333	18342	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NC_017307	CTTTT	2	10	19240	19249	0 %	80 %	0 %	20 %	387137634
11	NC_017307	GCTCT	2	10	19277	19286	0 %	40 %	20 %	40 %	387137634
12	NC_017307	CACAC	2	10	21443	21452	40 %	0 %	0 %	60 %	387137639
13	NC_017307	TGCGT	2	10	24367	24376	0 %	40 %	40 %	20 %	387137642
14	NC_017307	CTGAT	2	10	28398	28407	20 %	40 %	20 %	20 %	387137646
15	NC_017307	GGAGC	2	10	29351	29360	20 %	0 %	60 %	20 %	387137647
16	NC_017307	TTGCT	2	10	30439	30448	0 %	60 %	20 %	20 %	387137648
17	NC_017307	TGAGG	2	10	37272	37281	20 %	20 %	60 %	0 %	387137652
18	NC_017307	CACAT	2	10	39456	39465	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
19	NC_017307	AATCC	2	10	39505	39514	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
20	NC_017307	TGCGG	2	10	40389	40398	0 %	20 %	60 %	20 %	387137656
21	NC_017307	GCCTC	2	10	46372	46381	0 %	20 %	20 %	60 %	387137665
22	NC_017307	GAAGG	2	10	46386	46395	40 %	0 %	60 %	0 %	387137665
23	NC_017307	CAGTG	2	10	48297	48306	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_017307	TGAGA	2	10	48639	48648	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017307	AGTGA	2	10	48689	48698	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017307	TTGGA	2	10	51728	51737	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017307	TTGAT	2	10	51763	51772	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017307	TGCAC	2	10	51857	51866	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
29	NC_017307	CTGGC	2	10	52116	52125	0 %	20 %	40 %	40 %	387137673
30	NC_017307	GCAGC	2	10	52615	52624	20 %	0 %	40 %	40 %	387137673
31	NC_017307	GACTG	2	10	52631	52640	20 %	20 %	40 %	20 %	387137673
32	NC_017307	AAGGC	2	10	54873	54882	40 %	0 %	40 %	20 %	387137675
33	NC_017307	ATGGC	2	10	58398	58407	20 %	20 %	40 %	20 %	387137680
34	NC_017307	ATGTG	2	10	62567	62576	20 %	40 %	40 %	0 %	387137684
35	NC_017307	GCTGG	2	10	64729	64738	0 %	20 %	60 %	20 %	387137687
36	NC_017307	AGGGA	2	10	67340	67349	40 %	0 %	60 %	0 %	387137689
37	NC_017307	ATTTG	2	10	67915	67924	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017307	AAGAT	2	10	69147	69156	60 %	20 %	20 %	0 %	387137691
39	NC_017307	GGAGC	2	10	69254	69263	20 %	0 %	60 %	20 %	387137691
40	NC_017307	GGTCT	2	10	70968	70977	0 %	40 %	40 %	20 %	387137693
41	NC_017307	AGGGG	2	10	71522	71531	20 %	0 %	80 %	0 %	387137694
42	NC_017307	CATGT	2	10	71545	71554	20 %	40 %	20 %	20 %	387137694
43	NC_017307	CAGCG	2	10	72425	72434	20 %	0 %	40 %	40 %	387137695
44	NC_017307	ACTGA	2	10	72602	72611	40 %	20 %	20 %	20 %	387137695
45	NC_017307	CAGGC	2	10	72831	72840	20 %	0 %	40 %	40 %	387137695
46	NC_017307	ATGGC	2	10	73676	73685	20 %	20 %	40 %	20 %	387137696
47	NC_017307	AGGCA	2	10	74997	75006	40 %	0 %	40 %	20 %	387137697
48	NC_017307	TAATT	2	10	76243	76252	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017307	GCTTT	2	10	80839	80848	0 %	60 %	20 %	20 %	387137703
50	NC_017307	TGACC	2	10	81095	81104	20 %	20 %	20 %	40 %	387137703
51	NC_017307	CGTTA	2	10	81837	81846	20 %	40 %	20 %	20 %	387137704
52	NC_017307	TGCTG	2	10	82471	82480	0 %	40 %	40 %	20 %	387137704
53	NC_017307	TGGCC	2	10	84462	84471	0 %	20 %	40 %	40 %	387137705
54	NC_017307	GCGAC	2	10	85266	85275	20 %	0 %	40 %	40 %	387137705
55	NC_017307	TGGGA	2	10	88684	88693	20 %	20 %	60 %	0 %	387137711
56	NC_017307	GATCG	2	10	89784	89793	20 %	20 %	40 %	20 %	387137713
57	NC_017307	CAAAA	2	10	90517	90526	80 %	0 %	0 %	20 %	387137713
58	NC_017307	AACAA	2	10	93358	93367	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_017307	TGCAA	2	10	96365	96374	40 %	20 %	20 %	20 %	387137718
60	NC_017307	TGCAG	2	10	96585	96594	20 %	20 %	40 %	20 %	387137718
61	NC_017307	AGGTC	2	10	99021	99030	20 %	20 %	40 %	20 %	387137721
62	NC_017307	ACCAA	2	10	100880	100889	60 %	0 %	0 %	40 %	387137721
63	NC_017307	TCATC	2	10	102143	102152	20 %	40 %	0 %	40 %	387137722
64	NC_017307	TGCAC	2	10	103959	103968	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
65	NC_017307	CCTGG	2	10	104175	104184	0 %	20 %	40 %	40 %	387137723
66	NC_017307	CGGTG	2	10	104383	104392	0 %	20 %	60 %	20 %	387137723
67	NC_017307	CGGCG	2	10	107002	107011	0 %	0 %	60 %	40 %	387137726
68	NC_017307	CGCGG	2	10	107062	107071	0 %	0 %	60 %	40 %	387137727
69	NC_017307	CAGCG	2	10	107598	107607	20 %	0 %	40 %	40 %	387137728
70	NC_017307	GGATC	2	10	118450	118459	20 %	20 %	40 %	20 %	387137739
71	NC_017307	TGTTT	2	10	120923	120932	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017307	CGGGA	2	10	125567	125576	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
73	NC_017307	GACTG	2	10	127808	127817	20 %	20 %	40 %	20 %	387137745
74	NC_017307	GGGGC	2	10	133583	133592	0 %	0 %	80 %	20 %	387137749
75	NC_017307	AGACG	2	10	135388	135397	40 %	0 %	40 %	20 %	387137751
76	NC_017307	ACGGT	2	10	136718	136727	20 %	20 %	40 %	20 %	387137753
77	NC_017307	CGATC	2	10	136991	137000	20 %	20 %	20 %	40 %	387137753
78	NC_017307	TGGCC	2	10	137198	137207	0 %	20 %	40 %	40 %	387137753
79	NC_017307	TGGTG	2	10	137576	137585	0 %	40 %	60 %	0 %	387137753
80	NC_017307	GGAGT	2	10	138048	138057	20 %	20 %	60 %	0 %	387137753
81	NC_017307	ATTGC	2	10	141982	141991	20 %	40 %	20 %	20 %	387137756
82	NC_017307	AAAAC	2	10	144808	144817	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_017307	TCACT	2	10	145852	145861	20 %	40 %	0 %	40 %	387137761
84	NC_017307	ATTTC	2	10	146469	146478	20 %	60 %	0 %	20 %	387137761
85	NC_017307	AATGG	2	10	150169	150178	40 %	20 %	40 %	0 %	387137764
86	NC_017307	GTGAG	2	10	151151	151160	20 %	20 %	60 %	0 %	387137766
87	NC_017307	CTGAA	2	10	151949	151958	40 %	20 %	20 %	20 %	387137766
88	NC_017307	CCAGC	2	10	153241	153250	20 %	0 %	20 %	60 %	387137767
89	NC_017307	TTGCC	2	10	153751	153760	0 %	40 %	20 %	40 %	387137768
90	NC_017307	GTACC	2	10	155711	155720	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
91	NC_017307	TACGC	2	10	156268	156277	20 %	20 %	20 %	40 %	387137770
92	NC_017307	GGTTG	2	10	161037	161046	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017307	CCTTG	2	10	161413	161422	0 %	40 %	20 %	40 %	387137776
94	NC_017307	GCATA	2	10	163137	163146	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
95	NC_017307	TGTGC	2	10	164360	164369	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
96	NC_017307	CGGTG	2	10	165384	165393	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
97	NC_017307	CATGG	2	10	167518	167527	20 %	20 %	40 %	20 %	387137780
98	NC_017307	CAGAT	2	10	167874	167883	40 %	20 %	20 %	20 %	387137780
99	NC_017307	GGATG	2	10	168772	168781	20 %	20 %	60 %	0 %	387137780
100	NC_017307	TAACA	2	10	169776	169785	60 %	20 %	0 %	20 %	387137781
101	NC_017307	GGGAC	2	10	171402	171411	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
102	NC_017307	CACTT	2	10	171583	171592	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
103	NC_017307	AAACT	2	10	172459	172468	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_017307	ACCGG	2	10	172854	172863	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
105	NC_017307	CCTAC	2	10	177296	177305	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
106	NC_017307	TTAAG	2	10	182029	182038	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017307	TGACC	2	10	182947	182956	20 %	20 %	20 %	40 %	387137789
108	NC_017307	TAATA	2	10	183753	183762	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017307	TTGCA	2	10	184234	184243	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
110	NC_017307	TTGCA	2	10	184674	184683	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
111	NC_017307	TTTTA	2	10	184853	184862	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017307	GTTTG	2	10	186595	186604	0 %	60 %	40 %	0 %	387137792
113	NC_017307	CGGAT	2	10	187534	187543	20 %	20 %	40 %	20 %	387137793
114	NC_017307	AGCGC	2	10	188692	188701	20 %	0 %	40 %	40 %	387137794
115	NC_017307	GCAGT	2	10	190179	190188	20 %	20 %	40 %	20 %	387137795
116	NC_017307	CAATG	2	10	190450	190459	40 %	20 %	20 %	20 %	387137795
117	NC_017307	TAACG	2	10	191425	191434	40 %	20 %	20 %	20 %	387137796
118	NC_017307	AAGCC	2	10	192752	192761	40 %	0 %	20 %	40 %	387137797
119	NC_017307	GGCCC	2	10	194825	194834	0 %	0 %	40 %	60 %	387137800
120	NC_017307	GAATT	2	10	198390	198399	40 %	40 %	20 %	0 %	387137805
121	NC_017307	CAAGG	2	10	199279	199288	40 %	0 %	40 %	20 %	387137805
122	NC_017307	GATGG	2	10	201728	201737	20 %	20 %	60 %	0 %	387137806
123	NC_017307	TGGCG	2	10	202462	202471	0 %	20 %	60 %	20 %	387137807
124	NC_017307	CAGGC	2	10	205807	205816	20 %	0 %	40 %	40 %	387137810
125	NC_017307	TTGTA	2	10	206217	206226	20 %	60 %	20 %	0 %	387137811
126	NC_017307	GCGAC	2	10	210734	210743	20 %	0 %	40 %	40 %	387137816
127	NC_017307	AGATC	2	10	210759	210768	40 %	20 %	20 %	20 %	387137816
128	NC_017307	CAAGG	2	10	211673	211682	40 %	0 %	40 %	20 %	387137817
129	NC_017307	AGAAA	2	10	212402	212411	80 %	0 %	20 %	0 %	387137818
130	NC_017307	AGTGC	2	10	217435	217444	20 %	20 %	40 %	20 %	387137824
131	NC_017307	CGGGG	2	10	218437	218446	0 %	0 %	80 %	20 %	387137825
132	NC_017307	GAAAA	2	10	218576	218585	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017307	CGAGA	2	10	219215	219224	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
134	NC_017307	TGCGC	2	10	220876	220885	0 %	20 %	40 %	40 %	387137827
135	NC_017307	CATTG	2	10	222725	222734	20 %	40 %	20 %	20 %	387137829
136	NC_017307	CAAAA	2	10	222840	222849	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_017307	CGCAA	2	10	223539	223548	40 %	0 %	20 %	40 %	387137832
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270	NC_017307	TGCGC	2	10	452275	452284	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
271	NC_017307	CTGTG	2	10	452453	452462	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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369	NC_017307	CGTCA	2	10	611918	611927	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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371	NC_017307	TGTGT	2	10	612345	612354	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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443	NC_017307	GCTGA	2	10	735098	735107	20 %	20 %	40 %	20 %	387138307
444	NC_017307	TCCTG	2	10	735842	735851	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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