MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis 42/02-A chromosome

Total Repeats: 44177

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017306	ATC	2	6	26815	26820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387135589
502	NC_017306	GTG	2	6	26849	26854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387135589
503	NC_017306	CCG	2	6	26883	26888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387135589
504	NC_017306	CAG	3	9	26899	26907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387135589
505	NC_017306	TCA	2	6	26946	26951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387135589
506	NC_017306	CGG	2	6	27020	27025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387135590
507	NC_017306	AAG	2	6	27087	27092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387135590
508	NC_017306	TGA	2	6	27101	27106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387135590
509	NC_017306	TAC	2	6	27213	27218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387135590
510	NC_017306	CTG	2	6	27512	27517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135590
511	NC_017306	ACC	2	6	27547	27552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387135590
512	NC_017306	GCT	2	6	27553	27558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135590
513	NC_017306	CAC	2	6	27560	27565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387135590
514	NC_017306	AGTGCT	2	12	27577	27588	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387135590
515	NC_017306	GAA	2	6	27604	27609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387135590
516	NC_017306	AGC	2	6	27645	27650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387135590
517	NC_017306	AATT	2	8	27656	27663	50 %	50 %	0 %	0 %	387135590
518	NC_017306	GA	3	6	27707	27712	50 %	0 %	50 %	0 %	387135590
519	NC_017306	AGG	2	6	27754	27759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387135590
520	NC_017306	CA	3	6	27781	27786	50 %	0 %	0 %	50 %	387135590
521	NC_017306	TGG	2	6	27788	27793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387135590
522	NC_017306	TGGA	2	8	27813	27820	25 %	25 %	50 %	0 %	387135590
523	NC_017306	CAG	2	6	27909	27914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387135590
524	NC_017306	GCG	2	6	27933	27938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387135590
525	NC_017306	GAAG	2	8	27968	27975	50 %	0 %	50 %	0 %	387135590
526	NC_017306	GAA	2	6	28168	28173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387135591
527	NC_017306	GGT	2	6	28219	28224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387135591
528	NC_017306	GTT	2	6	28351	28356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387135591
529	NC_017306	ACT	2	6	28417	28422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387135591
530	NC_017306	AGA	2	6	28506	28511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387135591
531	NC_017306	TGC	2	6	28515	28520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135591
532	NC_017306	CTGAT	2	10	28529	28538	20 %	40 %	20 %	20 %	387135591
533	NC_017306	GC	3	6	28554	28559	0 %	0 %	50 %	50 %	387135591
534	NC_017306	TCT	2	6	28601	28606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387135591
535	NC_017306	GAAA	2	8	28629	28636	75 %	0 %	25 %	0 %	387135591
536	NC_017306	CTTC	2	8	28638	28645	0 %	50 %	0 %	50 %	387135591
537	NC_017306	AGAA	2	8	28670	28677	75 %	0 %	25 %	0 %	387135591
538	NC_017306	CAG	2	6	28736	28741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387135591
539	NC_017306	CTT	2	6	28756	28761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387135591
540	NC_017306	CAA	2	6	28794	28799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387135591
541	NC_017306	TC	3	6	28801	28806	0 %	50 %	0 %	50 %	387135591
542	NC_017306	TGA	2	6	28860	28865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387135591
543	NC_017306	TC	3	6	28880	28885	0 %	50 %	0 %	50 %	387135591
544	NC_017306	TCT	2	6	28919	28924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387135591
545	NC_017306	GAA	2	6	28986	28991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387135591
546	NC_017306	GAA	2	6	29004	29009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387135591
547	NC_017306	GAC	2	6	29032	29037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387135591
548	NC_017306	GAA	2	6	29083	29088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387135591
549	NC_017306	AAG	2	6	29107	29112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387135591
550	NC_017306	GCTA	2	8	29129	29136	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
551	NC_017306	TC	3	6	29157	29162	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
552	NC_017306	TAT	2	6	29175	29180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_017306	CAT	2	6	29325	29330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387135592
554	NC_017306	TAG	2	6	29373	29378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387135592
555	NC_017306	ATG	2	6	29401	29406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387135592
556	NC_017306	GGAGC	2	10	29482	29491	20 %	0 %	60 %	20 %	387135592
557	NC_017306	TA	3	6	29535	29540	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_017306	CGG	2	6	29709	29714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387135593
559	NC_017306	TGAG	2	8	29777	29784	25 %	25 %	50 %	0 %	387135593
560	NC_017306	GCA	2	6	29810	29815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387135593
561	NC_017306	TTG	2	6	29901	29906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387135593
562	NC_017306	CAA	2	6	29943	29948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387135593
563	NC_017306	GTAC	2	8	29978	29985	25 %	25 %	25 %	25 %	387135593
564	NC_017306	CAC	2	6	30046	30051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387135593
565	NC_017306	TGA	2	6	30087	30092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387135593
566	NC_017306	TTC	2	6	30175	30180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387135593
567	NC_017306	CTT	2	6	30210	30215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387135593
568	NC_017306	GC	3	6	30247	30252	0 %	0 %	50 %	50 %	387135593
569	NC_017306	AGA	2	6	30283	30288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387135593
570	NC_017306	GTG	2	6	30305	30310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387135593
571	NC_017306	T	7	7	30311	30317	0 %	100 %	0 %	0 %	387135593
572	NC_017306	TGA	2	6	30348	30353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387135593
573	NC_017306	GCT	2	6	30411	30416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135593
574	NC_017306	TGC	2	6	30486	30491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135593
575	NC_017306	GCC	2	6	30520	30525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387135593
576	NC_017306	TTGCT	2	10	30570	30579	0 %	60 %	20 %	20 %	387135593
577	NC_017306	GATC	2	8	30587	30594	25 %	25 %	25 %	25 %	387135593
578	NC_017306	TTC	2	6	30595	30600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387135593
579	NC_017306	GTG	2	6	30710	30715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387135593
580	NC_017306	AGC	2	6	30763	30768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387135593
581	NC_017306	GCA	2	6	30887	30892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387135593
582	NC_017306	GGA	2	6	30986	30991	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387135593
583	NC_017306	GA	3	6	31079	31084	50 %	0 %	50 %	0 %	387135593
584	NC_017306	TGG	2	6	31128	31133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387135593
585	NC_017306	CGT	2	6	31134	31139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135593
586	NC_017306	GC	3	6	31143	31148	0 %	0 %	50 %	50 %	387135593
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591	NC_017306	GCA	2	6	31503	31508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387135593
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593	NC_017306	TGA	2	6	31717	31722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387135594
594	NC_017306	GGAA	2	8	31725	31732	50 %	0 %	50 %	0 %	387135594
595	NC_017306	GGC	2	6	31786	31791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387135594
596	NC_017306	AAC	2	6	31797	31802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387135594
597	NC_017306	TTC	2	6	31881	31886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387135594
598	NC_017306	ACT	2	6	31941	31946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387135594
599	NC_017306	TCC	2	6	31959	31964	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387135594
600	NC_017306	CAA	2	6	31965	31970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387135594
601	NC_017306	TGGC	2	8	31987	31994	0 %	25 %	50 %	25 %	387135594
602	NC_017306	TGC	2	6	32019	32024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135594
603	NC_017306	GAG	2	6	32025	32030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387135594
604	NC_017306	TCC	2	6	32080	32085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387135594
605	NC_017306	TTG	2	6	32093	32098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387135594
606	NC_017306	GTG	2	6	32185	32190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387135594
607	NC_017306	GGTT	2	8	32232	32239	0 %	50 %	50 %	0 %	387135594
608	NC_017306	CTG	2	6	32250	32255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135594
609	NC_017306	CTGA	2	8	32264	32271	25 %	25 %	25 %	25 %	387135594
610	NC_017306	GTA	2	6	32299	32304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387135594
611	NC_017306	GTG	2	6	32417	32422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387135594
612	NC_017306	GCC	3	9	32620	32628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387135594
613	NC_017306	AGG	2	6	32677	32682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387135594
614	NC_017306	AAT	2	6	32724	32729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387135594
615	NC_017306	GCC	2	6	32743	32748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387135594
616	NC_017306	GA	3	6	32811	32816	50 %	0 %	50 %	0 %	387135594
617	NC_017306	CAC	2	6	32819	32824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387135594
618	NC_017306	GAT	2	6	32913	32918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387135594
619	NC_017306	GTC	2	6	33024	33029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135594
620	NC_017306	GCC	2	6	33051	33056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387135594
621	NC_017306	GTC	2	6	33084	33089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135594
622	NC_017306	GC	3	6	33156	33161	0 %	0 %	50 %	50 %	387135595
623	NC_017306	GCT	2	6	33167	33172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135595
624	NC_017306	GCT	2	6	33176	33181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135595
625	NC_017306	GGC	2	6	33205	33210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387135595
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